| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,899,297 | C→T | A33T (GCA→ACA) | yieK ← | putative glucosamine‑6‑phosphate deaminase YieK |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,899,297 | 0 | C | T | 100.0% | 15.7 / NA | 8 | A33T (GCA→ACA) | yieK | putative glucosamine‑6‑phosphate deaminase YieK |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (1/7); total (1/7) | |||||||||||
CGCGGTAGTTATCAATAGTGAGCTTCTGGATATTCTCTTCTTTGATCCCCGCAGGGGTGAAAAACAGATTACGCAGATTGGTAATCGTTACGCCTTCTCCCTCTTTGCCGCGAAATGGAATTTCATCAAAATTATAGAAATAGCAGTTATCGTACCAGGGCTTACCTTTAACCAGGGTGGTGAGGTATTCATACATGCCTTTGGGCGTGCTACCGGCGGTAATTGCCAGGTTAACACGACGCGTCTTCGACATATAACCAAGCAGATGGTGTGCCGCGACACGGCTCATTTCCTGGTAATCTTCGGTAATGATTAATTTCATCTTAATGCCTTATTTTATTTAAATAATTTCTGTACAAAGGCTGCATAGGCTGGTCGCCAGACATCCATTTCATGGTTCAGACCCGGATATTCCTGGTAATCAAAGTTAATTTTTTTCTGCTCAAGCTCAGTTTTCAGCCCGGC > NC_000913/3899072‑3899536 | cgcgGTAGTTATCAATAGTGAGCTTCTGGATATTCTCTTCTTTGATCCCCGCAGGGGTGAAAAACAGATTACGCAGATTGGTAATCGTTACGCCTTCTCCCTCTTTGCCGCGAAATGGAATTTCATCAAAATTATAGAAATAGCAGTTATCGTACCAGGGCTTACCTTTAACCAGGGTGGTGAGGTATTCATACATGCCTTTGGGCGTGCTACCGGCGGTAATTGTCAGGTTAACACGACGCGTCTTc < 1:286030/248‑1 (MQ=255) gTACCAGGGCTTACCTTTAACCAGGGTGGTGAGGTATTCATACATGCCTTTGGGCGTGCTACCGGCGGTAATTGTCAGGTTAACACGACGCGTCTTCGACAGATAACCAAGCAGATGGTGTGCCGCGACACGGCTCATTTCCTGGTAATCTTCGGTAATGATTAATTTCATCTTCATGCCTTATTTTATTTAAATAATTTCTGTACAAAGGCTGCATAGGCTGTTCGCCAGACATCCATTTCATGGTTCAg < 1:133713/251‑1 (MQ=255) cTTACCTTTAACCAGGGTGGTGAGGTATTCATACATGCCTTTGGGCGTGCTACCGGCGGTAATTGTCAGGTTAaca < 2:35765/76‑1 (MQ=255) cTTACCTTTAACCAGGGTGGTGAGGTATTCATACATGCCTTTGGGCGTGCTACCGGCGGTAATTGTCAGGGTaaaa > 1:35765/1‑74 (MQ=255) aCCTTTAACCAGGGTGGTGAGGTATTCATACATGCCTTTGGGCGTGCTACCGGCGGTAATTGTCAGGTTAACACGACGCGTCTTCGACATATAACCAAGCAGATGGTGTGCCGCGACACGGCTCATTTCCTGGTAATCTTCGGTAATGATTAATTTCAGCTTAATGCCTTATTTTATTTAAATAATTTCTGTACAAAGGCTGCATAGGCTGGTCGCCAg < 1:137301/219‑1 (MQ=255) ggTAGTCATACATGCCTTTGTGCGTGCTACCGGCGTTAATTGTCAGGTTAACACGACGCTGCTTCGACATATAACCAAGCAGATGGTGTGCCGCGACACGGCTCATTTCCTGGTAATCTTCGGTAATGAt < 1:200961/130‑1 (MQ=255) cNTACATGCCTTTGGGCNTGCTACCGGCGGTAATTGTCAGGTTAACACGACGCGTCTTCGACNNANNNCNAAGCAGAt < 2:313299/78‑1 (MQ=255) ggcggTAATTGTCAGGTTAACACGACGCGTCTTCGACATATAACCAAGCAGATGGTGTGCCGCGACACGGCTCATTTCCTGGTAATCTTCGGTAATGATTAATTTCATCTTAATGCCTTATGTTATTTAAATAATGTCTGTACGAAGGCTGCATAGGCTGGTCGCCAGATATCGATTTCATTGTTCAGACCCGTATATTCCTGGTAATTAAAGTTAATTTTTTTCTGCTCAAGCTCAGTTTTCAGCCCggn < 1:88532/251‑2 (MQ=255) | CGCGGTAGTTATCAATAGTGAGCTTCTGGATATTCTCTTCTTTGATCCCCGCAGGGGTGAAAAACAGATTACGCAGATTGGTAATCGTTACGCCTTCTCCCTCTTTGCCGCGAAATGGAATTTCATCAAAATTATAGAAATAGCAGTTATCGTACCAGGGCTTACCTTTAACCAGGGTGGTGAGGTATTCATACATGCCTTTGGGCGTGCTACCGGCGGTAATTGCCAGGTTAACACGACGCGTCTTCGACATATAACCAAGCAGATGGTGTGCCGCGACACGGCTCATTTCCTGGTAATCTTCGGTAATGATTAATTTCATCTTAATGCCTTATTTTATTTAAATAATTTCTGTACAAAGGCTGCATAGGCTGGTCGCCAGACATCCATTTCATGGTTCAGACCCGGATATTCCTGGTAATCAAAGTTAATTTTTTTCTGCTCAAGCTCAGTTTTCAGCCCGGC > NC_000913/3899072‑3899536 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |