| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 781322 | 65 (0.620) | 6 (0.070) | 5/510 | 7.8 | 7.4% | intergenic (+100/‑47) | lysY/lysZ | tRNA‑Lys/tRNA‑Lys |
| ? | NC_000913 | 781811 = | 94 (1.030) | intergenic (+159/‑274) | lysQ/nadA | tRNA‑Lys/quinolinate synthase | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
GGTGGGTTCGGTGGAAGTAGTTTGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAG‑TAA‑AAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGT‑‑‑CGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGT‑TCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAGGCAGCATAATCCCGCAAGGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATT > NC_000913/781025‑781620 | acccaccactaacatagttagttGTAGTATCCAGCGTAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGCTAACGTTGCGCCAGCACCGGCCCGCAGGGCGAGCGAAGCGAGCAATCCTGCATGACCCACCAATCt > 2:489620/22‑300 (MQ=11) gAAGTAGTTTGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGccc > 2:826896/1‑300 (MQ=255) gtagtaTCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCAACAATCTTAAAGATTGGCACAGAG‑Taa‑aaa > 1:130682/1‑300 (MQ=255) gtagtaTCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTGCGCCAGCAACGGCCCGCAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAGAGACTGGccacaaataagca > 1:657156/1‑289 (MQ=255) gtaTCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTGCGCAAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCAGAG‑TAA‑AAATCt > 2:461501/1‑300 (MQ=255) aTCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCAAAATCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAG‑TAA‑AAATCttt > 1:471637/1‑300 (MQ=255) aTCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTACCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCAACCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTACCATCAACCTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTGCGCCAGCAACGGCACGTAGGGCGCGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTCCAGCTTGGCCCCGAG‑TAA‑ACATCttt > 1:471823/1‑300 (MQ=14) aTCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTACCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCAACCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTGCGCCAGCAACGGCACGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCCTAAAGATTGGCCCCGAG‑TAA‑AAATCttt > 1:471594/1‑300 (MQ=255) gcgtaGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGTTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCGAAGACAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAG‑TAA‑AAATCTTTCAGGTa > 1:626387/5‑300 (MQ=255) ggTGATTAACTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAG‑TAA‑AAATCTTTCAGGTAACACCCGTAt < 1:719588/300‑1 (MQ=255) gATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCAAACTCAGATGTTACGCGTGAAGGATAACGTTGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCCTCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAG‑TAA‑AAATCTTTCAGGTAACACCCGTAt > 1:774597/1‑297 (MQ=255) aGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGTTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCGAAGACAGATGTNAAGCGTGAAGGATAACGTTGCGCCAGCAACGGNCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAG‑TAA‑AAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGT‑‑‑CGTTAGCTc < 2:626387/300‑1 (MQ=255) tCCCTTACAAGGAGGGGTTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTCTGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGTTCGCGGGTTCGGATACTGTACTACTCGCCAGGTTTAACATGAAACGTAGGTGTTAAGCGTGAAGGACAACGGTGCGCTAGCAACGGCTCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAG‑TAA‑AAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGT‑‑‑CGTTAGCTCAGTTGGTAGAGc < 1:755786/298‑1 (MQ=21) tCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAG‑TAA‑AAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGT‑‑‑CGTTAGCTCAGTTGGTAGAGc < 1:489620/298‑1 (MQ=255) cccTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCNTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAG‑TAA‑AAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGT‑‑‑CGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGt > 2:643346/1‑300 (MQ=255) cccTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCAAACTCAGATGTTAAGCGTGACGGATAACGTTGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGCCCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAG‑TAA‑AAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGT‑‑‑CGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGtt > 2:751993/1‑300 (MQ=255) gaggGGGTCGTCGGTTCGACCCCTTCACAACCCACCAC‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCAAACACAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAG‑TAA‑AAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGT‑‑‑CGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAAt < 1:663722/300‑1 (MQ=255) gTCATCACCCACCAC‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTTAACATCGCAGACAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAG‑TAA‑AAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGT‑‑‑CGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGT‑TCGCATcc > 1:487720/1‑300 (MQ=255) ccacTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCAAACTCAGANGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTGCGCCAGCAANGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCACGAG‑TAA‑AAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGT‑‑‑CGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGT‑TCGAATCCTGCACGAcca > 2:621123/1‑299 (MQ=255) accGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGAACGACCCACCAGTTTTAACATCACCCTCAGCTGTTAAGCGTAAAGGCTACCTTTGCTCCATCACCGACCCGCAGGGCGAGCGAAGCGGGTCATTCTCCATGACCCACCCCTCTTAAAGATTGGCCCCGCG‑TAG‑ACATCTTTCAGTTAACCACCGTATGGGT‑‑‑CTTTATCTCAGTTGGTAGAGCAATTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGT‑TCGAATCCTGCACGACccac > 2:224535/3‑299 (MQ=21) ggTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCAAACTCAGATGTTAAGCTTGAAGGATAACGTTGCGCCAGCAACGGCCCTTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAG‑TAA‑AAATCTTCCAGGTAACACCCGTAttg < 2:242370/223‑3 (MQ=255) tAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTTACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCAAACTCAGATGGTAAGCGTGAAGGATAACGTTGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCCAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATTGTAAAGATTGGTCCCGAG‑TAA‑AAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGT‑‑‑CGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGT‑TCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAgg < 1:826884/300‑1 (MQ=255) tAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAG‑TAA‑AAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGT‑‑‑CGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGT‑TCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAgg < 1:826896/300‑1 (MQ=255) tAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGAACCACCAGTTTTAACATCAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAG‑TAA‑AAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGT‑‑‑CGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGT‑TCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAgg < 1:807796/300‑1 (MQ=255) aGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCGAAGACAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAG‑TAA‑AAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGT‑‑‑CGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGT‑TCGAATCCTGCAc < 1:621328/276‑1 (MQ=255) aGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGAACCACCAGTTTTAACATCGAAGACAGATGTTAAGCGTGAAGGATAANGTTGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGANGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAG‑TAA‑AAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGT‑‑‑CGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGT‑TCGAATCCTGCAc > 2:621328/1‑276 (MQ=255) gTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAG‑TAA‑AAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGT‑‑‑CGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGT‑TCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTAc < 1:751993/300‑1 (MQ=255) ttGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCATCTCTAACATCACACTCATATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTGCGCCAGCAGTGGTACTTAGGGCGGGTGGGGTGGGGGATTTGGCGAGGCAAAACAATTTGAAAGGGTGGTTTCGAG‑GGGGAACTTTTTC‑GGTAACACCCATATGGGT‑‑‑CGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGT‑TCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTAc < 1:751994/299‑1 (MQ=12) tGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTACAGATTGGCACCGAG‑TAA‑AAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGT‑‑‑CGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGT‑TCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACt > 1:144570/1‑299 (MQ=255) agagCAGTTGACTTTTAATCAATTGTTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCAACCTCAAATGTTAAACGTGAAGGATAACGTTGCGCCAGCAACGGCCCTTAGTGCAAGCTAAGCTATTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCTC‑AAGATAG‑AAATCTTGTGGG‑‑‑CGCGGATAGGGGTGTGCGGGACCGCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGT‑TCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTag < 1:535716/300‑1 (MQ=12) agagCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAG‑TAA‑AAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGT‑‑‑CGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGT‑TCGAATCCTGGACGACCCACCAATGTaaaaaagcgccctaaagg < 1:461501/300‑16 (MQ=255) tcgaccgttAATCAATTGGTCACAGTTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCAAACCCAGATGTTAAGCGTGGAGGATAACGTTGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCTAAGCGATTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAATATGGGCCCCGAG‑GAA‑AAACCTTTCAGTTAACACCCGTATGGGT‑‑‑CGTTAGCTCAGTTGTTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGT‑TCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTag < 2:40401/286‑1 (MQ=25) cTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTAATCCTGCACGAACCCCCAATCTTCAAGGTTGGACAAGAG‑TAA‑AAGTCTTTCAGGTAGCACCCGTATGGGT‑‑‑CGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCCATTGGTCGCAGGT‑TCGAATCCCGCACGAACCAACAATTTAAAGGTGGTTCCTGGTAGAGAACGTGaa > 1:449402/1‑299 (MQ=25) aaTTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAG‑TAA‑AAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGT‑‑‑CGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGT‑TCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGt < 1:643346/299‑1 (MQ=255) gttCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAG‑TAA‑AAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGT‑‑‑CGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGT‑TCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGt < 1:731494/298‑1 (MQ=255) gTTCCAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAG‑TAA‑AAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGT‑‑‑CGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGT‑TCGAATCCTGCACGACCCAACAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAAc > 1:315100/1‑299 (MQ=255) cTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAG‑TAA‑AAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGT‑‑‑CGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGT‑TCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAagtgattcct > 2:687834/1‑248 (MQ=255) cTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCACCGAG‑TAA‑AAATCTTTAAGGTAACACCCGTATGGGT‑‑‑CGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGT‑TCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTACAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCACGaa > 2:328488/1‑298 (MQ=255) tGCACGACCCACCAGCTTTAACAGCAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAG‑TAA‑AAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGT‑‑‑CGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGT‑TCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAggg < 2:580294/300‑1 (MQ=255) aCCCACCAGTTTTAACATCAAACTCAGATGGTAAGCGTGAAGGATAACGTTGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAG‑TAG‑AAATCTTTCAGTTAACACCCGTATGGGT‑‑‑CGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGT‑TCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGAc < 2:322205/300‑1 (MQ=255) aGTTTTAACATCAAACGCAGATGTTAAGCTTGAAGGATAACGTTGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAG‑TAA‑AAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGT‑‑‑CGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTGATCAATTGGTCGCAGGT‑TCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGt < 2:315100/298‑1 (MQ=255) gTTTTAACATCAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCAGAG‑TAA‑AAATCTTTCAGGTAACACACGTATGGGT‑‑‑CGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGT‑TCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTCCTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGAGCGAGATGAAGTCGa > 1:416900/1‑300 (MQ=255) ttAACATCAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTGCGCCAGCAACGGCCCGTAGTGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAG‑TAA‑AAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGT‑‑‑CGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGT‑TCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTc < 1:224535/300‑1 (MQ=255) aaaCTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAG‑TAA‑AAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGT‑‑‑CGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGT‑TCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCa > 1:788562/1‑300 (MQ=255) aaCTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTGCGCCAGCAACCGCCCTCAGGTCGGGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCACTCTTAAAAATTGGCCCCGAG‑TAA‑AAAGCTTTCAGGTAACACCCGGATGGGG‑‑‑CGTGAGCGCAGTTGTTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCACAGGT‑TCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCAc < 2:144570/300‑1 (MQ=37) gTTAAGCGTGAAGGATAACGTTGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAAAGTGGCCCCGAG‑TAA‑ACATTTTTCAAGTAACAcc > 1:247652/1‑120 (MQ=18) aGCGTGAAGGATAACGTTGCGCCAGCAACGGCCCGTAGTGCGATCGAAGCGAGTCACCCTGCACAACCCACCCCCCTTAACGCCCTACCCCTAG‑TGG‑GAATGTTACGGGGAACACCTGGATAGGTA‑‑CGT‑AGCTAAGTTGGTAGAGAAGTTGATTTTGAGTCAATTGGTTAAAGGTGTGGAGTA‑GACACGACCCACAAATTTAAAGTCGAGTACAGGTATGGAACGTGGAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATcc < 2:759301/299‑1 (MQ=255) aaGGATGACGTTGCGCCAGCAACGGCTCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCTTGCACGGCCCACCAATCGTAAAGATTGGCCCTGAG‑TAA‑AAATCTTTCAGTTAACACCCGTATGGGT‑‑‑CGTTAGCTCAGTTGTTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGT‑TCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCAc < 1:204246/281‑1 (MQ=37) aGGATAACGTTGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGTGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATGGGCCCCGAG‑TAA‑AAATCCTTCAGGTAACACCCGTATGGGT‑‑‑CGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGT‑TCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCTAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTGAAt < 1:647600/297‑1 (MQ=255) ggATAACGTTGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGNCCCACCAAtgtaaaaa < 1:698733/74‑8 (MQ=14) ggATAACGTTGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAAtgtcaaaa > 2:698718/1‑67 (MQ=255) ggATAACGTTGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAAtgtaaaaa > 2:698733/1‑67 (MQ=255) ggATAACGTTGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAG‑TAA‑AAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGT‑‑‑CGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGT‑TCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGACCGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTGAATGAtt > 1:670192/1‑300 (MQ=255) ggATAACGTTGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTCAAAGATTGGCCCCGAG‑TCG‑ATATCTTTCAAGTAACAccc > 1:678438/1‑109 (MQ=18) ggATAACGTTGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTCAAAGATTGGCCCAGAG‑TAG‑AAATCTTTAAGGTAACACCCATATGGGT‑‑‑CGTTAGCTCAGTTAGTAGAGCAGTTGACTTTTACTCAATTGGTCGCAGGT‑TCGAATCCTGCACGACCCACCACTTCAAAGGCGGGTACTGGTAGAGAACGTGAGGGATAACGTTGCGTTAGCaa > 1:670182/1‑241 (MQ=37) gcgcCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAG‑TAA‑AAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGT‑‑‑CGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGT‑TCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAGGCAGCAt < 1:621123/300‑1 (MQ=255) aGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAG‑TAA‑AAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGT‑‑‑CGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGT‑TCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAGGCAGCATAATcc < 1:655598/300‑1 (MQ=255) aGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCGTAAAGATTGGCCCCGAG‑TAA‑AAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGT‑‑‑CGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGT‑TCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAGGCAGCATAATcc < 1:655503/300‑1 (MQ=255) cagTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCAGAG‑TAA‑AGATCTTTCCGGTCACACCCGTATGGGT‑‑‑CGCTAGCTCAGGTGGTATAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGT‑TCGAATCCTGCACGACCCATCCATTTAAAGGTGGTTACTAGTAGAGAACATGAAGGATAACGTTGCGTTAGCaa > 2:296431/3‑217 (MQ=37) gaGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAG‑TAA‑AAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGT‑‑‑CGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGT‑TCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAATGGCCCGAAGGGCGAGATGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCAACCATCCTGAATGATCAAGGCAGTATGATCCCGCAAGGGGTCGGTAGCTCGGTTGGTa > 2:241702/1‑300 (MQ=37) aGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAG‑TAA‑AAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGT‑‑‑CGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGT‑TCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAGGCAGCATAATCCCGCAAGGGGTCGTTAGCTCAGTGGGTag < 1:328488/300‑1 (MQ=255) aTCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAG‑TAA‑AAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGT‑‑‑CGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGT‑TCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCgaga > 2:228435/1‑211 (MQ=255) aTCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAG‑TAA‑AAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGT‑‑‑CGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGT‑TCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAGGCAGCATAATCCCGCAAGGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCa > 2:345181/1‑300 (MQ=255) aTCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAG‑TAA‑AAATCTTTCAGGTAACAACCGTATGGGT‑‑‑CGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGT‑TCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGAGTTAGCAACGGCACGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAGGCAGCATAATCCCGCAAGGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTATAGCa > 2:562203/1‑300 (MQ=255) aTCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCAGAG‑TAA‑AAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGT‑‑‑CGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGT‑TCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGCAGGGTAACGTTGCGTTAACAACGGCCCAAAGGGCGAAACGAAGTCGAGTCACCCTGCACGACCCACCACCCTGAATGGTTAAGGCAGCATCATCCCGCAAGGGGTTGTTCGCTAAGTTGGTCGAGCa > 2:231659/1‑300 (MQ=37) tCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAG‑TAA‑AAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGTT‑‑‑CGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGT‑TCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTGGGGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAGGCAGCATAATCCCGCAAGGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAg < 1:118751/300‑1 (MQ=255) ccTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAG‑TAA‑AAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGT‑‑‑CGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGT‑TCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGACCGTGAAGGATCACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAGGCAGCATAATCCCGAAAGGGGTAGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGt > 1:95719/1‑300 (MQ=255) aTCTTAAAGATTGGCCCCGAG‑TAA‑AAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGT‑‑‑CGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGT‑TCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAGGCAGCATAATCCCGCAAGGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAAtt > 1:747177/1‑300 (MQ=255) | GGTGGGTTCGGTGGAAGTAGTTTGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAG‑TAA‑AAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGT‑‑‑CGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGT‑TCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAGGCAGCATAATCCCGCAAGGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATT > NC_000913/781025‑781620 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |