| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 1135040 | 70 (1.070) | 3 (0.050) | 3/464 | 5.4 | 3.7% | coding (312/783 nt) | flgG | flagellar basal‑body rod protein FlgG |
| ? | NC_000913 | 1135723 = | 87 (1.370) | coding (160/699 nt) | flgH | flagellar L‑ring protein | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
CACCGATCAGATGCTGCAAAAACTGACGCAACTCTAAGGCTTAACCGGTGGCAGGTTCACCGGTTTACTGATTTTTGAAGATGATAGCCATGCAAAAAA‑ACGCTGCGCATACTT‑ATGCCATTTCCAGCTTGT‑TGGTGCTTTCACTAACCGGCTGCGCCTGGATACCCTCCACGCCGCTGGTGCAGGGGGCGACCAGTGCACAACCGGTTCCCGGTCCGACGCCCGTCGCCA‑ACGGTTCTATTTTCCAGTCTGCTCAGCCGATTAACTATGGCTATCAACCGCTGTTTGAAGATCGTCGACCACGCAATATTGGCGATACGCTGACCATCGTGTTGCAGGAGAACGTCAGCGCCAGCAAAAGCTCCTCTGCGAATGCCAGCCGTGACGGTAAAACTAATTTTGGCTTTGATACTGTGCCGCGCTATTTGCAGGGGCTGTTTGGTAACGCTCGTGCCG‑ATGTCGAAGCCTCCGGTGGTAACACGTTCAACGGAAAGG > NC_000913/1135475‑1135969 | caccgtacataTGCTGCAAAAACTGACGAAACTCTAAGGCTTAACCGGTGGCAGGTGCACCGTTTTACTGATTTTTGAAGATGATAGCCATGCAAAAAA‑ACGCTGCGCATACTT‑ATGCTATTTCCAGCTTGT‑TGGGGCTTTCACTAACCGGCTGCGCCTGGAGACCCGCCACGCCGCTGGTGCAGGGGGCGACCAGTGCACATCCGGTTCCCGGTCCGACGCCCGTCGCCA‑ACGGTTCTATTTTCCAGTCt < 2:619064/241‑1 (MQ=255)caccGATCAGATGCTGCAAAAACTGACGCAACTCTAAGGCTTAACCGGTGGCAGGTTCACCGGTTTACTGATTTTTGAAGATGATAGCCATGCAAAAAA‑ACGCTGCGCATACTT‑ATGCCATTTCCAGCTTGT‑TGGTGCTTTCACTAACCGGCTGCGCCTGGATCCCCTCCACGCCGCTGGTGCAGGGGGCGACCAGTGCACAACCGGTTCCCGGTCCGACGCCCGTCGCCA‑ACGGTTCTATTTTCCAGTCt < 1:388098/251‑1 (MQ=255) gATCAGATGCTGCAAAAACTGACGCAACTTTAAGGCTTAACCGGTGGCAGGTTCACCGGTTTACTGATTTTTGAAGATGATAGCCATGCAAAAAA‑ACGCTGCGCATACTT‑ATGCCATTTCCAGCTTGT‑TGGTGCTTTCACTAACCGGCTGCGCCTGGATACCCTCCACGCCGCTGGTGCAGGGGGCGACCAGTGCACAACCGGTTCCCGGTCCGACGCCCGTCGCCA‑ACGGTTCTATTTTCCAGTCTGCTc < 1:496945/251‑1 (MQ=255) gATCAGATGCTGCAAAAACTGACGCAACTCTAAGGCTTAACCGGTGGCAGGTTCACCGGTTTACTGATTTTTGAAGATGATAGCCATGCAAAAAA‑ACGCTGCGCATACTT‑ATGCCATTTCCAGCTTGT‑TGGTGCTTTCACTAACCGGCTGCGCCTGGATCCCCTCCACGCCGCTGGTGCAGGGGGCGACCAGTGCACAACCGGTTCCCGGTCCGACGCCCGTCGCCA‑ACGGTTCTATTTTCCAGTCTGCTc < 1:232654/251‑1 (MQ=255) gATCAGATGCTGCAAAAACTGACGCAACTCTAAGGCTTAACCGGTGGCAGGTTCACCGGTTTACTGATTTTTGAAGATGATAGCCATGCAAAAAA‑ACGCTGCGCATACTT‑ATGCCATTTCCAGCTTGT‑TGGTGCTTTCACTAACCGGCTGCGCATGGATACCCTCCACGCCGCTGGTGCAGGGAGCGACCAGTGCCCAACCGGTTCCCGGTCCGACGCCCGTCGCCA‑ACGGTTATATTTTCCAGTCTGCTc > 2:585934/1‑251 (MQ=255) aaaaaCTGACGCAACTCTAAGGCTTAACCGGTGGCAGGTTCACCGGTTTACTGATTTTTGAAGATGATAGCCATGCAAAAAA‑ACGCTGCGCATACTT‑ATGCCATTTCCAGCTTGT‑TGGTGCTTTCACTAACCGGCTGCGCCTGGATACCCTCCACGCCGCTGGTGCAGGGGGCGACCAGTGCACAACCGGTTCCCGGTCCGACGCCCGTCGCCA‑ACGGTTCTATTTTCCAGTCTGCTCAGCCGATTAACt > 1:432568/1‑250 (MQ=255) aaaaaCTGACGCAACTCTAAGGCTTAACCGGTGGCAGGTTCACCGGTTTACTGATTTTTGAAGATGATAGCCATGCAAAAAA‑ACGCTGCGCATACTT‑ATGCCATTTCCAGCTTGT‑TGGTGCTTTCACTAACCGGCTGCGCCTGGATACCCTCCACGCCGCTGGTGCAGGGGGCGACCAGTGCACAACCGGTTCCCGGTCCGACGCCCGTCGCCA‑ACGGTTCTATTTTCCAGTCTGCTCAGCCGATTAACTa < 1:84227/251‑1 (MQ=255) aaaaCTGACGCAACCCTAAGGCTTAACCGGGGGCAGTTTCACTGGTTTACTGATTTTTGAAGATGATAGCCATGCAAAAAA‑ACGCTGCGCATACTT‑ATGCCATTTCCAGCTTGT‑TGGTGCTTTCACTAACCGGCTGCGCCGGGATACCCTCCACGCCGCTGGTGCAGGGGGCGACCAGTGCACAACCGGTTCCCGGTCCGACGCCCGTCGCCA‑ACGGTTCTATTTTCCAGTCTGCTCAGCCGATTATCTag < 2:432568/251‑2 (MQ=255) gACGCAATTCTAAGGCTGACGCGGGGGCAGGTACTCAGGTTTACGTCTTTGTGAAAATGCTATCCATGCAACAAA‑ACTCTGCGCATACTT‑TTGCCTTTGTCAGCT‑GTATGGTGCTATCACGATCCGTCTGCTCCGGTACCCCCTCCTCGCCGCTGGTGCAGGGGGCGGCCAGTGCACAACCGTGTCCCGGTCCGACGCCCGTCGCCC‑ACGTGTCTCTTTTCCAGTCTGCTCAGCCGATTAACTATGGCTAt < 2:269442/251‑1 (MQ=255) aCTCTAAGGCTTAACCGGTGGCAGGTTCACCGGTTTACTGATTTTTGAAGATGATAGCCATGCAAAAAA‑ACGCTGCGCATACTT‑ATGCCATTTCCAGCTTGT‑TGGTGCTTTCACTAACCGGCTGCGCCTGGATACCCTCCACGCCGCTGGTGCAGGGGGCGACCAGTGCACAACCGGTTCCCGGTCCGACGCCCGTCGCCA‑ACGGTTCTATTTTCCAGTCTGCTCAGCCGATTAACTATGGCTATCAACCg > 1:673604/1‑251 (MQ=255) aaGGCTTAACCGGTGGCAGGTTCACCGGTTTACTGATTTTTGAAGATGATAGCCATGCAAAAAA‑ACGCTGCGCATACTT‑ATGCCATTTCCAGCTTGT‑TGGTGCTTTCACTAACCGGCTGCGCCTGGATACCCTCCACGCCGCTGGTGCAGGGGGCGACCAGTGCACAACCGGTTCCCGGTCCGACGCCCGTCGCCA‑ACGGTTCTATTTTCCAGTCTGCTCAGCCGATTAACTATGGCTATCAACCGCTGtt < 1:167654/251‑1 (MQ=255) cGGTGGCAGGTTCACCGGTTTACTGATTTTTGAAGATGATAGCCATGCAAAAAA‑ACGCTGCGCATACTT‑ATGCCATTTCCAGCTTGT‑TGGTGCTTTCACTAACCGGCTGCGCCTGGATACCCTCCACGCCGCTGGTGCAGGGGGCGACCAGTGCACAACCGGTTCCCGGTCCGACGCCCGTCGCCA‑ACGGTTCTATTTTCCAGTCTGCTCAGCCGATTAACTATGGCTATCAACCGCTGTTTGAAGAtcgt > 1:71078/1‑251 (MQ=255) gtgtttaCCGGTTTGTTGTTTTTTGAAGATGATAGCAATGCAAAAAAGAC‑CTGCGCATACTTTAT‑CCATTTCCGTCTGGT‑TGGTGTTTTCTCTAACCGGCCGCCCCTGGATCCCCTCCACGCCGCTGGTGCAGGGGGCGACAAGTGCACAACCGGTTCCCGGTCCGACGCCCGTCGCCA‑ACGGGTCTATTTTCCAGTCTGCTCAGCCGATTAACTATGGCTATCAACCGCTGTTTGAAGATCGTCGACCAc < 2:352838/245‑1 (MQ=255) aGGTTCACCGGTTTACTGATTTTTGAAGATGATAGCCATGCAAAAAA‑ACGCTGCGCATACTT‑ATGCCATTTCCAGCTTGT‑TGGTGCTTTCACTAACCGGCTGCGCCTGGATACCCTCCACGCCGCTGGTGCAGGGGGCGACCAGTGCACAACCGGTTCCCGGTCCGACGCCCGTCGCCA‑ACGGTTCTATTTTCCAGTCTGCTCAGCCGATTAACTATGGCTATCAACCGCTGTTTGAAGATCGTCGACCAc < 1:299403/251‑1 (MQ=255) ggTTCACCGGTTTACTGATGTTTGAAGATGATAGCCATGCAAAAAA‑ACGCTGCGCATACTT‑ATGCCATTTCCAGCTTGT‑TGGTGCTTTCACTAACCGGCTGCGCCTGGATACCCTCCACGCCGCTGGTGCAGGGGGCGACCAGTGCACAACCGGTTCCCGGTCCGACGCCCGTCGCCA‑ACGGTTCTATTTTCCAGTCTGCTCAGCCGATTAACTATGGCTATCAACCGCTGTTTGAAGATCGTCGACCACg < 1:104386/251‑1 (MQ=255) ttCACCGGTTTACTGATTTTTGAAGATGATAGCCATGCAAAAAA‑ACGCTGCGCATACTT‑ATGCCATTTCCAGCTTGT‑TGGTGCTTTCACTAACCGGCTGCGCCTGGATACCCTCCACGCCGCTGGTGCAGGGGGCGACCAGTGCACAACCGGTTCCCGGTCCGACGCCCGTCGCCA‑ACGGTTCTATTTTCCAGTCTGCTCAGCCGATTAACTATGGCTATCAACCGCTGTTTGAAGATCGTCGACCACGc > 1:345870/1‑250 (MQ=255) ttCACCGGTTTACTGATTTTTGAAGATGATAGCCATGCAAAAAA‑ACGCTGCGCATACTT‑ATGCCATTTCCAGCTTGT‑TGGTGCTTTCACTAACCGGCTGCGCCTGGATACCCTCCACGCCGCTGGTGCAGGGGGCGACCAGTGCACAACCGGTTCCCGGTCCGACGCCCGTCGCCA‑ACGGATCGATTTTCCAGTCTGCTCCGCCGATTAACGATGCATATCAACCGCTGTTTGAAGATCGTCTACCCCGc > 2:62077/1‑250 (MQ=255) ggTTTACTGATTTTTGAAGATGATAGCCATGCAAAAAA‑ACGCTGCGCATACTT‑ATGCCATTTCCAGCTTGT‑TGGTGCTTTCACTAACCGGCTGCGCCTGGATACCCTCCACGCCGCTGGTGCAGGGGGCGACCAGTGCACAACCGGTTCCCGGTCCGACGCCCGTCGCCA‑ACGGTTCTATTTTCCAGTCTGCTCAGCCGATTAACTATGGCTATCAACCGCTGTTTGAAGATCGTCGCCCCCGCAATATTg > 2:174840/1‑251 (MQ=255) tACTGATTTTTGAAGATGTTTGCCATGCAAAAAA‑ACGCTGCGCATTCTT‑ATGCCATTTCCTGCTTTT‑TGGTGCGTTCACTAACCGGCTGCGCCTGTATACCCTCCACGCCGCTGGTGCAGGGGGCGACCAGTGCACAACCGGTTCCCGGTCCGACGCCCGTCGCCA‑ACGGTTCTATTTTCCAGTCTGCTCAGCCGATTAACTATGGCTATCAACCGCTGTTTGAAGATCGTCGACCACGCAATATTGGCg < 2:325777/250‑1 (MQ=255) gttttGAAGATGATAGCCATGCAAAAAC‑ACGCCTCGAATACTT‑ATGCCATTCCCCGCGTGC‑TGTTGCTTTCCCTACCCGGTTTCGCCTGGATCCCCCCCCCGCCGCCGGTGCAGGGGGCGACCAGTGCACAACCGTGTCCCGGGCCGACTCCCGTCGCCA‑ACGGTTCTATTTTCCAGTCTGCTCCGCCGATTACCTATGGCTATCATCCGCTGTTTGAAGATCGTCGACTACGCAATATTGGCGATACGCt < 2:556365/250‑1 (MQ=255) tttGAAGATGATAGCCATGCAAAAAA‑ACGCTGCGCATACTT‑ATGCCATTTCCAGCTTGT‑TGGTGCTTTCACTAACCGGCTGCGCCTGGATACCCTCCACGCCGCTGGTGCAGGGGGCGACCAGTGCACAACCGGTTCCCGGTCCGACGCCCGTCGCCA‑ACGGTTCTATTTTCCAGTCTGCTCAGCCGATTAACTATGGCTATCAACCGCTGTTTGAAGATCGTCGACCACGCAATATTGGCGATACGCTg > 1:486411/1‑250 (MQ=255) gAAGATGATAGCCATGCAAAAAA‑ACGCTGCGCATACTT‑ATGCCATTTCCAGCTTGT‑TGGTGCTTTCACTAACCGGCTGCGCCTGGATACCCTCCACGCCGCTGGTGCAGGGGGCGACCAGTGCACAACCGGTTCCCGGTCCGACGCCCGTCGCCA‑ACGGTTCTATTTTCCAGTCTGCTCAGCCGATTAACTATGGCTATCAACCGCTGTTTGAAGATCGTCGACCACGCAATATTGGCGATACGCTGAcc > 1:455523/1‑250 (MQ=255) aaGATGATAGCCATGCAAAAAA‑ACGCTGCGCATACTT‑ATGCCATTTCCAGCTTGT‑TGGTGCTTTCACTAACCGGCTGCGCCTGGATACCCTCCACGCCGCTGGTGCAGGGGGCGACCAGTGCACAACCGGTTCCCGGTCCGACGCCCGTCGCCA‑ACGGTTCTATTTTCCAGTCTGCTCAGCCGATTAACTATGGCTATCAACCGCTGTTTGAAGATCGTCGACCACGCAATATTGGCGATACGCTGACCAt < 1:266498/251‑1 (MQ=255) aaGATGATAGCCATGCAAAAAA‑ACGCTGCGCATACTT‑ATGCCATTTCCAGCTTGT‑TGGTGCTTTCACTAACCGGCTGCGCCTGGATACCCTCCACGCCGCTGGTGCAGGGGGCGACCAGTGCACAACCGGTTCCCGGTCCGACGCCCGTCGCCA‑ACGGTTCTATTTTCCAGTCTGCTCAGCCGATTAACTATGGCTATCAACCGCTGTTTGAAGATCGTCGACCACGCAATATTGGCGATACGCTGACCAt > 1:1621/1‑251 (MQ=255) gatgatAGCCATGCAAAAAA‑ACGCTGCGCATACTT‑ATGCCATTTCCAGCTTGT‑TGGTGCTTTCACTAACCGGCTGCGCCTGGATACCCTCCACGCCGCTGGTGCAGGGGGCGACCAGTGCACAACCGGTTCCCGGTCCGACGCCCGTCGCCA‑ACGGTTCTATTTTCCAGTCTGCTCAGCCGATTAACTATGGCTATCAACCGCTGTTTGAAGATCGTCGACCACGCAATATTGGCGATACGCTGACCATCg > 1:407460/1‑251 (MQ=255) gCCATGCAAAAAA‑ACGCTGCGCATACTT‑ATGCCATTTCCAGCTTGT‑TGGTGCTTTCACTAACCGGCTGCGCCTGGATACCCTCCACGCCGCTGGTGCAGGGGGCTACCAGTGCACAACCGGTTCCCGGTCCGACGCCCGTCGCCA‑ACGGTTCTATTTTCCAGTCTGCTCAGCCGATTAACTATGGCTATCAACCGCTGTTTGAAGCTCGGCGACCACGCAATATTGGCGATACGCTGACCCTCGTGTTGcc > 2:399765/1‑250 (MQ=255) a‑aCGCTGCGCATACTT‑ATGCCATTTCCAGCTTGT‑TGGTGCTTTCACTAACCGGCTGCGCCTGGATACCCTCCACGCCGCTGGTGCAGGGGGCGACCAGTGCACCACCGGTTCCCGGTCCGACGCCCGTCGCCA‑ACGGTTCTATTTTCCAGTCTGCTCAGCCGATTAACTATGGCTATCAACCGCTGTTTGAAGATCGTCGACCACGCAATATTGGCGATACGCTGACCATCGTGTTGCAGGAGACCGTc > 1:467115/1‑249 (MQ=255) aaacgctgcgcaggctgtgggcATTTCCAGCTTGG‑TGGTGCTTTCACGAACCGGCTCCGCCGGGATACCCTCCACGCCGCTGGTGCAGGGGGCGACCAGTGCACAACCGGTTCCCGGTCCGACGCCCGTCGCCA‑ACGGTTCTATTTTCCAGTCTGCTCAGCCGATTAACTATGGCTATCAACCGCTGTTTGAATATCGTCGACCACGCAATATTGGCGATACGCTGACCATCGTGTTGCAGGAGAACGTCa < 1:481013/230‑1 (MQ=255) 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> 1:91761/1‑250 (MQ=255) aTGCCATTTCCAGCTTGT‑TGGTGCTTTCACTAACCGGCTGCGCCTGGATACCCTCCACGCCGCTGGTGCAGGGGGCGACCAGTGCACAACCGGTTCCCGGTCCGACGCCCGTCGCCA‑ACGGTTCTATTTTCCAGTCTGCTCAGCCGATTAACTATGGCTATCAACCGCTGTTTGAAGATCGTCGACCACGCAATATTGGCGTTACGCTGACCATCGTGTTGCAGGAGAACGTCAGCGCCAGCAAAAGctcc > 2:7174/1‑251 (MQ=255) aTTTCCAGATTGT‑TGGTGCTTTCACTAAACGGCTGCGCCTGGATACCCTCCACGCCGCTGGTGAAGGGGGCGACCAGTGCACAACCGGTTCCCGGTCCGACGCCCGTCGCCA‑ACGGATCTATTTTACAGTCTGCTCAGCCGATTAAATATGACTATCAACCGCTGCTTGAAGATCGTAGACCACGCAATATTGGCGATACACTGACCATCGTGTTGCAGGAGAACGTCAGAGCCAGCAAAAGCTCCTCTGc > 2:711135/1‑251 (MQ=255) tttCCAGCTTGT‑TGGTGCTTTCACTAACCGGCTGCGCCTGGATACCCTCCACGCCGCTGGTGCAGGGGGCGACCAGTGCACAACCGGTTCCCGGTCCGACGCCCGTAGCCA‑ACGGTTCTATTTTCCAGTCTGCTCAGCCGATTAACTATGGCTATCAACCGCTGTTTGAAGATCGTCGACCACGCAATATTGGCGATACGCTGACCATCGTGTTGCAGGAGAACGTCAGCGCCAGCAACAGCTCCTCTGCg > 1:452333/1‑251 (MQ=255) 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ccgcTGGTGCAGGGGGCGACCAGTGCACAACCGGTTCCCGGTCCGACGCCCGTCGCCA‑ACGGTTCTATTTTCCAGTGTGCTCAGCCGATTAACTATGGCTATCAACCGCTGTTTGAAGATCGTCGACCACGCAATATTGGCGATACGCTGACCATCGTGTTGCAGGAGAACGTCAGAGCCAGCAAAAGCTCCTCTGCGAATGCCAGCCGTGACGGTAAAACTAATTTTGGCTTTGATACTGTGCCGCGCt > 2:655647/1‑250 (MQ=255) tGGTGCAGGGGGCGACCAGTGCACAACCGGTTCCCGGTCCGACGCCCGTCGCCA‑ACGGTTCTATTTTCCAGTCTGCTCAGCCGATTAACTATGGCTATCAACCGCTGTTTGAAGATCGTCGACCACGCAATATTGGCGATACGCTGACCATCGTGTTGCAGGAGAACGTCAGCGCCAGCAAAAGCTCCTCTGCGAATGCCAGCCGTGACGGTAAAACTAATTTTGGCTTTGATACTGTGCCGCGCTATTTg > 2:628884/1‑251 (MQ=255) ggTGCAGGGGGCGACCAGTGCACAACCGGTTCCCGGTCCGACGCCCGTCGCCA‑ACGGTTCTATTTTCCAGTCTGCTCAGCCGATTAACTATGGCTATCAACCGCTGTTTGAAGATCGTCGACCACGCAATATTGGCGATACGCTGACCATCGTGTTGCAGGAGAACGTCAGCGCCAGCAAAAGCTCCTCTGCGAATGCCAGCCGTGACGGTAAAACTAATTTTGGCTTTGATACTGTGCCGCGCTATTTg < 1:245382/250‑1 (MQ=255) ggTGCAGGGGGCGACCAGTGCACAACCGGTTCCCGGTCCGACGCCCGTCGCCA‑ACGGTTCTATTTTCCAGTCTGCTCAGCCGATTAACTATGGCTATCAACCGCTGTTTGAAGATCGTCGACCACGCAATATTGGCGATACGCTGACCATCGTGTTGCAGGAGAACGTCAGCGCCAGCAAAAGCTCCTCTGCGAATGCCAGCCGTGACGGTAAAACTAATTTTGGCTTTGATACTGTGCCGCGCTATTTGc > 1:221308/1‑251 (MQ=255) gACCTGTGCAAAACCGGTTCCCGGTCCGACGCCCGTCGCCA‑ACGTTTCTATTTTCCAGTCTGCTCAGCCGATTAACTATGGCTATCAACCGCTGTTTGAAGATCGTCGACCACGCAATATTGGCGATACGCTGACCATCGTGTTGCAGGAGAACGTCAGCGCCAGCAAAAGCTCCTCTGCGAATGCCAGCCGTGACGGTAAAACTAATTTTGGCTTTGATACTGTGCCGCGCTATTTGCAGGGGCTGTTTg < 2:303272/251‑1 (MQ=255) gACCAGTGCACAACCGGTTCCCGGTCCGACGCCCGTCGCCA‑ACGGTTCTATTTTCCAGTCTGCTCAGCCGATTAACTATGGCTATCAACCGCTGTTTGAAGATCGTCGACCACGCAATATTGGCGATACGCTGACCATCGTGTTGCAGGAGAACGTCAGCGCCAGCAAAAGCTCCTCTGCGAATGCCAGCCGTGACGGTAAAACTAATTTTGGCTTTGATACTGTGCCGCGCTATTTGCAGGGGCTGTTTg > 2:456449/1‑251 (MQ=255) 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CACCGATCAGATGCTGCAAAAACTGACGCAACTCTAAGGCTTAACCGGTGGCAGGTTCACCGGTTTACTGATTTTTGAAGATGATAGCCATGCAAAAAA‑ACGCTGCGCATACTT‑ATGCCATTTCCAGCTTGT‑TGGTGCTTTCACTAACCGGCTGCGCCTGGATACCCTCCACGCCGCTGGTGCAGGGGGCGACCAGTGCACAACCGGTTCCCGGTCCGACGCCCGTCGCCA‑ACGGTTCTATTTTCCAGTCTGCTCAGCCGATTAACTATGGCTATCAACCGCTGTTTGAAGATCGTCGACCACGCAATATTGGCGATACGCTGACCATCGTGTTGCAGGAGAACGTCAGCGCCAGCAAAAGCTCCTCTGCGAATGCCAGCCGTGACGGTAAAACTAATTTTGGCTTTGATACTGTGCCGCGCTATTTGCAGGGGCTGTTTGGTAACGCTCGTGCCG‑ATGTCGAAGCCTCCGGTGGTAACACGTTCAACGGAAAGG > NC_000913/1135475‑1135969 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |