| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 1,291,151 | IS5 (–) +4 bp | coding (910‑913/1014 nt) | rssB → | regulator of RpoS |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | 1291151 = | 0 (0.000) | 55 (0.910) | 48/482 | 0.3 | 100% | coding (910/1014 nt) | rssB | regulator of RpoS |
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| * | ? | NC_000913 | = 1291154 | 0 (0.000) | 39 (0.650) | 31/480 | 0.8 | 100% | coding (913/1014 nt) | rssB | regulator of RpoS |
| ? | NC_000913 | 2101749 = | NA (NA) | noncoding (1195/1195 nt) | IS5 | repeat region | |||||
CATTGTTTAACGGATTATTACAGGAACAGCTTGCACACCAAAATCAACGGTTGCCAGAGTTGGGCGCGTTATTGAAGCAGGTAAACCATTTACTTCGTCAGGCCAATCTGCCGGGGCAGTTTCCGCTATTAGTTGGCTATTATCATCGCGAACTGAAAAATCTCATTCTGGTTTCTGCGGGTCTGAATGCGACGTTAAATACCGGCGAACACCAGGTGCAAATCAGTAATGGTGTTCCGTTAGGCACTTTAGGTAACGCTTATTTGAATCAATTGAGCCAGCGATGCGATGCCTGGCAATGCCAAATATGGGGAACCGGTGGTCGACTGCGCTTGATGTTGTCTGCAGAATGAGCAAACGATAACGCGGGCTAAATTTGCATTACCTGCTAATGTCGGCTGGTGGTACTATCGTCGCCATTCGTATAAGTAATTGTCTTAATTATGCTAACTCGCCTCCTTTTCAGAACTTAGCCCCTTCGGGGTGCTGATATAC > NC_000913/1290903‑1291397 | cATTGTTTAACGGATTATTACAGGAACAGCTTGCACACCAAAATCAACGGTTGCCAGCGTTGGGAGCGTTATTGAAGCAGGTAAACCATTTACTTCGTCAGGCCAATCTGCCGGGGCAGTTTCCGCTATTAGTTGGCTATTATCATCGCGACCTGAAAAATCTCATTCTGGTTTCTGCGGGTCTGAATGCGACGTTAAATACCTGCGAACACCAGGCGCATCTCAGTACTGGTGTTCAGTTAGGCACttt > 2:230136/1‑250 (MQ=255) aTTGTTTAACGGATTATTACAGGAACAGCTTGCACACCAAAATCAACGGTTGCCAGAGTTGGGCGCGTTATTGAAGCAGGTAAACCATTTACTTCGTCAGGCCAATCTGCCGGGGCAGTTTCCGCTATTAGTTGGCTATTATCATCGCGAACTGAAAAATCTCATTCTGGTTTCTGCGGGTCTGAATGCGACGTTAAATACCGGCGAACACCAGGTGCAAATCAGTAATGGTGTTCCGTTAGGCCCttt > 1:456307/1‑249 (MQ=255) aTTGTTTAACGGATTATGACAGGAACAGCTTGCACACCAAAATCAACGGTTGCCAGAGTTGGACGCGGTATTACGGCCGGTAAACCAATTACTTCGTCCGGCCAATCTGCCGAGGCAGTTTCCGCTATTAGTTGGCTATTATAATCGCGAACTGTCAACTGTCATTCTGATTTCTGCTGGTCTGAATGAGACGTTACTTACCGACGCACACCATGTGCAAATCAGTAAAGGGATTACGTTAGTCACttt > 2:234835/1‑249 (MQ=255) tAACGGATTATTACAGGAACAGCTTGCACACCAAAATCAACGGTTGCCAGAGTTGGGCGCGTTATTGAAGCAGGTAAACCATTTACTTCGTCAGGCCAATCTGCCGGGGCAGTTTCCGCTATTAGTTGGCTATTATCATCGCGCACTGAAAAATCTCATTCTGGTTTCTGCGGGTCTGAATGCGACGTTAAATACCGGCGAACACCAGGTGCAAATCAGTAATGGTGTTCCGTTAGGCACTTTAGggaagg > 1:96495‑M1/1‑245 (MQ=255) 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ccattaccagccttggggtaaaacggctcgatgacttccaccatgttttgccatggcagaatctgctccatgcgggacaagaaaatctcttttctggtctgacggcgcttactgctgaattcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccTTAGGTAACGCTTATTTGAATCAATTGAGcc > 1:373230‑M1/221‑251 (MQ=255) taccagccttggggtaaaacggctcgatgacgtccaccatgttttgccatggcagaatctgctccatgcgggacaagaaaatcgcttttctggtctgacggcgcttactgctgaattcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccTTAGGTAACGCTTATTTGAATCAATTGAGCCAgc > 1:215262‑M1/217‑250 (MQ=255) cacaCCAAAATCAACGGTTGCCAGAGTTGGGCGCGTTATTGAAGCAGGTAAACCATTTACTTCGTCAGGCCAATCTGCCGGGGCAGTTTCCGCTATTAGTTGGCTATTATCATCGCGAACTGAAAAATCTCATTCTGGTTTCTGCGGGTCTGAATGCGACGTTAAATACCGGCGAACACCAGGTGCAAATCAGTAATGGTGTTCCGTTAGGCACTTTAGggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctc < 1:59241‑M1/251‑33 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |