| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | NC_000913 | 3,888,720 | Δ6 bp | intergenic (+211/‑5) | tnaC → / → tnaA | tnaAB operon leader peptide/tryptophanase |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3888719 | 3 (0.090) | 20 (0.590) | 18/484 | 0.7 | 87.0% | intergenic (+210/‑11) | tnaC/tnaA | tnaAB operon leader peptide/tryptophanase |
| ? | NC_000913 | 3888726 = | 3 (0.090) | intergenic (+217/‑4) | tnaC/tnaA | tnaAB operon leader peptide/tryptophanase | |||||
TTCAATGTGATCTATTTGTTTGCTATATCTTAATTTTGCCTTTTGCAAAGGTCATCTCTCGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCGAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTAAAATAAATGAAGGATTATGTAATGGAAAACTTTAAACATCTCCCTGAACCGTTCCGCATTCGTGTTATTGAGCCAGTAAAACGTACCACTCGCGCTTATCGTGAAGAGGCAATTATTAAATCCGGTATGAACCCGTTCCTGCTGGATAGCGAAGATGTTTTTATCGATTTACTGACCGACAGCGGCACCGGGGCGGTGACGCAGAGCATGCAGGCTGCGATGATGCGCGGCGACGAAGCCTACAGCGGCAGTCGTAGCTACTATGC > NC_000913/3888551‑3888974 | attagattcaatgtgatctatttgtttgctatatcttaattttgccttttgcaaaggtcctctctcgtttatttacttgttttagtaaatgatggtgcttgcatatatatctggcgaattaatcggtatagcagctgtaatattcacagggatcactgtaattaaaataaatgaaTGTAATGGAAAACTTTAAACATCTCCCTGAACCGTTCCGCATTCGTGTTATTGAGCCAGTAAAACGTACCACTcgc > 1:151611‑M2/176‑251 (MQ=255) attcaatgtgatctatttgtttgctatatcttaattttgccttttgcaaaggtcatctctcgtttatttacttgttttagtaaatgatggtgcttgcatatatatctggcgaattaatcggtatagcagatgtaatattcacagggatcactgtaattaaaataaatgaaTGTAATGGAAAACTTTAAACATCTCCCTGAACCGTTCCGCATTCGTGTTATTGAGCCAGTAAAACGTACCACTCGCGCtt > 1:43751‑M2/171‑250 (MQ=255) actgtggtctatttgtttgctatgtctgaattttgccttttgcaaaggtcatctctcgtttatttacttgttttagtaaatgatggtgcttgcatatatatctggcgaattaatcggtatagcagatgaaatattcatagggatcactgtaattaaaataaatgaaTGTAATGGAAAACTTTAAACATATCACTGAACCATTCAGCATTCGTGTTATTGAGCCAGTAACACGTACCACTCGCGATTATCGt > 2:271172‑M2/167‑251 (MQ=255) tttgccttttgcaaaggtcatctctcgtttatttacttgttttagtaaatgatggtgcttgcatatatctctcgcgaattaatcggtatagcagatgtaatattcacagggatcactgtaattaaaataaatgaaTGTACTGGAAAACTTTAAACATCACCCTGAACCGTTCCGCATTCGTGTTATTGAGCAAGTAAAACGTACCACTCGCGCTTATCGTGAAGAGGCAATTATTAAATCCGGTCTGAAcc > 1:39257‑M2/136‑251 (MQ=255) ttgcataggccatctctcgtttatttacttgttgtagtaaatgatggtgcttgcatatatatctggcgaattaatcggtagagcagatgtaatattcacagggatcactgtaattaaaataaatgaaTGTAATGGAAAACTTTAAACATCTCGCTGAACCTTTCCGCATCCGTGTGATTTAGCCAGTGAAACGGACCTCTCGCGCTTATCGTGAAGACGCATTGATTGAATCCGGTGTGAACCCGTTCct < 2:340718‑M2/123‑1 (MQ=255) 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NC_000913/3888551‑3888974 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |