| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NC_000913 | 4,058,823 | G→A | W139* (TGG→TGA) | bipA → | 50S ribosomal subunit assembly factor BipA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 4,058,823 | 0 | G | A | 99.2% | 449.6 / NA | 127 | W139* (TGG→TGA) | bipA | 50S ribosomal subunit assembly factor BipA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/1); new base A (54/72); total (54/73) | |||||||||||
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| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 127 total aligned reads displayed.
GCGTGATGGACTCCAACGATTTGGAGAAAGAGCGTGGGATTACCATCCTCGCGAAAAACACCGCTATCAAATGGAATGATTACCGTATCAACATCGTTGATACCCCGGGGCACGCCGACTTCGGTGGTGAAGTTGAACGTGTAATGTCCATGGTAGACTCAGTGCTGCTGGTGGTTGACGCATTTGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAAGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACGCGACCGACGAGCAGCTGGACTTCCCGATCGTTTACGCTTCTGCGCTGAACGGTATCGCGGGTCTGGACCACGAAGATATGGCGGAAGACATGACCCCGCTGTACCAGGCGATTGTTGACCACGTTCCTGCGCCGGACGTTGACCTTGACGGTCCGTTCCAGATGCAGATTTCTCAGCTCGATTACAACAGCTATGTTGGCGTTATCGGCATTGGCCGCATCAAGCGCGGTAAAGTGAAGCCGAACCAGCAGGTCA > NC_000913/4058528‑4059118 | gcgTGATGGACTCCAANGATTTGGAGAAAGAGCGTGGGATTACCATCCTCGCGAAAAACACCGCTATCAAATGGAATGATTACCGTATCAACATCGTTGATACCCCGGGGCACGCCGACTTCGGTGGTGAAGTTGAACGTGTAATGTCCATGGTAGACTCAGTGCTGCTGGTGGTTGACGCATTTGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACNAAGTTGACCGCCCTGGCGNGCGTCCTGATTGAGtt > 1:769875/1‑299 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gCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGAGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACGCGACCGACGAGCAGCTGGACTTCCCGATCGTTTACGCTTCTGCGCTGAACGGTATCGCGGGTCTGGACCACGAAGATATGGCGGAAGACATGACCCCGCTGTACCAGGCGATTGTTGACCACGTTCCTGCGCCGGACGTTGACCTTGACGGTCCGTTCCAGATGCAGATTTCTCAGCTCGATTACAACAGCTATGTTGGCGTTATCGGCATTGGCCGCATCAAGCGCGGTAAAGTGa > 1:153411/1‑300 (MQ=255) gCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGAGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACGCGACCGACGAGCAGCTGGACTTCCCGATCGTTTACGCTTCTGCGCTGAACGGTATCGCGGGTCTGGACCACGAAGATATGGCGGAAGACATGACCCCGCTGTACCAGGCGATTGTTGACCACGTTCCTGCGCCGGACGTTGACCTTGACGGTCCGTTCCAGATGCAGATTTCTCAGCTCGATTACAACAGCTATGTTGGCGTTATCGGCATTGGCCGCATCAAGCGCGGTAAAGTGa > 2:863514/1‑300 (MQ=255) ttgcgcgcGTCCTGATTGAGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACGCGACCGACGAGCAGCTGGACTTCCCGATCGTTTACGCTTCTGCGCTGAACGGTATCGCGGGTCTGGACCACGAAGATATGGCGGAAGACATGACCCCGCTGTACCAGGCGATTGTTTACCACGTTCCTGCGCCGGACGTTGACCTTGACGGTCCGTTCCAGATGCAGATTTCTCAGCTCGATTACAACAGCTATGTTGGCGTTATCGGCATTGGCCGCATCAAGCGCGGTAAAGTGAAGc < 2:106059/297‑1 (MQ=255) ttgcgcacGTCCTGGTTGAATTGTGGATCAGGTATGCGATCTGTGCTTTAACCTCGCCGCGACCGACGAGCAGCTGGACTTCCCGATCGTTTACGCTTCTGCGCTGAACGGTATCACGGGTCTGGACCACTAAGATATGGCGGAAGACATGACCCCGCTGTACCATGCGATTGTTGACCACGTTCCTGCGCCGGACGTGGACCTTGACGGTCCGTTCCAGATGCAGATTTCTCAGCTCGATTACAACAGCTATGTTGGCGTTATCGGCATTGGc < 2:117964/272‑1 (MQ=255) cgTCCTGATTGAGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACGCGACCGACGAGCAGCTGGACTTCCCGATCGTTTACGCTTCTGCGCTGAACGGTATCGCGGGTCTGGACCACGAAGATATGGCGGAAGACATGACCCCGCTGTACCAGGCGATTGTTGACCACGTTCCTGCGCCGGACGTTGACCTTGACGGTCCGTTCCAGATGCAGATTTCTCAGCTCGATTACAACAGCTATGTTGGCGTTATCGGCATTGGCCGCATCAAGCGCGGTAAAGTGAAGCCGAACca > 1:134330/1‑299 (MQ=255) aTTGAGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACGCGACCGACGAGCAGCTGGACTTCCCGATCGTTTACGCTTCTGCGCTGAACGGTATCGCGGGTCTGGACCACGAAGATATGGCGGAAGACATGACCCCGCTGTACCAGGCGATTGTTGACCACGTTCCTGCGCCGGACGTTGACCTTGACGGTCCGTTCCAGATGCAGATTTCTCAGNTCGATTACAACAGCTATGTTGGCGTTATCGGCATTGGCCGCATCAAGCGCGGTAAAGTGAAGCCGAACCAGCAGGTCa > 1:667609/1‑300 (MQ=255) | GCGTGATGGACTCCAACGATTTGGAGAAAGAGCGTGGGATTACCATCCTCGCGAAAAACACCGCTATCAAATGGAATGATTACCGTATCAACATCGTTGATACCCCGGGGCACGCCGACTTCGGTGGTGAAGTTGAACGTGTAATGTCCATGGTAGACTCAGTGCTGCTGGTGGTTGACGCATTTGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAAGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACGCGACCGACGAGCAGCTGGACTTCCCGATCGTTTACGCTTCTGCGCTGAACGGTATCGCGGGTCTGGACCACGAAGATATGGCGGAAGACATGACCCCGCTGTACCAGGCGATTGTTGACCACGTTCCTGCGCCGGACGTTGACCTTGACGGTCCGTTCCAGATGCAGATTTCTCAGCTCGATTACAACAGCTATGTTGGCGTTATCGGCATTGGCCGCATCAAGCGCGGTAAAGTGAAGCCGAACCAGCAGGTCA > NC_000913/4058528‑4059118 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |