| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,436,956 | 2 bp→TT | coding (202‑203/741 nt) | cysQ → | 3'(2'),5'‑bisphosphate nucleotidase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,436,956 | 0 | C | T | 100.0% | 39.0 / NA | 16 | P68F (CCC→TTC) | cysQ | 3'(2'),5'‑bisphosphate nucleotidase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (8/8); total (8/8) | |||||||||||
| * | NC_000913 | 4,436,957 | 0 | C | T | 100.0% | 42.1 / NA | 16 | P68F (CCC→TTC) | cysQ | 3'(2'),5'‑bisphosphate nucleotidase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (8/8); total (8/8) | |||||||||||
AGGTGGAGAAATGTTAGATCAAGTATGCCAGCTTGCACGGAATGCAGGCGATGCCATTATGCAGGTCTACGACGGGACGAAACCGATGGACGTCGTCAGCAAAGCGGACAATTCTCCGGTAACGGCAGCGGATATTGCCGCTCACACCGTTATCATGGACGGTTTACGTACGCTGACACCGGATGTTCCGGTCCTTTCTGAAGAAGATCCTCCCGGTTGGGAAGTCCGTCAGCACTGGCAGCGTTACTGGCTGGTAGACCCGCTGGATGGTACTAAAGAGTTTATTAAACGTAATGGCGAATTCACCGTTAACATTGCGCTCATTGACCATGGCAAACCGATTTTAGGCGTGGTGTATGCGCCGGTAATGAACGTAATGTACAGCGCGGCAGAAGGCAAAGCGTGGAAAGAAGAGTGCGGTGTGCGCAAGCAGATTCAGGTCCGCGATGC > NC_000913/4436745‑4437194 || aGGTGGAGAAATGTTAGATCAAGTATGCCAGCTTGCACGGAATGCAGGCGATGCCATTATGCAGGTCTACGACGGGACGAAACCGATGGACGTCGTCAGCAAAGCGGACAATTCTCCGGTAACGGCAGCGGATATTGCCGCTCACACCGTTATCATGGACGGTTTACGTACGCTGACACCGGATGTTCCGGTCCTTTCTGAAGAAGATCCTTTCGGTTGGGAAGTCCGTCAGCACTGGCAGCGTTActggc > 1:222624/1‑251 (MQ=255) cGATGGACGTCGTCAGCAAAGCGGACAATTCTCCGGTAACGGCAGCGGATATTGCCGCTCACACCGTTATCATGGACGGTTTACGTACGCTGACACCGGATGTTCCGGTCCTTTCTGAAGAAGATCCTTTCGGTTGGGAAGTCCGTCAGCACTGGCAGCGTTACTGGCTTGTAGACCCGCTGGATGGTACTAAAGAGTTTATTAAACGTAATGGCGAAGTCACCGTGAACATTGCGCTCATTGACCATGGc < 1:407132/251‑1 (MQ=255) ggACGTCGTCAGCAAAGCGGACAATTCTCCGGTAACGGCAGCGGATATTGCCGCTCACACCGTTATCATGGACGGTTTACGTACGCTGACACCGGATGTTCCGGTCCTTTCTGAGGAAGATCCTTTCGGTTGGGAAGTCCGTCAGCACTGGCAGCGTTACTGGCTGGTAGACCCGCTGGATGGTACTAAAGAGTTTATTAAACGTAATGGCGAATTCACCGTTAAAATTGCGCTCATTGACCATGGCAAAc > 1:330383/1‑251 (MQ=255) gCAAAGCGGACAATTCTCCGGTAACGGCAGCGGATATTGCCGCTCACACCGTTATCATGGACGGTTTACGTACGCTGACACCGGATGTTCCGGTCCTTTCTGAAGAAGATCCTTTCGGTTGGGAAGTCCGTCAGCACTGGCAGCGTTACTGGCTGGTAGACCCGCTGGATGGTACTAAAGAGTTTATTAAACGTAATg < 1:95841/198‑1 (MQ=255) gCAAAGCGGACAATTCTCCGGTAACGGCAGCGGATATTGCCCCTCACACCGTTATCATGGATGGTTTACGTACGCTGACACCGGATGTTCCGGTCCTTTCTGAAGAAGATCCTTTCGGTTGGGAAGTCCGTCAGCACTGGCAg > 1:176775/1‑143 (MQ=255) aaaGCGGACAATTCTCCGGTAACGGCAGCGGATATTGCCGCTCACACCGTTATCATGGACGGTTTACGTACGCTGACACCGGATGTTCCGGTCCTTTCTGAAGAAGATCCTTTCGGTTGGGAAGTCCGTCAGCACTGGCAGCGTTACTGGCTGGTAg > 1:189880/1‑157 (MQ=255) taCAATTCTCCGGTAACGGCAGCGGATATTGCCGCTCACACCGTTATCATGGACGGTTTACGTACGCTGACACCGGATGTTCCGGTCCTTTCTGAAGAAGATCCTTTCGGTTGGGAAGTCCGTc > 1:96923/2‑124 (MQ=255) gACAATTCTCCGGTAACGGCAGCGGATATTGCCGCNCACACCGTTNNCANGGACTNTNNNCNNNCGNTGACACCGTATGTTCCGGTNCTNNCTGAAGNAGATCCTTTCGGTTGGGAAGTCCGTc < 2:96923/124‑1 (MQ=255) cAATTCTCCGGTAACGGCAGCGGATATTGCCGCTCACACCGTTATCATGGACGGTTTACGTACGCTGACACCGGATGTTCCGGTCCTTTCTGAAGAAGATCCTTTCGGTTGGGAAGTCCGTCAGCACGGGCAGCGTTACTGGCTGGTAGACCCGCTGGATGGTACTAAAGAGTTTATTAAACGTAATGGCGAATTCACCGTTAACATTGCGCTCATTGACCATGGCAAACCGATGTTAGGCGTGGTGTATg < 1:137542/251‑1 (MQ=255) nnnnnnncnttnnttGCNGCGCACCCCGTTATCATGGACGGTNTACGTACGCTGACACCGGATTTCCCGGTCCGNTNTGAAGAAGATCCTTTCGGTTGGGAAGTCCGGCAGCTCTGGCAGCGTGANTGGCTGGTAGNCCCNNTGGANGNTNCTAAAGAGTTTATTAAACGTAATGGCGAANTCACCGTTAACATTGCGCGCATTNNCCNNNGCNNACCGa < 2:330383/207‑1 (MQ=255) gCGGATATTGCCGCTCACACCGTTATCATGGACGGTTTACGTACGCTGACACCGGATGTTCAGGTCCTTTCTGACGAAGATCCTTTCGGTTGGGAAGTCCGTCAGCACTGGCAGCGTTACTGGCTGGTAGACCCGCTGGATGGTACTAAAGAGTTTATTAAACGTAATGGCGAATTCACCGTTAACATTGCGCTCATTGACCATGGCAAAc > 1:326775/1‑211 (MQ=255) cGGATATTGCCGCTCACACCGTGATCATGGACGGTTTACGTACGCTGACACCGGATGTTCCGGTCCTTTCTGAAGAAGCTCCTTTCGGTTGGGAAGTCCGTCAGCACTGGCAGCGTTACTGGCTGGTAGACCCGCTGGATGGTACTAAAGAGTTTATTAAACGTAATGGCGAATTCACCGTTAACATTGCGCTCATTGACCATGGCAAACCGATTTTAGGCGTGgtgt > 1:372592/1‑228 (MQ=255) cGCTCACACCGTGAGCATGGTCGGGTTACGTACGCTGACACCGGATGTTCCTGTCCTTTCTGAAGAAGATCCTTTCGGTTGGGAAGTCCGTCAGCACTGGCAGCGTTACTTGCTGGTAGACCCGCTGGATGTTACTAAATAGTTTATTAAACGTAATGTCGAATTCACCGTTAACATTGCGCTCAGTGACCATGGCAAACCGATTTTAGGCGTTGTGTATGCGCCGGTAATTAACGTAATGTACAGCGCgg < 1:319272/251‑1 (MQ=255) acgtacgCTGACACCGGATGTTCCGGTCCTTTCTGAAGAAGATCCTTTCGGTTGGGAAGTCCGTCAGCACTGGCAGCGTTACTGGCTGGTAGACCCGCTGGATGGTACTAAAGAGTTTATTAAACGTAATGGCGAATTCACCGTTAACATTGCGCTCATTGACCATGGCAAACCGATTTTAGGCGGGGGGTATGCGCCGGTAATGAACGTAATGTACAGCGCGGCAGAAGGCAAAGCGTGGAAAGAagag < 1:212156/250‑1 (MQ=255) ncTNTCTGANGAAGNTCCTTTCGGTTGGGANGTCCGTCAGCACTGGCAGCNNTNCTGTCNGGTAg < 2:189880/64‑1 (MQ=255) gaagaaGATCCTTTCGGTTGGGAAGTCCGTCAGCACTGGCAGCGTTACTGCCTGGAAGAACCGCTGGGTGGCACTAAAGAGTTTATTAAACGTAATAGAGAATTAAAAGTACACATTGAGCTCATTGACCCTGGCACACCGCTTTTCGGCGTGGTGTATGCGCCGGTAATGACCCTAATGTACAGCGCGGCAGAAGGCAAAGCGTGGAAAGAAGAGTGAGGTGTGCGCAAGCAGATTCAGGTCCGCGATgc > 1:307543/1‑251 (MQ=255) || AGGTGGAGAAATGTTAGATCAAGTATGCCAGCTTGCACGGAATGCAGGCGATGCCATTATGCAGGTCTACGACGGGACGAAACCGATGGACGTCGTCAGCAAAGCGGACAATTCTCCGGTAACGGCAGCGGATATTGCCGCTCACACCGTTATCATGGACGGTTTACGTACGCTGACACCGGATGTTCCGGTCCTTTCTGAAGAAGATCCTCCCGGTTGGGAAGTCCGTCAGCACTGGCAGCGTTACTGGCTGGTAGACCCGCTGGATGGTACTAAAGAGTTTATTAAACGTAATGGCGAATTCACCGTTAACATTGCGCTCATTGACCATGGCAAACCGATTTTAGGCGTGGTGTATGCGCCGGTAATGAACGTAATGTACAGCGCGGCAGAAGGCAAAGCGTGGAAAGAAGAGTGCGGTGTGCGCAAGCAGATTCAGGTCCGCGATGC > NC_000913/4436745‑4437194 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |