| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| JC JC | NC_000913 | 3,729,449 | IS1 (+) +9 bp | noncoding (89‑97/160 nt) coding (1309‑1317/1323 nt) |
xylZ ← xylA ← |
small RNA XylZ xylose isomerase |
| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_000913 | 3729449 = | 0 (0.000) | noncoding (97/160 nt) coding (1317/1323 nt) |
xylZ xylA |
small RNA XylZ xylose isomerase |
|||||
| * | ? | NC_000913 | 3583428 = | NA (NA) | 92 (2.070) | 82/484 | 0.0 | 100% | noncoding (1/768 nt) | IS1 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 3729457 | 0 (0.000) | noncoding (89/160 nt) coding (1309/1323 nt) |
xylZ xylA |
small RNA XylZ xylose isomerase |
|||||
Only 100 of 168 total aligned reads displayed.
TTCATTGCGCGATCAGTTGCCTGCCACCACTGTTCCGGGTCTTGTTCCGACCAGAGTGGATGCGGGCGCGAAACGGTCAGCTTTTCCGTTTGCGCAGCAACCACCTCACCCTGCTCGTTGAGCAAAATAACTTTTACGCCCGAGGTGCCAAGATCTATCCCGATATACATATCGATCGTTCCTTAAAAAAATGCCCGGTATCGCTACCGATAACCGGGCCAACGGACTGCACAGTTAGCCGTTATTTGTCGAACAGATAATGGTTTACCAGATTTTCCAGTTGTTCCTGGCGACCACTCTGATGCACCGGAGACAAATGATGTTCCTGAGCATATTTGGCTAAATCTGCCAGTGACATTTGGCCTTTCAGGATTTGCTGGCCCAATTCGCTATTCCAGCCGGAATAACGCTGCGCGATGCGTTTATCCAGCTCGCCATCTTCAATCATGCGCGCTGCAATTTTCAGCGCCAGTGCCATCGTATCCATCGCGCCGATAT > NC_000913/3729202‑3729699 | accctttgacgtggtgatatggatgacggatggctggccgctgtatgaatcccgcctgaagggaaagctgcacgtaatcagcaagcgatatacgcagcgaattgcgcggcataacctgaatctgaggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccGTCg > 1:232599‑M2/248‑251 (MQ=255) aTTGCGCGATCAGTTGCCTGCCACCACTGTTCCGGGTCTTGTTCCGACCAGAGTGGATGCGGGCGCGAAACGGTCAGCTTTTCCGTTTGCGCAGCAACCACCTCACCCTGCTCGTTGAGCAAAATAACTTTTACGCCCGAGGTGCCAAGATCTATCCCGATATACATATCGATCGTTCCTTAAAAAAATGCCCGGTATCGCTACCGATAACCGGGCCAACGGACTGCACAGTTAGCCGTTATTTGTCGAAc > 1:205010/1‑251 (MQ=255) gcgcGATCAGTTGCCTGCCACCACTGTTCCGGGTCTTGTTCCGACCAGAGTGGATGCGGGCGCGAAACGGTCAGCTTTTCCGTTTGCGCAGCAACCACCTCACCCTGCTCGTTGAGCAAAATAACTTTTACGCCCGAGGTGCCAAGATCTATCCCGATATACATATCGATCGTTCCTTAAAAAAATGCCCGGTATCGCTACCGATAACCGGGCCAACGGACTGCACAGTTAGCCGTTATTTGTCGAACAg < 2:80655/250‑1 (MQ=255) cgcgATCAGTTGCCTGCCACCACTGTTCCGGGTCTTGTTCCGACCAGAGTGGATGCGGGCGCGAAACGGTCAGCTTTTCCGTTTGCGCAGCAACCACCTCACCCTGCTCGTTGAGCAAAATAACTTTTACGCCCGAGGTGCCAAGATCTATCCCGATATACATATCAATCGTTCCTTAAAAAAATGCCCGGTATCGCTACCGATAACCGGGCCAACGGACTGCACAGTTAGCCGTTATTTGTCGAACAgtg < 2:246164/251‑3 (MQ=255) 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ccaccaCTGTTCCGGGTCTTGTTCCGACCAGAGTGGATGCGGGCGCGAAACGGTCAGCTTTTCCGTTTGCGCAGCAACCACCTCACCCTGCTCGTTGAGCAAAATAACTTTTACGCCCGAGGTGCCAAGATCTATCCCGATATACATATCGATCGTTCCTTAAAAAAATGCCCGGTATCGCTACCGATAACCGGGCCAACGGACTGCACAGTTAGCCGTTATTTGTCGAACAGggtgatgctgccaactt < 2:363857‑M2/250‑18 (MQ=255) gacggatggctggccgctgtatgaatcccgcctgaagggaaagctgcacgtaatcagcaagcgatatacgcagcgaattgagcggcataacctgaatctgaggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccGTCGAACAGATAATGGTTTACCAGAtt < 1:114578‑M2/27‑1 (MQ=255) acggatggctggccgctgtatgaatcccgcctgaagggaaagctgcacgtaatcagcaagcgatatacgcagcgaattgagcggcataacctgaatctgaggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccGTCGAACAGATAATGGTTTACCAGAtttt < 2:213057‑M2/29‑1 (MQ=255) cggatggctggccgctgtatgaatcccgcctgaagggaaagctgcacgtaatcagcaagcgatatacgcagcgaattgagcggcataacctgaatctgaggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccGTCGAACAGATAATGGTTTACCAGATTTTc < 2:363032‑M2/30‑1 (MQ=255) ccacTGTTCCGGGTCTTGTTCCGACCAGAGTGGATGCGGGCGCGAAACGGTCAGCTTTTCCGTTTGCGCAGCAACCACCTCACCCTGCTCGTTGAGCAAAATAACTTTTACGCCCGAGGTGCCAAGATCTATCCCGATATACATATCGATCGTTCCTTAAAAAAATGCCCGGTATCGCTACCGATAACCGGGCCAACGGACTGCACAGTTAGCCGTTATTTGTc > 1:213468/1‑224 (MQ=255) atggcgagccgctgtatgaatcccgcctgcagggcaagctgcacgtaatcagcaagcgatatacgcagcgccttgagcggcatcacctgactctgaggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcattctcacaatcagtggagctgcatggcaaagtcatcgggcattatctgcacataaaacactatcaatacgttggagtcatgaccGGCGACCAGATCATGGTTTACCAGATTTTcc > 2:418997‑M2/219‑249 (MQ=255) 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tCCGACCAGAGTGGATGCGTGCGCGAAACGGTCAGCTTTTCCGTTTGCGCAGCAACCACCTCACCCTGCTCGTTGAGCAAAATAACTTTTACGCCCGAGGTGCCAAGATCTATCCCGATATACATATCGATCGTTCCTTAAAAAAATGCCCGGTATCGCTACCGATAACCGGGCCAACGGACTGCACAGTTAGCCTTTATTTGTCTAACAGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtattatggtg > 2:37231‑M2/1‑211 (MQ=255) gACCAGAGTGGATGCGGGCGCGAAACGGTCAGCTTTTCCGTTTGCGCAGCAACCACCTCACCCTGCTCGTTGAGCAAAATAACTTTTACGCCCGAGGTGCCAAGATCTATCCCGATATACATATCGATCGTTCCTTAAAAAAATGCCCGGTATCGCTACCGATAACCGGGCCAACGGACTGCACAGTTAGCCGTTATTTGTCGAACAGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttt < 1:392333‑M2/251‑44 (MQ=255) ccgcctgaagggaaagctgcacgtaatcagcaagcgatatacgcagcgaattgagcggcataacctgaatctgaggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccGTCGAACAGATAATGGTTTACCAGATTTTCCAGTTGTTCCTGGCGACCACTCTg > 1:308604‑M2/197‑250 (MQ=255) agagTGGATGCGGGCGCGAAACGGTCAGCTTTTCCGTTTGCGCAGCAACCACCTCACCCTGCTCGTTGAGCAAAATAACTTTTACGCCCGAGGTGCCAAGATCTATCCCGATATACATATCGATCGTTCCTTAAAAAAATGCCCGGTATCGCTACCGATAACCGGGCCAACGGACTGCACAGTTAGCCGTTATTTGTCGAACAGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgag > 2:233420‑M2/1‑204 (MQ=255) agagTGGATGAGAGCGAGTAACGGTCAGCTTTCCAGTTTGCGCAGAAACCACCTCACCATGCTCGTTGCGCAAAATACATTTTACGCCCGAGGTGCCACGGTCTCTCCCGATATACATATCGATAGTTCCTTAAAAAAATGCCCGGTATCGCTACCGCTAACCGGGCCAACGGACTGCACAGTTAGCCGTTATTTGTCGAACAGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttg < 2:213137‑M2/249‑46 (MQ=255) ggATGCGGGCGCGAAAAGGTCAGCTTTTCCGATTGCGCAGCAACCACCTCACCCTGATCGTTGAGCAAAATAACTTTTACGCCAGAGGAGCCAAGATCTATCACGATATACATATCGATAGTTCCTTAAAAAAATGCCCGGTATCGCTACCGATAAACGGGCCAACGGACTGCACAGTTAGCCGTTATTTGTCGAACAGggtgatgctgccaacttaatgatttagtgaatgatggtgtttttgaggcgat < 1:238713‑M2/251‑53 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |