| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 4,273,041 | Δ1 bp :: IS186 (+) +6 bp :: Δ1 bp | coding (826‑831/2823 nt) | uvrA ← | UvrABC excision nuclease subunit A |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 2514274 = | NA (NA) | 39 (1.010) | 33/476 | 0.2 | 100% | noncoding (2/1345 nt) | IS186 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 4273046 | 0 (0.000) | coding (826/2823 nt) | uvrA | UvrABC excision nuclease subunit A | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 2515616 | NA (NA) | 41 (1.060) | 41/478 | 0.1 | 97.6% | noncoding (1344/1345 nt) | IS186 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 4273041 = | 1 (0.030) | coding (831/2823 nt) | uvrA | UvrABC excision nuclease subunit A | |||||
CAGAAAATTGCTTCCACGCTCTCTCCGCGTGCTGAAGGCATCATCTCTGTGTTCCTGGTTTCCTTCGCTAACTTCTCTTCAATCGGGATTATCGCAGGTGCAGTTAAAGGCCTGAATGAAGAGCAAGGTAACGTGGTTTCTCGCTTCGGTCTGAAGCTGGTTTACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCGGGGCTCTAACCCGCCGCCGCGAAATTCGTGATGCTGCAACTCTGCTACGTCTGGGGCTGGCTTACGGCCCCGGGGGGATGTCATTACGTGAAGTCACTGCA > NC_000913/2514026‑2514516 | cAGAAAATTGCTTCCACGCTCTCTCCGCGTGCTGAAGGCATCATCTCTGTGTTCCTGGTTTCCTTCGCTAACTTCTCTTCAATCGGGATTATCGCAGGTGCAGTTAAAGGCCTGAATGAAGAGCAAGGTAACGTGGTTTCTCGCTTCGGTCTGAAGCTGGTTTACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTccc < 1:210075/251‑1 (MQ=255)cAGAAAATTGCTTCCACGCTCTCTCCGCGTGCTGAAGGCATCATCTCTGTGTTCCTGGTTTCCTTCGCTAACTTCTCTTCAATCGGGATTATCGCAGGCGCAGTTAAAGGCCTGAATGAAGAGCAAGGTAACGTGGTTTCTCGCTTCGGTCTGAAGCTGGTTTACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTccc < 1:360209/251‑1 (MQ=255) gCTTCCACGCTCTCTCCGCGTGCTGAAGGCATCATCTCTGTGTTCCTGGTTTCCTTCGCTAACTTCTCTTCAATCGGGATTATCGCAGGTGCAGTTAAAGGCCTGAATGAAGAGCAAGGTAACGTGGTTTCTCGCTTCGGTCTGAAGCTGGTTTACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCt < 1:319193/251‑1 (MQ=255) tCCACGCTCTCTCCGCGTGCTGAAGGCATCATCTCTGTGTTCCTGGTTTCCTTCGCTAACTTCTCTTCAATCGGGATTATCGCAGGTGCAGTTAAAGGCCTGAATGAAGAGCAAGGTAACGTGGTTTCTCGCTTCGGTCTGAAGCTGGTTTACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGGAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTaa < 1:290508/250‑1 (MQ=255) 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tGAAGGCATCATCTCTGTGTTCCTGGTTTCCTTCGCTAACTTCTCTTCAATCGGGATTATCGCAGGTGCAGTTAAAGGCCTGAATGAAGAGCAAGGTAACGTGGTTTCTCGCTTCGGTCTGAAGCTGGTTTACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAACAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACg > 2:417584/1‑251 (MQ=255) atcatcTCTGTGTTCCTGGTTTCCTTCGCTAACTTCTCTTCAATCGGGATTATCGCAGGTGCAGTTAAAGGCCTGAATGAAGAGCAAGGTAACGTGGTTTCTCGCTTCGGTCTGAAGCTGGTTTACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGat > 1:78303/1‑250 (MQ=255) catcTCTGTGTTCCTGGTTTCCTTCGCTAACTTCTCTTCAATCGGGATTATCGCAGGTGCAGTTAAAGGCCTGAATGAAGAGCAAGGTAACGTGGTTTCTCGCTTCGGTCTGAAGCTGGTTTACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGatat < 1:392046/250‑1 (MQ=255) tgtTCCTGGTTTCCTTCGCTAACTTCTCTTCAATCGGGATTATCGCAGGTGCAGTTAAAGGCCTGAATGAAGAGCAAGGTAACGTGGTTTCTCGCTTCGGTCTGAAGCTGGTTTACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGACCTGGTGCTATAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGAATTACGCCTGATATGCTTTAACg > 2:194178/1‑251 (MQ=255) ccTGATTTCCTTCGCTAACTTCTCTTCAATCGGGATTATCGCAGGTGCCGTTAAAGGCCTAAATGAAAAGAAAGGGAACGTGGTTTCTCGCTTCGGTCTGACGCTGGTTTACGGCTCTACCCTGGTGAGTGGGCTGTCTGCTTCAATCGCAGCACTGGAGCTGTAAGACCATACATAAACAAGCCGGGGATAATTCACATAATCGCTAACTTAAAGGATGTGATATTACGCCTCAAATGATTTAACgatac > 2:168674/1‑247 (MQ=255) ccTTCGCTAACTTCTCTTCAATCGGGATTATCGCAGGTGCAGTTAAAGGCCTGAATGAAGAGCAAGGTAACGTGGTTTCTCGCTTCGGTCTGAAGCTGGTTTACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAAtt > 2:344113/1‑251 (MQ=255) cTTCTCTTCAATCGGGATTATCGCAGGTGCAGTTAAAGGCCTGAATGAAGAGCACGGTAACGTGGTTTCTCGCTTCGGTCTGAAGCTGGTTTACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGAttt > 2:36481/1‑225 (MQ=255) cTTCTCTTCAATCGGGATTATCGCAGGTGCAGTTAAAGGCCTGAATGAAGAGCAAGGTAACGTGGTTTCTCGCTTCGGTCTGAAGCTGGTTTACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGAttt < 1:36481/225‑1 (MQ=255) tCAATCGGGATTATCGCAGGTGCAGCTAAAGGCCTGAATGAAGAGCAAGGTAACGTGGTGTCTCGCTTCGGTCTGAAGCTGGTTTACGGCTGTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGAAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACAGAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACt < 2:283864/249‑1 (MQ=255) aTTATCGCCGGTGCAGTTAAAGGCCTGAATGAAGAGCAAGGTAACGTGGATTCTGGCTTCGGTCTGAAGCTGGTTTACGGCTCTACCCTGGCATGTGTGCTGTCCGCGTCGATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAACGCCGGGGCTAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTAGCATTACGACTGCTCTGATTTAACGTGCCGGTGCATTACTATCAAGAAAACAGGTCAggcatt > 1:256882/1‑246 (MQ=255) ttAAAGGCCTGAATGAAGAGCAAGGTAACGTGGTTTCTCGCTTCGGTCTGAAGCTGGTTTACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGt > 1:261574/1‑250 (MQ=255) ttAAAGGCCTGAATGAAGAGCAAGGTAACGTGGTTTCTCGCTTCGGTCTGAAGCTGGTTTACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGt > 2:313302/1‑250 (MQ=255) ggCCTGAATGAAGAGCAAGGTAACGTGGTTTCTCGCTTCGGTCTGAAGCTGGTGTACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATACGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATGTGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCACTTCTGGCCCATATTGGTAAGccc > 1:372970/1‑251 (MQ=255) tgaaGAGCAAGGTAACGTGGTTTCTCGCTTCGGTCTGAAGCTGGTTTACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGc > 2:346730/1‑168 (MQ=255) tgaaGAGCAAGGTAACGTGGTTTCTCGCTTCGGTCTGAAGCTGGTTTACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGc < 1:346730/168‑1 (MQ=255) aGGTAACGTGGTGTCTCGCATTGTTCTGAAGCTGGTTTACGGCTCTTCCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCCGCACTGTTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTTACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGTTAATCCCTTAGAACTGGAttcttc < 2:80214/251‑1 (MQ=21) tctcGCTTCGGTCTGAAGCTGGTTTACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGc < 1:344113/250‑1 (MQ=255) cGCTTCGGTCTGAAGCTGGTTTACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCg < 1:39763/249‑1 (MQ=255) gTCTGAAGCTGGTTTACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACGGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACGTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACGTCGGCAAGTAATGCCTGGGCTCTaa < 2:372970/251‑1 (MQ=255) 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gTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCGGGGCTCTAACCCGCCGCCGCGAAATTCGTGATGCTGCAACTCTGCTACGTCTggg > 2:128456/1‑251 (MQ=255) aTCGCAGCACTGGTGCGGTAAGACTATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAAATTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATGTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCATGTAATGCCGGGGCTCTAACCCGCCGCCGCGAAATTCGTGATGCTGCAACTCTGTTACGTCTGGggctg < 1:168674/251‑1 (MQ=255) tGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGCTAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCGGGGCTCTAACCCGCCGCCGCGAAATTCGTGATGCTGCAACTATGCTACGTCTGGGGCTGGCTTACGGcc > 2:278830/1‑251 (MQ=255) ccgacgcgtgtccgatctAATTCCCAAAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTAGTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACGGGTCAGCAATGCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCGGGGCTCTAACCCGCCGCCGCGAAATTCGTGATGCTGCAACTCTGCTACGTCGGGGGCTGGCTTACGGCCCCGGGGGGATGTCATTAc < 2:48563/234‑1 (MQ=11) aaaaaaGACGGGGATCATTCCCATAACCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTAAGCCTGCTATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCACATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCCCGTAATGCCGGGGCTCTAACCCGCCGCCGCGAAATTCGTGATGCTGCAACTCTGCTACTGCTGGGGCTGGCTTACGGCCCAGGGGGGATGTCATTACGTg > 1:153297/1‑251 (MQ=11) aaaaGCCGGGGATAATACCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTGAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCGGGGCTCTAACCCGCCGCCGCGAAATTCGTGATGCTGCAACTCTGCTACGTCTGGGGCTGGCTTACGGCCCCGGGGGGATGTCATTACGTGaa < 1:267093/251‑1 (MQ=25) ggggATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGGGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCGGGGCTCTAACCCGCCGCCGCGAAATTCGTGATGCTGCAACTCTGCTACGTCTGGGGCTGGCTTACGGCCCCGGGGGGATGTCATTACGTGAAGTCACTg < 1:278830/251‑1 (MQ=18) ggATAATTCCCATAAGCTCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTTCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCTATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATTCTTCGGCACGTAATGCCGGGGCTCTAACCCGCCGCCGCGAAATTCGTGATGCTGCAACTCTGCTACGTCTGGGGCTTGCTTACTGCCCCGGGTGGATGTCATTACGTTAAGTCACTGCa < 1:105510/251‑1 (MQ=11) aaTTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCGGGGCTCTAACCCGCCGCCGCGAAATTCGTGATGCTGCAACTCTGCTACGTCTGGGGCTGGCTTACGGCCCCGGGGGGATGTCATTAc > 1:48563/1‑233 (MQ=31) | CAGAAAATTGCTTCCACGCTCTCTCCGCGTGCTGAAGGCATCATCTCTGTGTTCCTGGTTTCCTTCGCTAACTTCTCTTCAATCGGGATTATCGCAGGTGCAGTTAAAGGCCTGAATGAAGAGCAAGGTAACGTGGTTTCTCGCTTCGGTCTGAAGCTGGTTTACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCGGGGCTCTAACCCGCCGCCGCGAAATTCGTGATGCTGCAACTCTGCTACGTCTGGGGCTGGCTTACGGCCCCGGGGGGATGTCATTACGTGAAGTCACTGCA > NC_000913/2514026‑2514516 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |