| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| JC JC | NC_000913 | 1,995,620 | IS5 (–) +4 bp | intergenic (‑261/‑32) | uvrY ← / → yecU | DNA‑binding transcriptional activator UvrY/protein YecU |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | 1995620 = | 0 (0.000) | 115 (1.250) | 72/586 | 0.1 | 100% | intergenic (‑261/‑35) | uvrY/yecU | DNA‑binding transcriptional activator UvrY/protein YecU |
| ? | NC_000913 | = 2290113 | NA (NA) | noncoding (1/1195 nt) | IS5 | repeat region | |||||
Only 100 of 236 total aligned reads displayed.
ACCAGTTCGTGGTCATCAACAAGTAGAACGTTGATCAAAGGAATATCTCCAGAAATAGGGATAACGCTACTGATAGTTAGTCATTCGTATATTAGCGGTTTTTATTGCAACTTTGAAACGTTAAAAATGGTGGGTATTCGATTTTTCTCTCGTTTTTGTCAATTCGATTGTCCACAGTTATGGTCACGCCCGTCACCAACGGCTTACCGGATCGTTTCACAGTAAGCCCTACGATGAAATGTGACAAAAATTG‑ACTTTATTCAGCAAAAATGAAAATCAGCCCGCTGAATATGTAACATTAATTAA‑CCCGAAC‑AATACGGGCAAAAAACATTCATGATAAAAATATTTATTGGTCATTATATTAACGTATTTTATAGCACTGCCGATATCACGCTCAAAAAACAACCACTGCTATTTTTAGCAAAGCTTATGGTATACTCCGCCGCCTTAACATTTTTCACCGCAAATTTTCATTGCAACATGACGAGGAAAATAAATGAGTACGCCTGATTTTTCTACTGCCGAGAATAATCAAGAACTGGCAAATGAAG‑TCTCCTGCCTGAAAGCGATGCTGACGCTGATGCTGCAGGCGATGGG > NC_000913/1995322‑1995918 | gTTCGTGGTCCTCAACAAGTAGAACGTTGATCAAAGGAATATCTACAGAAATAGGGATAACGCTACTGATAGTTAGTCATTCGTATATTAGCGGTTTTTATTGCAACTTTGAAACGTTAAAAATGGTGGGTATTCGATTTTTCTCTCGTTTTTGTCAATTCGATTGTCCACAGTTATGGTCACGCCCGTCACCAACGGCTTACCGGATCGTTTCACAGTAAGCCCTACGATGAAATGTGACAAAAATTG‑ACTTTATTCAGCAAAAATGAAAATCAGCCCGCTGAATATGTAACattaa > 1:645932/1‑298 (MQ=255) 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(MQ=255) tccTTAATTAA‑CCCGAAC‑AATACGGGCAAAAAACATTCATGATAAAAATATTTATTGGTCATTATATTAACGTATTTTATAGCACTGCCGATATCACGCTCAAAAAACAACCACTGCTATTTTTAGCAAAGCTTATGGTATACTCCGCCGCCTTAACATTTTTCACCGCAAATTTTCATTGCAACATGACGAGGAAAATAAATGAGTACGCCTGATTTTTCTACTGCCGAGAATAATCAAGAACTGGCAAATGAAG‑TCTCCTGCCTGAAAGCGATGCTGACGCTGATGCTGCAGGCGAt < 1:232286‑M1/296‑1 (MQ=255) cATTAAggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttcatgtttgagccgattttttctcccgtaaatgccttgaatcagcctatttagaccgtttcttcgccatttaaggcgttatccccagtttttagtgagatctctaccactgacgtatcatttggtccgcccgaaacaggttggccagcgtgaataacatcgccagttggttatcgtttttcagcaaccccttgtatctggctttcacgaagccgaactgtcgcttgatgatgcgaaat < 1:269051‑M2/300‑295 (MQ=255) | ACCAGTTCGTGGTCATCAACAAGTAGAACGTTGATCAAAGGAATATCTCCAGAAATAGGGATAACGCTACTGATAGTTAGTCATTCGTATATTAGCGGTTTTTATTGCAACTTTGAAACGTTAAAAATGGTGGGTATTCGATTTTTCTCTCGTTTTTGTCAATTCGATTGTCCACAGTTATGGTCACGCCCGTCACCAACGGCTTACCGGATCGTTTCACAGTAAGCCCTACGATGAAATGTGACAAAAATTG‑ACTTTATTCAGCAAAAATGAAAATCAGCCCGCTGAATATGTAACATTAATTAA‑CCCGAAC‑AATACGGGCAAAAAACATTCATGATAAAAATATTTATTGGTCATTATATTAACGTATTTTATAGCACTGCCGATATCACGCTCAAAAAACAACCACTGCTATTTTTAGCAAAGCTTATGGTATACTCCGCCGCCTTAACATTTTTCACCGCAAATTTTCATTGCAACATGACGAGGAAAATAAATGAGTACGCCTGATTTTTCTACTGCCGAGAATAATCAAGAACTGGCAAATGAAG‑TCTCCTGCCTGAAAGCGATGCTGACGCTGATGCTGCAGGCGATGGG > NC_000913/1995322‑1995918 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |