| Predicted mutation | ||||||
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| JC JC | NC_000913 | 1,908,726 | IS2 (–) +5 bp | coding (37‑41/144 nt) | mgrB ← | PhoQ kinase inhibitor |
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| * | ? | NC_000913 | 1908726 = | 0 (0.000) | 36 (0.760) | 35/486 | 0.4 | 100% | coding (41/144 nt) | mgrB | PhoQ kinase inhibitor |
| ? | NC_000913 | = 2070271 | NA (NA) | noncoding (1/1331 nt) | IS2 | repeat region | |||||
CGATACAACCAAAGACGCAATGTTCATCACGCCTGAATTTACAACTTCGTTCATTTCACCACCTCTGAGTAGAGGCGCTATTCTACCACTGCTGGAGAGGAAGAAAATCTAGTGCTGAAAAAATGATATCACCACGGGATAAACTGGTTAATGGCACAAATTCCGCTGAAAAATTGTACATCCTGATCGCACATCATGTTGAATACCTGCGCCCAAAGCAGCAAGCAAGCCAACACCACGACAACCAGAACGACCCATCGAAACTTTTTCACTCCAATCTCCGTTTCACCTACCTTATGTCATTAAACTAGCATGCGTTAGTTAAACAGCGCCTAACTATGTCGATATTCGTGCTTTTTCGGAATGAGTCGCTTGCTTCAGCGCATATTGCCGCTACGATTAAGCGAACATAAAAAGAGAAGAGGTTGTAATGCGATTCATCATTCGCACAGTTATGCTGATAGCACTGGTATGGATA > NC_000913/1908495‑1908972 | cGATACAACCAAAGACGCAATGTTCATCACGCCTGAATTTACAACTTCGTTCATTTCACCACCTCTGAGTAGAGGCGCTATTCTACCACTGCTGGAGAGGAAGAAAATCTAGTGCTGAAAAAATGATATCACCACGGGATAAACTGGTTAATGGCACAAATTCCGCTGAAAAATTGTACATACTGATCGCACATCATGTTGAATACCTGCGCCCAAAGCAGCAAGCAAGCCAACACtggatttgcccctat < 1:503336‑M2/251‑16 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aaGCAGCAAGCAAGCCAACACtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcctctgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctggtttgggcatgatactgatgtagtcacgctttatcgttttcacgaagctctctgctattccgtt < 2:476720‑M2/251‑231 (MQ=255) gggccagtctaAACACCACGACAACCAGAACGACCCATCGAAACTTTTTCACTCCAATCTCCGTTTCACCTACCTTATGTCATTAAACTAGCATGCGTTAGTTAAACAGCGCCTAACTATGTCGATATTCGTGCTTTTTCGGAATGAGTCGCTTGCTTCAGCGCATATTGCCGCTACGATTAAGCGAACATAAAAAGAGAAGAGGTTGTAATGCGATTCATCATTCGCACAGTTATGCTGATAGCACTGGt < 2:359026‑M1/240‑1 (MQ=255) ggccagtctaAACACCACGACAACCAGAACGACCCATCGAAACTTTTTCACTCCAATCTCCGTTTCACCTACCTTATGTCATTAAACTAGCATGCGTTAGTTAAACAGCGCCTAACTATGTCGATATTCGTGCTTTTTCGGAATGAGTCGCTTGCTTCAGCGCATATTGCCGCTACGATTAAGCGAACATAAAAAGAGAAGCGGTTGTAATGCGATTCATCATTCGCACAGTTATGCTGATAGCACTGGt < 2:220762‑M1/240‑1 (MQ=255) agtctaAACACCACGACAACCAGAACGACCCATCGAAACTTTTTCACTCAAATCTCCGTTTCACCTACCTTATGTCATTAGACTAGCATGCGTTAGTTACACAGCGCCTAACTATGTCGATATTCGTGCTTTTTCGGAATGAGTCGCTTGCTTCAGAGCATATTGCCGCTACGATTAAGCGAAAATAAAAAGAGAAGAGGTTGTAATGCGATTCATCATTCGCACTGTTATGCTGCTAGCACTGGCATgg < 2:496293‑M1/244‑1 (MQ=255) aagcCAACACtggatttgcccctatatttccatacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcctctgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctggtttgggcatgatactgatgtagtcacgctttatcgttttcacgaagctctctgctattccgttactctccggac < 1:127011‑M2/251‑242 (MQ=255) agcCAACACtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcctctgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctggtttgggcatgatactgatgtagtcacgctttatcgttttcacgaagctctctgctattcagttactctccggact < 2:393583‑M2/251‑243 (MQ=255) | CGATACAACCAAAGACGCAATGTTCATCACGCCTGAATTTACAACTTCGTTCATTTCACCACCTCTGAGTAGAGGCGCTATTCTACCACTGCTGGAGAGGAAGAAAATCTAGTGCTGAAAAAATGATATCACCACGGGATAAACTGGTTAATGGCACAAATTCCGCTGAAAAATTGTACATCCTGATCGCACATCATGTTGAATACCTGCGCCCAAAGCAGCAAGCAAGCCAACACCACGACAACCAGAACGACCCATCGAAACTTTTTCACTCCAATCTCCGTTTCACCTACCTTATGTCATTAAACTAGCATGCGTTAGTTAAACAGCGCCTAACTATGTCGATATTCGTGCTTTTTCGGAATGAGTCGCTTGCTTCAGCGCATATTGCCGCTACGATTAAGCGAACATAAAAAGAGAAGAGGTTGTAATGCGATTCATCATTCGCACAGTTATGCTGATAGCACTGGTATGGATA > NC_000913/1908495‑1908972 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |