| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 968,837 | G→A | D158N (GAT→AAT) | lpxK → | tetraacyldisaccharide 4'‑kinase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 968,837 | 0 | G | A | 100.0% | 41.2 / NA | 17 | D158N (GAT→AAT) | lpxK | tetraacyldisaccharide 4'‑kinase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (6/11); total (6/11) | |||||||||||
GGGGATATGGTGGTAAGGCTGAATCTTATCCGCTGTTATTGTCGGCAGATACCACAACAGCACAGGCGGGTGATGAACCTGTGTTGATTTATCAACGCACTGATGCGCCTGTTGCGGTTTCTCCCGTTCGTTCTGATGCGGTAAAAGCCATTCTGGCGCAACACCCTGATGTGCAGATCATCGTAACCGACGACGGTTTACAGCATTACCGTCTGGCGCGTGATGTGGAAATTGTCGTTATTGATGGTGTGCGTCGCTTTGGCAATGGCTGGTGGTTGCCGGCGGGGCCAATGCGTGAGCGAGCGGGGCGCTTAAAGTCGGTTGATGCGGTAATCGTCAACGGCGGTGTCCCTCGCAGCGGTGAAATCCCCATGCATCTGCTGCCGGGTCAGGCGGTGAATTTACG‑TACCGGTACGCGTTGTGACGTTGCTCAGCTTGAACATGTAGTGGCGATGGCGGGGATTGG > NC_000913/968616‑969081 | ggggATATGGTGGTAAGGCTGAATCTTATCCGCTGTTATTGTCGGCAGATACCACAACAGCACAGGCGGGTGATGAACCTGTGTTGATTTATCAACGCACTGGTGCGCCTGTTGCGGTTTCTCCCGTTCGTTCTGATGCGGTAAAAGCCATTCTGGCGCAACACCCTGATGTGCAGATCATCGTAACCGACGACGGTTTACAGCATTACCGTCTGGCGCGTAATGTGGAAATTGTCGTTATTGATGGtgtg < 1:445028/251‑1 (MQ=255) ggATATGGTGGTAAGGCTGAATCTTATCCGCTGTTATTGTCGGCAGATACCACAACAGCACAGGCGGGTGATGAACCTGTGTTGATTTATCAACGCACTGATGCGCCTGTTGCGGTTTCTCCCGTTCGTTCTGATGCGGTAAAAGCCATTCTGGCGCAACACCCTGATGTGCAGATCATCGTAACCGACGACGGTTTACAGCATTACCGTCTGGCGCGTAATGTGGAAATTGTCGTTATTGATGGTGTGCg < 1:133987/251‑1 (MQ=255) ggCAGATACCACAACAGCACAGGCGGGTGATGAACCTGTGTTGATTTATCAACGCACTGATGCGCCTGTTGCGGTTTCTCCCGTTCGTTCTGATGCGGTAAAAGCCATTCTGGCGCAACACCCTGATGTGCAGTTCATCGTAACCGACGACGGTTTACAGCATTACCGTCTGGCGCGTAATGTGGAAATTGTCGTTATTGATGGTGTGCGTCGCTTTGGCAATGGCtggtgn < 1:88588/232‑2 (MQ=255) gATACCACAACAGCACAGGCGGGTGATGAACATCCGTGGATATGTCAACGCCCTGGAGCGCCTGTTGGGGTTTGTCCCGTTCGTTCTGTTCCGGTCAACACCAGTCCGTCGCACAACCCCCGTGTGGAATTCATCGTAAACGACGACGGTTTACCACATTTCCGTCTTGCGGGGAATAGAGAAATTGTCGTTATTGACGGTGTGCGTCGGTTTGGCCATGGTCGGAGGTTGCCGGGGGGGcacattcgtgg > 1:177170/1‑241 (MQ=255) aCCACAACAGCACAGGCTGGTGATGATCCTGTGTTGATTTATCAACGCACTGATGCGCCTGTTGCGGTTTCTCCCGGTCGTTCTGATGCGGTAAAAGCCATTCTGGCGCAACACCCTGATGTGCAGATCATCGTAACCGACGACGGTTTACAGCATTTCCGTCTGGCGCGTAATGTGGAAATTGTCGTGATTGATGGTGTGCGTCGCTTTGGCAATGGCTGGTGGTTGCCGGCGGGGCCAATGCGTgagc < 1:415389/250‑1 (MQ=255) gtgtTGATTTATCAACGCACTGATGCGCCTGTTGCGGTTTCTCCCGTTCGTTCTGATGCGGTAAAAGCCATTCTGGCGCAACACCCTGATGTGCAGATCATCGTAACCGACGACGGTTTACAGCATTACCGTCTGGCGCGTAATGTGGAAATTGTCGTTATTGATGGTGTGCGTCGCTTTGGCAATGGCTGGTGGTTGCCGGCGGGGCCAATGCGTGAGCGAGCGGGGCGCTTAAAGTCGGTTGATGCgg < 1:189337/250‑1 (MQ=255) aTCAACGCACTGATGCGCCTGTTGCGGTTTCTCCCGTTCGTTCTGATGCGGTAAAAGCCATTCTGGCGCAACACCCTGATGGGCAGATCATCGTAACCGACGACGGTTTACAGCATTACCGTCTGGCGCGTAATGTGGAAATTGTCGTTATTGATGGTGTGCGTCGCTTTGGCAATGGCTTGTGGTTGCCGGCGGGGCCAATGCGTGAGCGAGCGGGGCGCTTAAAGTCGGTTGATGCGGTAATCGTCAAc < 1:202502/251‑1 (MQ=255) aCGCACAGATGCGCCTGTTGCGGTTTCTCCCGTTCGTTCTGATGCGGTAAAAGCCATTCTGGCGCCACACCCTGATGTGCAGATCATCGTAACCGACGACGGTTTACAGCATTACCGTCTGGCGCGTAATGTGGAAATTGt > 1:350944/1‑141 (MQ=255) ccTGTTGCGGTTTCTCCCGTTCGTTCTGATGCGGTATAAGCCATTCTGGCGCAACACCCTGATGTGCAGATCATCGTAACCGACGACGGTTTACAGCATTACCGTCTGGCGCGTAATGTGGAAATTGTCGTTATTGATGGTGTGCGTCGCTTTGGCAATGGCTGGTGGTTGCCGGCGGGGCCAATGCGTGAGCGCGCGGGGCGCTTAAAGTCGGTTGATGCgg > 1:328096/1‑223 (MQ=255) tGATGCGGTAAAAGCCATTCTGGCGCAACACCCTGATGTGCAGATCATCGTAACCGACGACGGTTTACAGCATTACCGTCTGGCGCGTAATGTGGAAATTGTCGTTATTGATGGTGTGCGTCGCTTTGGCAATGGCTGGTGGTTGCCGGCGGGGc < 1:227491/155‑1 (MQ=255) aaaaGCCATTCTGGCGCAACACCCTGATGTGCAGATCATCGTAACCGACGACGGTTTACAGCATTACCGTCTGGCGCGTAATGTGGAAATTGTCGGTATTGATGGTGTGCGTCGCTTTGGCAATGGCTGGTGGTTGcn < 1:80722/138‑2 (MQ=255) ntGATGTGCAGATCATCGTAACCGACGACGGTTTACAGCATTACCGTCTGGCGCGTAATGTGGAAATTGTCGTTATTGATGGTGTGCGTCGCTTTGGCAATGGCTGGTGGTTGCCGGCggg > 1:274681/2‑121 (MQ=255) cTGATGTGCAGATCATCGTAACCGACGACGGTTTACAGCATTACCGTCTGGCGCGTAATGTGGAAATTGTCGTTATTGATGGTGTGCGTCGCTTTGGCAATGGCTGGTGGTTGCCGGCggg < 2:274681/121‑1 (MQ=255) cgGTTTACAGCATTACCGTCTGGCGCGTAATGTGGACATTGTCGTTATTGATGGTGTGCGTCGCTTTGGCAATGGCTGGTGGTTGCCGGCGGGGCCCATGCGTGAGCGAGCGGGGCGCTTAAAGTCGGTTGATGCGGTAATCGTCAATGGCGGGGTCCCTCGc > 1:370970/1‑163 (MQ=255) tNNAGCATTNNCGTCTGGCGCGTAATGTGGAAATTGTCGTTATTGATGGTGTGCGTCGCTTTGGCAATGGCTGGTGGTTTCCGGCGGGGCCAATGCGTg < 2:30126/99‑1 (MQ=255) aTTACCGTCTGGCGCGTAATGTGGAAATTGTCGTTATTGATGGTGTGCGTCGCTTGGGCAATGGCTTGTGGTTGCCGGCGGGGCCAATGCGTGAGCGAGCgggg < 1:202716/104‑1 (MQ=255) gcgcGTAATGTGGAACTTGTCGTCATTGATGGTGCGCGTCGCTTTGGCAATGGCTGGTGGTTGCCGGCGGGGCCAATGCGTGAGCGAGCGGGGCGCTTAAAGTCGGTTGGTGCGGTAATTGGCAACGGCGGGGTCCCCCGCAGCGGTGAAATCCCCATGCATCTGCTGCCGGGTCCGGCGGGGAATTTACGGTAC‑GGTAAGCGTTGTGACGTTGCTCAGCTTGAACATGGAGTGGCGATGGGGGGGAATgg > 1:357147/1‑251 (MQ=255) | GGGGATATGGTGGTAAGGCTGAATCTTATCCGCTGTTATTGTCGGCAGATACCACAACAGCACAGGCGGGTGATGAACCTGTGTTGATTTATCAACGCACTGATGCGCCTGTTGCGGTTTCTCCCGTTCGTTCTGATGCGGTAAAAGCCATTCTGGCGCAACACCCTGATGTGCAGATCATCGTAACCGACGACGGTTTACAGCATTACCGTCTGGCGCGTGATGTGGAAATTGTCGTTATTGATGGTGTGCGTCGCTTTGGCAATGGCTGGTGGTTGCCGGCGGGGCCAATGCGTGAGCGAGCGGGGCGCTTAAAGTCGGTTGATGCGGTAATCGTCAACGGCGGTGTCCCTCGCAGCGGTGAAATCCCCATGCATCTGCTGCCGGGTCAGGCGGTGAATTTACG‑TACCGGTACGCGTTGTGACGTTGCTCAGCTTGAACATGTAGTGGCGATGGCGGGGATTGG > NC_000913/968616‑969081 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |