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| * | ? | NC_000913 | = 3931182 | 0 (0.000) | 136 (1.200) | 74/586 | 0.2 | 100% | intergenic (‑89/‑134) | ravA/kup | regulatory ATPase RavA/K(+):H(+) symporter Kup |
| ? | NC_000913 | 4502090 = | NA (NA) | noncoding (1426/1426 nt) | IS4 | repeat region | |||||
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AAACGCGCGGGCATTCTGAAAGGCGAATTTTAAGCGCCGGGCGATCAAACTTTTGGCAATACCTGGCGGGCCAAGGAGGAACACACTTTCACCACTTAATGCCGCTAATAAACACAAGCGGATGGCGTGGCTACGTTCATAAAGCCCCTTTTCCAACGAACTGCTCAGGCGGGAAATTCTTTCCGCTAATAAATGAGGGTGAGCCATAATGAAGTGGCGTCCTTTCGTCAAAAGTTCTGCGTAAATTGCGAGTATAGACGTTTCTTGCTGGTGGCTAAAATAGTCTCAAAGGGGGGGTATTTTTCTTTGAGCCAGGTTAATGTGGCCGCATTTAGGAGTACGATTTTGCCGTTAATCGTGCATACTGTGCGCTTTTTTGTGGGCCAAGGGACTAAGCACACATTTCATATTTCAACGAAAGACTAGTCTATGAGCACTGATAATAAGCAATCATTGCCCGCGATTACCCTCGCGGCGATTGGAGTTGTCTACGGCGATATTGGTACCAGCCCGTTATATACACTTCGTGAATGTTTGTCCGGCCAGTTTGGTTTTGGCGTTGAACGCGATGCCGTGTTTGGCTTTTTATCGCT > NC_000913/3930887‑3931479 | tctttacgctcaagcgccatgccaacaatacaccagaccatcatttcgaggggaagacggcgtttgcgtagcgttacagtacctgattcggcaaggcaacgagagatgagttcggggtcgaggtaatcccccagagaagtaagtgggttacgcagagaatcgtaacgggataccagatcaagagcctgtccaatgtgcataaaaaaatccggaaaccagtgagcgtttacggattcttacacagccactggatcggtcaactgatccctcactgatcggcattaCTCAAAGGGGGGGTAt < 1:753570‑M1/16‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |