| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NC_000913 | 4,578,548 | G→A | Q264* (CAG→TAG) Q264* (CAG→TAG) |
mcrB ← mcrB ← |
5‑methylcytosine‑specific restriction enzyme subunit McrB 5‑methylcytosine‑specific restriction enzyme subunit McrB |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | NC_000913 | 4,578,548 | 0 | G | A | 99.4% | 606.1 / NA | 168 | Q264* (CAG→TAG) Q264* (CAG→TAG) | mcrB mcrB | 5‑methylcytosine‑specific restriction enzyme subunit McrB 5‑methylcytosine‑specific restriction enzyme subunit McrB |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base A (93/74); minor base C (1/0); total (94/74) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 168 total aligned reads displayed.
GTATCAAAACCTGGCTCAATATCTATGAAAGAAAATCGTCTGCGTAGGGCATAGTCAACAACGGCCAGAGAGCGATCGGCAGTATTCATTAAACCGATGATATAAACATTCTCCGGGACATAGAATCGTTCTTCATCGTTTTCGGAGTAGGTTAGGGGAACAGACCAGTTTTCACCTCGTTTATCATGTTCCATTAACATCATCACTTCGCCAAATACTTTACTGAGATTGGCACGATTGATTTCATCTATAATAAAAATATACTTTTTCTCTGGCTGCTCTTTAGCTTGCTGACAAAAATTGTAAAATATGCCGTCTTTACGTCGGAAGCCGACGCCATTCGGACGATAGCCCTGTATAAAATCCTCATAGCTATAAGATTGATGGAACTGAACCATATTGACGCGTTGCGGAGCCTTTTCTCCTGTCAGCAAGTAAGCCAGACGGCGTGCAACAAAGGTTTTTCCAACGCCGGGCGGCCCCTGGAGGATAATATTTTTTTTGATGGTTAATCGTTTGAGTATCGTCTCTATTGTGGTTTCAGGGATAAACAAATCATTTAACGCATCTTCCAGACAGTATGATTC > NC_000913/4578256‑4578842 | gtATCAAAACCTGGCTCAATATCTATGAAAGAAAATCGTCTGCGTAGGGCATAGTCAACAACGGCCAGAGAGCGATCGGCAGTATTCATTAAACCGATGATATAAACATTCTCAGGGACATAGAATCGTTCTTCATCGTTTTCGGAGTAGGTTAGGGGAACAGACCAGTTTTCACCTCGTTTATCATGTTCCATTAACATCATCACTTCGCCAAATACTTTACTGAGATTGGCACGATTGATTTCATCTATAATAAAAATATACTTTTTCTCTGGCTGCTCTTTAGCTTGCTAACaaaaa > 2:272276/1‑300 (MQ=255) 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gCTTGCTAACAAAAATTGTAAAATATGCCGTCTTTACGTCGGAAGCCGACGCCATTCGGACGATAGCCCTGTATAAAATCCTCATAGCTATAAGATTGATGGAACTGAACCATATTGACGCGTTGCGGAGCCTTTTCTCCTGTCAGCAAGTAAGCCAGACGGCGTGCAACAAAGGTTTTTCCAACGCCGGGCGGCCCCTGTAGGATAATATTTTTTTTGATGGTTAATCGTTTGAGTATCGTCTCTATTGTGGTTTCAGGGATAAACAAATCATTTAACGCATCTTCCAGACAGTATGAt < 2:13561/300‑1 (MQ=255) gCTTGCTAACAAAAATTGTAAAATATGCCGTCTTTACGTCGGAAGCCGACGCCATTCGGACGATAGCCCTGTATAAAATCCTCATAGCTATAAGATTGATGGAACTGAACCATATTGACGCGTTGCGGAGCCTTTTCTCCTGTCAGCAAGTAAGCCAGACGGCGTGCAACAAAGGTTTTTCCAACGCCGGGCGGCCCCTGGAGGATAATATTTTTTTTGATGGTTAATCGTTTGAGTATCGTCTCTATTGTGGTTTCAGGGATAAACAAATCATTTAACGCATCTTCCAGACAGTATGAt < 1:903629/300‑1 (MQ=255) ttGCTAACAAAAATTGTAAAATATGCCGTCTTTACGTCGGAAGCCGACGCCATTCGGACGATAGCCCTGTATAAAATCCTCATAGCTATAAGATTGATGGAACTGAACCATATTGACGCGTTGCGGAGCCTTTNCTCCTGTCAGCAAGTAAGCCAGACGGCGTGCAACAAAGGTTTTTCCAACGCCGGGCGGCCCCTGGAGGATAATATTTTTTTTGATGGTTAATCGTTTGAGTATCGTCTCTATTGTGGTTTCATGGATAAACAAATCATTTAACGCATCTTCCAGACAGTATGATTc < 2:307967/300‑1 (MQ=255) | GTATCAAAACCTGGCTCAATATCTATGAAAGAAAATCGTCTGCGTAGGGCATAGTCAACAACGGCCAGAGAGCGATCGGCAGTATTCATTAAACCGATGATATAAACATTCTCCGGGACATAGAATCGTTCTTCATCGTTTTCGGAGTAGGTTAGGGGAACAGACCAGTTTTCACCTCGTTTATCATGTTCCATTAACATCATCACTTCGCCAAATACTTTACTGAGATTGGCACGATTGATTTCATCTATAATAAAAATATACTTTTTCTCTGGCTGCTCTTTAGCTTGCTGACAAAAATTGTAAAATATGCCGTCTTTACGTCGGAAGCCGACGCCATTCGGACGATAGCCCTGTATAAAATCCTCATAGCTATAAGATTGATGGAACTGAACCATATTGACGCGTTGCGGAGCCTTTTCTCCTGTCAGCAAGTAAGCCAGACGGCGTGCAACAAAGGTTTTTCCAACGCCGGGCGGCCCCTGGAGGATAATATTTTTTTTGATGGTTAATCGTTTGAGTATCGTCTCTATTGTGGTTTCAGGGATAAACAAATCATTTAACGCATCTTCCAGACAGTATGATTC > NC_000913/4578256‑4578842 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |