| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | NC_000913 | 59,092 | (15-bp)2→1 | coding (619‑633/651 nt) | yabP → | putative uncharacterized protein YabP |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 59090 = | 1 (0.030) | 13 (0.490) | 13/450 | 0.7 | 93.1% | coding (617/651 nt) | yabP | putative uncharacterized protein YabP |
| ? | NC_000913 | = 59074 | 1 (0.040) | coding (601/651 nt) | yabP | putative uncharacterized protein YabP | |||||
CTGCATAAGGGCCAAGGTAACTTGGGCGTTGATCTTAGAAAGGCTTACCTTCCCGGCGTTGACATGAGGGATTGTTACCTTGGTAAAAAAACAATGAAAGGTAGCAATGATATCCTTTATGAGAGACCTGGGTGGAATGCTAACCTGGGCGTGCTACCCCGGACGGTGCTACCCCGGACGGTGCTAACCCGGACGGTGCTAACCTGGACGGTGCTACCGTGAACGGTGCTACCTCCTTATATGATGAGGTAATTATTATTAATAAAATCCCCCCCAAAAAAATTGATACTAAAGGAGTTGCTACTGAAGAAGTTGCTACTAAAAAAGTACTGCTGAACAAATTACTGACAACGCAATTATTGAATGAGCCAGAATAAGCTAAGGTTGAAGGGGCTGGAACGCCCCTTCAACCTTAGCAGTAGCGTGGGAT > NC_000913/58903‑59332 | actcagacgttgcagctgcataagggccaaggtaacttgggcgttgatcttagaaaggcttaccttcccggcgttgacatgagggattgttaccttggtaaaaaaacaatgaaaggtagcaatgatatcctttatgagagacctgggtggaatgctaacctgggcgtgctaccccggacggtgctacCCCGGACGGTGCTAACCTGGACGGTGCTACCGTGAACGGTGCTACCTCCTTATATGATGAGGt < 1:167499‑M1/63‑1 (MQ=255) gggccaaggtaacttgggcgttgatcttagaaaggcttaccttcccggcgttgacatgagggattgttaccttggtaaaaaaacaatgaaaggtagcaatgatatcctttatgagagacctgggtggaatgctaacctgggcgtgctaccccggacggtgctacCCCGGACGGTGCTAACCTGGACGGTGCTACCGTGAACGGTGCTACCTCCTta < 1:69433‑M1/52‑1 (MQ=255) gggccaaggtaacttgggcgttgatcttagaaaggcttaccttcccggcgttgacatgagggattgttaccttggtaaaaaaacaatgaaaggtagcaatgatatcctttatgagagacctgggtggaatgctaacctgggcgtgctaccccggacggtgctacCCCGGACGGTGCTAACCTGGACGGTGCTACCGTGAACGGTGATACCTCCTta > 2:69433‑M1/165‑216 (MQ=255) tgatcttagaaaggcttaccttcccggcgttgacatgagggattgttaccttggtaaaaaaacaatgaaaggtagcaatgatatcctttatgagagacctgggtggaatgctaacctgggcgtgctaccccggacggtgctacCCCGGACGGTGCTAACCTGGACGGTGCTACCGTGAACGGTGCTACCTCCTTATATGATGAGGTAATTATTATTAATAAAATCCCCCCCAAAAAAATTGATACTAAAgg < 1:147201‑M1/108‑1 (MQ=255) tagaaaggcttaccttcccggcgttgacatgagggattgttaccttggtaaaaaaacaatgaaaggtagcaatgatatcctttatgagagacctgggtggaatgctaacctgggcgtgctaccccggacggtgctacCCCGGACGGTGCTAACCTGGACGGTGCTACCGTGAACGGTGCTACCTCCTTATATGATGAGGTAATTATTATTAATAAAATCCCCCCCAAAAAAATTGATACTAAAGGAGTTg > 2:167499‑M1/138‑250 (MQ=255) gcgttgacatgagggattgttaccttggtaaaaaaacaatgaaaggtagcaatgatatcctttatgagagacctgggtggaatgctaacctgggcgtgctaccccggacggtgctacCCCGGACGGTGCTAACCTGGACGGTGCTACCGTGAACGGTGCTACCTCCTTATATGATGAGGTAATTATTATTAATAAAAGCCCCCCCAAAAAAATTGATACTAAAGGAGTTGCTACTGAAGAAGTTGctacta > 1:148266‑M1/118‑251 (MQ=255) ggTAAAATAACAATGAAAGGTAGAAATGATATCCTTTATGAGAGACCTGGAGGGAATGCTAACCTGGGAGTGATACC‑‑‑‑A‑‑‑‑‑‑‑AC‑‑‑GG‑CGGTGCTACCCCGGGCGGTTCTCACCTGGACGGTGCTACCGTGAACGGTGCTACCACCTTATATGATTGGGCAATTATTGTTAATAACATCCACCCAAAAAAAATTGATACTAAAGGAGTTGCTAATGAAAAAGTTGCTACTCAAAACGTACAGCTGAACACATTACTg > 2:315820/1‑251 (MQ=255) aatgaaaggtagcaatgatatcctttatgagagacctgggtggaattctaacctgggcgtgctaccccggacggtgctacCCCGGACGGTGCTAACCTGGACGGTGCTACCGTGAACTGTGCTACCTCCTTATATGATGAGGTAATTATTATTAATAAAATCCCCCCCAAAAAAATTGATACTAAAGGAGTTGCTACTGAAGAAGTTGCTACTAAAAAATTACTGCTGAACAAATTACTGACAACGCAatt > 1:313041‑M1/81‑251 (MQ=255) aggtagcaatgatatcctttatgagaggcctgggtggaatgctaaccggggcgtgctaccccggacggtgctacCCCGGACGGTGCTAACCTGGACGGTGCTACCGTGAACGGTGCTACCTCCTTATATGATGAGGTAATTATTATTAATAAAATCCCCCCCAAAAATATTGATACTAAAGGAGTCGCTACTGAAGAAGTTGCTACTAAAAAAGTACTGCTGAACAAATTACTGACAACGCAATTATTGaa > 2:174442‑M1/75‑251 (MQ=255) tcatgagagacctgggtggaatgctaacctgggcgtgctaccccggacggtgctacCCCGGACGGTGCTAACCTGGACGGTGCTACCGTGAACGGTGCTACCTCCTTATATGATGAGGTAATTATTATTAATAAAATCCCCCCCAAAAAAATTGATACTAAAGGAGTTGCTACTGAAGAAGTTGCTACTAAAAAAGTACTGCTGAACAAATTACTGACAACGCAATTATTGAATGAGCCAGAATAAGCTa > 1:135648‑M1/57‑250 (MQ=255) ctgggtggaatgctaacctgggcgtgctaccccggacggtgctacCCCGGACGGTGCTAACCTGGACGGTGCTACCGTGAACGGTGCTACCTCCTTATATGATGAGGTAATTATTATTAATAAAATCCCCCCCAAGAAAATTGATACTAAAGGAGTTGCTACTGAAGAAGTTGCTACTAAAAAAGTACTGCTGAACAAATTACTGACAACGCAATTATTGAATGAGCCAGAATAAGCTAAGGTTGAAgggg < 1:221011‑M1/206‑1 (MQ=255) gtggaatgctaacctgggcgtgctaccccggacggtgctacCCCGGACGGTGCTAACCTGGACGGTGCTACCGTGAACGGTGCTACCTCCTTATATGATGAGGTAATTATTATTAATAAAATCCCCCCCAAAAAAATTGATACTAAAGGAGTTGCTACTGAAGAAGTTGCTACTAAAAAAGTACTGCTGAACAAATTACTGACAACGCAATTATTGAATGAGCCAGAATAAGCTAAGGTTGAAggg < 1:245521‑M1/205‑1 (MQ=255) gtggaatgctaacctgggcgtgctaccccggacggtgctacCCCGGACGGTGCTAACCTGGACGGTGCTACCGTGAACGGTGCTACCTCCTTATATGATGAGGTAATTATTATTAATAAAATCCCCCCCAAAAAAATTGATACTAAAGGAGTTGCTACTGAAGAAGTTGCTACTAAAAAAGTACTGCTGAACAAATTACTGACAACGCAATTATTGAATGAGCCAGAATAAGCTAAGGTTGAAggg > 2:245521‑M1/42‑246 (MQ=255) ggtgctacACCGGACGGTGCTAACCTGGACGGCGCTACCGTGAACGGTGCTACATCCTTATATGATGAGGCAATTATTATTAATAAAATACCCCCCAAAAAAAATGATACTAAAGGAGTTGCTACTGAAGAAGTTGCTACTAAAAAAGTACTGCTGAACAAATTAATGACAACGAAATTATTGAATGAGCCAGAATAAGCTAAGATTGAAGGGGCTGGAACGCCCATTCAACAATAGCAGTAGCGTGGgat < 2:194014‑M1/243‑1 (MQ=255) | CTGCATAAGGGCCAAGGTAACTTGGGCGTTGATCTTAGAAAGGCTTACCTTCCCGGCGTTGACATGAGGGATTGTTACCTTGGTAAAAAAACAATGAAAGGTAGCAATGATATCCTTTATGAGAGACCTGGGTGGAATGCTAACCTGGGCGTGCTACCCCGGACGGTGCTACCCCGGACGGTGCTAACCCGGACGGTGCTAACCTGGACGGTGCTACCGTGAACGGTGCTACCTCCTTATATGATGAGGTAATTATTATTAATAAAATCCCCCCCAAAAAAATTGATACTAAAGGAGTTGCTACTGAAGAAGTTGCTACTAAAAAAGTACTGCTGAACAAATTACTGACAACGCAATTATTGAATGAGCCAGAATAAGCTAAGGTTGAAGGGGCTGGAACGCCCCTTCAACCTTAGCAGTAGCGTGGGAT > NC_000913/58903‑59332 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |