| New junction evidence | |||||||||||
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gggataagtgctaacagatgtctggaaatataggggcaaatccaGGCTGTTGATGATTGCATAGATAACCACGCCAAATACGCCCAGCAGGAACAGCCAGACGGACGTTTTTTCACCGGATTTGATTTCAATCTGCTTTTCACCGCGCAGTTCAACCAGGCACTCTTCCAGACGCTTGCGGTAAATCGGAGCTTCATAGAGTTTGGAGTTGAAAATCATAGTGACCAGGAAGGACATCGTCAGAACCGcc < 2:230917‑M1/206‑1 (MQ=255) ggtgTTCATCAGCGGTTTTTCAACCAGACCCATGCTTGGGCTGtagactggccccctgaatctccagacaaccaatatcacttaaataagtgatagtcttaatactagtttttagactagtcattggagaacagatgattgatgtcttagggccggagaaacgcagacggcgtaccacacaggaaaagatcgcaattgttcagcagagctttgaaccggggatgacggtctccctcgttgcccggcaacat < 1:304244‑M2/251‑209 (MQ=255) catcaGCGGTTTTTCAACCAGACCCATGCTTGGGCTGtcgactggccccctgaatctccagacaaccaatatcacttaaataagtgatagtcttaatactagtttttagactagtcattggagaacagatgattgatgtcttagggccggagaaacgcagacggcgtaccacacaggaaaagatcgcaattgttcagcagagctttgaaccggggatgacggtctccctcgttgcccggcaacatggtgt < 1:130563‑M2/250‑214 (MQ=255) 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gCTTGGGCTGTTGATGATGGCATAGATAACCACGCAAACTACGCCCAGCAGGAACAGCCAGACGGACGTTTTTGCACCGGATTTGATTTCAATCTGCTTTTCACCGCGCAGTTCAACCAGGCCTTCTGCCAGACGCTTGCGATAAATCGGATCGTCAGAGAGTTTGGATTTGAACAGCATAGTGACCAGGAAGGACATCACCAGAACCGCCAGCAGGGTGGACGGGATGACCACGGAGAGCAGATGGAgg < 1:291282/250‑1 (MQ=255) gggCTGTGGAGGATGGCATAGATACCCCCGCAAACTACGCCCAGCAGGAACAGCCAGCCGGACGTTTTTGCACCGGATTTGATTCCAATCTGCTTTTCCCCCCGCAGTCCACCCAGGCCCTCTCCCAGACGCTGGCGATAAATCGGATCGTCAGAGAGTTTGGAGTTGAACAGCATAGTGACCAGGAAGGACATCACCAGAACCGCCAGCAGGGTGGACGGGATGACCACGGAGAGCAGATGGAAGTAGCt < 1:122666/251‑1 (MQ=255) gCTGTTGATGATTGCATAGATAACCACGCCAACTACGCCCAGCAGGAACAGCCAGACGGACGTTTTTGCACCGGATTTGATTTCAATCTGCTTTTCACCGCGCAGTTCAACCAGGCCCTCTTCCAGACGCTTGCGATAAATCGGATCGGCAGAGAGTTTGGAGTTGAACAGCATAGTGACCAGGAAGGACATCACCAGAACCGCCAGCAGGGTGGACGGGATGACCCCGGAGAGCAGATGGAGGTAGcgg > 2:46863/1‑248 (MQ=255) | CCTGAATCACTTCACCAGCGGTATCTTTGATCCAGTCGATGTTGTTGGAAACGAAAGTATCGCCCAGCCACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGATGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATTGCGTTGGTGGTGTTCATCAGCGGTTTTTCAACCAGACCCATGCTTGGGCTGTTGATGATTGCATAGATAACCACGCCAACTACGCCCAGCAGGAACAGCCAGACGGACGTTTTTGCACCGGATTTGATTTCAATCTGCTTTTCACCGCGCAGTTCAACCAGGCCCTCTTCCAGACGCTTGCGATAAATCGGATCGTCAGAGAGTTTGGAGTTGAACAGCATAGTGACCAGGAAGGACATCACCAGAACCGCCAGCAGGGTGGACGGGATGACCACGGAGAGCAGATGGAGGTAGCTG > NC_000913/4365792‑4366288 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |