| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 295,738 | IS2 (–) +5 bp | coding (1355‑1359/1401 nt) | intF ← | putative phage integrase |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | = 295742 | 1 (0.030) | 42 (1.030) | 39/496 | 0.2 | 97.6% | coding (1355/1401 nt) | intF | putative phage integrase |
| ? | NC_000913 | = 382590 | NA (NA) | noncoding (1331/1331 nt) | IS2 | repeat region | |||||
GTTTTACTTGAATTAATACACCAGCGAGCTCTGATAGCTGCCAGAGTGGGTTCTATGGATACAGTTGCTGGGGTTGCCATTGGCTTATCTCCTGTGTAGTTGCTGTATCATTGACTAAACTGTGTATTACGATACATGAAAATCTATCTTGATCAATAGTTGATGATATTTTGTAATATGTTGATTTTTAATGGAATCAACGCATATCAACGTTGTTTTTTATGGTAATACCTGCTTCATTTAAGATCCATGTCTCAATTTTCTCGTGCCATTTTCGTAACAGATCTAACGGACGACGGCGATAGTGTTTTTCGGCAAGAGCGCTGGGTTTGTGTCCCATAATTTGAGCAACAATACCAGTGGGAACTTCAACCCACTCGGCCAAAGTACCAAAACTACGACGTAAACCGTGAAGGCTGATATGTGGTAACTCAGCCAGCACTAATGCTCTGTTGTGCGCTGAACGCGGCTCAATAATTTTGCCACTTTTACT > NC_000913/295500‑295992 | ccagagaaataactggctggctgctacaccatgttgccgggcaacgagggagaccgtcatccccggttcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaATTTAAGATCCAt > 1:48433‑M1/239‑251 (MQ=255) gaaataactggctggctgctacaccatgttgccgggcaacgagggagaccgtcatccccggttcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctgATTTAAGATCCATGtctc < 1:354088‑M1/18‑1 (MQ=255) tctggctggctgctacaccatgttgccggtcaacgagggagaccgtcatccccggttcaaagctctgctgaccaattgcgatcttttcctgtgtggtacgacgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactgatctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaATTTAAGATCCATGTCTCAAtttt < 2:393573‑M1/24‑1 (MQ=255) actggctggctgctacaccatgttgccgggcaacgagggagaccgtcatcccctgttcaaagctctgctgaacaattgctatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctgtagagtcatggggccagtctaATTTAATAGCCATTTCTCAAtttt > 2:227390‑M1/228‑251 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |