| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | NC_000913 | 59,092 | (15-bp)2→1 | coding (619‑633/651 nt) | yabP → | putative uncharacterized protein YabP |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 59090 = | 2 (0.060) | 13 (0.450) | 13/446 | 1.1 | 87.1% | coding (617/651 nt) | yabP | putative uncharacterized protein YabP |
| ? | NC_000913 | = 59074 | 2 (0.070) | coding (601/651 nt) | yabP | putative uncharacterized protein YabP | |||||
AGAATAAGATATGTACTCAGACGTTGCAGCTGCATAAGGGCCAAGGTAACTTGGGCGTTGATCTTAGAAAGGCTTACCTTCCCGGCGTTGACATGAGGGATTGTTACCTTGGTAAAAAAACAATGAAAGGTAGCAATGATATCCTTTATGAGAGACCTGGGTGGAATGCTAACCTGGGCGTGCTACCCCGGACGGTGCTACCCCGGACGGTGCTAACCCGGACGGTGCTAACCTGGACGGTGCTACCGTGAACGGTGCTACCTCCTTATATGATGAGGTAATTATTATTAATAAAATCCCCCCCAAAAAAATTGATACTAAAGGAGTTGCTACTGAAGAAGTTGCTACTAAAAAAGTACTGCTGAACAAATTACTGACAACGCAATTATTGAATGAGCCAGAATAAGCTAAGGTTGAAGGGGCTG > NC_000913/58874‑59298 | aGAATAAGATATGTACTCAGACGTTGCAGCTGCATAAGGGCCAAGGTAACTTGGGCGTTGATCTTAGAAAGGCTTACCTTCCCGGCGTTGACATGAGGGATTGTTACCTTGGTAAAAAAACAATGAAAGGTAGCAATGATATCCTTTATGAGAGACCTGGGTGGAATGCTAACCTGGGCGTGCTACCCCGGACGGTGCTACcccggacggtgctaacctggacggtgctaccgtgaacggtgctacctcct > 2:76163‑M2/1‑201 (MQ=255) tACTCAGAAGCTGCAGCTGCATAAGGGCCAAGGTAACTTGGGCGTTGATCTTAGAAAGGCTTACCTTCCCGGCGATGACATGAGGGATTGTTACCTTGGTAAAAAAACAATGAAAGGTAGCAATGATATCCTTTATGAGAGACCTGGGTGGAATGCTAACCTGGGCGTGCTACCCCGGACGGTGCTACcccggacggggctaacctggacggtgctaccgttacaggtgctacctccttatatgatgaggt < 2:214799‑M2/251‑64 (MQ=255) tCAGACGTTGCAGCTGCATAAGGGCCAAGGTAACTTGGGCGTTGATCTTAGAAAGGCTTACCTTCCCGGCGTTGACATGAGGGATTGTTACCTTGGTAAAAAAACAATGAAAGGTAGCAATGATATCCTTTATGAGAGACCTGGGTGGAATGCTAACCTGGGCGTGCTACCCCGGACGGTGCTACcccggacggtgctaacctggacggtgctaccgtgaacggtgctccctccttatatgatgaggaaat < 2:276999‑M2/251‑67 (MQ=255) gCAGCTGCATAAGGGCCAAGGTAACTTGGGCGTTGATCTTAGAAAGGCTTACCTTCCCGGCGTTGACATGAGTGATTGTTACCTTGGTAAAAAAACAATGAAAGGTAGCAATGATATCCTTTATGAGAGACCTGGGTGGAATGCTAACCTGGGCGTGCTACCCCGGACGGTGCTACCCCGGACGGTGCTAACCCGGACGGTGCTAACCTGGACGGTGCTACCGTGAACGGTGCTACCTCCTTATatgatg < 2:158344/250‑1 (MQ=255) aaCTTGGTGGTTTATCGTAGAAAGGGGTACTTTCCCGGCGTTGACATGAGGGATTGTTAGCTTGGTAAAGAAACAAGGAAAGGGATCAATGATATCCTTTATGAGAGACCTTGGGGGAATGCTAACCTTGGCGTGCTACCCCGGATGGTGCTACCCCG‑‑‑‑‑‑‑‑T‑‑‑‑‑‑‑ACGGTGCTAATCTGGACGGTGCTACCGGTAACGGTGCTTCCTCCTTAGATGATGAGGTAATTATTATTAATAAAATCCCCCCCaaaaaaagt < 2:344141/251‑3 (MQ=255) ccccgGCGGTGACATGAGGGATTGTTACCTTGGTAAAAAAACAATTAAAGGTAGCAATTATATCCTTTATGAGAGACCTGGCTGGAATGCTAACCTGGGCGTGCTACCCCGGACGGTGCTTAcccggacggtgctaacctggacggtgctaccgtgaacggtgctacctccttatatgatgaggtaattattattaataaaatcccccccaaaaaaattgatactaaaggagttgctactgaagaagttgc > 2:302307‑M2/2‑122 (MQ=255) tACCTTGGTAAAAAAACAATGAACGGTAGCAATGATATCCTTTATGAGAGACCTGGGTGGAATGCTAACCTGGGCGTGCTACCCCGGACGGTGCTACcccggacggtgctaacctggacggtgctaccgtgaacggtgctacctccttatatgatgaggtaattattattaataaaatcccccccaaaaaaattgatactaaaggagttgctactgaagaagttgctactaaaaaagtactgctgaacaa < 1:262051‑M2/250‑154 (MQ=255) ggTAAAAAAACAATGAAAGGTAGCAATGATATCCTTTATGAGAGACCTGGGTGGAATGCTAACCTGGGCGTGCTACCCCGGACGGTGCTACcccggacggtgctaacctggacggtgctaccgtgaacggtgctacctccttatatgatgaggtaattattattaataaaatcccccccaaaaaaattgatactaaaggagttgctactgaagaagttgctactaaaaaagtactgctgaacaaattactg > 1:276999‑M2/1‑91 (MQ=255) ggTAGCAATGATATCCTGTATGAGAGACCTGGGTGGAATGCTAACCTGGGCGTGCTACCCCGGACGGTGCTCCcccggacggtgctaacctggacggtgctaccgtgaacggtgctacctccttatatgatgaggtaattattattaataaaatcccccccaaaaaaattgatactaaaggagttgctactgaagaagttgctactaaaaaagtactgctgaacaaattactgacaacgcaattattgaat > 2:205116‑M2/1‑73 (MQ=255) ccTGGGTGGAATGCTAACCTGGGCGTGCTACCCCGGACGGTGCTACcccggacggcgctaacctggacggtgctaccgtgaacggtgctacctccttatatgatgaggtaattattattaataaaatcccccccaaaaaaattgatactaaaggagttgctactgaagaagttgctactaaaaaagtactgctgaacaaattactgacaacgcaattattgaatgagccagaataagctaaggttgaaggg < 1:160760‑M2/251‑206 (MQ=255) cTGGGTGGAATGCTAACCTGGGCGTGCTACCCCGGACGGTGCTACcccggacggtgctaacctggacggtgctaccgtgaacggtgctacctccttatatgatgaggtaattattattaataaaatcccacccaaaaaaattgatactaaaggagttgctactgaagaagttgctactaaaaaagaactgatgaacaaattactgacaacgcaattattgaatgagccagaataagcaaaggttgaagggg < 2:319505‑M2/251‑207 (MQ=255) tGGGCGTGCTACCCCGGACGGTGCTACcccggacggtgctaacctggacggtgctaccgtgaacggtgctacctccttatatgatgaggtaattattattaataaaatcccccccaaaaaaattgatactaaaggagttgctactgaagaagttgctactaaaaaagtactgctgaacaaattactgacaacgcaattattgaatgagccagaataagctaaggttgaaggggctggaacgccccttcaac < 1:213318‑M2/251‑225 (MQ=255) ggggcGTGCTACCCCGGACGGTGCTACcccggacggtgctaacctggacggtgctaccgtgaatggtgctacctccttatatgatgagggaattattattaataaaatcccccccaaaaaaattgatactaaaggagttgctactgaagaagttgctactaaaaaagtacttctgaacaaattactgacaacgcaattatttaatgagccagaagaagctaaggttgaaggggctggaacgccccttcaac > 2:197971‑M2/2‑27 (MQ=255) gacggtgctaccccggacggtgctaacctggacggtgctaccgtgaacggtgctacctccttatatgatgaggtaattattattaataaa > 1:345200‑M2/1‑11 (MQ=255) gacggtgctaccccggacggtgctaacctggacggtgctaccgtgaacggtgctacctccttatatgatgaggtaattattattaataaa < 2:345200‑M2/90‑80 (MQ=255) | AGAATAAGATATGTACTCAGACGTTGCAGCTGCATAAGGGCCAAGGTAACTTGGGCGTTGATCTTAGAAAGGCTTACCTTCCCGGCGTTGACATGAGGGATTGTTACCTTGGTAAAAAAACAATGAAAGGTAGCAATGATATCCTTTATGAGAGACCTGGGTGGAATGCTAACCTGGGCGTGCTACCCCGGACGGTGCTACCCCGGACGGTGCTAACCCGGACGGTGCTAACCTGGACGGTGCTACCGTGAACGGTGCTACCTCCTTATATGATGAGGTAATTATTATTAATAAAATCCCCCCCAAAAAAATTGATACTAAAGGAGTTGCTACTGAAGAAGTTGCTACTAAAAAAGTACTGCTGAACAAATTACTGACAACGCAATTATTGAATGAGCCAGAATAAGCTAAGGTTGAAGGGGCTG > NC_000913/58874‑59298 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |