| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 1,588,756 | Δ970 bp | [ydeS]–[ydeT] | [ydeS], [ydeT] | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 1588756 | 1589725 | 970 | 31 [0] | [0] 31 | [ydeS]–[ydeT] | [ydeS],[ydeT] |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 1588755 | 0 (0.000) | 31 (0.540) | 29/490 | 0.8 | 100% | coding (85/531 nt) | ydeS | putative fimbrial protein YdeS |
| ? | NC_000913 | 1589726 = | 0 (0.000) | coding (276/1149 nt) | ydeT | fimbrial usher domain‑containing protein YdeT | |||||
TCCTTCATCCAGTTTCAACAAAGTATTATTTTCTGCATCCTCAATACCGTTAAATGCAACCCGAACCCCCGTTGTCCCTTTGCTGCATTCACTTAACGTAATCTGAAAAGGGACGGCTGGACTTGTGCTACCGGTCGTTGGAAATTGTCTGGCACTGTTTTTTTGGAGATCTACGGTAAAATTAAGCGAATCCGATGAGACTGTGCAGCCATAATCGAGGACGCGCCCGCTAATTTTAATAACGCTATCTGCGGATAAAGCAGAATAGGTGGTTAACCCCAGACATAAACCGAGGAAAATAATGTTATTGTATTTCATAATCTATTGTTCCTTAGCGACAGATTGCTGTCTGCTGGTTCAGTAAGGTACCAGGAGAAACTTCAGGAAGCTTGTACTCGACAATACAGTTTGAGTTTTTATCTTTGCCCCATGAAACCTGTAATTGCCCTGACTGTGGAAGTCCAGTCAGATAAA > NC_000913/1588522‑1588995 | tccttcATCCAGTTTCAACAAAGTATTATTTTCTGCATCCTCAATACCGTTAAATGCAACCCGAACCCCCGTTGTCCCTTTGCTGCATTCACTTAACGTAATCTGAAAAGGGACGGCTGGACTTGTGCTACCGGTCGTTGGAAATTGTCTGGCACTGTTTTTTTGGAGATCTACGGTAAAATTAAGCGAATCCGATGAGACTGTGCAGCCATAATCGAGGACGCGCCCGCTAATgttttgccatatatta < 1:546035‑M1/250‑17 (MQ=255) ttcATCCAGTTTCAACAAAGTATTATTTTCTGCATCCTCAATACCGTTAAATGCAACCCGAACCCCCGTTGTCCCTTTGCTGCATTCACTTAACGTAATCTGAAAAGGGACGGCTGGACTTGTGCTACCGGTCGTTGGAAATTGTCTGGCACTGTTTTTTTGGAGATCTACGGTAAAATTAAGCGAATCCGATGAGACTGTGCAGCCATAATCGAGGACGCGCCCGCTAATgttttgccatatattattgg > 1:93708‑M1/1‑231 (MQ=255) cAGTTTCAACAAAGTATTATTTTCTGCATCCTCAATACCGTTAAATGCAACCCGAACCCCCGTTGTCCCTTTGCTGCATTCACTTAACGTAATCTGAAAAGGGACGGCTGGACTTGTGCTACCGGTCGTTGGAAATTGTCTGGCACTGTTTTTTTGGAGATCTACGGTAAAATTAAGCGAATCCGATGAGACTGTGCAGCCATAATCGAGGACGCGCCCGCTAATgttttgccatatattattggaatagc > 1:281630‑M1/1‑225 (MQ=255) aGTTTCAACAAAGTATTATTTTCTGCATCCTCAATACCGTTAAATGCAACCCGAACCCCCGTTGTCCCTTTGCTGCATTCACTTAACGTAATCTGAAAAGGGACGGCTGGACTTGTGCTACCGGTCGTTGGAAATTGTCTGGCACTGTTTTTTTGGAGATCTACGGTAAAATTAAGCGAATCCGATGAGACTGTGCAGCCATAATCGAGGACGCGCCCGCTAATgttttgccatatattattggaatagct > 1:191797‑M1/1‑224 (MQ=255) ttCAACAAAGTATTATTTTCTGCATCCTCAATACCGTTAAATGCAACCCGAACCCCCGTTGTCCCTTTGCTGCATTCACTTAACGTAATCTGAAAAGGGACGGCTGGACTTGTGCTACCGGTCGTTGGAAATTGTCTGGCACTGTTTTTTTGGAGATCTACGGTAAAATTAAGCGAATCCGATGAGACTGTGCAGCCATAATCGAGGACGCGCCCGCTAATgttttgccatatattattggaatagctgt > 1:543983‑M1/1‑221 (MQ=255) caacaaAGTATTATTTTCTGCATCCTCAATACCGTTAAATGCAACCCGAACCCCCGTTGTCCCTTTGCTGCATTCACTTAACGTAATCTGAAAAGGGACGGCTGGACTTGTGCTACCGGTCGTTGGAAATTGTCTGGCACTGTTTTTTTGGAGATCTACGGTAAAATTAAGCGAATCCGATGAGACTGTGCAGCCATAATCGAGGACGCGCCCGCTAATgttttgccatatattattggaatagctgtaat < 1:299721‑M1/251‑33 (MQ=255) caacaaAGTATTATTTTCTGCATCCTCAATACCGTTAAATGCAACCCGAACCCCCGTTGTCCCTTTGCTGCATTCACTTAACGTAATCTGAAAAGGGACGGCTGGACTTGTGCTACCGGTCGTTGGAAATTGTCTGGCACTGTTTTTTTGGAGATCTACGGTAAAATTAAGCGAATCCGATGAGACTGTGCAGCCATAATCGAGGACGCGCCCGCTAATgttttgccatatattattggaatagctgtaat < 1:457712‑M1/251‑33 (MQ=255) acaaAGTATTATTTTCTGCATCCTCAATACCGTTAAATGCAACCCGAACCCCCGTGGTCCCTTTTCTGCATTCACTTAACGTAATCTGAAAAGGGACGGCTGGACTTGTGCTACCGGTCGTTGGAAATTGTCTGGCACTGTTTTTTTGGAGATCTACGGTAAAATTAAGCGAATCCGATGAGACTGTGCAGCCATAATCGAGGACGCGCCCGCTAATgttttgccatatattattggaatagctgtaattc < 2:316162‑M1/251‑35 (MQ=255) tattatTTTCTGCATCCTCAATACCGTTAAATGCAACCCGAACCCCCGTTGTCCCTTTGCTGCATTCACTTAACGTAATCTGAAAAGGGACGGCTGGACTTGTGCTACCGGTCGTTGGAAATTGTCTGGCACTGTTTTTTTGGAGATCTACGGTAAAATTAAGCGAATCCGATGAGACTGTGCAGCCATAATCGAGGACGCGCCCGCTAATgttttgccatatcttattggaatagctgtaattcagcga > 2:400353‑M1/1‑211 (MQ=255) attTTCTGCATCCTCAATACCGTTAAATGCAACCCGAACACCCGTTGTCCCTTTGATGCATTCACTTAACGTAATCTGAAAAGGGACGGCTGGACTTGTGCTACCGGTCGTTGGAAATTGTCTGGCACTGTTTTTTTGGAGATCTACGGTAAAATTAAGCGAATCCGATGAGACTGTGCAGCCATAATCGAGGACGCGCCCGCTAATggtttgccatatattattggaatagctgtaattcagcgaagtcg > 1:206408‑M1/1‑207 (MQ=255) cATCCTCAATACCGTTAAATGCAACCCGAACCCCCGTTGTCCCGTTGCTGCATTCACTTAACGTAATCTGAAAAGGGACGGCTGGACTTGTGCTACCGGTCGTTGGAAATTGTCTGGCACTGTTTTTTTGGAGATCTACGGTAAAATTAAGCGAATCCGATGAGACTGTGCAGCCATAATCGAGGACGCGCCCGCTAATgttttgccatatattattggaatagctgtaattcagcgaagtcgtaatatca < 1:579575‑M1/251‑53 (MQ=255) cTCAATACCGTTAAATGCAACCCGAACCCCCGTTGTCCCTTTGCTGCATTCACTTAACGTAATCTGAAAAGGGACGGCTGGACTTGTGCTACCGGTCGTTGGAAATTGTCTGGCACTGTTTTTTTGGAGATCTACGGTAAAATTAAGCGAATCCGATGAGACTGTGCAGCCATAATCGAGGACGCGCCCGCTAATgttttgccatatattattggaatagctgtaattcagcgaagtcgtaatatcacca > 2:262788‑M1/1‑195 (MQ=255) cAATACCGTTAAATGCAACCCGAACCCCCGTTGTCCCTTTGCTGCATTCACTTAACGTAATCTGAAAAGGGACGGCTGGACTTGTGCTACCGGTCGTTGGAAATTGTCTGGCACTGTTTTTTTGGAGATCTACGGTAAAATTAAGCGAATCCGATGAGACTGTGCAGCCATAATCGAGGACGCGCCCGCTAATgttttgccatatattattggaatagctgtaattcagcgaagtcgtaatatcaccaa < 2:191875‑M1/249‑57 (MQ=255) cAATACCGTTAAATGCAACCCGAACCCCCGTTGTCCCTTTGCTGCATTCACTTAACGTAATCTGAAAAGGGACGGCTGGACTTGTGCTACCGGTCGTTGGAAATTGTCTGGCACTGTTTTTTTGGAGATCTACGGTAAAATTAAGCGAATCCGATGAGACTGTGCAGCCATAATCGAGGACGCGCCCGCTAATgttttgccatatattattggaatagctgtaattcagcgaagtcgtaatatcacca < 1:262788‑M1/248‑56 (MQ=255) cGTTAAATGCAACCCGAACCCCCGTTGTCCATTTGCTGCATTCACTTAACGAAAGCTGAAAAGGGACGGCTGGACTTGTGCTACCGGTCGTTGGAAATTGTCTGGCACTGTTTTTTTGGAGATCTACGGTAAAATTAAGCGAATCCGATGAGACTGTGCAGCCATAATAGGGGACGCGCCCGATAATgttttgccatatattattggaatagctgtaattcagcgaagtcgaaatatcaccaaccggaac > 1:21438‑M1/1‑187 (MQ=255) aaaTGCAACCCGAACCCCCGTTGTCCCTTTGCTGCATTCACTTAACGTAATCTGAAAAGGGACGGCTGGACTTGTGCTACCGGTCGTTGGAAATTGTCTGGCACTGTTTTTTTGGAGCTCTACGGTAAAATTAAGCGAATCCGATGAGACTGTGCAGCCATAATCGAGGACGCGCCCGCTAATgttttgccatatattattggaatagttgtaattcagcgaagtcgtaatatcaccaaacggcacattt > 2:370537‑M1/1‑183 (MQ=255) aaaTGCAACCCGAACCCCCGTTGTCCCTTTGCTGCATTCACTTAACGTAATCTGAAAAGGGACGGCTGGACTTGTGCTACCGGTCGTTGGAAATTGTCTGGCACTGTTTTTTTGGAGATCTACGGTAAAATTAAGCGAATCCGATGAGACTGTGCAGCCATAATCGAGGACGCGCCCGCTAATgttttgccatatattattggaatagctgtaattcagcgaagtcgtaatatcaccaaacggcacattt < 1:400353‑M1/250‑68 (MQ=255) cccccGTTGTCCCTTTGCTGCATTCACTTAACGTAATCTGAAAAGGGACGGCTGGACTTGTGCTACCGGTCGTTGGAAATTGTCTGGCACTGTTTTTTTGGAGATCTACGGTAAAATTAAGCGAATCCGATGAGACTGTGCAGCCATAATCGAGGACGCGCCCGCTAATgttttgccatatattattggaatagctgtaattcagcgaagtcgtaatatcaccaaacggcacatttaatccaaatgatatt > 2:407610‑M1/1‑169 (MQ=255) ccTTTGCTGCATTCACTTAACGTAATCTGAAAAGGGACGGCTGGACTTGTGCTACCGGTCGTTGGAAATTGTCTGGCACTGTTTTTTTGGAGATCTACGGTAAAATTAAGCGAATCCGATGAGACTGTGCAGCCATAATCGAGGACGCGCCCGCTAATgttttgccatatattattggaatagctgtaattcagcgaagtcgtaatatcaccaaacggcacatttaatccaaatgatatttgctggtcgct < 1:532087‑M1/251‑94 (MQ=255) tCACTTAACGTAATCTGAAAAGGGACGGCTGGACTTGTGCTACCGGTCGTTGGAAATTGTCTGGCACTGTTTTTTTGGAGATCTACGGTAAAATTAAGCGAATCCGATGAGACTGTGCAGCCATAATCGAGGACGCGCCCGCTAATgttttgccatatattattggaatagctgtaattcagcgaagtcgtaatatcaccaaacggcacatttaatccaaatgatatttgctggtcgctgcgtgacgtgt < 1:507400‑M1/250‑105 (MQ=255) taaagtaatCTGAAAAGGGACGGCTGGACTTGTGCTACCGGTCGTTGGAAATTGTCTGGCAATGTTTTTTTGGAGATCTACGGAAAAATTAAGCGAATCCGATGAGACTGTGCAGCCATAATCGAGGACGCGCCCGCTAATgttttgccatatattattggaatagctgtaattcagcgaagtcgtaatatcaccaaacggcacatttaatccaaatgatatttgctggtcgctgcgtgacgtgttcca < 2:281630‑M1/245‑109 (MQ=255) gTAATCTGAAAAGGGACGGCTGGACTTGTGCTACCGGTCGTTGGAAATTGTCTGGCACTGTTTTTTTGGAGATCTACGGTAAAATTAAGCGAATCCGATGAGACTGTGCAGCCATAATCGAGGACGCGCCCGCTAATgttttgccatatattattggaatagctgtaattcagcgaagtcgtaatatcaccaaacggcacatttaatccaaatgatatttgctggtcgctgcgtgacgtgttccagtaact < 1:250643‑M1/251‑115 (MQ=255) gAAAAGGGACGGCTGGACTTGTGCTACCGGTCGTTGGAAATTGTCTGGCACTGTTTTTTTGGAGATCTACGGTAAAATTAAGCGAATCCGATGAGACTGTGCAGCCATAATCGAGGACGCGCCCGCTAATgttttgccatatattattggaatagctgtaattcagcgaagtcgtaatatcaccaaacggcacatttaatccaaatgatatttgctggtcgctgcgtgacgtgttccagtaactttggc < 1:190620‑M1/249‑120 (MQ=255) aaGGGACGGCTGGACTTGTGCTACCGGTCGTTGGAAATTGTCTGGCACTGTTTTTTTGGAGATCTACGGTAAAATTAAGCGAATCCGATGAGACTGTGCAGCCATAATCGAGGACGCGCCCGCTAATgttttgccatatattattggaatagctgtaattcagcgaagtcgtaatatcaccaaacggcacatttaatccaaatgatatttgctggtcgctgcgtgacgtgttccagtaactttggcgactg < 1:82381‑M1/251‑125 (MQ=255) tttGGAGATCTACGGTAAAATTAAGCGAATCCGATGAGACTGTGCAGCCATAATCGAGGACGCGCCCGCTAATgttttgccatatattattggaatagctgtaattcagcgaagtcgtaatatcaccaaacggcacatttaatccaaatgatatttgctggtcgctgcgtgacgtgttccagtaactttggcgactggcactgaaaaatgtcgtaccgtaatttccaagctgctgagagatgcttatttgt > 1:326151‑M1/1‑73 (MQ=255) aaaTTAAGCGAATCCGATGAGACTGGGCAGCCATAATCGAGGACGCGCCCGCTAATgttttgccatatattattggaatagctgtaattcagcgaagtcgtaatatcaccaaacggcacatttaatccaaatgatatttgctggtcgctgcgtgacgtgttccagtaactttggcgactggcactgaaaaatgtcgtaccgtaatttccaagctgctgagagatgcttatttgttcctgaccacgcttact < 2:191797‑M1/251‑196 (MQ=255) aaTTAAGCGAATCCGATGAGACTGTGCAGCCATAATCGAGGACGCGCCCGCTAATgttttgccatatattattggaatagctgtaattcagcgaagtcgtaatatcaccaaacggcacatttaatccaaatgatatttgctggtcgctgcgtgacgtgttccagtaactttggcgactggcactgaaaaatgtcgtaccgtaatttccaagctgctgagagatgcttatttgttcctgaccacgcttactg > 1:118306‑M1/1‑55 (MQ=255) gCGAATCCGATGAGACTGTGCAGCCATAATCGAGGACGCGCCCGCTAATgttttgccatatattattggaatagctgtaattcagcgaagtcgtaatatcaccaaacggcacatttaatccaaatgatatttgctggtcgctgcgtgacgtgttccagtaactttggcgactggcactgaaaaatgtcgtaccgtaatttccaagctgctgagagatgcttctttgttcctgaccacgcttactgtagaa > 2:313785‑M1/1‑49 (MQ=255) gAGGACGCGCCCGCTAATgttttgccatatattattggaatagctgtaattcagcgaagtcgtaatatcaccaaacggcacatttaatccaaatgatatttgctggtcgctgcgtgacgtgttccagtaactttggcgactggcactgaaaaatgtcgtaccgtaatttccaagctgctgagagatgcttatttgttcctgaccacgcttactgtagaacagattaaaataatcaataaattgtgtctgct > 1:510023‑M1/1‑18 (MQ=255) cgcCCGCTAATgttttgccatatattattggaatagctgtaattcagcgaagtcgtaatatcaccaaacggcacatttaatccaaatgatatttgctggtcgctgcgtgacgtgttccagtaactttggcgactggcactgaaaaatgtcgtaccgtaatttccaagctgctgagagatgcttatttgttcctgaccacgcttactgtagaacagattaaaataatcaataaattgtgtctgctcattggt < 2:198878‑M1/251‑241 (MQ=255) cgcCCGCTAATgttttgccatatattattggaatagctgtaattcagcgaagtcgtaatatcaccaaacggcacatttaatccaaatgatatttgctggtcgctgcgtgacgtgttccagtaactttggcgactggcactgaaaaatgtcgtaccgtaatttccaagctgctgagagatgcttatttgttcctgaccacgcttactgtagaacagattaaaataatcaataaattgtgtctgctcattggt < 2:93708‑M1/251‑241 (MQ=255) | TCCTTCATCCAGTTTCAACAAAGTATTATTTTCTGCATCCTCAATACCGTTAAATGCAACCCGAACCCCCGTTGTCCCTTTGCTGCATTCACTTAACGTAATCTGAAAAGGGACGGCTGGACTTGTGCTACCGGTCGTTGGAAATTGTCTGGCACTGTTTTTTTGGAGATCTACGGTAAAATTAAGCGAATCCGATGAGACTGTGCAGCCATAATCGAGGACGCGCCCGCTAATTTTAATAACGCTATCTGCGGATAAAGCAGAATAGGTGGTTAACCCCAGACATAAACCGAGGAAAATAATGTTATTGTATTTCATAATCTATTGTTCCTTAGCGACAGATTGCTGTCTGCTGGTTCAGTAAGGTACCAGGAGAAACTTCAGGAAGCTTGTACTCGACAATACAGTTTGAGTTTTTATCTTTGCCCCATGAAACCTGTAATTGCCCTGACTGTGGAAGTCCAGTCAGATAAA > NC_000913/1588522‑1588995 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |