| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 2,262,279 | Δ6,678 bp | [fruK]–[lpxT] | [fruK], fruB, setB, yeiW, yeiP, yeiQ, yeiR, [lpxT] | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 2262279 | 2268956 | 6678 | 34 [1] | [3] 34 | [fruK]–[lpxT] | [fruK],fruB,setB,yeiW,yeiP,yeiQ,yeiR,[lpxT] |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 2262278 | 1 (0.020) | 31 (0.480) | 30/478 | 1.1 | 94.0% | coding (88/939 nt) | fruK | 1‑phosphofructokinase |
| ? | NC_000913 | 2268957 = | 3 (0.050) | coding (104/714 nt) | lpxT | lipid A‑core phosphotransferase | |||||
CGTTGCGCCACCGGACAGCCGTATTGAGCTGATTTCCAGCAGCGAAGCTGACTGGAATGCCTTGCAGAGCGCGCTGTTGAAGCTTCGTTTAGCGACTACCGCGTAAGGTTGCCTGCGTTTTTCAGTAAGATAATTAGAGAAAATATGATTAAAAATTTGCCGCAAATAGTGTTGTTGAATATTGTCGGCCTCGCGCTGTTTCTTTCCTGGTATATCCCCGTTAATCATGGATTCTGGTTGCCGATTGATGCGGATATTTTTTATTTCTTTAATCAGAAACTGGTCGAAAGTAAGGCCTTTTTGTGGCTGGTTGCATTGACCAACAATCGCGCCTTCGACGGTTGTTCACTGCTGGCGATGGGTATGTTGATGCTGAGTTTCTGGCTGAAAGAAAACGCCCCTGGCAGACGACGTATCGTGATTATTGGTCTGGTCATGCTATTAACTGCAGTGGTATTAAACCAGCTGGGTCAGGCATTAATTCCTG > NC_000913/2268710‑2269196 | caaaacccgagaagttgaagtcggtcacttcgccgtctttttccgtcagcttaacgttaattcgggtgcgcccctgtacaacctggaaacggttggcaatgcccagctcgctgaacagttgctgaaaaccatcctgattgtctttacccaggaagccgccaacggtgacatcaattcccaggtcttttaatactttggccacgttgatgcctttacccgccgcatgcagaccggtggttttcaccagATGc > 1:151637‑M2/248‑251 (MQ=255) aaaacccgagaagttgaagtcggtcacttcgccgtctttttccgtcagcttaaagttaattcgggtgcgcccctgtacaacctggaaacggttggcaatgcccagctcgctgcacagttgctgaaaaccatcctgattgtctttacccaggaagccgccaaaggtgacatcaattcccaggtcttttaatactttggacacgttgatgcctttacccgccgcatgcagaccggtggttttcaccagATGCg > 1:133794‑M2/247‑251 (MQ=255) accccgagaagttgaagtcggtcacttcgccgtctttttccgtcagcttaacgttaattcgggtgcgcccctgtacaacctggaaacggttggcaatgcccagctcgctgaacagttgctgaaacccatcctgattgtctttacccaggaagccgccaacggtgacatcaattcccagttcttttaatcctttggccccgttgatgcctttacccgccgcatgcagaccggtggttttcaccagATGCGGa < 1:176391‑M2/7‑1 (MQ=255) acccgagaagttgaagtcggtcacttcgccgtctttttccgtcagcttaacgttaattcgggagcgcccctgtacaacctggaaacggttggcaatgcccagctcgctgaacagttgctgaaaaccatcctgattgtctttacccaggaagccgccaacggtgacatcaattcccaggtcttttaatactttggccacgttgatgcctttacccgccgcatgcagaccggtggttttcaccagATGCGGat > 1:663562‑M2/244‑251 (MQ=255) cgagaagttgaagtcggtcacttcgccgtctttttccgtcagcttaacgttaattcgggtgcgcccctgtacaacctggaaacggttggcaatgcccagctcgctgaacagttgctgaaaaccatcctgattgtctttacccaggaagccgccaacggtgacatcacttcccaggtcttttaatactttggccacgttgatgcctttacccgccgcatgcagaccggtggttttcaccagATGcggatttt > 2:373426‑M2/241‑248 (MQ=255) ccACCGGACAGCCGTATTGGGCTGATTTCCAGCAGCGAAGCTGACTGGAATGCCTTGCAGAGCGCGCTGTTGAAGCTTCGTTTAGCGACTACCGCGTAAGGTTGCCTGCGTTTTTCAGTAAGATAATTAGAGAAAATATGATTAAAAATTTGCCGCAAATAGTGTTGTTGAATATTGTCGGCCTCGCGCTGTTTCTTTCCTGGTATATCCCCGTTAATCATGGATTCTGGTTGCCGATTGATGCGGATAtt < 2:328322/251‑1 (MQ=255) gtataggtcggtcactccgccctcttttaccgtcagcttaccgttatttcgggtgcgcccctttacaccctggaaacggttggcaatgcccagctcgctgaacagttgctgaaaaccatcctgattgtctttccccaggaagccgccaacggtgacatcaatccccaggtcttttaatactttggccacgttgatgcttttacccgccgcatgcagaccggtggttttcaccagATGCGGATATTTTTTAt < 1:371938‑M2/17‑1 (MQ=255) tgaagtcggtcacttcgccgtctttttccgtcagcttaacgttaattcgggtgcgcccctgtacaacctggaaacggttggcaatgcccagctcgctgaacagttgctgaaaaccatcctgcttgtctttacccaggaagccgccaacggtgacatcaattcccaggtcttttaatactttggccacgttgatgcctttacccgcagcatgcagaccggtggttttcaccagATGCGGATATTTTTTAttt > 2:322075‑M2/233‑251 (MQ=255) aagtcggtcacttcgccgtctttttccgtcagcttaacgttaattcgggtgcgcccctgtacaacctggaaacggttggcaatgcccagctcgctgaacagttgctgaaaaccatcctgattgtctttacccaggaagccgccaacggtgacatcaattcccaggtcttttaatactttggccacgttgatgcctttacccgccgcatgcagaccggtggttttcaccagATGCGGATATTTTTTATTTCt > 1:122813‑M2/231‑251 (MQ=255) aagtcggtcacttcgccgtctttttccgtcagcttaacgttaatccgggtgcgcccctgtacaaccgggaaacggttggcaatgcccagctcgctgaacagttgctgaaaaccatcctgattgtctttacccaggaagccgccaacggtgacatcaattcccaggtcttttaatactttggccacgttgatgcctttacccgccgcatgcagaccggtggttttcaccagATGCGGATATTTTTTATTTCt < 1:373426‑M2/21‑1 (MQ=255) agtcggtcacttcgccgtctttttccgtcagcttaacgttaattcgggtgcgcccctgtacaacctggacacggttggcaatgcccagctcgctgaacagttgctgtaaaccatcctgattgtctttacccaggaagccgccaacggtgacatcaattcccaggtcttttaatactttggccacgttgatgcctttacccgccgcatgcagaccggtggttttcaccagATGCGGATATTTTTTATTTCtt > 1:327342‑M2/230‑251 (MQ=255) ccttcgccttttttttccggcagcttaactttaattcgggtgcgcccctgtacaacctggaaacggttggcaatgcccagctcgctgaacagttgctgaaaaccatcctgattgtctttccccaggaagccgccaacggtgacatcaattcccaggtcttttaatactttggccacgttgatgcctttacccgccgcatgcagaccggtggttttcaccagATGCGGATATTTTTTATTTCTTTAATCAGa < 1:622124‑M2/30‑1 (MQ=255) acttcgccgtctttttccgtcagcttaacgttaattcaggtgagcccctgtacaacctggaaacggtttgcaatgcccagctcgctcaacaggtgctgaaaaccatcctgattgtctttaaccaggaagccgccaacggtgacatcacttccccagtctttatatacttaggccacgttgatgcctttacccgccgcactcagaccggtggttttcaacagATGCGGATATTTTTTCTTTCTTTAATCagc > 2:378200‑M2/222‑250 (MQ=255) agcttaacgttaattcgggagcgcccctgtacaacctggaaacggttggcaatgcccagctcgctgaacagttgctgaaaaccatcctgattgtctttacccaggaagccgccaacggtgacatcaattcccaggtcttttaatactttgaccacgttgatgcctttacccgccgaatgcggaccggtggttttcaccagATGCGGAAATTTTTTATTTcgttaatcagaaaatgggcagatcggaaaggg > 2:549329‑M2/201‑236 (MQ=255) cgttaattcgggtgcgcccctgtacaacctggaaacggttggcaatgcccagctcgctgaacagttgctgaaaaccatcctgattgtctttacccaggaagccgccaacggtgacatcaattcccaggtcttttaatactttggccacgttgatgcctttacccgccgcatgcagaccggtggttttcaccagATGCGGATATTTTTTATTTCTTTAATCAGAAACTGGTCGAAAGTAAGGCCTTTTtgtg > 1:320708‑M2/194‑251 (MQ=255) acaacctggaaacggttggcaatgcccagctcgctgaacagttgctgaaaaccatcctgattgtctttacccaggaagccgccaacggtgacataaattcccatgtcttttaatactttggccacgttgatgcctttacccgccgcatgcagaccggtggttttcaccatATGCGGATATTTTTTATTTCTTTAATCAGAAACTTGTCGAAAGTAAGGCCTTTTTGTGGCTGGGTGCGTTGTCCCACAatt > 2:225414‑M2/171‑250 (MQ=255) gaaacggttggcaatgcccagctcgctgaacagttgctgaaaaccatcctgattgtctttacccaggaagccgccaacggtgacatcaattcccaggtcttttaatactttggccacgttgatgcctttacccgccgcatgcagaccggtggttttcaccagATGCGGATATTTTTTATTTCTTTAATCAGAAACTGGTCGAAAGTAAGGCCTTTTTGTGGCTGGTTGCATTGACCAACAATCGCGCCTTc > 1:290265‑M2/163‑251 (MQ=255) cagctcgctgaacagttgctgaaaaccatcctgattgtctttacccaggaagccgccaacggtgacatcaattcccaggtcttttaatactttggccacgttgatgcctttacccgccgcatgcagaccggtggttttcaccagATGCGGATATTTTTTATTTCTTTAATCAGCAACTGGTCGAAAGTAAGGCCTTTTTGTGGCTGGTTGCATTGACCAACAATCGCGCCTTCCGCGGTTGTTCActgc > 1:310303‑M2/145‑249 (MQ=255) ctgaacagttgctgaaaaccatcctgattgtctttacccaggaagccgccaacggtgacatcaattcccaggtcttttaatactttggccacgttgatgcctttacccgccgcatgcagaccggtggttttcaccagATGCGGATATTTTTTATTTCTTTAATCAGAAACTGGTCGAAAGTAATGCCTTTTTGTGGCTGGTTGCATTGGACAACAATCACGCCATCGACGGTTGTTCACTGCTGGCGGTgg > 2:484292‑M2/138‑251 (MQ=255) aaaaaccaccctgattgtctttacccaggaagccgcaaacggtgacatcaattcccaggtcttttaatactttggccacgttgatgcctttacccgccgcatgcagaccggtggttttcaccagATGCGGATATTTTTTATTTCTTTAATCAGAAACTGGTCGAAAGTAAGGCCTTTTTGTGGCTGGTTGCATTGACCAACAATCGCGCCTTCGACGGTTGTTCACTGCTGGCGATGGGTATGTTGATGCt < 1:172978‑M2/127‑1 (MQ=255) aaaaccatcctgtttttctttacccaggaagccgccaacggtgacatcaatccccaggtcttttaattctttggccacgttgatgcctttacccgccgcatgcagaccggtggttttcaccagATGCGGATATTTTTTATTTCTTTAATCAGAAACTGGTCGAAAGTAAGGCCTTTTTGTGGCTGGTTGCATTGACCAACAATCGCGCCTTCGACGGTTGTTCACTGCTGGCGATGGGTATGTTGATGCTg < 1:223954‑M2/128‑1 (MQ=255) aaaccatcctgattgtctttacccaggaagccgccaacggtgacatcaattcccaggtcttttaatactttggccacgttgatgcctttacccgccgcatgcagaccggtggttttcaccagATGCGGATATTTTTTATTTCTTTAATCAGAAACTGGTCGAAAGTAAGGCCTTTTTGTGGCTGGTTGAATTTACCAACACACGCGCCTTCGACGGGTGTTCGCTGCTGGCGGTGGGTTTTTTGATGCtgg > 2:624664‑M2/123‑250 (MQ=255) ccatcctgattgtctttacccaggaagccgccaacggtgacatcaattcccaggtcttttaatactttggccacgttgatgcctttacccgccgcatgcagaccggtggttttccccagATGCGGATATTTTTTATTTCTTTAATCAGAAACTGGTCGAAAGTAAGGCCTTTTTGTGGCTGGTTGCATTTGCCAACAATCACGCCTTCGACGGTTGTTTAATGCTGGCGCTGGGGATGTTGTTGCTGCGtt > 2:97987‑M2/120‑251 (MQ=255) ccatcctgattgtctttacccaggaagccgccaacggtgacatcaattcccaggtcttttaatactttggccacgttgatgcctttacccgccgcatgcagaccggtggttttcaccagATGCGGATATTTTTTATTTCTTTAATCAGAAACTGGTCGAAAGTAAGGCCTTTTTGTGGCTGGTTGCATTGACCAACAATCGCGCCTTCGAc > 1:110288‑M2/120‑211 (MQ=255) ggtgacatcaattcccaggttttttaatactttggcctctttgttgcctttccccgccgcatgcagaccggtggttttcaccagATGCGGATATTTTTTATTTCTTTAATCAGAAACTGGTCGAAAGTAAGGCCTTTTTGTGGCTGGTTGCATTGACCAACAATCGCGCCTTCGACGGTTGTTCACTGCTGGCGATGGGTATGTTGATGCTGAGTTTCTGGCTGAAAGAAAACGCCCCTGGCAGACGACGt < 1:412543‑M2/167‑1 (MQ=255) ctttacccgccgcatgcagaccggtggttttcaccagATGCGGATATTTTTTATTTCTTTAATCAGAAACTGGTCGAAAGTAAGGCCTTTTTGTGGCTGGTTGCATTGACCAACAATCGCGCCTTCGACGGTTGTTCACTGCTGGCGATGGGTATGTTGATGCTGAGTTTCTGGCTGAAAGAAAACCCCCCTGGCAGACGACGTATCGTGCTTATTGGTCTGGTCATGCTATTAACTGCAGTGGTATTaa > 1:480112‑M2/38‑250 (MQ=255) tccccgccgcatgcagaccggtggttttcaccagATGCGGATATTTTTTATTTCTTTAATCAGAAACTGGTCGAAAGTAAGGCCTTTTTGTGGCTGGTTGCATTGACCAACAATCGCGCCTTCGACGGTTGTTCACTGCTGGCGATGGGTATGTTGATGCTGAGTTTCTGGCTGAAAGAAAACGCCCCTGGCAGACGACGTATCGTGATTATTGGTCTGGTCATGCTATTAACTGCAGTGGTATTAAAcc < 1:37022‑M2/216‑1 (MQ=255) acccgccgcatgcagaccggtggttttcaccagATGCGGATATTTTTTATTTCTTTAATCAGAAACTGGTCGAAAGTAAGGCCTTTTTGTGGCTGGTTGCATTGACCAACAATCGCGCCTTCGACGGTTGTTCACTGCTGGCGATGGGTATGTTGATGCTGAGTTTCTGGCTGAAAGAAAACACCCCTGGCAGACGACGTATCGTGATTATTGGTCTGGTCATGCTATTAACTGCAGTGGTATTAAAcc > 2:241502‑M2/34‑249 (MQ=255) atgcagaccggtggttttcaccagATGCGGATATTTTTTATTTCTTTAATCAGAAACTGGTCGAAAGTAAGGCCTTTTTGTGGCTGGTTGCATTGACCAACAATCGCGCCTTCGACGGTTGTTCACTGCTGGCGATGGGTATGATGATGCTGAGTTTCTGGCTGAAAGAAAACGCCCCTGGCAGACGACGTATCGTGATTATTGGTCTGGTCATGCTATTAACTGCAGTGGTATTAAACCAGCTGGGTc > 1:711174‑M2/25‑249 (MQ=255) cagaccggtggttttcaccagATGCGGAGATTTTTTATTTCTTTAATCAGAAACTGGTCGAAAGTAAGGCCTTTTTGTGGCTGGTTGCAGTGACCAACAATCGCGCCTTCGACGGTTGTTCACTGCTGGCGATGGGTATGTTGATGCTGAGTTTCTGGCTGAAAGAAAACGCCCCTGGCAGACGACGTATCGGGATTATTGGTCTGGTCATGCTATTAACTGCAGTGGTATTAAACCAGCTGGGTCAGGCa < 2:320708‑M2/230‑1 (MQ=255) ggttttcaccagATGCGGATATTTTTTATTTCTTTAATCAGAAACTGGTCGAAAGTAAGGCCTTTTTGTGGCTGGTTGCATTGACCAACAATCGCGCCTTCGACGGTTGTTCACTGCTGGCGATGGGTATGTTGATGCTGAGTTTCTGGCTGAAAGAAAACGCCCCTGGCAGACGACGTATCGTGATTATTGGTCTGGTCATGCTATTAACTGCAGTGGTATTAAACCAGCTGGGTCAGGCATTAATTCCt > 1:531627‑M2/13‑251 (MQ=255) gttttcaccagATGCGGATATTTTTTATTTCTTTAATCAGAAACTGGTCGAAAGTAAGGCCTTTTTGTGGCTGTTTGCATTGACCAACAATCGCGCCTTCGACGGTTGTTCACTGCTGGCGATGGGTATGTTGATGCTGAGTTTCTGGCTGAAAGAAAACGCCCCTGGCCGACGACGTATCGTGATTATTGGTCTGGTCATGCTATTAACTGCAGTGGCATTAAACCAGCTGGGTCAGGCCTTAATTCCTg > 2:495571‑M2/12‑251 (MQ=255) tGCCGATTGATGCGGATATTTTTTATTTCTTTAATCAGAAACTGGTCGAAAGTAAGGCCTTTTTGTGGCTGGTTGCATTGACCAACAATCGCGCCTTCGACGGTTGTTCACTGCTGGCGATGGGTATGTTGATGCTGAGTTTCTGGCTGAAAGAAAACGCCCCTGGCAGACGACGTATCGTGCTTATTGGTCTGGTCATGCTATTAACTGCAGTGGTATTAAAc > 2:117503/1‑224 (MQ=255) tGCCGATTGATGCGGATATTTTTTATTTCTTTAATCAGAAACTGGTCGAAAGTAAGGCCTTTTTGTGGCTGGTTGCATTGACCAACAATCGCGCCTTCGACGGTTGTTCACTGCTGGCGATGGGTATGTTGATGCTGAGTTTCTGGCTGAAAGAAAACGCCCCTGGCAGACGACGTATCGTGATTATTGGTCTGGTCATGCTATTAACTGCAGTGGTATTAAAc < 1:117503/224‑1 (MQ=255) | CGTTGCGCCACCGGACAGCCGTATTGAGCTGATTTCCAGCAGCGAAGCTGACTGGAATGCCTTGCAGAGCGCGCTGTTGAAGCTTCGTTTAGCGACTACCGCGTAAGGTTGCCTGCGTTTTTCAGTAAGATAATTAGAGAAAATATGATTAAAAATTTGCCGCAAATAGTGTTGTTGAATATTGTCGGCCTCGCGCTGTTTCTTTCCTGGTATATCCCCGTTAATCATGGATTCTGGTTGCCGATTGATGCGGATATTTTTTATTTCTTTAATCAGAAACTGGTCGAAAGTAAGGCCTTTTTGTGGCTGGTTGCATTGACCAACAATCGCGCCTTCGACGGTTGTTCACTGCTGGCGATGGGTATGTTGATGCTGAGTTTCTGGCTGAAAGAAAACGCCCCTGGCAGACGACGTATCGTGATTATTGGTCTGGTCATGCTATTAACTGCAGTGGTATTAAACCAGCTGGGTCAGGCATTAATTCCTG > NC_000913/2268710‑2269196 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |