| Predicted mutation | ||||||
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| JC JC | NC_000913 | 3,546,574 | IS2 (+) +5 bp | coding (16‑20/1317 nt) | gntT → | high‑affinity gluconate transporter |
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| * | ? | NC_000913 | 3186096 = | NA (NA) | 54 (0.830) | 51/476 | 0.3 | 94.6% | noncoding (1/1331 nt) | IS2 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 3546578 | 3 (0.050) | coding (20/1317 nt) | gntT | high‑affinity gluconate transporter | |||||
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |