| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 2,187,650 | IS1 (–) +9 bp | coding (757‑765/1035 nt) | yehA ← | putative fimbrial adhesin YehA |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 1978503 = | NA (NA) | 22 (0.770) | 21/484 | 0.4 | 100% | noncoding (768/768 nt) | IS1 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 2187658 | 0 (0.000) | coding (757/1035 nt) | yehA | putative fimbrial adhesin YehA | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 1979270 | NA (NA) | 20 (0.700) | 20/484 | 0.4 | 100% | noncoding (1/768 nt) | IS1 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 2187650 = | 0 (0.000) | coding (765/1035 nt) | yehA | putative fimbrial adhesin YehA | |||||
CGGTTGCCTCCAGTGCGCCAGATTTAACTTTGTTTGTATCGTAGACGTAGTAACTGGCTGTTATCGGAATTGAAACCGTTGTATCTGTAAGTTTTGACTTCGCCGCAACTTCCTTTAAATTTGTATATCCTTTACTGCTGTTAGTGATATTTAAAAGTGTGACTGGCGAACCATTACTTTCAAGAATAAATCCTACGCCATTATCTTCCGCACCTTTCAGTATTGTGTTGCTGTTGGTTAACAAGTCAGAACTTGATAAATACACCTGCATTTTCCGTGA‑TGTTTGATTTTGTTGACCTAATAAATTTTTACAACGCAGAATAATATCCCCTTGTTTACTATTTATTGTTGCTTTGTTACCTGTGGCTGGTAATTGTGAAACGGGAATACTGTCTAAAGTAATTAATAAATCGTCCGGTTTGCAGGTTGTGGTTATCGGGTTGTATGACAATGTCAGATTAAAGGAATAGACACCTGCATTTTGTGCC > NC_000913/2187406‑2187893 | cGGTTGCCTCCAGTGCGCCAGATTTAACTTTGTTTGTATCGTAGACGTATTAACTGGCTGTTATCGGAATTGAATCCGTTGTATCTGTAAGTTTTGACTTCGCCGCAACTTCCTTTAAATTTGTATATCCTTTACTGCTGTTATTGATATTTAAAAGGGTGACTGGCGAACCATTACGTTCAAGAATAAAGTCTTCGCCATTAGCTGCCGCACTGTTCATTATTGTGTTGCTGGTTGTTAACAAGGCAGaa < 2:19160/251‑1 (MQ=255) tcatggccatatcaatgattttctggtgcgtaccgggttgagaagcggtgtaagtgaactgcagttgccatgttttacggcagtgagagcagagatagcgctgatgtccggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccGTCAGAACTTg < 1:221159‑M2/11‑1 (MQ=255) catggccatatcaatgattttctggtgcgtaccgggttgagaagcggtgtaagtgaactgcagttgccatgttttacggcagtgagagcagagatagcgctgatgtccggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacacgaaatcagtaagttggcagcatcaccGTCAGAACTTGa < 2:17399‑M2/12‑1 (MQ=255) tggccatatcaatgattttctggtgcgttccgggttgagaagcggtgtaagtgaactgcagttgccatgttttacggcagtgagagccgagatagcgctgatgtccggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccGTCAGAACtt < 1:104133‑M2/10‑1 (MQ=255) tggccatatcaatgattttctggagcgtaccgggttgagaagcggtgtaagtgacctgcagttgccatgttttacggcagtgagagcagagatagcgctgatgtccggcggtgcttttgccgttacgcaccaacccgtcagacgcggaaaagaagggacaggtgataaaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacaataaatcagaaagttggcagcatccccGGCAGAACtt > 2:104133‑M2/237‑246 (MQ=255) gTGCGCCAGATTTAACTTTGTTTGGATCGTAGACGTAGTAACCGGCTGTTATCGGAATTGAAACCGTTGTATCTGTAAGTTTTGACTTCGCAGCAGCTTCCTTTAAATTTGTATATCCTTTAATGCTGTTAGTGATATTTAAAAGTGTGACTGGCGAACCATTACTTTCAAGAATAAATCCTACGCCATTATCTTCCGCACCTTTCAGTATTGTGTTGCTGTTGGTTAACAAGTCAGAACTggtaatgact < 1:38220‑M2/251‑11 (MQ=255) ccAGATTTAACTTTGTTTGTATCGTAGACGTATTAACTGGCTGTTATCGGAATTGAATCCGTTTTATCTGTAAGTTTTGACTTCGCCGCAACTTCCTTTAAATGTGTATATCCTTTACTTCTGTTAGTGATAATTAAAAGTGTGACTGGCGAACCATTACTTTCAAGAATAAATCCTACGCCATTATCTTCCGCACCTTTCAGTATTGTGTTGCTGTTGGTTAACAAGTCAGAACTggtaatgactcca > 2:168861‑M2/1‑236 (MQ=255) cAGATTTAACGTTGTTTGTATCGTAGACGTAGTAACTGGCTGTTATCGGAATTGAAACCGTTGTATCTGTAAGTTTTGACTTCGCCGCAACTTCCTTTAAATTTGTATATCCTTTACTGCTGTTAGTGATATTTAAAAGTGTGACTGGCGAACCATTTCTTTCAAGAATAAATCCTACGCCATTATCTCCCGCACCTTTCAGTATTGTGTTGCTGTTGTTTAACAAGTCAGAACTggtaatgactccaact > 2:82676‑M2/1‑235 (MQ=255) tAACTTTGTTTTTTTCGTAGACGTAGTAACTGGCTGTTATCGGAATTGAATCCGTTGTATCTGTAAGTTTTGACTTCGCCGCAACTTCCTTTAAATTTGTATATCCTTTACTGCTGTTAGGGATATTTAAAAGTGTGACTGGCGAACCATTACTTTCAAGAATAAATCCTACGCCATTATCTTCCGCACCTTTCAGTATTGTGTTTCTGTTGGTTAACAAGTCAGAGCGggtaatgactccagcttattg > 2:181624‑M2/1‑229 (MQ=255) cgtaccgggttgagaagcggtgtaagtgaactgcagttgccatgttttacggcagtgagagcagagatagcgctgatgtccggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagcttatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccGTCAGAACTTGATAAATACACCTGCATTTTCCGTGA‑TGtt < 1:104030‑M2/40‑1 (MQ=255) cgggttgagaagaggggtaagtgaacagcagttgccatgttttacggcagtgagagcagagatagcgctgatgtcaggcggtgcttttgccgtgacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcaccgcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaaggtggcagcatcgccGTCAGAACTTGATAAATACACCGGCATTTTCCGTGA‑TGTTTGAtt < 2:83455‑M2/45‑1 (MQ=255) ggttgagaagcggtgtaagtgaactgcagttgccatgttttacggcagagagagcagagatagcgctgatgtccggcggtgcttttgccgttacgcaccaccacgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagcccctggagcacctcaaaaacaccatcatacaccaaatcagtaagttggcagcaccaccGTCAGAACTTGATAAATACACCTGCATTTTCCG‑GACTGTTTGAtttt > 2:200417‑M2/205‑251 (MQ=255) cGGAATTGAAACCGTTGTATCTGTAAGTTTTGACTTCGCCGCAACTTCCTTTAAATTTGTATATCCTTTACTGCTGTTAGTGATATTTAAAAGTGTGACTGGCGAACCATTACTTTCAAGAATAAATCCTACGCCATTATCTTCCGCACCTTTCAGTATTGTGTTGCTGTTGGTTAACAAGTCAGAACTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcat < 1:59342‑M2/251‑63 (MQ=255) gttttacggcagtgagagcagagatagcgctgctgtccggcggtgcttttgccattacgcaccacaccgtcagtagctgaaccggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccGTCAGAACTTGATAAATACACCTGCATTTTCCGTGA‑TGTTTGATTTTGTTGACCTAATAAATTTTTACAACGCAGAATAatat > 1:127879‑M2/169‑251 (MQ=255) ttacggcagtgagagcagagatagcgctgatgtccggcggtgctgttgccggtacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagctcctcaaaaacaccatcagacactaaatcagtaagttggcagcatcaccGTCAGAACTGGATAAATACACCTGCAGTTTCCGTGA‑TGTTTGATTGTGTTTGCCGAATAAATTTTTACAACGCAGAATAATATcc < 2:133473‑M2/85‑1 (MQ=255) gTAAGTTTTGACTTCGCCGCAACTTCCTTTAAATTTGTATATCCTTTACTGCTGTTAGTGATATTTAAAAGTGTGACTGGCGAACCATTACTTTCAAGAATAAATCATACGCCATTATCTTCCGCACCTTTCAGTATTGTGTTGCTGTTGGTTAACAAGTCAGAACTggtaatgactccaacttattgatagtgatttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgaga < 1:145848‑M2/250‑84 (MQ=255) agagcagagatagcgctgatgtccggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccGTCAGAACTTGATAAATACACCTGCATTTTCCGTGA‑TGTTTGATTTTGTTGACCTAATAAATTTTTACAACGCAGAATAATATCCCCTTGTTTACt > 1:116481‑M2/155‑250 (MQ=255) tccggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccGTCAGAACTTGATAAATACACCTGCATTTTCCGTGA‑TGTTTGATTTTGTTGACCTAATAAATTTTTACAACGCAGAATAATATCCCCTTGTTTACTATTTATTGTTGCTTTGTTACCt > 2:30471‑M2/134‑251 (MQ=255) ttAAATTTGTATATCCTTTACTGCTGTTAGTGATATTTAAAAGAGTGACTGGCGAACCATTACTTTCAAGAATAAATCCTACGCCATTCTCTTCCGCACCTTTCAGTATTGTGTTGCTGTTGGTTAACAAGTCAGAACTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgcc < 1:30515‑M2/251‑113 (MQ=255) gtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggtgggacagctgatagaaacagaagcaactggaacacctcaaaaacaccatcatacactagatcagcaagttggcagcatcaccGTCAGAACTTGATAACTACACCTGCATTTTCCGTGA‑TGTTTGCTTTTGTTGACCTAATAAATTTTTACACCTCAGAATATTTTCCTCTTGTTTACTTTTTTTTGTTGCTTTGTTACCTGTGGCTg > 2:221151‑M2/127‑251 (MQ=255) gTATATCCTTTACTGCTGTTAGTGATATTTAAAAGTGTGACTGGCGAACCATTACTTTCAAGAATAAATCCTACGCCATTATCTTCCGCACCTTTCAGTATTGTGTTGCTGTTGGTTAACAAGTCAGAACTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctg > 2:69211‑M2/1‑131 (MQ=255) gaacctttACTGCTGTTAGTGATATTTACAAGTGTGACAGGCGAACCATTACTTTCAAGAATAAATCCTACGCCATTATCTTCCGCACCTTTCAGTATTGAGTTGCTGTTGGTTAACAAGTAAGAACTggtaatgactccaacttattgatagcgttttatgttaagataatgcccgatgactttgtcatacagctccactgattttgagaacgaaagcgaattccgtcccagccgtgccagcggatgcgt < 2:7664‑M2/248‑124 (MQ=255) atCCTTTACTGCTGTTAGTGATATTTAAAAGTGTGACTGGCGAACCATTACTTTCAAGAATAAATCCTACGCCATTATCTTCCGCACCTTTCAGTATTGTGTTGCTGTTGGTTAACAAGTCAGAACTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcct > 1:213732‑M2/1‑127 (MQ=255) aCTGCTGTTAGTGATATTTAAAAGTGTGACTGGCGAACCATTACTTTCAAGAATAAATCCTACGCCATTATCTTCCGCACCTTTCAGTATTGTGTTGCTGTTGGTTAACAAGTCAGAACTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattca > 2:59342‑M2/1‑120 (MQ=255) gcaccaccccgtcagtagctgaacaggagtgacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccGTCAGAACTTGATAAATACACCTGCATTTTCCGTGA‑TGTTTGATTTTGTTGACCTAATAAATTTTTACAACGCAGAATAATATCCCCTTGTTTACTATTTATTGTTGCTTTGTTACCTGTGGCTGGTAATTGTGAAACggg < 1:102715‑M2/141‑1 (MQ=255) gATATTTAAAAGTGTGACTGGCGAACCATTACTTTCAAGAATAAATCCTACGCCATTATCTTCCGCACCTTTCAGTATTGTGTTGCTGTTGGTTAACAAGTCAGAACTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccgct < 2:183581‑M2/251‑144 (MQ=255) atatTTAAAAGTGTGACTGGCGAACCATTACTTTCAAGAATAAATCCTACGCCATTATCTTCCGCACCTTTCAGTATTGTGTTGCTGTTGGTTAACAAGTCAGAACTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccgctc > 1:195367‑M2/1‑107 (MQ=255) gtagctgaacatgagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatctccGTCAGAACTTGATAAATTCACCTGCATTTTCCGTGA‑TGTTTGATTTTGTTTACCTTATAAATTTTTACAGCGCATAATAATATCCCCTTGTTTACTATTTATTGTTGCTTTGTTTCCTGTGGCTGGTAAGTGTGAAACGGGAATACTGTCTAAAg < 1:265400‑M2/155‑1 (MQ=255) gctgaacaggcgggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccGTCAGAACTTGATAAATACACCTGCATTTTCCGTGA‑TGTTTGATTTTGTTGACCTAATAAATTTTTACAACGCAGAATAATATCCCCTTGTTTACTATTTATTGTTGCTTTGTTACCTGTGGCTGGTAATTGTGAAACGGGAATACTGTCTAAAGta > 2:39493‑M2/94‑250 (MQ=255) aacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccGTCAGAACTTGATAAATACACCTGCATTTTCCGTGA‑TGTTTGATTTTGTTGACCTAATAAATTTTTACAACGCAGAATAATATCCCCTTGTTTACTATTTATTGTTGCTTTGTTACCTGTGGCTGGTAATTGTGAAACGGGAATACTGTCTAAAGtaattaa < 1:307160‑M2/162‑1 (MQ=255) ggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccGTCAGAACTTGATAAATACACCTGCATTTTCCGTGA‑TGTTTGATTTTGTTGACCTAATAAATTTTTACAACGCAGAATAATATCCCCTTGTTTACTATTTATTGTTGCTTTGTTACCTGTGGCTGGTAATTGTGAAACGGGAATACTGTCTAAAGTAATTAATaaa < 1:30471‑M2/166‑1 (MQ=255) cATTACTTTCAAGAATAAATCCTACGCCATTATCTTCCGCACCTTTCAGTATTGTGTTGCTGTTGGTTAACAAGTCAGAACTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccgctcaattcgctgcgtatatcgcttgctg > 1:134533‑M2/1‑82 (MQ=255) aTTACTTTCAAGAATAAATCCTACGCCATTATCTTCCGCACCTTTCAGTATTGTGTTGCTGTTGGTTAACAAGTCAGAACTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccgctcaattcgctgcgtatatcgcttgctga > 1:183581‑M2/1‑81 (MQ=255) aGAATAAATCCTACGCCATTATCTTCCGCACATTTCAGACTTGCGTTGCTGATAGTTAACAAGTCAGAACTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctacaccgattttgcgaacgacagcgccttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctccgattcaggttatgccgctcaattcgctgcgtatatcgcttgctgattacgtgc < 1:39871‑M2/249‑179 (MQ=255) gagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccGTCAGAACTTGATAAATACACCTGCATTTTCCGTGA‑TGTTTGATTTTGTTGACCTAATAAATTTTTACAACGCAGAATAATATCCCCTTGTTTACTATTTATTGTTGCTTTGTTACCTGTGGCTGGTAATTGTGAAACGGGAATACTGTCTAAAGTAAGTAATAAATCGTCCGGTTTGCAGGTTGTGGTTATCGGGtt < 2:154265‑M2/198‑1 (MQ=255) cGCCATTATCTTCCGCACCTTTCAGTATTGTGTTGCTGTTGGTTAACAAGTCAGAACTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccgctcaattcgctgcgtatatcgcttgctgattacgtgcagctttcccttcagg < 1:136942‑M2/251‑194 (MQ=255) gCCATTATCTTCCGCACCTTTCAGTATTGTGTTGCTGTTGGTTAACAAGTCAGAACTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccgctcaattcgctgcgtatatcgcttgctgattacgtgcagctttcccttcaggc < 1:288411‑M2/251‑195 (MQ=255) aTCTGCCGCACCTTTCAGTATTGTGTTGCTGTTGGTTAACAAGTCAGAACTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccgctcaattcgctgcgtatatcgcttgctgattacgtgcagctttcccttcaggcgggat > 2:263366‑M2/1‑51 (MQ=255) cAGTATTGTGTTGCTGTTGGTTAAAAAGTCAGAACTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccacagattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccgctcaattcgctgcgtatatcgcttgctgattacgtgcagctttcccttcaggcgggattcatacagccgccagc < 1:272222‑M2/251‑216 (MQ=255) cAGTATTGTGTTGCTGGTGGTTAACAAGTCAGAACTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccgctcaattcgctgcgtatatcgcttgctgattacgtgcagctttcccttcaggcgggattcatacagcggccag > 1:155654‑M2/1‑36 (MQ=255) ccattaagttggcagcatcaccGTCAGAACTTGATAAATACACCTGCATTTTCCGTGA‑TGTTTGAGTTGGTTGACCTAATAAATTTTTACAACGCAGAATAATATCCCCTTGTTTACTATTGATTGTTGCTTTGTTACCTGTGGCTGGTAATTGTGAAACGGGAATACTGTCTAAAGGAATTAGTAAATCGTCGGGGTTGAAGGGTGGGGTTATCGGGTTGGACGACTACGTCTGATTAAAGGAGTAGaca < 2:127879‑M2/229‑1 (MQ=255) agcatcacaGTCAGAACTTGATAAATACACCTGCCTTTTCCGAGA‑TATTTGATTTTATTGACCTAATAAACTTTTACACCGCCGAATAATATACCCTTGTTTACTCTTTATTGTTGCTTTGTTACCTGTGGATTATAATTGTGAAACGGGAATACTGTCTAAAGCAATTAATAAATCGTCCGGTTTGCAGGTTGTGGTTATCGGGTTGTATGACAATGTCAGATTAAAGGCATAGAAACCTGCATTTtgtg > 2:255583‑M2/10‑251 (MQ=255) agtcaccgTCAGAACTTTATAAATACACCTGCATTTTCCGTGA‑TGTGTGATCTTGTTGACCTTATAAATTTTTACAACGCAGAATAATATCCCATTGTTTACTATTTAGTGTTGCTTTGTTACCTGTGGCTGGTAATTGTGAAACGGGATGACTGGCTAAAGTAATTATGAAATCATTCGGTTTGCAGGTTGTGGTTATCAGTTTGTATGGCATTGTTAGATTATAGGAATAGACACCTGCGTTTTTTGcc < 2:255973/244‑1 (MQ=255) | CGGTTGCCTCCAGTGCGCCAGATTTAACTTTGTTTGTATCGTAGACGTAGTAACTGGCTGTTATCGGAATTGAAACCGTTGTATCTGTAAGTTTTGACTTCGCCGCAACTTCCTTTAAATTTGTATATCCTTTACTGCTGTTAGTGATATTTAAAAGTGTGACTGGCGAACCATTACTTTCAAGAATAAATCCTACGCCATTATCTTCCGCACCTTTCAGTATTGTGTTGCTGTTGGTTAACAAGTCAGAACTTGATAAATACACCTGCATTTTCCGTGA‑TGTTTGATTTTGTTGACCTAATAAATTTTTACAACGCAGAATAATATCCCCTTGTTTACTATTTATTGTTGCTTTGTTACCTGTGGCTGGTAATTGTGAAACGGGAATACTGTCTAAAGTAATTAATAAATCGTCCGGTTTGCAGGTTGTGGTTATCGGGTTGTATGACAATGTCAGATTAAAGGAATAGACACCTGCATTTTGTGCC > NC_000913/2187406‑2187893 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |