| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 2,698,402 | IS30 (+) +2 bp | coding (148‑149/636 nt) | pgpC ← | phosphatidylglycerophosphatase C |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 1470516 | NA (NA) | 31 (0.770) | 31/492 | 0.3 | 96.9% | noncoding (1221/1221 nt) | IS30 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 2698402 = | 1 (0.030) | coding (149/636 nt) | pgpC | phosphatidylglycerophosphatase C | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 2698403 | 1 (0.020) | 31 (0.760) | 28/496 | 0.4 | 96.9% | coding (148/636 nt) | pgpC | phosphatidylglycerophosphatase C |
| ? | NC_000913 | = 4508679 | NA (NA) | noncoding (1/1221 nt) | IS30 | repeat region | |||||
ACAGTGTCAGGTGAGCTACAGCCCGCTTACGCTCATGGGGTTTTATGCCGCCAGTATCCCTTAACATAGTGAAGATCGTTCCGGGTTTTGAACCCAGGATATTCGCTATTTCACTGAAGCCTGTTCCGTTCTTCCATAGTTCAAAAACAGAGGCTTTTTCCTCTGCTGTAAATGTTCGTCTCATTCAAAAAACCTCCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAGTTGCTTTTTTTAATATATCTCGCTCAAGGCGAGCTTCATTTAACGCCTTACGCAGTTGCAGAATTTCAGATTCCAGTTCAGCCACCGTGCGGGAACCAGGAGTACCGAGCCCTTTTCTGGCGGCGGTAACCCATTGTCCTAAAGTGCCTTCAGGAAGAGATAATCGGGAAGCGCCTTCACTGATCGAAAGTTGATTTTCAAGAACCGTTCTGACAGCTTCGGCTTTGAACTTTTTAGAGTAACGTTGG > NC_000913/4508434‑4508928 | aCAGTGTCAGGTGAGCTACAGCCCGCTTACGCTCATGGGGTTTTATGCCGCCAGTATCCCTTAACATAGTGAAGATCGTTCCGGGTTTTGAACCCAGGATATTCGCTATTTCACTGAAGCCTGTTCCGTTCTTCCATAGTTCAAAAACAGAGGCTTTTTCCTCTGCTGTAAATGTTCGTCTCATTCAAAAAACCTCCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAGTTGc > 1:227153/1‑251 (MQ=31) aCAGCCCGCTTACGCTCATGGGGTTTTATTCCGCCATGATCCATTAACATAGTGAATATCGTTTCTGGTTCTTAACCCAGGATATCCGTTATTTCACTTGAGCCTCCTCCGTTCTTCCATAGTTCAAAAACAGAGGCTCCTCCCTCTGCTGTAAATGTTCGACTCATTCAAAAAACCTCCGCCACCACATGGTTTCCCATAACTGTTGTGTTGACGGATTGAATCCCAAGTTACTTTCTTTAatatctca < 2:68996/250‑5 (MQ=2) gCCCGCTTACGCTCATGGGGTTTTATGCCGCCAGTATCCCTTAACATAGTGAAGATCGTTCCGGGTTTTGAACCCAGGATATTCGCTATTTCACTGAAGCCTGTTCCGTTCTTCCATAGTTCAAAAACAGAGGCTTTTTCCTCTGCTGTAAATGTTCGTCTCATTCAAAAAACCTCCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAGTTGCTTTTTTTAATATATCTCGCt < 1:157372/251‑1 (MQ=37) cccGCTTACGCTCATGGGGTTTTATGCCGCCAGTATCCCTTAACATAGTGAAGATCGTTCCGGGTTTTGAACCCAGGATATTCGCTATTTCACTGAAGCCTGTTCCGTTCTTCCATAGTTCAAAAACAGAGGCTTTTTCCTCTGCTGTAAATGTTCGTCTCATTCAAAAAACCTCCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAGTTGCTTTTTTTAATATATCTCGCTc < 1:119161/251‑1 (MQ=37) ggTTTTATGCCGCCAGTATCCCTTAACATAGTGCCGATCGTTCCGGGTTTTGAACCAAGGATATTCGCTATTTCACTGAAGCCTGTTCCGTTCTTCCATAGTTCAAAAACAGAGGCTTTTTCCTATGCTGTAAATGTTCGTCTCATTCAAAAAACCTCCGCACCCCCATGTTTTCACATCACTGTTGCGTTGACCAATTGCATCTACAGTTGCTTTTTTTATTATATCTCGCTACAGGCGAGCTTCAtttt > 2:173605/1‑250 (MQ=14) tttATGCCGCACGTATCCCTTAACATAGTGAAGATCGTTCCGGGTTTTGAACCCAGGATATTCGCTATTTCACTGAAGCCTGTTCCGTTCTTCCATAGTTCAAAAACAGAGGCTTTTTCCTCTGCTGTAAATGTTCGTCTCATTCAAAAAACCTCCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAGTTGCTTTTTTTAATATATCTCGCTCAAGGCGAGCTTCATTTAAc < 2:72273/250‑1 (MQ=255) tGCCGCCAGTATCCCTTAACATAGTGAAGATCGTTCCGGGTTTTGAACCCAGGATATTCGCTATTTCACTGAAGCCTGTTCCGTTCTTCCATAGTTCAAAAACAGAGGCTTTTTCCTCTGCTGTAAATGTTCGTCTCATTCAAAAAACCTCCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAGTTGCTTTTTTTAATATATCTCGCTCAAGGCGCGCTTCATTTAACGCCtt > 1:336527/1‑251 (MQ=255) gccgacAGTATCCCTTAACATAGTGAAGATCGTTCCGGGTTTTGAACACAGGATATTCGCTATTTCACTGAAGCCTGTTCCGTTCTTCCATAGTTCAAAAACAGAGGCTTTTTCCTCTGCTGTAAATGTTCGTCTCATTCAAAAAACCTCCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAGTTGCTTTTTTTAATATATCTCGCTCAAGGCGAGCTTCATTTAACGCCtt < 2:228714/250‑1 (MQ=255) gTATCCCTTAACATAGTGAAGATCGTTCCGGGTTTTGAACCCAGGATATTCGCTATTTCACTGAAGCCTGTTCCGTTCTTCCATAGTTCAAAAACAGAGGCTTTTTCCTCTGCTGTAAATGTTCGTCTCATTCAAAAAACCTCCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTGGCGTTGACCAATTGAATCTGCAGTTGCTTTTTTTAATATATCTCGCTCAAGGCGAGCTTCATTTAACGCCGTACGCAGtt < 2:377951/251‑1 (MQ=255) aGTGAAGATCGTTCCGGGTTTTTAACCCAGGATATTCGCTATTTCACTGAAGCCTGTTCCTTTCTTCCATAGTTCAAAAACAGAGGCTTTTTCCTCTGCTGTAAATGTTCGTCTCATTCAAAAAACCTCCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTGCAGTTGCTTTTGTTAATATATCTCGCTCAAGGCGAGCTTCATTTAACGCCTTACGCAGTTGCAGAGTTTCAGa < 2:226762/250‑1 (MQ=255) ccGGGTTTTGAACCCAGGATATTCGCTATTTCACTGAAGCCTGTTCCGTTCTTCCATAGTTCAAAAACAGAGGCTTTTTCCTCTGCTGTAAATGTTCGTCTCATTCAAAAAACCTCCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAGTTGCTTTTTTTAATATATCTCGCTCAAGGCGAGCTTCATTTAACGCCTTACGCAGTTGCAGAATTTCAGATTCCAGTTCAGCCa < 1:66008/251‑1 (MQ=255) tttGAACCCAGGATATTCGCTATTTCACTGAAGCCTGTTCCGTTCTTCCATAGTTCAAAAACAGAGGCTTTTTCCTCTGCTGTAAATGTTCGTCTCATTCAAAAAACCTCCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAGTTGCTTTTTTTAATATATCTCGCTCAAGGCGAGCTTCATTTAACGCCGTACGCAGTTGCAGAATTTCAGATTCCAGTTCAGCCACCGTg < 1:178660/250‑1 (MQ=255) aagATATTCGCTATTTCACTGAAGCCTGTTACGTTCTTCCATAGATCAAAAACAGAGGCTTTTTCCTCTGCTGTAAATGTTCGTCTCATTCAAAAAACCTCCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACAAATTGAATCTACAGTTGCTTTTTTTAATATATCTCGCTCAAGGCGAGCTTCATTTAACGCCTTACGCAGTTGCAGAATTTCAGATTCCAGTTCCGCCACCGTACGGGAAcc > 1:433013/3‑249 (MQ=255) aGGATATTCGCTATTTCACTGAAGCCTGTTCCGTTCTTCCATAGTTCAAAAACAGAGGCTTTTTCCTCTGCTGTAAATGTTCGTCTCATTCAAAAAACCTCCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAGTTGCTTTTTTTAATATATCTCGCTCAAGGCGAGCTTCATTTAACGCCTTACGCAGTTGCAGAATTTCAGATTCCAGTTCAGCCACCGTGCGGGAAcc > 1:79563/1‑249 (MQ=255) ggATATTCTCTAGTTCACTGAAGCCTGTTCCGTTCTTCCATAGTTCAAAAACAGAGGCTTTTTCCTCTGCTGTAAATGTTCGTCTCATTCAAAAAACCTCCGCAACCCCATGTGTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAGTGGCTTTTTTTAATATATCTCGCTCAAGGCGAGCTTCATTTAACGCCTTACGCAGTTGCAGAATTTCAGATTCCAGTTCAGCCACCGTGCGGGAACCAgg < 2:140484/251‑1 (MQ=255) ggATATTCGCTATTTCACTGAACCCTGTTCCGTTCTTCCATAGTTCAAAAACAGAGGCTTTTTCCTCTGCTGTAACTGTTCGTCTCATTCAAAAAACCTCCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTCCAGTTGCTTTTTTTAATATATCTCGCTCAAGGCGAGCTTCATTTAACGCCTTACGCAGTTGCAGAATTTCAGATTCCAGTTCAGCCACCGTGCGGGACCCAgg > 2:264452/1‑251 (MQ=255) atatTCGCTATTTCACTGAAGCCTGTTCCGTTCTTCCATAGTTCAAAAACAGAGGCTTTTTCCTCTGCTGTAAATGTTCGTCTCATTCAAAAAACCTCCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAGTTGCTTTTTTTAATATATCTCGCTCAAGGCGAGCTTCATTTAACGCCTTACGCAGTTGCAGAATTTCAGATTCCAGTTCAGCCACCGTGCGGGAACCAgg > 1:347882/1‑249 (MQ=255) cGCTATTTCACTGAAGCCTGTTCCGTTCTTCCATAGTTCAAAAACAGAGGCTTTTTCCTCTGCTGTAAATGTTCGTCTCATTCAAAAAACCTCCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAGTTGCTTTTTTTAATATATCTCGCTCAAGGCGAGCTTCATTTAACGCCTTACGCAGTTGCAGAATTTCAGATTCCAGTTCAGCCACCGTGCGGGAACCAGGAGTACCg < 1:68266/251‑1 (MQ=255) aGTTCAAAAACAGAGTCTTTTTCCTCTGCTGTAAATGTTCGTCTCATTCAAAGAACCTCCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGGTGCGTTGACCAATTGAATCTACAGTTGCTTTTTTGAAGATATCTCGTGCAATGCGAGCTTCATTTAACGCCTTACGCAGTTGCAGAATTTCAGATTCCAGTTCAGTCGCGGTGCTGGTTCCAGTAGTACGGAGCCCTTTTCTGGCGGCGGTAACCCATTGTCCt < 1:201082/250‑1 (MQ=21) cAAAAACAGAGGCTTTTTCCTCTGCTGTAAATGTTCGTCTCATTCAAAAAACCTCCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAGTTGCTTTTTTTAATATATCTCGCTCAAGGCGAGCTTCATTTAACGCCTTACGCa > 2:58063/1‑160 (MQ=255) cAAAAACAGAGGCTTTTTCCTCTGCTGTAAATGTTCGTCTCATTCAAAAAACCTCCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAGTTGCTTTTTTTAATATATCTCGCTCAAGGCGAGCTTCATTTAACGCCTTACGCa < 1:58063/160‑1 (MQ=255) ccTCTGCTGTAAATGTTCGTCTCATTCAAAAAACCTCCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGCCCAATTGAATCTACAGTTGCTTTTTTTAATATATCTCGCTCAAGGCAAGCTTCATTTAACGCCTTACGCAGTTGCAGAATTTCAGATTCCAGTTCGGCCACCGGGCGGGAACCAGGAGTACCGAGCCCTTTTCTGGCGGCGGTAACCCATTGTCCTAAAGTGCCTTCAGGAAGGGATa > 2:175729/1‑250 (MQ=255) tctGCTGTAAATGTTCGTCTCATTCAAAAAACCTCCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAGTTGCTTTTTTTAATATATCTCGCTCAAGGCGAGCTTCATTTAACGCCTTACGCAGTTGCAGAATTTCAGATTCCAGTTCAGCCACCGTGCGGGAACCAGGAGTACCGAGCCCTTTTCTGGCGGCGGTAACCCATTGTCCTAAAGTGCCTTCAGGAAGAGATAATc > 1:209410/1‑251 (MQ=255) ttgctgTAAATGATCGTCTCATTCACCAAACATCCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGATGACCAATTGAATCTACAGTTGCTTTTTTTAATATATCTCGCTCAAGGCGAGCTTAATTTAACGCCTTACGCAGTTGCAGAATTTCAGATTCCAGTTCAGCCACCGTGCGAGAACCAGGAGTACAGAGCCGTTTTCTGGCGGCGGTAACACATTGTCCTAAAGAGCCTTCAGGAAGAGATAATCg > 2:326324/2‑251 (MQ=37) aaaTGTTCGTCTCATTCAAAAAACCTCCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAGTTGCTTTTTTTAATATATCTCGCTCAAGGCGAGCTTCATTTAACGCCTTACGCAGTTGCAGAATTTCAGATTCCAGTTCAGCCACCGTGCGGGAACCAGGAGTACCGAGCCCTTTGCTGGCGGCGGTAACCCATTGTCCTAAAGTGCCTTCAGGAAGAGATAATCGGGAAgc < 1:264689/250‑1 (MQ=255) aaaaaCCTCCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAGTTGCTTTTTTTAATATATCTCGCTCAAGGCGAGCTTCATTTAACGCCTTACGCAGTTGCAGAATTTCAGATTCCAGTTCAGCCTCCGTGCGGGAACCAGGAGTACCGAGCCCTTTTCTTGCGGCGGTAACCCATTGTCCCAAAGTGCCTTCAGGAAGAAATAATCGGGAAGCGCCTTCACTGATCGAAAGt < 1:42931/251‑1 (MQ=255) aaaaCCTCCGCAACACCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAGTTGCTTTTTTTAATCTATCTCGCTCAAGGCGAGCTTCATTTAACGCCTTACGCAGTTGCAGAATTTCAGATTCCAGTTCAGCCACCGTGCGGGAACCAGGCGTACCGAGCCCTTTTCTGGCGGCGGTAACCCATTGTCCTAACGTGCCTTCAGGAAGAGATAATCGGGAAGCGCATTCACTGATCGAACGtt > 2:404306/1‑251 (MQ=255) aCCTCCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTCCAGATGCTTTTTTTAATATATCTCGCTCAAGGCGAGCTTCATTTAACGCCTTACGCAGTTGCAGAGTTTCAAATTCCAGATCAGCCACCGTGCAGGAACCAGGAGTACCGAGCCCTTTTCTGTCGGCGGCAACACATTGTCCTCAAGTGACTTCGGAAAGGGATAGTGGGGAAGAGTCTTAACTGCTCGAAAGTTGAt > 2:6815/1‑251 (MQ=25) cTCCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAGTTGCTTTTTTTAATATATCTCGCTCAAGGCGAGCTTCATTTAACGCCTTACGCAGTTGCAGAATTTCAGATTCCAGTTCAGCCACCGTGCGGGAACCAGGAGTACCGAGCCCTTTTCTGGCGGCGGTAACCCATTGTCCTAAAGTGCCTTCAGGAAGAGATAATCGGGAAGCGCCTTCACTGATCGCAAGTTGAttt > 1:84996/1‑251 (MQ=255) tCCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAGTTGCTTTTTTTAATATATCTCGCTCAAGGAGAGCTTCATTTAACGCCTTACGCAGTTGCAGAATTTCAGATTCCAGTTCAGCCACCGTGCGGGAACCAGGAGTACCGAGCCCTTTTCTg > 1:200385/1‑172 (MQ=255) tCCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAGTTGCGTTTTTTAATATATCTCGCTCAAGGCGAGCTTCATTTAACGCCTTACGCAGTTGCAGAATTGCAGATTCCAGTTCAGCTACCGTGCGGGAACCAGGAGTACCGAGCCCGTTTCTg < 2:200385/172‑1 (MQ=255) cccATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAGTTGCTTTTTTTAATATATCTCGCTCAAGGCGAGCTTCATTTAACGCCTTACGCAGTTGCAGAATTTCAGATTCCAGTTCAGCCACCGTGCGGGAACCAGGAGTACCGAGCCCTTTTCTGGCGGCGGTAACCCATTGTCCTAAAGTGCCTTCAGGAAGAGATAATCGGGAAGCGCCTTCACTGATCGAAAGTTGATTTTCAAGAAcc > 1:4879/1‑251 (MQ=255) cacaTAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAGTTGCTTTCATTAATATATCTCGCTCAAGGCGAGCTTCATTTAACGCCTTCCGCAGTTGCAGACTTTCAGATTCCAGTTCAGCCACCGTACGGGAACCAGGCGCACCGAGCCCTTTTCTGGCGGCGGTACCCCATTGTCCTAAAGGGCCTTCAGGAAGAGATAATCGGGAAGCGCCTTCACTGCTCGAACGTTGATTTTCAAGAACCGTTCTgcc > 1:225211/1‑247 (MQ=255) caTAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAGTTGCTTTTTTTAATATATCTCGCTCAAGGCGAGCTTCATTTAACGCCTTACGCAGTTGCAGAATTTCAGATTCCAGTTCAGCCACCGTGCGGGAACCAGGAGTACCGAGCCCTTTTCTGGCGGCGGTAACCCATTGTCCTACAGTGCCTTCAGGAAGAGATAATCGGGAAGCGCCTTCACTGATCGAAAGTTGATTTTCAAGAACCGTTCTGACAGCt > 1:368686/1‑251 (MQ=255) ataCTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAGTTGCTTTTTTTAATATATCTCGCTCACGGCGAGCTTCATTTACCGCCTTACGCATTTGCAGAATTTCAGATTCCAGTTCAGCCTCCGTGCTGGAACCGGGAGTACCTAGCCCTTTTCGTTCGGCGGTAACCCATTGTCCTAAAGTGCCTTCAGGAAGAGATAATCGGGAAGCTCCTTCTCTGATCGAAAGTTGATTTTCAAGAACCGTTCTGACAGCtgc < 2:361467/249‑3 (MQ=255) ttGCGTTGACCAATTGAATCTACAGTTGCTTTTTTTAATATATCTCGCTCAAGGCGAGCTTCATTTAACGCCTTACGCAGTTGCAGAATTTCAGATTCCAGTTCAGCCACCGTGCGGGACCCAGGAGTACCGAGCCCTTTTCTGGCGGCGGTAACCCCTTGTCCTAAAGTGCCTTCAGGAAGAGATAATCGGGAAGCGCCTTCACTGATCGAAAGTTGATTTTCACGAACCGTTCTGACAGCTTCGGCttt > 2:374796/1‑251 (MQ=255) aaTTGAATCTACAGTTGCTTTTTTTAATATATCTCGCTCAAGGCGAGCTTCATTTAACGCCTTACGCAGTTGCAGAATTTCAGATTCCAGTTCAGCCACCGTGCGGGAACCAGGAGTACCGAGCCCTTGTCTGGCGGCGGTAACCCATTGTCCTAAAGTGCCTTCAGGAAGAGATAATCGGGAAGCGCCTTCACTGATCGAAAGTTGATTTTCAAGAACCGTTCTGACAGCTTCGGCTTTGAACTTTTTag < 1:370603/251‑1 (MQ=255) aaTTGAATCTACAGTTGCTTTTTTTAATATATCTCGCTCAAGGCGAGCTTCATTTAACGCCTTACACAGTTGCAGAATTTCAGCTTCCAGTTCAGCCACCGTGCGGGCACCAGGAGTACCGAGCCCTTTTATGGCGGCGGTAACCCATTGTCCTAAAGTGCCTTCAGGAAGAGATAATCGGGAAGCGCCTTAACTGATCGAAAGTTGATTTTCAGGAACCGTTATGACAGCATAGGCTTTGAACttttt > 2:306906/1‑249 (MQ=255) aaTCTACAGTTGCTTTTTTTAATATATCTCGCTCAAGGCGAGCTTCATTTAACGCCTTACGCAGTTGCAGAATTTCAGATTCCAGTTCAGCCACCGTGCGGGAACCAGGAGTACCGAGCCCTTTTCTGGCGGCGGTAACCCATTGTCCTAAAGTGCCTTCAGGAATAGATAATCGGGAAGCGCCTTCACTGATCGAAAGTTGATTTTCAAGAACCGTTCTGACAGCTTCGGCTTTGAACTTTTTAGAGTaa < 1:327951/251‑1 (MQ=255) aCAGTTGCTTTTTTTAATATATCTCGCTCAAGGCGAGCTTCATTTAACGCCTTACGCAGTGGCAGAATTTCAGATTCCAGTTCAGCCACCGTGCGGGAACCAGGAGTACCGAGCCCTTTTCTGGCGGCTGTATCCCATTGTCCTAAAGTGCCTTCAGTAAGAGATAATCGGGAAGCGCCTTCACTGATCGAAAGTTGATTTTCAAGAACCGTGCTGACATCTTCGGCTTTGAACTTTTTAGAGTAACGtt < 1:404306/250‑1 (MQ=255) cAGTTGCTTTTTTTAATCTATCTAGCTCAAGTCGAGCTTCATTTACCCCCTTACGCAGTTGCAGAATTTCAGCTTCAAGTTCAGCCACCGTGCGGGAACCAGGCGTACCGAGCCCTTTTCTGGCGGCGGTAACCCATTGTCCTAAAGCGCCTTCAGGAAGAGCTTATCGGGAAGCGCCTTCACTGCTCGAAAGGTGTTTTTCAAGAAACGATTTGAACGCTTCGGCTTTGCAATTTTTCGAGAAACGTTgg > 2:440240/1‑251 (MQ=255) | ACAGTGTCAGGTGAGCTACAGCCCGCTTACGCTCATGGGGTTTTATGCCGCCAGTATCCCTTAACATAGTGAAGATCGTTCCGGGTTTTGAACCCAGGATATTCGCTATTTCACTGAAGCCTGTTCCGTTCTTCCATAGTTCAAAAACAGAGGCTTTTTCCTCTGCTGTAAATGTTCGTCTCATTCAAAAAACCTCCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAGTTGCTTTTTTTAATATATCTCGCTCAAGGCGAGCTTCATTTAACGCCTTACGCAGTTGCAGAATTTCAGATTCCAGTTCAGCCACCGTGCGGGAACCAGGAGTACCGAGCCCTTTTCTGGCGGCGGTAACCCATTGTCCTAAAGTGCCTTCAGGAAGAGATAATCGGGAAGCGCCTTCACTGATCGAAAGTTGATTTTCAAGAACCGTTCTGACAGCTTCGGCTTTGAACTTTTTAGAGTAACGTTGG > NC_000913/4508434‑4508928 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |