| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 1,185,790 | IS2 (–) +5 bp | intergenic (‑196/‑50) | potA ← / → pepT | spermidine preferential ABC transporter ATP binding subunit/peptidase T |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 381260 = | NA (NA) | 22 (0.760) | 20/484 | 0.4 | 100% | noncoding (1/1331 nt) | IS2 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 1185790 = | 0 (0.000) | intergenic (‑196/‑54) | potA/pepT | spermidine preferential ABC transporter ATP binding subunit/peptidase T | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 1185794 | 0 (0.000) | 19 (0.660) | 17/482 | 0.6 | 100% | intergenic (‑200/‑50) | potA/pepT | spermidine preferential ABC transporter ATP binding subunit/peptidase T |
| ? | NC_000913 | 1467910 = | NA (NA) | noncoding (1331/1331 nt) | IS2 | repeat region | |||||
TGTTTATTCAATTTTTTACTCTGTCCCATGTAAACGCAACGGATGGCTTACCGATGCGGGGTTTGTGGTTAACCACCTTGGTGACTCTTAATGAGGGCGGTAATTCTACGGCAAACCGCTTGAATCGCCAATCTTTGTTGTGAATTACTGGCTTAGCTTTATATTCATTAAGGTAATGCTGATAAATATTCCCGCTTGCAGGGGTAAAAGTGACCTGACGCAATATTTGTCTTTTCTTGCTTCTTAATAATGTTGTCACAAAAAGTGAGGGTGACTACATGGATAAACTACTTGAGCGATTTTTGAACTACGTGTCTCTGGATACCCAATCAAAAGCAGGGGTGAGACAGGTTCCCAGCACGGAAGGCCAATGGAAGTTATTGCATCTGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCC > NC_000913/1185566‑1186042 | ggctggctgctacaccatgttgccgggcaacgagggagaccgtcatccccggttcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaATTTGTCTTTTCTTGCTTCTtaataa < 1:19516‑M2/26‑1 (MQ=255) 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tGTCTTTTCTTGCTTCTTAATAATGTTGTCACAAAAAGTGAGGGTGACTACATGGATAAACTACTTGAGCGATTTTTGAACTACGTGTCTCTGGATACCCAATCAAAAGCAGGGGTGAGACAGGTTCCCAGCACGGAAGGCCAATGGAAGTTATTGCATCTGCTGAAAGAGCAGCTCGaa < 1:113614/180‑1 (MQ=255) tGTCTTTTCTTGCTTCTTAATAATGTTGTCACAAAAAGTGAGGGTGACTACATGGATAAACTACTTGAGCGATTTTTGAACTACGTGTCTCTGGATACCCAATCAAAAGCAGGGGTGAGACAGGTTCCCAGCACGGAAGACCAATGGAAGTTATTGCATCTGCTGAAAGAGCAGCTCgta > 2:113614/1‑178 (MQ=255) | TGTTTATTCAATTTTTTACTCTGTCCCATGTAAACGCAACGGATGGCTTACCGATGCGGGGTTTGTGGTTAACCACCTTGGTGACTCTTAATGAGGGCGGTAATTCTACGGCAAACCGCTTGAATCGCCAATCTTTGTTGTGAATTACTGGCTTAGCTTTATATTCATTAAGGTAATGCTGATAAATATTCCCGCTTGCAGGGGTAAAAGTGACCTGACGCAATATTTGTCTTTTCTTGCTTCTTAATAATGTTGTCACAAAAAGTGAGGGTGACTACATGGATAAACTACTTGAGCGATTTTTGAACTACGTGTCTCTGGATACCCAATCAAAAGCAGGGGTGAGACAGGTTCCCAGCACGGAAGGCCAATGGAAGTTATTGCATCTGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCC > NC_000913/1185566‑1186042 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |