| Predicted mutation | ||||||
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| JC JC | NC_000913 | 1,656,656 | IS2 (–) +5 bp | coding (473‑477/561 nt) | speG → | spermidine N‑acetyltransferase |
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| * | ? | NC_000913 | 1656656 = | 1 (0.020) | 20 (0.490) | 19/480 | 1.0 | 95.1% | coding (473/561 nt) | speG | spermidine N‑acetyltransferase |
| ? | NC_000913 | = 2070271 | NA (NA) | noncoding (1/1331 nt) | IS2 | repeat region | |||||
GGAAATTAACCATGTTCATCGCCGCGCAGAATTTCAGATAATTATCTCCCCGGAGTATCAGGGGAAAGGTCTGGCAACCCGTGCCGCCAAATTAGCAATGGACTATGGCTTTACCGTTCTCAATCTCTATAAGCTGTATCTGATCGTTGATAAAGAGAATGAAAAAGCGATTCACATTTACCGCAAGCTTGGCTTTTCGGTTGAAGGTGAATTGATGCACGAGTTCTTTATTAATGGTCAATATCGTAATGCCATTCGCATGTGTATATTCCAGCATCAGTATCTGGCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCACCGGATTAGCGTGACTGTCATATTCACAGCTCTGTTTTACATTACCAACCCGTTGATTATTCAGTAAAG > NC_000913/1656408‑1656904 | gtataTTAGCCATGTTCATCGCCGCGCAGAATTTCAGATAATTAGCTCCCCGAAGTATCAGGGGAAAGGTCTGGCAACCCGTTCCGCCAAATGAGCCATGGACTATGGCTTTACCGTTCTCAATCTCTATAAGCTGTATCGTATCGTTGATAAAGAGAATGAATAAGCGATTCACATTTTTCGCAAGTTTGTCTTTTCGGTTGAAGGTGAAATGATGCACGAGTTCTTTATTAATGGTCAATATCGTAAt < 2:142373/246‑1 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cACGAGTTCTTTATTAATGGTCAATATCGTAATGCCtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcctctgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctggtttgggcatgatactgatgtagtcacgctttatcgttttcacgaagct < 1:318582‑M2/251‑216 (MQ=255) ggttgtctggagattcagggggccagtctaATGCCATTCGCATGTGTATATTCCAGCATCAGTATCTGGCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGAcggcgg < 1:112680‑M1/141‑1 (MQ=255) ggttgtctggagattcagggggccagtctaATGCCATTCGCATGTGTATATTCCAGCATCAGTATCTGGCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGAcggcgg > 2:112680‑M1/31‑171 (MQ=255) ggttgtctggagattcagggggccagtctaATGCCATTCGCATGTGTATATTCCAGCATCAGTATCTGGCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCATTCATCAACAAAGATTAGCTGACAGTCCACCGGATTAGCGTGACTGTCATATTCACAGCTCTGTTTTAc < 1:373343‑M1/220‑1 (MQ=255) 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cAATATCGTAATGCCtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaaccccttacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggctgccattcgttataatgctcgaacgcctctgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctggtttgggcatgatactgctgtagtcacgctttatcgttttcacgaagctctctgctattccgttactctc < 2:282106‑M2/251‑237 (MQ=255) tAATGCCtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcctctgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctggtttgggcatgatactgatgtagtcacgctttatcgttttcacgaagctctctgctattccgttactctccggactcc < 1:198332‑M2/251‑245 (MQ=255) | GGAAATTAACCATGTTCATCGCCGCGCAGAATTTCAGATAATTATCTCCCCGGAGTATCAGGGGAAAGGTCTGGCAACCCGTGCCGCCAAATTAGCAATGGACTATGGCTTTACCGTTCTCAATCTCTATAAGCTGTATCTGATCGTTGATAAAGAGAATGAAAAAGCGATTCACATTTACCGCAAGCTTGGCTTTTCGGTTGAAGGTGAATTGATGCACGAGTTCTTTATTAATGGTCAATATCGTAATGCCATTCGCATGTGTATATTCCAGCATCAGTATCTGGCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCACCGGATTAGCGTGACTGTCATATTCACAGCTCTGTTTTACATTACCAACCCGTTGATTATTCAGTAAAG > NC_000913/1656408‑1656904 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |