| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 1,908,726 | IS2 (–) +5 bp | coding (37‑41/144 nt) | mgrB ← | PhoQ kinase inhibitor |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 1651548 | NA (NA) | 26 (0.550) | 25/486 | 0.8 | 100% | noncoding (706/706 nt) | IS2 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 1908730 | 0 (0.000) | coding (37/144 nt) | mgrB | PhoQ kinase inhibitor | |||||
| * | ? | NC_000913 | 1908726 = | 0 (0.000) | 36 (0.760) | 35/486 | 0.4 | 100% | coding (41/144 nt) | mgrB | PhoQ kinase inhibitor |
| ? | NC_000913 | = 2070271 | NA (NA) | noncoding (1/1331 nt) | IS2 | repeat region | |||||
CGATACAACCAAAGACGCAATGTTCATCACGCCTGAATTTACAACTTCGTTCATTTCACCACCTCTGAGTAGAGGCGCTATTCTACCACTGCTGGAGAGGAAGAAAATCTAGTGCTGAAAAAATGATATCACCACGGGATAAACTGGTTAATGGCACAAATTCCGCTGAAAAATTGTACATCCTGATCGCACATCATGTTGAATACCTGCGCCCAAAGCAGCAAGCAAGCCAACACCACGACAACCAGAACGACCCATCGAAACTTTTTCACTCCAATCTCCGTTTCACCTACCTTATGTCATTAAACTAGCATGCGTTAGTTAAACAGCGCCTAACTATGTCGATATTCGTGCTTTTTCGGAATGAGTCGCTTGCTTCAGCGCATATTGCCGCTACGATTAAGCGAACATAAAAAGAGAAGAGGTTGTAATGCGATTCATCATTCGCACAGTTATGCTGATAGCACTGGTATGGATA > NC_000913/1908495‑1908972 | cGATACAACCAAAGACGCAATGTTCATCACGCCTGAATTTACAACTTCGTTCATTTCACCACCTCTGAGTAGAGGCGCTATTCTACCACTGCTGGAGAGGAAGAAAATCTAGTGCTGAAAAAATGATATCACCACGGGATAAACTGGTTAATGGCACAAATTCCGCTGAAAAATTGTACATACTGATCGCACATCATGTTGAATACCTGCGCCCAAAGCAGCAAGCAAGCCAACACtggatttgcccctat < 1:503336‑M2/251‑16 (MQ=255)agATACAACCAAAGACGCAATGTTCATCACGCCTGAATTTACAACGTCGTTCCTTTCACAACGTCTGAGTAGAGGCGCTACTCTACCACTGCTGGAGCGGAAGAAAATCTAGTGCTGAAAACACGCTATCACCAAGGGATAAACCGGTTAACGGCACAAAATCCGCTGAAAAATTGTACACACTAATCGCACATCATGTTGAATACCTGAGCCCAAAGCAGCAAGCACGCCCacactggttttgcctcta > 1:503344/2‑236 (MQ=255) gATACAACCAAAGACGCAATGTTCATCACGCCTGAATTTACAACTTCGTTCATTTCACCACCTCTGAGTAGAGGCGCTATTCTACCACTGCTGGAGAGGAAGAAAATCTCGTGCTGAAAAAATGATATCACCACGGGATAAACTGGTTAATGGCACAAATTCCGCTGAAAAATTGTACATCCTGATCGCACATCATGTTGAATACCTGCGCCCAAAGCAGCAAGCAAGCCAACACtggatttgcccctat < 2:32427‑M2/250‑16 (MQ=255) aactggctggctgctacaccatgttgccgggcaacgagggagaccgtcatccccggttcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttatccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaAACACCACGACAACCAGAACGAc < 1:52277‑M1/23‑1 (MQ=255) ctgctagaccatgttgcccggcaccgggggagaccgtcatccccggttcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagcttcagggggccagtctaAACACCACGACAACCAGAACGACCCATCGAAAc < 2:312221‑M1/33‑1 (MQ=255) gttgccgggcaacgagggagaccgtcatccccggttcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaAACACCACGACAACCAGAACGACCCATCGAAACTTTTTCACTcc > 1:293741‑M1/207‑250 (MQ=255) cgggcaacgagggagaccgtcatcctcggttcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaAACACCACGACAACCAGAACGACCCATCGAAACTTTTTCACTCCAAtctc > 2:148914‑M1/202‑251 (MQ=255) cTGAATTTACAACTTCGTTCATTTCACCACCTCTGAGTAGAGGCGCTATTCTACCACTGCTGGAGAGGAAGAAAATCTAGTGCTGAAAAAATGATATCACCACGGGATAAACTGGTTAATGGCACAAATTCCGCTGAAAAATTGTACATCCTGATCGCACATCATGTTGAATACCTGCGCCCAAAGCAGCAAGCAAGCCAACACtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccatt < 2:244486‑M2/251‑48 (MQ=255) aacgagggagaccgtcatccccggttcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaAACACCACGACAACCAGAACGACCCATCGAAACTTTTTCACTCCAATCTCCGttt > 1:470946‑M1/197‑251 (MQ=255) gagaccgtcatccccggttcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggaacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaAACACCACGACAACCAGAACGACCCATCGAAACTTTTTCACTCCAATCTCCGTTTCacctac > 1:62590‑M1/190‑251 (MQ=255) ccgtcatccccggttcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccggctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatatttgttgtctggagattcagggggccagtctaAACACCACGACAACCAGAACGACCCATCGAAACTTTTTCACTCCAATCTCCGTTTCACCTACCTTa > 1:44228‑M1/186‑251 (MQ=255) cggttcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggacctaagccatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcaattatttaagcgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaAACACCACGACAACCAGAACGACCCATCGAAACTTTTTCACTCCAATCTCCGTTTc < 1:471084‑M1/56‑1 (MQ=255) cggttcaaagctctgctgaacaattgcgagcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactaggattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaAACACCACGACAACCAGAACGACCCATCGAAACTTGTTCACACCAATCTCCGTTTc > 2:471084‑M1/176‑231 (MQ=255) caccacCTCTGAGTAGAGGCGCTATTCTCCCACTGATGGAGCGGAAGAAAATATAGTGCTGAAAAAATGATATCACCACGGGATAAACTGGTTAATGGCACAACTTCCGCTGAAAAATTGTACATCCTGATAGCACATCATGTTGAATACCTGCGCCCAAAGCAGCAAGCAAGCCAACACtggctttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattc < 2:246212‑M2/251‑72 (MQ=255) ggttcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaAACACCACGACAACCAGAACGACCCATCGAAACTTTTTCACTCCAATCTCCGTGTCACCTACCTTATGTCATTAAAc > 2:328684‑M1/175‑251 (MQ=255) tcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaAACACCACGACAACCAGAACGACCCATCGAAACTTTTTCACTCCAATCTCCGTTTCACCTACCTTATGTCATTAAACTa > 1:149276‑M1/172‑250 (MQ=255) caaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaAACACCACGACAACCAGAACGACCCATCGAAACTTTTTCACTCCAATCTCCGTTTCACCTACCTTATGTCATTAAACTAg > 2:368420‑M1/171‑250 (MQ=255) gcTATTCTACCACTGCTGGAGAGGAAGAAAATCTAGTGCTGAAAAAATGATATCACCACGGGATAAACTGGTTAATGGCACAAATTCCGCTGAAAAATTGTACATCCTGATCGCACATCATGTTGAATACCTGCGCCCAAAGCAGCAAGCAAGCCAACACtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataaccca > 1:378467‑M2/1‑160 (MQ=255) ttCTACCACTGCTGGAGAGGAAGAAAATCTAGTGCTGAAAAAATGCTATCACCACGGGATAAACTGGTTAATGGCACAAATTCCGCTGAAAAATTGTACATCCTGATCGCACATCATGTTGACTACCTGCGCCCAAAGCAGCAAGCAAGCCAac > 1:79046/1‑154 (MQ=255) ttCTACCACTGCTGGAGAGGAAGAAAATCTAGTGCTGAAAAAAGGATATCACCACGGGAGAAACTGGTGAAGGGCACAAATTCCGCTGAAAAATGGTACAGCCTGATCGCACATCATGTTGAATACCTGCGCCCAAAGCAGCAAGCAAGCCAac < 2:79046/154‑1 (MQ=255) aCTGCTGGAGAGGAAGAAAATCTAGTGCTGAAAAAATGATATCACCACGGGATAAACTGGTTAATGGCACAAATTCCGCTGAAAAATTGTACATCCTGATCGCACATCATGTTGAATACCTGCGCCCAAAGCAGCAAGCAAGCCAACACtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgc > 1:127664‑M2/1‑149 (MQ=255) ggAGAGGAAGAAAATCTAGTGCTGAAAAAATGATATCACCACGGGATAAACTGGTTAATGGCACAAATTCCGCTGAAAAATTGTACATCCTGATCGCACATCATGTTGAATACCTGCGCCCAAAGCAGCAAGCAAGCCAACACtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggat > 1:203576‑M2/1‑143 (MQ=255) gtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaAACACCACGACAACCAGAACGACCCATCGAAACTTTTTCACTCCAATCTCCGTTTCACCTACCTTATGTCATTAAACTAGCATGCGTTAGTTAAACAGCGCCTAACTATGTc > 1:296798‑M1/138‑249 (MQ=255) agaagaagaAAATCTAGTGCTGAAAAAATGATATCACCACGTGATAAACTGGTTAATGGCACAAAGTCCGCTGAAAAATTGTACATCCTGATCGCACATCATGTTGAATTCCTGCGCCCAAAGCAGCAAGCAAGCCAACACtggatttgcccctagatttccagacagctgtgatcgcttaacccatgacaagcccgctgccggagatagtcgcgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgcca > 2:79807‑M2/1‑141 (MQ=255) gccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaAACACCACGACAACCAGAACGACCCATCGAAACTTTTTCACTCCAATCTCCGTTTCACCTACCTTATGTCATTAAACTAGCATGCGTTAGTTAAACAGCGCCTAACTATGTCGATATTCGTGc > 1:76584‑M1/129‑251 (MQ=255) cgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaAACACCACGACAACCAGAACGACCCATCGAAACTTTTTCACTCCAATCTCCGTTTCACCTACCTTATGTCATTAAACTAGCATGCGTTAGTTAAACAGCGCCTAACTATGTCGATATTCGTGCtt < 2:384662‑M1/125‑1 (MQ=255) cggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatatcggttgtctggagattcagggggccagtctaAACACCACGACAACCAGAACGACCCATCGAAACTTTTTCACTCCAATCTCCGTTTCACCTACCTTATGTCATTAAACTAGCATGCGTTAGTTAAACAGCGCATAACTATGTCGATATTCGTGCTTTTTCGGAATGAGTc < 1:454851‑M1/139‑1 (MQ=255) aTGATATCACCACGGGATAAACTGGTTAATGGCACAAATTCCGCTGAAAAATTGTACATCCTGATCGCACATCATGTTGAATACCTGCGCCCAAAGCAGCAAGCAAGCCAACACtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccatta < 2:147127‑M2/162‑49 (MQ=255) aTGATATCACCACGGGATAAACTGGTTAATGGCACAAATTCCGCTGAAAAATTGTACATCCTGATCGCACATCATGTTGAATACCTGCGCCCAAAGCAGCAAGCAAGCCAACACtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccatta > 1:147127‑M2/1‑114 (MQ=255) gggATAAACTGGTTAATGGCACAAATTCCGCTGAAAAATTGTACATCCTGATCGCACATCATGTTGAATACCTGCGCCCAAAGCAGCAAGCAAGCCAACACtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcctctgcaaggttctttgct > 1:29436‑M2/1‑101 (MQ=255) ttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaAACACCACGACAACCAGAACGACCCATCGAAACTTTTTCACTCCAATCTCCGTTTCACCTACCTTATGTCATTAAACTAGCATGCGTTAGTTAAACAGCGCCTAACTATGTCGATATTCGTGCTTTTTCGGAATGAGTCGCTTGCTTCAGCGCATATTGCCGc < 2:115639‑M1/163‑1 (MQ=255) cTGGTTAATGGCACAAATTCCGCTGAAAAATTGTACATCCTGATCGCACATCATGTTGAATACCTGCGCCCAAAGCAGCAAGCAAGCCAACACtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcctctgcaaggttctttgctgccgtta < 1:102914‑M2/250‑158 (MQ=255) ccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagttatattggttgtctggagattcagggggccagtctaAACACCACGACATCCAGAACGACCCATCGAAACTTTTTCACTCCAATCTCCGTTTCACCTACCTTATGTCATTAAACTAGCATGCGTTAGTTAAACAGCTCCTAACTATGTCGATATTCGTGCTTTTTCGGAATGAGTCGCTTGCTTCAGCGCATATTGCCGCTa > 1:312715‑M1/85‑249 (MQ=255) tAATGGCACAAATTCCGCTGAAAAATTGTACATCCTGATCGCACATCATGTTGAATACCTGCGCCCAAAGCAGCAAGACAGCCAACACtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgactctgcaaggttctttgctgccgttaacccgt < 1:207389‑M2/251‑164 (MQ=255) ggCACAAATTCCGCTGAAAAATTGTACATCCTGATCGCACATCATGTTGAATACCTGCGCCCAAAGCAGCAAGCAAGCCAACACtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcctctgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctg > 2:170688‑M2/1‑84 (MQ=255) ctagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaAACACCACGACAACCAGAACGACCCATCGAAACTTTTTCACTCCAATCTCCGTTTCACCTACCTTATGTCATTAAACTAGCATGCGTTAGTTAAACAGCGCCTAACTATGTCGATATTCGTGCTTTTTCGGAATGAGTCGCTTGCTTCAGCGCATATTGCCGCTACGATTAAGc < 1:417050‑M1/174‑1 (MQ=255) ctaaaaactagtattaagcctatcacttatttacgtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaAACACCACTACAACCAGAACGACCCATCGAAACTTTTTCACTCCAATCTCCGTTTCACCTACCTTATGTCATTAAACTAGCATGCGTTAGTTAAACAGCGCCTAACTATGTCGATATTCGTGCTTTTTCGGAATGAGTCGCTTGCTTCAGCGCATATTGCCGCTACGATTAAGCGAAc < 2:46926‑M1/178‑1 (MQ=255) taaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaAACACCACGACAACCAGAACGACCCATCGAAACTTTTTCACTCCAATCTCCGTTTCACCTACCTTATGTCATTAAACTAGCATGCGTTAGTTAAACAGCGCCTAACTATGTCGCTATTCGTGCTTTTTCGGGATGAGTCGCTTGCTTCAGCGCATATTGCCGCTACGATTAAGCGAACAt < 2:5124‑M1/180‑1 (MQ=255) gaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgactggagattaagggggccagtattAACACCACGACAACCAGAACGACCCATCGAAACTTTTGCTCTCCACTCTCCGTTTCACCTACCTTATGTCATTACACTAGCATGCGTTAGTTAAACAGCGACTAACTATGTCGATATTCGTGTTTTTTCGGACTGAGTCGCTTGCTTCAGCGCATATTGCCGCTAAGATTAAGCGaacct < 2:5082‑M1/180‑3 (MQ=255) aaactagtattaagactatcacttatttaagtgagattggttgtctggagattcagggtgccagtctaAACACCACGACAACCAGAACGACCCATCGAAACTTTTTCACTCCAATCTCCGTTTCACCTACCTTATGTCATTAAACTAGCATGCGTTAGTTAAACAGCGCCTAACTATGTCGATATTCGTGCTTTTTCGGAATGAGTCGCTTGCTTCAGCGCATATTGCCGCTACGATTAAGCGAACATaaa > 1:51134‑M1/69‑251 (MQ=255) aactagtattaagtctatcacttatttaagagatattggttgtctggagattcagggggccagtctaTACACAACGACAACCAGAACGACCCGTCGAAACTTTTTCACTCCAATCTCCGTTTCACCTACCTTATGTCATTAAACTAGCATGCGTTCGTTAAACAGCGCCTAACTATGTCGTTATTAGTGCTTTTTCGGAATGAGTCGCTTGCTTAAGCGCATATTGCCGCTACGATTAAGCGAACATaaa < 2:262806‑M1/183‑1 (MQ=255) attaagtctatcacttatttaagtgatattggttgtcttgagattcagggggccagtctaAACACCACGACAACCAGAACGACCCATCGAAACTTTTTCACTCCAATCTCCGTTTCACCTACCTTATGTCATTAAACTAGCATGCGTTAGTTAAACAGCGCCTAACTATGTCGATATTCGTGCTTTTTCGGAATGAGTCGCTTGCTTCAGCGCATATTGCCGCTACGATTAAGCGAACATAAAaagagaa > 1:487405‑M1/61‑250 (MQ=255) agactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaAACACCACGACAACCAGAACGACCCATCGAAACTTTTTCACTCCAATCTCCGTTTCACCTACCTTATGTCATTAAACTAGCATGCGTTAGTTAAACAGCGCCTAACTATGTCGATATTCGTGCTTTTTCGGAATGAGTCGCTTGCTTCAGCGCATATTGCCGCTACGATTAAGCGAACATAAAAAGAGAAGAGGt < 1:214200‑M1/195‑1 (MQ=255) agactatcacttatttaaggtatattggttggctggagagtcagggggccagtataAACACCACGACAACCAGAACGACCCATCGAATCTTTGTCACTCCAATCTCCGTTTCACCTACCTTATGTCATTAAACTAGCATGCGTTAGTTAAACAGCGCCTAACTATGTCGAAACTCGTGCTTTTTCGGAATGAGTCGCTTGCTTCAGCGCATATTGCCGCTACGATTAAGCGAACATAAAAGGCGAAGAGGt > 2:180485‑M1/57‑251 (MQ=255) aCATCCTGATCGCACATCATGTTGAATACCTGCGCCCAAAACAGCAAGCAAGCCAACACtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcatatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcctctgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctggtttgggaatgatactgaatcagtc < 2:366016‑M2/250‑192 (MQ=255) ccTGATCGCACATCATGTGGAATACCTGCGCCCAAAGCAGCAAGCAAGCCAACACgggatttgccccgatatttccagacattggttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcgtatgccagtcgttataatgctcgaacgcctctgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctggtttgggcatgatactgatgtagtcacgct > 2:368493‑M2/1‑55 (MQ=255) ccttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaAACACCACGACAACCAGAACGACCCATCGAAACTTTTTCACTCCAATCTCCGTTTCACCGACCTTATGTCATTAAACTAGCATGCGTTAGTTAAACAGCGCCTAACTATGTCGATATTCGTGCTGTTTCGGAATGAGTCGCTTGCTTCAGCGCATATTGCCGCTACGATTAAGCGAACATAAAGAGAGAAGAGGTTGTAATGc > 1:433120‑M1/49‑251 (MQ=255) aTCGCACATCATGTTGAATACCTGCGCCCAAAGCAGCAAGCAAGCCAACACtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcctctgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctggtttgggcatgatactgatgtagtcacgctttat < 1:343796‑M2/251‑201 (MQ=255) gCACATCATGTTGAATACCTGCGCCCAAAGCAGCAAGCAAGCCAACACtggatttgccactatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcctctgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctggtttgggcatgatactgctgtagtcacgctttatcgt < 2:214594‑M2/251‑204 (MQ=255) agtgatattggttgtctagagattcagggggccagtctaAACACCACGACAACCAGAACGACCCATCGAAACTTTTTCACTCCAATCTCCGTTTCACCTACCTTATGTCATTAAACTAGCATGCGTTAGTTAAACAGCGCCTAACTATGTCGATATTCGTGCTTTTTCGGAATGAGTCGCTTGCTTCAGCGCATATTGCCGCTACGATTAAGCGAACATAAAAAGAGAAGAGGTTGTAATGCGATtcatc < 1:391764‑M1/211‑1 (MQ=255) catTTTGAATACCTGCGCCCAAAGCATCAAGCAAGCCAACACtggatttgcccctatatttccagacatctgttatctcttaacccattacaagcccgctgacgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcctctgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctggtttgggcatgatactgatgtagtcacgctttatcgttttcac > 2:503336‑M2/1‑42 (MQ=255) catGTTGAATACCTGCGCCCAAAGCAGCAAGCAAGCCAACACtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcctctgcaaggctctttgctgccgttaacccgtctggtttgggcatgatactgatgtagtcacgctttatcgttttcac < 1:15707‑M2/251‑210 (MQ=255) atattggttgtctggagattcagggggccagtctaAACACCACGACAACCAGAACGACCCATCGAAACTTTTTCACTCCAATCTCCGTTTCACCTACCTTATGTCATTAAACTAGCATGCGTTAGTTAAACAGCGCCTAACTATGTCGATATTCGTGCTTTTTCGGAATGAGTCGCTTGCTTCAGCGCATATTGCCGCTACGATTAAGCGAACATAAAAAGAGAAGAGGTTGTAATGCGATTCATCATTCg < 1:400288‑M1/216‑1 (MQ=255) gtgggtgtctggagagtcaggggtccagtcaaAACACCACGACAACCAGAACGACCCATCGAAACTTTTTCACTCCAATCTCCGTTTCTCCTACCTTATGTCATTAATCTAGCATTCGTTAGTTAAACAGCGCCGATCTATGGCGAGATTCGTGCTTTTTCGGAATGAGTCGCTTGCTGCAGCGCATATTGCCGCTACGATTAAGCGAACATAAAAAGAGAAGAGGTTGTAATGCGATTCATCATTCGca > 1:444584‑M1/33‑250 (MQ=255) tggagattcaggtgtccagtctaAACACCACGACAACCAGAACGACCCATCGAAACGTTTTCACTCCAATCTCCGTTTCACCTACCTTATGTCATGAAACTAGCATGCGTTAGTTAAACAGCGCCTAACTATGTCGatat > 2:297985‑M1/24‑140 (MQ=255) tggagattcagggggccagtctaAACACCACGACAACCAGAACGACCCATCGCAACTTTTTCACTCCACTCTACGTTTCACCTACCTTATGTCATTAAACTAGCATGCGTTAGTTAAACAGCGCCTAACTATGTCGatat < 1:297985‑M1/117‑1 (MQ=255) ccAAAGCAGCAAGCAAGCCAACACtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccagtacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcctctgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctggtttgggcatgatactgatgtagtcacgctttatcgttttcacgaagctctctgctattcc > 1:250095‑M2/1‑24 (MQ=255) ccAAAGCAGCAAGCAAGCCAACACtggatttgcccctatatttccagacagctgttatcccttaacccagtacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcgtatgccattcgttataatgctcgaacgcctctgcaaggttcttttctgccgttaacccgtctggtttgggcatgatactgatgtagtcacgctttatcgttgtcacgaagctctctgctattcc > 1:68729‑M2/1‑24 (MQ=255) aaaGCAGCAAGCAAGCCAACACtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcctctgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctggtttgggcatgatactgatgtagtcacgctttatcgttttcacgaagctctctgctattccgt < 2:63798‑M2/251‑230 (MQ=255) aaGCAGCAAGCAAGCCAACACtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcctctgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctggtttgggcatgatactgatgtagtcacgctttatcgttttcacgaagctctctgctattccgtt < 2:476720‑M2/251‑231 (MQ=255) gggccagtctaAACACCACGACAACCAGAACGACCCATCGAAACTTTTTCACTCCAATCTCCGTTTCACCTACCTTATGTCATTAAACTAGCATGCGTTAGTTAAACAGCGCCTAACTATGTCGATATTCGTGCTTTTTCGGAATGAGTCGCTTGCTTCAGCGCATATTGCCGCTACGATTAAGCGAACATAAAAAGAGAAGAGGTTGTAATGCGATTCATCATTCGCACAGTTATGCTGATAGCACTGGt < 2:359026‑M1/240‑1 (MQ=255) ggccagtctaAACACCACGACAACCAGAACGACCCATCGAAACTTTTTCACTCCAATCTCCGTTTCACCTACCTTATGTCATTAAACTAGCATGCGTTAGTTAAACAGCGCCTAACTATGTCGATATTCGTGCTTTTTCGGAATGAGTCGCTTGCTTCAGCGCATATTGCCGCTACGATTAAGCGAACATAAAAAGAGAAGCGGTTGTAATGCGATTCATCATTCGCACAGTTATGCTGATAGCACTGGt < 2:220762‑M1/240‑1 (MQ=255) agtctaAACACCACGACAACCAGAACGACCCATCGAAACTTTTTCACTCAAATCTCCGTTTCACCTACCTTATGTCATTAGACTAGCATGCGTTAGTTACACAGCGCCTAACTATGTCGATATTCGTGCTTTTTCGGAATGAGTCGCTTGCTTCAGAGCATATTGCCGCTACGATTAAGCGAAAATAAAAAGAGAAGAGGTTGTAATGCGATTCATCATTCGCACTGTTATGCTGCTAGCACTGGCATgg < 2:496293‑M1/244‑1 (MQ=255) aagcCAACACtggatttgcccctatatttccatacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcctctgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctggtttgggcatgatactgatgtagtcacgctttatcgttttcacgaagctctctgctattccgttactctccggac < 1:127011‑M2/251‑242 (MQ=255) agcCAACACtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcctctgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctggtttgggcatgatactgatgtagtcacgctttatcgttttcacgaagctctctgctattcagttactctccggact < 2:393583‑M2/251‑243 (MQ=255) | CGATACAACCAAAGACGCAATGTTCATCACGCCTGAATTTACAACTTCGTTCATTTCACCACCTCTGAGTAGAGGCGCTATTCTACCACTGCTGGAGAGGAAGAAAATCTAGTGCTGAAAAAATGATATCACCACGGGATAAACTGGTTAATGGCACAAATTCCGCTGAAAAATTGTACATCCTGATCGCACATCATGTTGAATACCTGCGCCCAAAGCAGCAAGCAAGCCAACACCACGACAACCAGAACGACCCATCGAAACTTTTTCACTCCAATCTCCGTTTCACCTACCTTATGTCATTAAACTAGCATGCGTTAGTTAAACAGCGCCTAACTATGTCGATATTCGTGCTTTTTCGGAATGAGTCGCTTGCTTCAGCGCATATTGCCGCTACGATTAAGCGAACATAAAAAGAGAAGAGGTTGTAATGCGATTCATCATTCGCACAGTTATGCTGATAGCACTGGTATGGATA > NC_000913/1908495‑1908972 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |