| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NC_000913 | 606,604 | G→A | T260T (ACC→ACT) | ybdK ← | putative glutamate‑‑cysteine ligase 2 |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 606,604 | 0 | G | A | 99.1% | 361.6 / NA | 105 | T260T (ACC→ACT) | ybdK | putative glutamate‑‑cysteine ligase 2 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/1); new base A (54/50); total (54/51) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.86e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 105 total aligned reads displayed.
ATCGGCGACGAAATCGCGCATTAGCTGCGCTTCATTCAGACCGCTGACGACCTGGCGATGCAGGGCCTCAATCGCGCTCGATGCACCAATTTTATGTGCGGAAGGGGCGATTTTTTCCAGCAATCGCAAGGTATCTTCCGTTAGCGGTCGACGATCTCCAGTGTGCGGATCGGTGATGACGCCTTCAAGCCCATAGCGACAGGCCTGGAAACGGTTGAATTTATACAGCAGGTAATCTTTTTCCTGATGTTTAAACGGGCGTTCCGTCAGTAACCAGTGGGCGGTAGCCTGAATTAATCCCGCCATATTTACTGCGTGGCTAAGGGTTAACGGGGTATCCATCACCCGAACCTCCACCGT‑GCCAAAATGAGGACTGGGGCGAATATCCCAGTGCAGATCTTTAATGCTGTCGATCATCGTGGTGTAACTCAGACAGCGAAACAGGGCTTCAAATTGTTGCCAGTTACTGACCCACGGCATCGGGCCATTATCAGGAAAGGCGGAAAAAATATTCGGTCGTGAGGAGGCAAAACGCGTATCCGTTCCCTGCATATATGGCGACGCGGCGGAAAGGGC > NC_000913/606322‑606897 | aTCGGCGACGAAATCGCGCATTAGCTGCGCTTCATTCAGACCGCTGACGACCTGGCGATGCAGGGCCTCAATCGCGCTCGATGCACCAATTTTATGTGCGGAAGGGGCGATTTTTTCCAGCAATCGCAAGGTATCTTCCGTTAGCGGTCGACGATCTCCAGTGTGCGGATCGGTGATGACGCCTTCAAGCCCATAGCGACAGGCCTGGAAACGGTTGAATTTATACAGCAGGTAATCTTTTTCCTGATGTTTAAACGGGCGTTCCGTCAGTAACCAGTGGGCAGTAGCCTGAATTAATc < 1:466285/299‑1 (MQ=255) 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gCGTTCCGTCAGTAACCAGTGGGCAGTAGCCTGAATTAATCCCGCCATATTTACTGCGTGGCTAAGGGTTAACGGGGTNTCCATCACCCGAACCTCCACCGT‑GCCAAAATGAGGACGGGGGCGAATATCCCAGTGCAGATCTTTAATGCTGTCGATCATCGTGGTGTAACTCAGACAGCGAAACAGGGCTTCAAATTGTTGCCAGTTACTGACCCACGGCATCGGGCCATTATCAGGAAAGGCGGAAAAAATATTCGGTCGTGAGGAGGCAAAACGCGTATCCGTTCCCTGCATATATgg < 1:198865/300‑1 (MQ=255) tCCGTCAGTAACCAGTGGGCAGTAGCCTGAATTAATCCCGCCATATTTACTGCGTGGCTAAGGGTTAACGGGGTATCCATCACCCGAACCTCCACCGT‑GCCAAAATGAGGACTGGGGCGAATATCCCAGTGCAGATCTTTAATGCTGTCGATCATCGTGGTGTAACTCAGACAGCGAAACAGGGCTTCAAATTGTTGCCAGTTACTGACCCACGGCATCGGGCCATTATCAGGAAAGGCGGAAAAAATATTCGGTCGTGAGGAGGCAAAACGCGTATCCGTTCCCTGCATATATGGCGAc > 1:50741/1‑300 (MQ=255) gTCAGTAACCAGTGGGCAGTAGCCTGAATTAATCCCGCCATATTTACTGCGTGGCTAAGGGTTAACGGGGTATCCATCACCCGAACCTCCACCGT‑GCCAAAATGAGGACTGGGGCGAATATCCCAGTGCAGATCTTTAATGCTGTCGATCATCGTGGTGTAACTCAGACAGCGAAACAGGGCTTAAAATTGTTGCCAGTTACTGACCCACGGCATCGGGCCATTATCAGGAAAGGCGGAAAAAATATTCGGTCGTGAGGAGGCAAAACGCGTATCCGTTCCCTGCATATATGGCGAcgc > 2:157441/1‑299 (MQ=255) acccAGTGGGCAGTAGCCTGAATTAATCCCGCCATATTTACTGCGTGGCTAAGGGTTAACGGGGTATCCATCACCCGAACCTCCACCGT‑GCCAAAATGAGGACTGGGGCGAATATCCCAGTGCAGATCTTTAATGCTGTCGATCATCGTGGTGTAACTCAGACAGCGAAACAGGGCTTCAAATTGTTGCCAGTTACTGACCCACGGCATCGGGCCATTATCAGGAAAGGCGGAAAAAATATTCGGTCGTGAGGAGGCAAAACGCGTATCCGTTCCCTGCATATATGGCGAAGCGGCGGaa > 1:262394/3‑300 (MQ=255) ccAGTGGGCAGTAGCCTGAATTAATCCCGCCATATTTACTGCGTGGCTAAGGGTTAACGGGGTATCCATCACCCGAACCTCCACCGT‑GCCAAAATGAGGACTGGGGCGAATATCCCAGTGCAGATCTTTAATGCTGTCGATCATCGTGGTGTAACTCAGACAGCGAAACAGGGCTTCAAATTGTTGCCAGTTACTGACCCACGGCATCGGGCCATTATCAGGAAAGGCGGAAAAAATATTCGGTCGTGAGGAGGCAAAACGCGTATCCGTTCCCTGCATATATGGCGACGCGGCGGaaa > 1:145572/1‑299 (MQ=255) gTGGGCAGTAGCCTGAATTAATCCCGCCATATTTACTGCGTGGCTAAGGGTTAACGGGGTATCCATCACCCGAACCTCCACCGT‑GCCAAAATGAGGACTGGGGCGAATATCCCAGTGCAGATCTTTAATGCTGTCGATCATCGTGGTGTAACTCAGACAGCGAAACAGGGCTTCAAATTGTTGCCAGTTACTGACCCACGGCATCGGGCCATTATCAGGAAAGGCGGAAAAAATATTCGGTCGTGAGGAGGCAAAACGCGTATCCGTTCCCTGCATATATGGCGACGCGGCGGAAAGGGc > 2:484722/1‑300 (MQ=255) | ATCGGCGACGAAATCGCGCATTAGCTGCGCTTCATTCAGACCGCTGACGACCTGGCGATGCAGGGCCTCAATCGCGCTCGATGCACCAATTTTATGTGCGGAAGGGGCGATTTTTTCCAGCAATCGCAAGGTATCTTCCGTTAGCGGTCGACGATCTCCAGTGTGCGGATCGGTGATGACGCCTTCAAGCCCATAGCGACAGGCCTGGAAACGGTTGAATTTATACAGCAGGTAATCTTTTTCCTGATGTTTAAACGGGCGTTCCGTCAGTAACCAGTGGGCGGTAGCCTGAATTAATCCCGCCATATTTACTGCGTGGCTAAGGGTTAACGGGGTATCCATCACCCGAACCTCCACCGT‑GCCAAAATGAGGACTGGGGCGAATATCCCAGTGCAGATCTTTAATGCTGTCGATCATCGTGGTGTAACTCAGACAGCGAAACAGGGCTTCAAATTGTTGCCAGTTACTGACCCACGGCATCGGGCCATTATCAGGAAAGGCGGAAAAAATATTCGGTCGTGAGGAGGCAAAACGCGTATCCGTTCCCTGCATATATGGCGACGCGGCGGAAAGGGC > NC_000913/606322‑606897 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |