| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | NC_000913 | 3,791,179 | 0 | G | T | 30.4% | 201.4 / 11.7 | 116 | P56Q (CCG→CAG) | tdh | threonine dehydrogenase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (45/35); new base T (0/35); total (46/70) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.09e-10 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 116 total aligned reads displayed.
GCGTTACCGAAGGGATCAAAAATTGCGGCTAAGTCATCGGAAATATTGTCGGGGATTTTGAAGGCGTTGAATGCCGGGATCACCAGATATTCGGCAAAGCAGCCCGGGCGATTAACACCAACGCCTATCGTGTTGCGGCACAAATGGGTACGACCACCACGACAGTTGCGGCAATGACCACAGGTGATATGGCCTTCGCCAGAAACGCGATCGCCGATCTTGAAGCCTTTCACTTCCTGACCAATACCTACCACTTCACCGACATATTCATGGCCCACGACCATCGGCACCGGGATGGTTTTTTGCGACCACTCATCCCAGTTATAGATGTGAACGTCAGTCCCGCAGATGGCTGTTTTACGGATTTTAATCAGCAGATCGTTATGCCCGAGTTCCGGTACAGGAACGTCGGTCATCCAGATGCCCTCTTCCGCTTTCAGTTTGGATAACGCTTTCATCTCACATCCTCAGGCGATAACGCCCAGTTGTTTACCAATACGCGTAAATGCTTCTACTGCACGCGTAATTTGCTCAGGGGTATGCGCCGCAGACATCTGGGTACGAATACGCGCCTGACCTTT > NC_000913/3790888‑3791468 | gCGTTACCGACGGGATCAAAAATTGCGGCTAAGTCATCGGAAATATTGTCGGGGATTTTGAAGGCGTTGAATGCCGGGATCACCAGATATTCGGCAAAGCAGCCCGGGCGATTAACACCAACGCCTATCGTGTTGCGGCACAAATGGGTACGACTACCACGACAGTTGCGGCAATGACCACAGGTGATATGGCCTTCGCCAGAAACGTGATCGTCGATCTTGAAGCCTTTCACTTCCTGACCAATACCTACCACTTCACCGACATATTCATGGACCATGACCATCGGCACCGGGGTGGtt > 2:266723/1‑300 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gCCCACGACCATCGGCACCGGGATGGTTTTTTGCGACCACTCATCCCAGTTATAGATGTGAACGTCAGTCCCGCAGATGGCTGTTTTACGGATTTTAATCAGCAGATCGTTATGCCCGAGTTCCGGTACAGGAACGTCGGTCATCCAGATGCCCTCTTCCGCTTTCAGTTTGGATAACGCTTTCATCTCACATCCTCAGGCGATAACGCCCAGTTGTTTACCAATACGCGTAAATGCTTCTAc < 2:469556/243‑1 (MQ=255) gACCATCGGCACCGGGATGGTTTTTTGCGACCACTCATCCCAGTTATAGATGTGAACGTCAGTCCCGCAGATGGCTGTTTTACGGATTTTAATCAGCAGATCGTTATGCCCGAGTTCCGGTACAGGAACGTCGGTCATCCAGATGCCCTCTTCCGCTTTCAGTTNGGATAACGCTTTCATCTCACATCCTCAGGCGATAACGCCCAGTTGTTTACCAATACGCGTAAATGCTTCTACTGCACGCGTAATTTGCTCAGGGGTATGCGCCGCAGACATCTGGGTACGAATACGCGCCTGAcc < 2:534624/300‑1 (MQ=255) cATCGGCACCGGGATGGTTTTTTGCGACCACTCATCCCAGTTATAGATGTGAACGTCAGTCCCGCAGATGGCTGTTTTACGGATTTTAATCAGCAGATCGTTATGCCCGAGTTCCGGTACAGGAACGTCGGTCATCCAGATGCCCTCTTCCGCTTTCAGTTTGGATAACGCTTTCATCTCACATCCTCAGGCGATAACGCCCAGTTGTTTACCAATACGCGTAAATGCTTCTACTGCCCGCATAATTTGCTCAGGGGTATGCGCCGCAGACATCTGGGTACGAATAAGCGCCTGACCttt > 2:652450/1‑300 (MQ=255) | GCGTTACCGAAGGGATCAAAAATTGCGGCTAAGTCATCGGAAATATTGTCGGGGATTTTGAAGGCGTTGAATGCCGGGATCACCAGATATTCGGCAAAGCAGCCCGGGCGATTAACACCAACGCCTATCGTGTTGCGGCACAAATGGGTACGACCACCACGACAGTTGCGGCAATGACCACAGGTGATATGGCCTTCGCCAGAAACGCGATCGCCGATCTTGAAGCCTTTCACTTCCTGACCAATACCTACCACTTCACCGACATATTCATGGCCCACGACCATCGGCACCGGGATGGTTTTTTGCGACCACTCATCCCAGTTATAGATGTGAACGTCAGTCCCGCAGATGGCTGTTTTACGGATTTTAATCAGCAGATCGTTATGCCCGAGTTCCGGTACAGGAACGTCGGTCATCCAGATGCCCTCTTCCGCTTTCAGTTTGGATAACGCTTTCATCTCACATCCTCAGGCGATAACGCCCAGTTGTTTACCAATACGCGTAAATGCTTCTACTGCACGCGTAATTTGCTCAGGGGTATGCGCCGCAGACATCTGGGTACGAATACGCGCCTGACCTTT > NC_000913/3790888‑3791468 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |