| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 2,262,279 | Δ6,678 bp | [fruK]–[lpxT] | [fruK], fruB, setB, yeiW, yeiP, yeiQ, yeiR, [lpxT] | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 2262279 | 2268956 | 6678 | 34 [1] | [3] 34 | [fruK]–[lpxT] | [fruK],fruB,setB,yeiW,yeiP,yeiQ,yeiR,[lpxT] |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 2262278 | 1 (0.020) | 31 (0.480) | 30/478 | 1.1 | 94.0% | coding (88/939 nt) | fruK | 1‑phosphofructokinase |
| ? | NC_000913 | 2268957 = | 3 (0.050) | coding (104/714 nt) | lpxT | lipid A‑core phosphotransferase | |||||
TCAAAACCCGAGAAGTTGAAGTCGGTCACTTCGCCGTCTTTTTCCGT‑CAGCTTAACGTTAATTCGGGTGCGCCCCTGTACAACCTGGAAACGGTTGGCAATGCCCAGCTCGCTGAACA‑GTTGCTGAAAACCATCCTGATTGTCTTTACCCAGGAAGCCGCCAACGGTGACATCAATTCCCAGGTCTTTT‑AATACTTTGGCCACGTTGATGCCTTTACCCGCCGCATGCAGACCGGTGGTTTTCACCAGGTTCACTTCGCCGCGTTCAATTTCCGGGCAGAAACCAACAAGGTCATAAGCCGGATTAAGGGTGATAGTAGCAACACGTCTGCTCATTATGCGCCCTCCCCAAGACCAGCAGCGATAGCGTCGCCGATTGCTTTCAGCGCCTGTTCAGCATCTGCACCCTGGGCGGTAAAGCGTAGGCGATGACCTTTCTTAACGCCAAGTGCCACAACTTTCATCAGACTACGTCCGTTTGCCGGTTTG > NC_000913/2262031‑2262518 | acAAAATCCGAGAAGTTGAAGTCGGTCTCTCCGCCGTTTTTTTCCGT‑CAGCTTAACGTTAATTCGTGTGCCCCCCTGTACAACCTGAAACCGGTTGGCAATGCCCAGCTCGCT‑AACAAGTTGCTAAAACCCACCCTGATTGTTTTTCCCCAGGAAGCCGCCAACGGTGACATCAATCCCCAGGTCTTTT‑AATACTTGGGCCCCGTTGATGCCTTTCCCCGCCGCATGCAGACCGGTGGTTTTCACCAgatg < 2:201637/250‑4 (MQ=255) cAAAACCCGAGAAGTTGAAGTCGGTCACTTCGCCGTCTTTTTCCGT‑CAGCTTAACGTTAATTCGGGTGCGCCCCTGTACAACCTGGAAACGGTTGGCAATGCCCAGCTCGCTGAACA‑GTTGCTGAAAACCATCCTGATTGTCTTTACCCAGGAAGCCGCCAACGGTGACATCAATTCCCAGGTCTTTT‑AATACTTTGGCCACGTTGATGCCTTTACCCGCCGCATGCAGACCGGTGGTTTTCACCAGatgc > 1:151637‑M1/1‑247 (MQ=255) aaaaCCCGAGAAGTTGAAGTCGGTCACTTCGCCGTCTTTTTCCGT‑CAGCTTAAAGTTAATTCGGGTGCGCCCCTGTACAACCTGGAAACGGTTGGCAATGCCCAGCTCGCTGCACA‑GTTGCTGAAAACCATCCTGATTGTCTTTACCCAGGAAGCCGCCAAAGGTGACATCAATTCCCAGGTCTTTT‑AATACTTTGGACACGTTGATGCCTTTACCCGCCGCATGCAGACCGGTGGTTTTCACCAGatgcg > 1:133794‑M1/1‑246 (MQ=255) accccgaGAAGTTGAAGTCGGTCACTTCGCCGTCTTTTTCCGT‑CAGCTTAACGTTAATTCGGGTGCGCCCCTGTACAACCTGGAAACGGTTGGCAATGCCCAGCTCGCTGAACA‑GTTGCTGAAACCCATCCTGATTGTCTTTACCCAGGAAGCCGCCAACGGTGACATCAATTCCCAGTTCTTTT‑AATCCTTTGGCCCCGTTGATGCCTTTACCCGCCGCATGCAGACCGGTGGTTTTCACCAGatgcgga < 1:176391‑M1/249‑8 (MQ=255) ccccGAGAGGTTGAAGTCGTTCTCTTCGCCGT‑TTTTTCCCTACAGCTTAACGTTAATTGGGGTGCGCCCTTGTACAACCGGGAAACGGTTGTCAATCCCCCGCTCTCTGAACA‑GTTGCTAAACTCCATCCTGATGGTCTTTCCCCAGGAAGCCGCCAACGGTGACATCAACTCCCAG‑TCTTTTTAATATTTGGGTCTCGTTGATGTCTTTACCCGCCGCATGCAGACCGGTGGTTTTCACCAgatgcggat < 1:258071/250‑9 (MQ=255) aCCCGAGAAGTTGAAGTCGGTCACTTCGCCGTCTTTTTCCGT‑CAGCTTAACGTTAATTCGGGAGCGCCCCTGTACAACCTGGAAACGGTTGGCAATGCCCAGCTCGCTGAACA‑GTTGCTGAAAACCATCCTGATTGTCTTTACCCAGGAAGCCGCCAACGGTGACATCAATTCCCAGGTCTTTT‑AATACTTTGGCCACGTTGATGCCTTTACCCGCCGCATGCAGACCGGTGGTTTTCACCAGatgcggat > 1:663562‑M1/1‑243 (MQ=255) cGAGAAGTTGAAGTCGGTCACTTCGCCGTCTTTTTCCGT‑CAGCTTAACGTTAATTCGGGTGCGCCCCTGTACAACCTGGAAACGGTTGGCAATGCCCAGCTCGCTGAACA‑GTTGCTGAAAACCATCCTGATTGTCTTTACCCAGGAAGCCGCCAACGGTGACATCACTTCCCAGGTCTTTT‑AATACTTTGGCCACGTTGATGCCTTTACCCGCCGCATGCAGACCGGTGGTTTTCACCAGatgcggatttt > 2:373426‑M1/1‑240 (MQ=255) 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aaGTCGGTCACTTCGCCGTCTTTTTCCGT‑CAGCTTAACGTTAATCCGGGTGCGCCCCTGTACAACCGGGAAACGGTTGGCAATGCCCAGCTCGCTGAACA‑GTTGCTGAAAACCATCCTGATTGTCTTTACCCAGGAAGCCGCCAACGGTGACATCAATTCCCAGGTCTTTT‑AATACTTTGGCCACGTTGATGCCTTTACCCGCCGCATGCAGACCGGTGGTTTTCACCAGatgcggatattttttatttct < 1:373426‑M1/251‑22 (MQ=255) aGTCGGTCACTTCGCCGTCTTTTTCCGT‑CAGCTTAACGTTAATTCGGGTGCGCCCCTGTACAACCTGGACACGGTTGGCAATGCCCAGCTCGCTGAACA‑GTTGCTGTAAACCATCCTGATTGTCTTTACCCAGGAAGCCGCCAACGGTGACATCAATTCCCAGGTCTTTT‑AATACTTTGGCCACGTTGATGCCTTTACCCGCCGCATGCAGACCGGTGGTTTTCACCAGatgcggatattttttatttctt > 1:327342‑M1/1‑229 (MQ=255) cctTCGCCTTTTTTTTCCGG‑CAGCTTAACTTTAATTCGGGTGCGCCCCTGTACAACCTGGAAACGGTTGGCAATGCCCAGCTCGCTGAACA‑GTTGCTGAAAACCATCCTGATTGTCTTTCCCCAGGAAGCCGCCAACGGTGACATCAATTCCCAGGTCTTTT‑AATACTTTGGCCACGTTGATGCCTTTACCCGCCGCATGCAGACCGGTGGTTTTCACCAGatgcggatattttttatttctttaatcaga < 1:622124‑M1/250‑31 (MQ=255) aCTTCGCCGTCTTTTTCCGT‑CAGCTTAACGTTAATTCAGGTGAGCCCCTGTACAACCTGGAAACGGTTTGCAATGCCCAGCTCGCTCAACA‑GGTGCTGAAAACCATCCTGATTGTCTTTAACCAGGAAGCCGCCAACGGTGACATCACTTCCCCAGTCTTTA‑TATACTTAGGCCACGTTGATGCCTTTACCCGCCGCACTCAGACCGGTGGTTTTCAACAGatgcggatattttttctttctttaatcagc > 2:378200‑M1/1‑221 (MQ=255) aGCTTAACGTTAATTCGGGAGCGCCCCTGTACAACCTGGAAACGGTTGGCAATGCCCAGCTCGCTGAACA‑GTTGCTGAAAACCATCCTGATTGTCTTTACCCAGGAAGCCGCCAACGGTGACATCAATTCCCAGGTCTTTT‑AATACTTTGACCACGTTGATGCCTTTACCCGCCGAATGCGGACCGGTGGTTTTCACCAGatgcggaaattttttatttcgttaatcagaaaatgggcagatcggaaaggg > 2:549329‑M1/1‑200 (MQ=255) cGTTAATTCGGGTGCGCCCCTGTACAACCTGGAAACGGTTGGCAATGCCCAGCTCGCTGAACA‑GTTGCTGAAAACCATCCTGATTGTCTTTACCCAGGAAGCCGCCAACGGTGACATCAATTCCCAGGTCTTTT‑AATACTTTGGCCACGTTGATGCCTTTACCCGCCGCATGCAGACCGGTGGTTTTCACCAGatgcggatattttttatttctttaatcagaaactggtcgaaagtaaggcctttttgtg > 1:320708‑M1/1‑193 (MQ=255) gTACACCCTGGAAACGGTTGGCAATCCCCAGCTCGCTGAACA‑GTTGCTGAAAACCATCCTGATTGTCTTTACCCAGGAAGCCGCCAACGGTGACATCAATTCCCAGGTCTTTT‑AATACTTTGGCCACGTTGATGCCTTTACCCGCCGCATGCAGACCGGTGGTTTTCACCAGGTTCACTTCGCCGCGTTCAATTTCCGGGCAGAAACCAACAAGGTCATAAGCCGGATTAAGGGTGATAGTAGCAacac < 1:244646/249‑1 (MQ=255) aCAACCTGGAAACGGTTGGCAATGCCCAGCTCGCTGAACA‑GTTGCTGAAAACCATCCTGATTGTCTTTACCCAGGAAGCCGCCAACGGTGACATAAATTCCCATGTCTTTT‑AATACTTTGGCCACGTTGATGCCTTTACCCGCCGCATGCAGACCGGTGGTTTTCACCATatgcggatattttttatttctttaatcagaaacttgtcgaaagtaaggcctttttgtggctgggtgcgttgtcccacaatt > 2:225414‑M1/1‑170 (MQ=255) gAAACGGTTGGCAATGCCCAGCTCGCTGAACA‑GTTGCTGAAAACCATCCTGATTGTCTTTACCCAGGAAGCCGCCAACGGTGACATCAATTCCCAGGTCTTTT‑AATACTTTGGCCACGTTGATGCCTTTACCCGCCGCATGCAGACCGGTGGTTTTCACCAGatgcggatattttttatttctttaatcagaaactggtcgaaagtaaggcctttttgtggctggttgcattgaccaacaatcgcgccttc > 1:290265‑M1/1‑162 (MQ=255) 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aaaaCCATCCTGTTTTTCTTTACCCAGGAAGCCGCCAACGGTGACATCAATCCCCAGGTCTTTT‑AATTCTTTGGCCACGTTGATGCCTTTACCCGCCGCATGCAGACCGGTGGTTTTCACCAGatgcggatattttttatttctttaatcagaaactggtcgaaagtaaggcctttttgtggctggttgcattgaccaacaatcgcgccttcgacggttgttcactgctggcgatgggtatgttgatgctg < 1:223954‑M1/251‑129 (MQ=255) aaaCCATCCTGATTGTCTTTACCCAGGAAGCCGCCAACGGTGACATCAATTCCCAGGTCTTTT‑AATACTTTGGCCACGTTGATGCCTTTACCCGCCGCATGCAGACCGGTGGTTTTCACCAGatgcggatattttttatttctttaatcagaaactggtcgaaagtaaggcctttttgtggctggttgaatttaccaacacacgcgccttcgacgggtgttcgctgctggcggtgggttttttgatgctgg > 2:624664‑M1/1‑122 (MQ=255) ccATCCTGATTGTCTTTACCCAGGAAGCCGCCAACGGTGACATCAATTCCCAGGTCTTTT‑AATACTTTGGCCACGTTGATGCCTTTACCCGCCGCATGCAGACCGGTGGTTTTCCCCAGatgcggatattttttatttctttaatcagaaactggtcgaaagtaaggcctttttgtggctggttgcatttgccaacaatcacgccttcgacggttgtttaatgctggcgctggggatgttgttgctgcgtt > 2:97987‑M1/1‑119 (MQ=255) ccATCCTGATTGTCTTTACCCAGGAAGCCGCCAACGGTGACATCAATTCCCAGGTCTTTT‑AATACTTTGGCCACGTTGATGCCTTTACCCGCCGCATGCAGACCGGTGGTTTTCACCAGatgcggatattttttatttctttaatcagaaactggtcgaaagtaaggcctttttgtggctggttgcattgaccaacaatcgcgccttcgac > 1:110288‑M1/1‑119 (MQ=255) ggTGACATCAATTCCCAGGTTTTTT‑AATACTTTGGCCTCTTTGTTGCCTTTCCCCGCCGCATGCAGACCGGTGGTTTTCACCAGatgcggatattttttatttctttaatcagaaactggtcgaaagtaaggcctttttgtggctggttgcattgaccaacaatcgcgccttcgacggttgttcactgctggcgatgggtatgttgatgctgagtttctggctgaaagaaaacgcccctggcagacgacgt < 1:412543‑M1/251‑168 (MQ=255) cTTTACCCGCCGCATGCAGACCGGTGGTTTTCACCAGatgcggatattttttatttctttaatcagaaactggtcgaaagtaaggcctttttgtggctggttgcattgaccaacaatcgcgccttcgacggttgttcactgctggcgatgggtatgttgatgctgagtttctggctgaaagaaaacccccctggcagacgacgtatcgtgcttattggtctggtcatgctattaactgcagtggtattaa > 1:480112‑M1/1‑37 (MQ=255) tccccgcCGCATGCAGACCGGTGGTTTTCACCAGatgcggatattttttatttctttaatcagaaactggtcgaaagtaaggcctttttgtggctggttgcattgaccaacaatcgcgccttcgacggttgttcactgctggcgatgggtatgttgatgctgagtttctggctgaaagaaaacgcccctggcagacgacgtatcgtgattattggtctggtcatgctattaactgcagtggtattaaacc < 1:37022‑M1/248‑217 (MQ=255) aCCCGCCGCATGCAGACCGGTGGTTTTCACCAGatgcggatattttttatttctttaatcagaaactggtcgaaagtaaggcctttttgtggctggttgcattgaccaacaatcgcgccttcgacggttgttcactgctggcgatgggtatgttgatgctgagtttctggctgaaagaaaacacccctggcagacgacgtatcgtgattattggtctggtcatgctattaactgcagtggtattaaacc > 2:241502‑M1/1‑33 (MQ=255) aTGCAGACCGGTGGTTTTCACCAGatgcggatattttttatttctttaatcagaaactggtcgaaagtaaggcctttttgtggctggttgcattgaccaacaatcgcgccttcgacggttgttcactgctggcgatgggtatgatgatgctgagtttctggctgaaagaaaacgcccctggcagacgacgtatcgtgattattggtctggtcatgctattaactgcagtggtattaaaccagctgggtc > 1:711174‑M1/1‑24 (MQ=255) cAGACCGGTGGTTTTCACCAGatgcggagattttttatttctttaatcagaaactggtcgaaagtaaggcctttttgtggctggttgcagtgaccaacaatcgcgccttcgacggttgttcactgctggcgatgggtatgttgatgctgagtttctggctgaaagaaaacgcccctggcagacgacgtatcgggattattggtctggtcatgctattaactgcagtggtattaaaccagctgggtcaggca < 2:320708‑M1/251‑231 (MQ=255) ggtTTTCACCAGatgcggatattttttatttctttaatcagaaactggtcgaaagtaaggcctttttgtggctggttgcattgaccaacaatcgcgccttcgacggttgttcactgctggcgatgggtatgttgatgctgagtttctggctgaaagaaaacgcccctggcagacgacgtatcgtgattattggtctggtcatgctattaactgcagtggtattaaaccagctgggtcaggcattaattcct > 1:531627‑M1/1‑12 (MQ=255) gtTTTCACCAGatgcggatattttttatttctttaatcagaaactggtcgaaagtaaggcctttttgtggctgtttgcattgaccaacaatcgcgccttcgacggttgttcactgctggcgatgggtatgttgatgctgagtttctggctgaaagaaaacgcccctggccgacgacgtatcgtgattattggtctggtcatgctattaactgcagtggcattaaaccagctgggtcaggccttaattcctg > 2:495571‑M1/1‑11 (MQ=255) | TCAAAACCCGAGAAGTTGAAGTCGGTCACTTCGCCGTCTTTTTCCGT‑CAGCTTAACGTTAATTCGGGTGCGCCCCTGTACAACCTGGAAACGGTTGGCAATGCCCAGCTCGCTGAACA‑GTTGCTGAAAACCATCCTGATTGTCTTTACCCAGGAAGCCGCCAACGGTGACATCAATTCCCAGGTCTTTT‑AATACTTTGGCCACGTTGATGCCTTTACCCGCCGCATGCAGACCGGTGGTTTTCACCAGGTTCACTTCGCCGCGTTCAATTTCCGGGCAGAAACCAACAAGGTCATAAGCCGGATTAAGGGTGATAGTAGCAACACGTCTGCTCATTATGCGCCCTCCCCAAGACCAGCAGCGATAGCGTCGCCGATTGCTTTCAGCGCCTGTTCAGCATCTGCACCCTGGGCGGTAAAGCGTAGGCGATGACCTTTCTTAACGCCAAGTGCCACAACTTTCATCAGACTACGTCCGTTTGCCGGTTTG > NC_000913/2262031‑2262518 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |