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Only 100 of 169 total aligned reads displayed.
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1:348189/300‑1 (MQ=255) gaagagagTTGTGATTTTTGCCCTGACTTTTTCAGGTTTTATTGTTCTTTCTTACTAATTTCTTGATTTTGCGACATGTAAAAGCGATTCAATTCGTTATATGGCATCAG‑AAGAGTATGCGTCATGCCGGAACGCCCAGCATAAGAAATCTGATATAAAAAACTGTGGCGTGTATGGTACGG‑‑ATTAGA‑‑GTGGAAAATGTCAGCAC‑A‑TTTGCGAAATGAATCAAAAAGCCCGCAGCAATGTGCGGGCGGTAGTGTCAGCGCACAACCAGCACGGAGCACTCTGCGTGGCGCACTACAGCTg < 1:348265/298‑1 (MQ=255) gTTGTGATTTTTGCCCTTACTTGTTCAGGTTGTATTGTTCTTTCTTACTAATTTCTTGATTTTGCGACATTTAAAAGCGACTCAATTCGTTATATGGCATCAG‑AAGAGTATGCGTCATGCCGGAACGCCCAGCATAAGAAATCTGATATAAAAAACTGTGGCGTGTATGGTACGG‑‑ATTAGA‑‑GGGGAAAATGTCAGCAC‑A‑TTTGCGAAATGAATCAAAAAGCCCGCAGCAATGTGCGGGCGTTAGTGTCAGCGCACAACCAGCACGGAGCACTCTGCGTGACGCACTACAGCTGCGGCGtt > 1:29880/1‑300 (MQ=255) gATTTTTGCCCTTACTTGTTCAGGTTGTATTGTTCTTTCTTACTAATTTCTTGATTTTGCGACATTTAAAAGCGACTCAATTCGTTATATGGCATCAG‑AAGAGTATGCGTCATGCCGGAACGCCCAGCATAAGAAATCTGATATAAAAAACTGTGGCGTGTATGGTACGG‑‑ATTAGA‑‑GGGGAAAATGTCAGCAC‑A‑TTTGCGAAATGAATCAAAAAGCCCGCAGCAATGTGCGGGCGTTAGTGTCAGCGCACAACCAGCACGGAGCACTCTGCGTGACGCACTACAGCTGCGGCGTTGGAAc < 1:453596/300‑1 (MQ=255) gATTTTTGCCCTTACTTGTTCAGGTTGTATTGTTCTTTCTTACTAATTTCTGGATTTTGCGACATTTAAAAGCGACTCAATTCGTTATATGGCATCAG‑AAGAGTATGCGTCATGCCGGAACGCCCAGCATAAGAAATCTGATATAAAAAACTGTGGCGTGTATGGTACGG‑‑ATTAGA‑‑TGGGAAAATGTCAGCAC‑A‑TTTGCGAAATGAATCAAAAAGCCCGCAGCAATGTGCGGGCGTTAGTGTCAGCGCACAACCAGCACTGAGCACTCTGCTTGACGCACTACAGCTGCGGCGTTGGAAc < 1:327087/300‑1 (MQ=255) ttACTTGTTCAGGTTGTATTGTTCTTTCTTACTAATTTCTTGATTTTGCGACATTTAAAAGCGACTCAATTCGTTATATGGCATCAG‑AAGAGTATGCGTCATGCCGGAACGCCCAGCATAAGAAATCTGATATAAAAAACTGTGGCGTGTATGGTACGG‑‑ATTAGA‑‑GGGGAAAATGTCAGCAC‑A‑TTTGCGAAATGAATCAAAAAGCCCGCAGCAATGTGCGGGCGTTAGTGTCAGCGCACAACCAGCACGGAGCACTCTGCGTGACGCACTACAGCTGCGGCGTTGGAACCGAGCAGATa < 2:412487/299‑1 (MQ=255) ttACTTGTTCAGGTTGTATTGTTCTTTCTTACTAATTTCTTGATTTTGCGACATTTAAAAGCGACTCAATTCGTTATATGGCATCAG‑AAGAGTATGCGTCATGCCGGAACGCCCAGCATAAGAAATCTGAGATAAAAAACTGTGGCGTGTATGGTACGG‑‑ATTAGA‑‑GGGGAAAATGTCAGCAC‑A‑TTTGCGAAATGAATCAAAAAGCCCGCAGCAATGTGCGGGCGTGAGTGTCAGCGCACAACCAGCACGGAGCACTCTGCGTGACGCACTACAGcctgtctcttatacacatctcgc < 1:326229/297‑23 (MQ=255) | GATATAGCCTATATGCCTTTGATGCGGAGGAATGAATGTGATGGGAGTGATGTATCTGAATAGTTGAAAAACCGCAGTCACGTCGTATGCAAGAACGTGCTGCGGTTGGTTTGACTTTGATTGAGACGTTTTGGAATTTTTTTCGGTGGCAAAAATGGGGCAAAACGCTGCAAAAGGGGCAAAAAAGGGGCAAAAAAAGAGTGGATTATCGTAGCTTA‑‑TTGTTGTCGCTGATGATATTTAACACATTGAAAAATAAGTAAAATACTTATGAGTCAGAGAGTTGTGATTTTTGCCCTTACTTGTTCAGGTTGTATTGTTCTTTCTTACTAATTTCTTGATTTTGCGACATTTAAAAGCGACTCAATTCGTTATATGGCATCAG‑AAGAGTATGCGTCATGCCGGAACGCCCAGCATAAGAAATCTGATATAAAAAACTGTGGCGTGTATGGTACGG‑‑ATTAGA‑‑GGGGAAAATGTCAGCAC‑A‑TTTGCGAAATGAATCAAAAAGCCCGCAGCAATGTGCGGGCGTTAGTGTCAGCGCACAACCAGCACGGAGCACTCTGCGTGACGCACTACAGCTGCGGCGTTGGAACCGAGCAGATA > NC_000913/1434660‑1435253 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |