| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 480,919 | IS2 (–) +5 bp | intergenic (‑211/+331) | tomB ← / ← acrB | Hha toxicity modulator TomB/multidrug efflux pump RND permease AcrB |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 382590 | NA (NA) | 37 (1.090) | 34/486 | 0.2 | 100% | noncoding (1331/1331 nt) | IS2 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 480923 | 0 (0.000) | intergenic (‑215/+331) | tomB/acrB | Hha toxicity modulator TomB/multidrug efflux pump RND permease AcrB | |||||
| * | ? | NC_000913 | 480919 = | 0 (0.000) | 20 (0.590) | 14/484 | 1.0 | 100% | intergenic (‑211/+335) | tomB/acrB | Hha toxicity modulator TomB/multidrug efflux pump RND permease AcrB |
| ? | NC_000913 | = 1469240 | NA (NA) | noncoding (1/1331 nt) | IS2 | repeat region | |||||
ATATCATGTCTTTTGGGTGAGTATTCATCCATAACGCGTCCCCTTCTTAGCGGTTGAACTAACGGACACCTTTCGGGATGGAAAAAACTTACTGACCTGGACTTGCCCTCTCGTTTGTTAGCTTAACTATAAGCCACTCTTTGCAGGTTTTCATCGCATTATTACGAAAAATTACAATTAGGAAGGAAGCGGGACAGGACTCACTTTTTCATACTAGCACTAACCCGCAGCAGGTAAAAGCAGTTTGCTCGAACTATTCATAACATTTCAGGATTATCGCCAGATGAAATTGGTGACACTAATACCAGGATTGCTCTGAATATGACGTAATAACCGAGGAATGAATAAAGAATTACCGCAAATAATTAAGAATAGCCTCTAAATGATTATGGATTATTAAATCTATTAGCGCTACTTAATATAAATTAACTAACAATCAGTATTTTTTATGAATTTTATCCGTGGTTAATACTGGTTTTCGTATGAGATC > NC_000913/480677‑481166 | tacgccagagaaataactggctggctgctacaccatgttgccgggcaacgagggagaccgtcatccccggttcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGTTTGCt > 1:132562‑M1/243‑249 (MQ=255) ccagagaaataactggctggctgctacaccatgttgccgggcaacgagggagaccgtcatccccggttcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGTTTGCTCGAACt > 2:11104‑M1/239‑251 (MQ=255) gggTGAGTATTCATCCATAACGCGTCCCCTTCTTAGCGGTTGAACTAACGGACACCTTTCGGGATGGAAAAAACTTACTGACCTGGACTTGCCCTCTCGTTTGTTAGCTTAACTATAAGCCACTCTTTGCAGGTTTTCATCGCATTATTACGAAAAATTACAATTAGGAAGGAAGCGGGACAGGACTCACTTTTTCATACTAGCACTAACCCGCAGCAGGTAAAAGCAGTTTGtggatttgcccctatatt < 1:4793‑M2/251‑19 (MQ=255) aGTATTCATCCATAACGCGTCCCCTTCTTAGCGGTTGAACTAACGGACACCTTTCGGGATGGAAAAAACTTACTGACCTGGACTTGCCCTCTCGTTTGTTAGCTTAACTATAAGCCACTCTTTGCAGGTTTTCATCGCATTATTACGAAAAATTACAATTAGGAAGGAAGCGGGACAGGACTCACTTTTTCATACTAGCACTAACCCGCAGCAGGTAAAAGCAGTTTGtggatttgcccctatatttcc < 1:155980‑M2/249‑22 (MQ=255) tATTCATCCATAACGCGTCCCCTTCTTAGCGGTTGAACTAACGGCCAACTTACGGGATGGAAAAAACTTCCTGACCTGGACTTACCCTCTCGCTTGTTAGCTTAACTATCAGCCACTATTTGCCGGTTTTCATCGCCTTATTACGAAAAATTACAATTAGGAAGGACGCGGAACAGGACTCACTTTTTCATACTAGAACTAACCCGCAGCAGGTAAAAGCCGTTTGtggatttgcccctatatttcccgac < 1:23508‑M2/251‑26 (MQ=255) ggctgctacaccatgttgccgggcaacgagggataccttcatccccggttcaaagctctgctgaacaattgcgatcttgtcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaattgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGTTTGCTCGAACTATTCATAACATTTCAg > 2:235034‑M1/221‑249 (MQ=255) ggctgctacaccatgttgccgggcaacgagggagaccgtcatccccggttcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttggctggagattcagggggccagtctaGTTTGCTCGAACTATTCATAACATTTCAg > 1:339098‑M1/221‑249 (MQ=255) ggctgctacaccatgttgccgggcaacgagggagaccgtcatccccggttcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtagtaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcaggtggtcagtctaGTGTGCTCGAACTATTCATAACATTTCAg > 1:314334‑M1/221‑249 (MQ=255) cATCCATAACGCGTCCCCTTCTTAGCGGTTGAACTAACGGCCACCTTTCGGGATGGAAAAAACTTACTGACCTGGACTTGCCCTCTCGTTTGTTAGCTTAACTATAAGCCACTCTTTGCAGGTTTTCATCGCATTATTACGAAAAATTACAATTAGGAAGGAAGCGGGACAGGACTCACTTTTTCATACTAGCACTAACCCGCAGCAGGTAAAAGCAGTTTGtggatttgcccctatatttccagacatct < 1:137100‑M2/251‑30 (MQ=255) cATCCATAACGCGTCCCCTTCTTAGCGGTTGAACTAACGGACACCTTTCGGGATGGAAAAAACTTACTGACCTGGACTTGCCCTCTCGTTTGTTAGCTTAACTATAAGCCACTCTTTGCAGGTTTTCATCGCATTATTACGAAAAATTACAATTAGGAAGGAAGCGGGACAGGACTCACTTTTTCATACTAGCACTAACCCGCAGCAGGTAAAAGCAGTTTGtggatttgcccctatatttccagacatct < 2:233197‑M2/251‑30 (MQ=255) catgttgccgggcaacgagggagcccgtcatccccggttcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGTTTGCTCGAACTATTCATAACATTTCAGGATTATCGcc < 1:138910‑M1/39‑1 (MQ=255) aCGCGTCCCCTTCTTAGCGGTTGAACTAAAGGACACCATTCGGGATGGAAACAACTTACTGACATGGACTTGCCCTCTCGTTTGTTAGCTTAACTATAAGCCACTCTTTGCAGGTTTTCATCGCATTATTACGAAAAATTACAATTAGGAAGGAAGCGGGACAGGACTCACTTTTTCATCCTAGCACTAACCCGCAGCAGGCAAAAGCAGTTTGtggatttgccactatatttcctgacatcggttatcac < 2:362786‑M2/251‑38 (MQ=255) tgccgggcaacgagggagaccgtcatccccggttcaaagctctgctgaacaattgcgctcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagtgggccagtctaGTTTGCTCGAACTATTCATAACATTTCAGGATTATCGCCAGATGaa < 1:198654‑M1/46‑1 (MQ=255) ccgggcaacgagggagaccgtcatccccggttcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGTTTGCTCGAACTATTCATAACATTTCAGGATTATCGCCAGATGAAAtt < 1:57575‑M1/49‑1 (MQ=255) gggcaacgagggagaccgtcatccccgggtcaaagctctgctgaacaattgctagcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcaactgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacgtatttaagtgatagtggttgtcttgagattcagggggccagtctaGTTTGCTCGAACTATTCATAACATTTCAGGATTATCGCCAGATGAAATTgg > 2:160928‑M1/201‑251 (MQ=255) cttcttAGCGGTTGAACTAACGGACACCTTTCGGGATGGAAAAAACTTACTGACCTGGACTTGCCCTCTCGTTTGTTAGCTTAACTATAAGCCACTCTTTGCAGGTTTTCATCGCATTATTACGAAAAATTACAATTAGGAAGGAAGCGGGACAGGACTCACTTTTTCATACTAGCACTAACCCGCAGCAGGTAAAAGCAGTTTGtggatttgcccctatatttccagccatctgttatcacttaacccat < 2:48954‑M2/251‑47 (MQ=255) tcttAGCGGTTGAACTAACGGACACCTTTCGGGATGGAAAAAACTTACTGACCTTGACTTGCCCTCTCGTTTGTTAGCTTAACTATAAGCCACTCTGTGCAGGTTTTCATCGCATTATTACGAAAAATTACAATTAGGAAGGAAGCGGGACAGGACTCACTTTTTCATGCTAGCACTAACCCGCAGCAGGTAAAAGCAGTTTGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccat > 1:137925‑M2/1‑203 (MQ=255) gggagaccgtcatccccggttcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtagtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGTTTGCTCGAACTATTCATAACATTTCAGGATTATCGCCAGATGAAATTGGTGACACTa < 1:51664‑M1/59‑1 (MQ=255) agaccgtcatccccgggtcaaagctctgctgaacaattgcgttattttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccgtccctaagacatcattcatctgttctccaacgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatatagattgtctggagattcagggggccagtctaGTTTGCTCGAACTATTCATAACATTTCAGGATTATCGCCAGATGAAATTGGTGACACAAATAc < 1:199000‑M1/63‑1 (MQ=255) aCGGACACCTTTCGGGATGGAAAAAACTTACTGACCTGGACTTGCCCTCTCGTTTGTTAGCTTAACTATAAGCCACTCTTTGCAGGTTTTCATCGCATTATTACGAAAAATTACAATTAGGAAGGAAGCGGGACAGGACTCACTTTTTCATACTAGCACTAACCCGCAGCAGGTAAAAGCAGTTTGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgc < 1:74312‑M2/249‑64 (MQ=255) gACACCTTTCGGGATAGAAAAAACTTACTGCACTGAACCTGCCCTCTCGTTTGTTAGCTTAACTATAAGCCACTCTCTGCAGGTTTTCATCGCATTATTACGCAAAATTACAATTCGGAAGGAAGCGGGACCGGACTCACTTTTTCATACTCGCACTAACCCGCAGCAGGTAAAAGCAGTTTGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagat < 2:320017‑M2/250‑68 (MQ=255) aagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatatgggttgtctggagattcagggggcgagtctaGTTTGCTCGAACTATTCATAACATTTCAGGATTATCGCCAGATGAAATTGTGGACACTAATACCAGGATTGCTCTGAATATGa > 1:358682‑M1/169‑251 (MQ=255) ggATGGAAAAAACTTACTGACCTGGACTTGCCCTCTCGTTTGTTAGCTTAACTATAAGCCACTCTTTGCAGGTTTTCATCGCATTATTACGAAAAATTACAATTAGGAAGGAAGCGGGACAGGACTCACTTTTTCATACTAGCACTAACCCGCAGCAGGTAAAAGCAGTTTGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcg < 1:69429‑M2/251‑80 (MQ=255) gctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGTTTGCTCGAACTATTCATAACATTTCAGGATTATCGCCAGATGAAATTGGTGACACTAATACCAGGATTGCTCTGAATATGACg > 2:340249‑M1/167‑251 (MQ=255) tGGACTTGCCCTCTCGTTTGTTAGCTTAACTATAAGCCACTCTTTGCAGGTTTTCATCGCATTATTACGAAAAATTACAATTAGGAAGGAAGCGGGACAGGACTCACTTTTTCATACTAGCACTAACCCGCAGCAGGTAAAAGCAGTTTGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatg < 2:354306‑M2/251‑102 (MQ=255) cTTGCCCTCTCGTTTGTTAGCTTAACTATAAGCCACTCTTTGCAGGTTTTCATCGCATTATTACGAAAAATTACAATTAGGAAGGAAGCGGGACAGGACTCACTTTTTCATACTAGCACTAACCCGCAGCAGGTAAAAGCAGTTTGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcgg < 1:55641‑M2/250‑105 (MQ=255) tGCCCTCGCGTTTGTTACCTTAACTATAAGCCACTCTGTGCAGGTTTTCATCGCATTATTACGAAAAATTACAATTAGGAAGGAAGCGGGACAGGACTCACGTTTTCATACGAGCACTAACCCGCAGCAGGTAAAAGCAGTTTGtggatttgcccctatattcccagacatctattagcacttaacccagtacaagcccgctgtcggagttattctcatggcgagcgataacccagcgcaccatgcggat > 2:28103‑M2/1‑144 (MQ=255) gCCCTCTCGTTTGTTAGCTTAACTATAAGCCACTCTTTGCAGGTTTTCATCGCATTATTACGAAAAATTACAATTAGGAAGGAAGCGGGACAGGACTCACTTTTGCATACTAGCACTAACCCGCAGCAGGTAAAAGCAGTTTGtggatttgcccctatattgccagacatctgttatcacgtaacccattacaagcccgctgccgcagatatgcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatg > 1:205211‑M2/1‑143 (MQ=255) tacgcagtctgcgtttatccggaactaagacataaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaaaactatcacttatttaagtgagattggttgtctggagattaagggggccagtctaGTTTGCTCGAACTATTCATAACATTTCAGGATTATCGCCAGGTGCAATTGGTGACACTAATACCAGGATTGCTATGAATATGACGAAATAACCGAGGCAAGAATAAAGAATTaccgtgg < 2:200808‑M1/119‑4 (MQ=255) cGTTTGTTAGCTTAACTATAAGCCGCTCTTTGCAGGTTTTCATCGCATTATTACGAAAAATTACAATTAGGAAGGAAGCGGGACAGGACGCACTTTTTCATACTAGCCCTAACCCGCAGCAGGTAAAAGCAGTTTGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattct > 2:262200‑M2/1‑136 (MQ=255) gccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatactggttgtctggagattcagggggccagtctaGTTTGCTCGAACTATTCATAACATTTCAGGATTATCGCCAGATGAAATTGGTGACACTAATACCAGGATTGCTCTGAATATGACGTAATAACCGAGGAATGAATAAAGaattaccgtggattt > 1:1081‑M1/129‑244 (MQ=255) ccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGTTTGCTCGAACTATTCATAACATTTCAGGATTATCGCCAGATGAAATTGGTGACACTAATACCAGGATTGCTCTGAATATGACGTAATAACCGAGGAATGAATAAAgaattaccgtggatttg > 2:298738‑M1/128‑243 (MQ=255) gCTTAACTATAAGCCACTCTTTGCAGGTTTTCATCGCATTATTACGAAAAATTACAATTAGGAAGGAAGCGGGACAGGACTCACTTTTTCATACTAGCACTAACCCGCAGCAGGTAAAAGCAGTTTGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgct < 1:316579‑M2/251‑125 (MQ=255) tctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactagcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGTTTGCTCGAACTATTCATAACATTTCAGGATTATCGCCAGATGAAATTGGTGACACTAATACCAGGATTGCTCTGAATATGACGTAATAACCGAGGaatgaataaagaattaccgtggatttgcccctatatt > 1:190644‑M1/117‑232 (MQ=255) ccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactattctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGTTTGCTCGAACTATTCATAACATTTCAGGATTATCGCCAGATGAAATTGGTGACACTAATACCAGGATTGCTCTGAATATTACGTAATAACCGaggaatgaataaagaattaccgtggatttgcccctatatttcc > 2:206052‑M1/114‑229 (MQ=255) ttGCAGGTTTTCATCGCATTATTACGAAAAATTACAATTAGGAAGGAAGCGGGACAGGACTCACTTTTTCATACTAGCACTAACCCGCAGCAGGTAAAAGCAGTTTGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcctctgcaaggt > 1:58440‑M2/1‑107 (MQ=255) cGCATTATTACGAAAAATTACAATTAGGAAGGAAGCGGGACAGGACTCACTTTTTCATACTAGCACTAACCCGCAGCAGGTAAAAGCAGTTTGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcctctgcaaggttcttggctgccgtta > 2:251974‑M2/1‑93 (MQ=255) ttattaCGAAAAATTACAATTAGGAAGGAAGCGGGACAGGACTCACTTTTTCATACTAGCACTAACCCGCAGCAGGTAAAAGCAGTTTGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcctctgcaaggttctttgctgccgttaacccg < 2:254646‑M2/251‑163 (MQ=255) gactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGTTTGCTCGAACTATTCATAACATTTCAGGATTATCGCCAGATGAAATTGGTGACACTAATACCAGGATTGCTCTGAATATGACGTAATAACCGAGgaatg > 2:97196‑M1/80‑180 (MQ=255) gactagcctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGTTTGCTCGAACTATTCATAACATTTCAGGATTATCGCCAGATGAAATTGGTGACACTAATACCAGGATTGCTCTGAATATGACGTAATAACCGAGgaatg < 1:97196‑M1/101‑1 (MQ=255) gAAAAATTACAATTAGGAAGGAAGCGGGACAGGACTCACTTTTTCATACTAGCACTAACCCGCAGCAGGTAAAAGCAGTTTGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcctctgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctggtt > 1:176725‑M2/1‑82 (MQ=255) aaTTACAATTAGGAAGGAAGCGGGACAGGACTCACTTTTTCATACTAGCACTAACCCGCAGCAGGTAAAAGAAGTTTGtggatttgcccctatatttccagccatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcctctgcaaggttctttgctgccgttaacccctctggattggg < 2:124101‑M2/251‑174 (MQ=255) cAATTAGGCAGGAAGCGGGACAGGACTCACTTTTTCATACTAGCACTCACCCGCAGCAGGTAAAAGCAGTTTGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgcagcagatattcccgtggcgagcgataacccagagcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcctctgcaaggttctttgctgccgttaaaccgtctggtttgggcatg < 1:234907‑M2/250‑178 (MQ=255) cAATTAGGAAGGAAGCGGGTCAGGACTCACTTTTTCATACTAGCACTATCCCGCAGCAGGTAAAAGCAGTTTGtggatttgcccctatatttccagacatcggttatcacttaacccattaaaagcccgctgacgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcctctgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctggtttgggcatga > 1:263110‑M2/1‑73 (MQ=255) aaTTAGGAAGGAAGCGGGACAGGACTCACTTTTTCATACTAGCACTAACCCGCAGCAGGTAAAAGCAGTTTGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcctctgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctggtttgggcatgat < 1:67075‑M2/251‑180 (MQ=255) aTTAGGAAGGAAGCGGGACAGGACTCACTTTTTCATACTAGCACTAACCCGAAGCAGGTAAAAGCAGTTTGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcctctgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctggtttgggcatgat < 1:356507‑M2/250‑180 (MQ=255) aaggaagCGGGACAGGACTCACTTTTTCATACTAGCACTAACCCGCAGCAGGTAAAAGCAGTTTGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcct < 2:324319‑M2/198‑134 (MQ=255) aaggaagCGGGACAGGACTCACTTTTTCATACTAGCACTAACCCGCAGCAGGTAAAAGCAGTTTGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcct > 1:324319‑M2/1‑65 (MQ=255) gggACAGGACTCACTTTTTCATACTAGCACTAACCCGCAGCAGGTAAAAGCAGTTTGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcctctgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctggtttgggcatgatactgatgtagtcacg > 1:6270‑M2/1‑57 (MQ=255) aCAGGACTCACTTTTTCATACTAGCACTAACCCGCAGCAGGTAAAAGCAGTTTGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcctctgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctggtttgggcatgatactgatgtagtcacgctt < 1:358990‑M2/251‑198 (MQ=255) aGGACTCACTTTTTCATACTAGCACTAACCCGCAGCAGGTAAAAGCAGTTTGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcctctgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctggtttgggcatgatactgatgtagtcacgcttta > 1:21645‑M2/1‑52 (MQ=255) cTCACTTTTTCATACTAGCACTAACCCGCAGCAGGTAACAGCGGTTTGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcctctgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctggtttgggcatgatactgatgtagtcacgctttatcgt < 1:325851‑M2/251‑204 (MQ=255) aCTTTTTCATACTAGCACTAACCCGCAGCAGGTAAAAGCAGTTTGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttctaatgctcgaacgcctctgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctggtttgggcatgatactgatgtagtcacgctttatcgtttt < 1:301576‑M2/251‑207 (MQ=255) aCTTTTTCATACTAGCACTAACCCGCAGCAGGTAAAAGCAGTTTGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgcacgcctctgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctggtttgggcatgatactgatgtagtcacgctttatcgtttt < 1:241888‑M2/251‑207 (MQ=255) aTACTAGCACTAACCCGCAGCAGGTAAAAGCAGTTTGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcccttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcctctgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctggtttgggcatgatactgatgtagtcacgctttatcgttttcacgaagc > 1:9968‑M2/1‑37 (MQ=255) aGCACTAACCCGCAGCAGGTAAAAGCAGTGTGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccagtacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactaggcggatgccattcgttataatgctcgaacgcctctgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctggttggggcatgatactgatgtagtcacgctttagcgttttcacgaagctct > 2:358990‑M2/1‑32 (MQ=255) gCAGTTTGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcctctgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctggtttgggcatgatactgatgtagtcacgctttatcgttttcacgaagctctctgctattccgttactctccggactc < 2:195816‑M2/251‑244 (MQ=255) tGCTCGAACTATTCATAACATTTCAGGATTATCGCCAGATGAAATTGGTGACACTAATACCAGGATTGCTCTGAATATGACGTAATAACCGAGGAATGAATaaa < 2:303739/104‑1 (MQ=255) tGCTCGAACTATTCATAACATTTCAGGATTATCGCCAGATGAAATTGGTGACACTAATACCAGGATTGCTCTGAATATGACGTAATAACCGAGGAATGAATaaa > 1:303739/1‑104 (MQ=255) | ATATCATGTCTTTTGGGTGAGTATTCATCCATAACGCGTCCCCTTCTTAGCGGTTGAACTAACGGACACCTTTCGGGATGGAAAAAACTTACTGACCTGGACTTGCCCTCTCGTTTGTTAGCTTAACTATAAGCCACTCTTTGCAGGTTTTCATCGCATTATTACGAAAAATTACAATTAGGAAGGAAGCGGGACAGGACTCACTTTTTCATACTAGCACTAACCCGCAGCAGGTAAAAGCAGTTTGCTCGAACTATTCATAACATTTCAGGATTATCGCCAGATGAAATTGGTGACACTAATACCAGGATTGCTCTGAATATGACGTAATAACCGAGGAATGAATAAAGAATTACCGCAAATAATTAAGAATAGCCTCTAAATGATTATGGATTATTAAATCTATTAGCGCTACTTAATATAAATTAACTAACAATCAGTATTTTTTATGAATTTTATCCGTGGTTAATACTGGTTTTCGTATGAGATC > NC_000913/480677‑481166 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |