Predicted mutation | ||||||
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JC JC | NC_000913 | 1,656,656 | IS2 (–) +5 bp | coding (473‑477/561 nt) | speG → | spermidine N‑acetyltransferase |
New junction evidence | |||||||||||
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* | ? | NC_000913 | 1656656 = | 1 (0.020) | 20 (0.490) | 19/480 | 1.0 | 95.1% | coding (473/561 nt) | speG | spermidine N‑acetyltransferase |
? | NC_000913 | = 2070271 | NA (NA) | noncoding (1/1331 nt) | IS2 | repeat region |
AATTAACCATGTTCATCGCCGCGCAGAATTTCAGATAATTATCTCCCCGGAGTATCAGGGGAAAGGTCTGGCAACCCGTGCCGCCAAATTAGCAATGGACTATGGCTTTACCGTTCTCAATCTCTATAAGCTGTATCTGATCGTTGATAAAGAGAATGAAAAAGCGATTCACATTTACCGCAAGCTTGGCTTTTCGGTTGAAGGTGAATTGATGCACGAGTTCTTTATTAATGGTCAATATCGTAATGCCATTCGCATGTGTATATTCCAGCATCAGTATCTGGCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCACCGGATTAGCGTGACTGTCATATTCACAGCTCTGTTTTACATTACCAACCCGTTGATTATTCAGTAAAGTA > NC_000913/1656411‑1656906 | aaTTAACCATGTTCATCGCCGCGCAGAATTTCAGATAATTATCTCCCCGGAGTATCAGGGGAAAGGTCTGGCAACCCGTGCCGCCAAATTAGCAATGGACTATGGCTTTACCGTTCTCAATCTCTATAAGCTGTATCTGATCGTTGATAAAGAGAATGAAAAAGCGATTCACATTTACCGCAAGCTTGGCTTTTCGGTTGAAGGTGAATTGATGCACGAGTTCTTTATTAATGGTCAATATCGTAATGcc > 2:140213/1‑250 (MQ=255) 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tGCCtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaaacccactgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgccactgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctggtttgggcattatactgatgtagtcacgctttatcgttgtcacgaagctctctgctattccgtgactattcggactccgc < 1:182647‑M2/250‑247 (MQ=255) | AATTAACCATGTTCATCGCCGCGCAGAATTTCAGATAATTATCTCCCCGGAGTATCAGGGGAAAGGTCTGGCAACCCGTGCCGCCAAATTAGCAATGGACTATGGCTTTACCGTTCTCAATCTCTATAAGCTGTATCTGATCGTTGATAAAGAGAATGAAAAAGCGATTCACATTTACCGCAAGCTTGGCTTTTCGGTTGAAGGTGAATTGATGCACGAGTTCTTTATTAATGGTCAATATCGTAATGCCATTCGCATGTGTATATTCCAGCATCAGTATCTGGCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCACCGGATTAGCGTGACTGTCATATTCACAGCTCTGTTTTACATTACCAACCCGTTGATTATTCAGTAAAGTA > NC_000913/1656411‑1656906 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |