| Predicted mutation | ||||||
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| MC JC | NC_000913 | 1,588,756 | Δ970 bp | [ydeS]–[ydeT] | [ydeS], [ydeT] | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
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| * | * | ÷ | NC_000913 | 1588756 | 1589725 | 970 | 64 [0] | [0] 63 | [ydeS]–[ydeT] | [ydeS],[ydeT] |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | = 1588755 | 0 (0.000) | 63 (0.780) | 56/490 | 0.4 | 100% | coding (85/531 nt) | ydeS | putative fimbrial protein YdeS |
| ? | NC_000913 | 1589726 = | 0 (0.000) | coding (276/1149 nt) | ydeT | fimbrial usher domain‑containing protein YdeT | |||||
AAGAGAACTGTAACCACTGGTGCCAGACGATGTATTACCTCCGTGGGTGTTACCGACCTGAACGCTATAATTCAGGTTATTATCCGGCAGCAGAGTGCCATAAACCCCCGATAGATTGGTCATGCCGCCTTTCAAATCGTTTGACATACTGTAACTGGCGTTTGAATTACGAAATGCCGACTGACTGTCTGTACGCATCCAATGACTGAAGGGAACATTAAGCGTAAAAGCGAGTAAATGATCCCGATCGTTTTGCCATATATTATTGGAATAGCTGTAATTCAGCGAAGTCGTAATATCACCAAACGGCACATTTAATCCAAATGATATTTGCTGGTCGCTGCGTGACGTGTTCCAGTAACTTTGGCGACTGGCACTGAAAAATGTCGTACCGTAATTTCCAAGCTGCTGAGAGATGCTTATTTGTTCCTGACCACGCTTACTGTAGAACAGATTAAAATAATCAATAAATTGTGTCTGCT > NC_000913/1589477‑1589958 | ggaggccgtattgcttccttcatccagtttcaacaacgtattaatttctgcatcctcaataccgttaaatgcaacccgaaaccccgttgtccctttgctgcattcacttaacgtaatctgaaaagggacggctggatttctgctacaggtcgttggacattgtatggcgctgtttttttgaagatctacgggaaaattaagcgactccgatgagactgtgaagccataagcgaggccgcgaccgctcatGt > 2:92394‑M2/250‑251 (MQ=255) ggccgtattgcttccctcatccagtttcaacaaagtattattttcttcatcctcaataccgttaaatgcaacccgaacccccgttgtccctttgctgcattcacttaacgtaatctgaaaagggacggctggacttgtgctaccggtcgttggaaattgtctggcactgtttttttggagatctacggtaaaattaagcgaatccgatgagactgtgcagccataatcgaggacgcgcccgctaatGtttt < 2:432731‑M2/5‑1 (MQ=255) ccgtattgcttccttcatccagtttcaacaaagtattattttctgcatcctcaataccgttaaatgcaacccgaacccccgttgtccctttgctgcattcacttaacgtaatctgaaaagggacggctggacttgtgctaccggtcgttggaaattgtctggcactgtttttttggagatctacggtaaaattaagcgaatccgatgagactgtgcagccataatcgaggacgcgcccgctaatGTTTTGc < 1:55507‑M2/7‑1 (MQ=255) tattgcttccttcatccagtttcaacaaagtattattttctgcatcctcaataccgttaaatgcaacccgaacccccgttgtccctttgctgcattcacttaacgtaatctgaaaagggacggctggacttgtgctaccggtcgttggaaattgtctggcactgtttttttggagatctacggtaaaattaagcgaatccgatgagactgtgcagccataatcgaggacgcgcccgctaatGTTTTGCCat > 1:167621‑M2/242‑251 (MQ=255) 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tattattttctgcatcctcaataccgttaaatgcaacccgaacccccgttgtccctttgctgcattcacttaacgtaatctgaaaagggacggctggacttgtgctaccggtcgttggaaattgtctggcactgtttttttggagatctacggtaaaattaagcgaatccgctgagactgtgcagccataatcgaggacgcgcccgctaatGTTTTGCCATATATTATTGGAATAGCTGTAATTCAGCGa > 1:120780‑M2/212‑250 (MQ=255) tattttctgcatcctcaataccgttaaatgcaacccgaacccccgttgtccctttgctgcattcacttaacgtaatctgaaaagggacggctggacttgtgctaccggtcgttggaaattgtctggcactgtttttttggagatccacggtaaaattaagcgaatccgatgagactgtgcagccataatcgaggacgcgcccgctaatGTTTTGCCATATATTATTGGAATAGCTGTAATTCAGCGAAGTc > 1:11774‑M2/209‑251 (MQ=255) catcctcaataccgttaaatgcaacccgaacccccgttgtccctttgctgcattcacttaacgtaatctgaaaagggacggctggacttgtgctaccggtcgttggaaattgtctggcactgtttttttggagatctacggtaaaattaagcgaatccgatgagactgtgcagccataatcgaggacgcgcccgctaatGTTTTGCAATATATTATTGGAATAGCTGTAATTCAGCGAAGTCGTaatata > 1:110374‑M2/200‑249 (MQ=255) 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(MQ=255) gatgagactgtgcagccataatcgaggacgcgcccgctaatGTTTTGCCATATATTATTGGAATAGCTGTAATTCAGCGAAGTCGTAATATCACCAAACGGCACATTTAATCCAAATGATATTTGCTGGTCGCTGCGTGACGTGTTCCAGTAACTTTGGCGACTGGCACTGAAAAATGTCGTACCGTAATTTCCAAGCTGCTGAGAGATGCTTATTTGTTCCTGACCACGCTTACTGTAGAACAGATTaa > 1:587471‑M2/42‑250 (MQ=255) tggcagccataatcgagtgcgcgcccgctaatAGTTTGCCATATATTATTGGAATAGCGGTAAATCAGCTAAGTCTTAATACCACCAAACGGCACATTTAATCCAAATGAGATTTGCTGGTCGCTGCGTGACGTGTTCCAGTAACTTTGGCGACTGGCACTTAAAAATGTCGTACCGTACTTTCCAAGCTGCTTAGAGATGCTTATTTGTTCCCGACCACGCTTACTGTATAACAGATTAAAATAATCaa < 2:837062‑M2/218‑1 (MQ=255) cagccataatcgaggacgcgcccggtaatGTTTTGCCATATATTATTGGAATAGCTGTAAATCAGCGAAGTCGTAATATCTCCAAACGGCACATTTAATCCAAATGATATTTGCTGGTCGCTGCGTGACGTTTTCCAGTAACTTTGGCGACTGGCACTGAAAAATGTCGTACCGTAATTTCCAAGCTGCTGAGAGATGCTTATTTGTTCCTGACCACGCTTCCTGTAGAACAGATTAAAATAATCAATaaa < 1:607662‑M2/222‑1 (MQ=255) ccataatcgaggacgcgcccgctaatGTTTTGCCATATATTATTGGAATAGCTGTAATTCAGCGAAGTCGTAATATCACCAAACGGCACATTTAATCCAAATGATATTTGCTGGTCGCTGCGTGACGTGTTCCAGTAACTTTGGCGACTGGCACTGAAAAATGTCGTACCGTAATTTCCAAGCTGCTGAGAGATGCTTATTTGTTCCTGACCACGCTTACTGTAGAACAGATTAAAATAATCAATAAATtg < 1:362168‑M2/225‑1 (MQ=255) ccataatcgaggacgcgcccgctaatGTTTTGCCATATATTATTGGAATAGCTGTAATTCAGCGAAGTCGTAATATCACCAAACGGCACATTTAATCCAAATGATATTTGCTGGTCGCTGCGTGACGTGATCCAGTAACTTTGGCGACTGGCACTGAAAAATGTCGTACCGTAATTTCCAAGCTGCTGAGAGATGCTTATTTGTTCCTGACCACGCTTACTGTAGAACAGATTAAAATAATCAATAAATtg > 1:54102‑M2/27‑251 (MQ=255) aatcgaggacgcgcccgctaatGTTTTGCCATATATTATTGGAATAGCTGTAATTCAGCGAAGTCGTAATATCACCAAACGGCACATTTAATCCAAATGATATTTGCTGGTCGCTGCGTGACGTGTTCCAGTAACTTTGGCGACTGGCACTGAAAAATGTCGTACCGTAATTTCCAAGCTGCTGAGAGATGCTTATTTGTTCCTGACCACGCTTACTGTAGAACAGATTAAAATAATCAATAAATTgtgt < 1:528535‑M2/228‑1 (MQ=255) cgaggacgcgcccgctaatGTTTTGCCATATATTATTGGAATAGCTGTAATTCAGCGAAGTCGTAATATCACCAAACGGCACATTTAATCCAAATGATATTTGCTGGTCGCTGCGTGACGTGTTCCAGTAACTTTGGCGACTGGCACTGAAAAATGTCGTACCGTAATTTCCAAGCTGCTGAGAGATGCTTATTTGTTCCTGACCACGCTTACTGTAGAACAGATTAAAATAATCAATAAATTGTGTCTg < 1:215089‑M2/231‑1 (MQ=255) gaggacgcgcccgctaatGTTTTGCCATATATTATTGGAATAGCTGTAATTCAGCGAAGTCGTAATATCACCAAACGGCACATTTAATCCAAATGATATTTGCTGGTCGCTGCGTGACGTGTTCCAGTAACTTTGGCGACTGGCACTGAAAAATGTCGTACCGTAATTTCCAAGCTGCTGAGAGATGCTTATTTGTTCCTGACCACGCTTACTGTAGAACAGATTAAAATAATCAATAAATTGTGTCTGCt < 1:289003‑M2/233‑1 (MQ=255) taatGTTTTGCCATATATTATTGGAATAGCTGTAATTCAGCGAAGTCGTAATATCACCAAACGGCACATTTAATCCAAATGATATTTGCTGGTCGCTGCGTGACGTGTTCCAGTAACTTTGGCGACTGGCACTGAAAAATGTCGTACCGTAATTTCCAAGCTGCTGAGAGATGCTTATTTGTTc > 2:278242‑M2/5‑184 (MQ=255) taatGTTTTGCCATATATTATTGGAATAGCTGTAATTCAGCGAAGTCGTAATATCACCAAACGGCACATTTAATCCAAATGATATTTGCTGGTCGCTGCGTGACGTGTTCCAGTAACTTTGGCGACTGGCACTGAAAAATGTCGTACCGTAATTTCCAAGCTGCTGAGAGATGCTTATTTGTTc < 1:278242‑M2/180‑1 (MQ=255) | AAGAGAACTGTAACCACTGGTGCCAGACGATGTATTACCTCCGTGGGTGTTACCGACCTGAACGCTATAATTCAGGTTATTATCCGGCAGCAGAGTGCCATAAACCCCCGATAGATTGGTCATGCCGCCTTTCAAATCGTTTGACATACTGTAACTGGCGTTTGAATTACGAAATGCCGACTGACTGTCTGTACGCATCCAATGACTGAAGGGAACATTAAGCGTAAAAGCGAGTAAATGATCCCGATCGTTTTGCCATATATTATTGGAATAGCTGTAATTCAGCGAAGTCGTAATATCACCAAACGGCACATTTAATCCAAATGATATTTGCTGGTCGCTGCGTGACGTGTTCCAGTAACTTTGGCGACTGGCACTGAAAAATGTCGTACCGTAATTTCCAAGCTGCTGAGAGATGCTTATTTGTTCCTGACCACGCTTACTGTAGAACAGATTAAAATAATCAATAAATTGTGTCTGCT > NC_000913/1589477‑1589958 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |