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| * | ? | NC_000913 | 480919 = | 0 (0.000) | 20 (0.590) | 14/484 | 1.0 | 100% | intergenic (‑211/+335) | tomB/acrB | Hha toxicity modulator TomB/multidrug efflux pump RND permease AcrB |
| ? | NC_000913 | = 1469240 | NA (NA) | noncoding (1/1331 nt) | IS2 | repeat region | |||||
ATATCATGTCTTTTGGGTGAGTATTCATCCATAACGCGTCCCCTTCTTAGCGGTTGAACTAACGGACACCTTTCGGGATGGAAAAAACTTACTGACCTGGACTTGCCCTCTCGTTTGTTAGCTTAACTATAAGCCACTCTTTGCAGGTTTTCATCGCATTATTACGAAAAATTACAATTAGGAAGGAAGCGGGACAGGACTCACTTTTTCATACTAGCACTAACCCGCAGCAGGTAAAAGCAGTTTGCTCGAACTATTCATAACATTTCAGGATTATCGCCAGATGAAATTGGTGACACTAATACCAGGATTGCTCTGAATATGACGTAATAACCGAGGAATGAATAAAGAATTACCGCAAATAATTAAGAATAGCCTCTAAATGATTATGGATTATTAAATCTATTAGCGCTACTTAATATAAATTAACTAACAATCAGTATTTTTTATGAATTTTATCCGTGGTTAATACTGGTTTTCGTATGAGATC > NC_000913/480677‑481166 | tacgccagagaaataactggctggctgctacaccatgttgccgggcaacgagggagaccgtcatccccggttcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGTTTGCt > 1:132562‑M1/243‑249 (MQ=255) 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1:324319‑M2/1‑65 (MQ=255) gggACAGGACTCACTTTTTCATACTAGCACTAACCCGCAGCAGGTAAAAGCAGTTTGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcctctgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctggtttgggcatgatactgatgtagtcacg > 1:6270‑M2/1‑57 (MQ=255) aCAGGACTCACTTTTTCATACTAGCACTAACCCGCAGCAGGTAAAAGCAGTTTGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcctctgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctggtttgggcatgatactgatgtagtcacgctt < 1:358990‑M2/251‑198 (MQ=255) aGGACTCACTTTTTCATACTAGCACTAACCCGCAGCAGGTAAAAGCAGTTTGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcctctgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctggtttgggcatgatactgatgtagtcacgcttta > 1:21645‑M2/1‑52 (MQ=255) 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ATATCATGTCTTTTGGGTGAGTATTCATCCATAACGCGTCCCCTTCTTAGCGGTTGAACTAACGGACACCTTTCGGGATGGAAAAAACTTACTGACCTGGACTTGCCCTCTCGTTTGTTAGCTTAACTATAAGCCACTCTTTGCAGGTTTTCATCGCATTATTACGAAAAATTACAATTAGGAAGGAAGCGGGACAGGACTCACTTTTTCATACTAGCACTAACCCGCAGCAGGTAAAAGCAGTTTGCTCGAACTATTCATAACATTTCAGGATTATCGCCAGATGAAATTGGTGACACTAATACCAGGATTGCTCTGAATATGACGTAATAACCGAGGAATGAATAAAGAATTACCGCAAATAATTAAGAATAGCCTCTAAATGATTATGGATTATTAAATCTATTAGCGCTACTTAATATAAATTAACTAACAATCAGTATTTTTTATGAATTTTATCCGTGGTTAATACTGGTTTTCGTATGAGATC > NC_000913/480677‑481166 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |