| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 1286892 | 75 (0.790) | 5 (0.050) +C |
5/582 | 7.7 | 6.3% | coding (184/276 nt) | ychS | putative uncharacterized protein YchS |
| ? | NC_000913 | 1287544 = | 75 (0.790) | noncoding (79/85 nt) | tyrT | tRNA‑Tyr | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
ATGCGCTTCGCTTATCCGACCTACAG‑GGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCT‑CAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGA‑ATATTTGATTGCG‑‑GATTCGTTTGAGAA‑TTCCGGGG‑CTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGA‑GTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTC‑AGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCA > NC_000913/1286599‑1287187 | aTGCGCTTCGCTTATCCGACCTACAG‑TGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCT‑CGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGA‑ATATTTGATTGCG‑‑GATTCGCTTGAGAG‑TTCAGGGA‑CTTTTGAAAGTGATGGTGGTgggg < 2:761176/300‑1 (MQ=17) gcttcgcttATCCGACCTACAG‑GGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCT‑CAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCGCGCTTGGGCAGA‑ATATTTGATTGCG‑‑GATTCGTTTGAGAA‑TTCCGGGG‑CTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGaa < 1:557504/299‑1 (MQ=255) tcgcttATCCGACCTACAG‑GGTAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCT‑CAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGA‑ATATTTGATTGCG‑‑GATTCGTTTGAGAA‑TTCCGGGG‑CTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGTGGAAGGAt < 2:181611/300‑1 (MQ=255) gctcaTCCGACCTACAG‑GTGAGGATATTGTATGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAATGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGNCAACGCTCTCTCGCTGGCGCT‑CAAGTCGAACCNTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGA‑ATATTTGATTGCG‑‑GATTCGTTTGAGAA‑TTCCGGGG‑CTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGAt < 2:590756/294‑1 (MQ=255) tATCCGACCTACAT‑GGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGTGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTTGCGCT‑CAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGA‑ATATTTGATTGCG‑‑GATTCGTTTGAGAA‑TTCCGGGG‑CTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTc < 1:213062/300‑1 (MQ=255) tATCCGACCTACAG‑TTGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCT‑CAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGA‑ATATTTGATTGCG‑‑GATTCGTTTGAGAA‑TTCCGGGG‑CTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTc < 1:213193/300‑1 (MQ=255) tATCCGACCTACAG‑GGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAGATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCT‑CAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGA‑ATATTTGATTGCG‑‑GATTCGTTTGAGAA‑TTCCGGGG‑CTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGTAAGGATTACTc < 1:213088/300‑1 (MQ=255) tATCCGACCTACAG‑GGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCT‑CAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGA‑ATATTTGATTGCG‑‑GATTCGCTTGAGAG‑TTCAGGGA‑CTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTc < 1:336740/300‑1 (MQ=255) aTCCGACCTACAG‑GGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGATATCTCGCTGGCGCT‑CAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGA‑ATATTTGATTGCG‑‑GATTCGTTTGAGAA‑TTCCGGGG‑CTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTc < 1:593631/299‑1 (MQ=255) gACCTACAGTGGGAG‑ATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCAGCGGGCAAAATTAACTCGGAGTGACGGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGTTTCGCCCTTCGGGTCGGTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCT‑CAGGTCGAACCTTGGGCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGA‑AGATTTGATTGCG‑‑GATTCGTTTGAGAA‑TTCCGGGG‑CTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGTGGAAGGATTACTCAgc < 2:694710/298‑1 (MQ=21) gACCTACAG‑GTGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCT‑CAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGA‑ATATTTGATTGCG‑‑GATTCGTTTGAGAA‑TTCCGGGG‑CTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAgcgc < 1:641985/300‑1 (MQ=255) gACCTACAG‑GGGAGGATATTGTAGGCCCGTTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAANCGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCT‑CAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGA‑ATATTTGATTGCG‑‑GATTCGTTTGAGAA‑TTCCGGGG‑CTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAgcgc < 2:632553/300‑1 (MQ=255) aCCTACAG‑GGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCT‑CGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGA‑ATATTTGATTGCG‑‑GATTCGTTTGAGAG‑TTCAGGGA‑ATTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCt > 2:635421/1‑300 (MQ=17) cTACAG‑TGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGTGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCT‑CAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGA‑ATATTTGATTGCG‑‑GATTCGTTTGAGAA‑TTCCGGGG‑CTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTc < 2:797357/292‑1 (MQ=255) cTACAG‑GGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCT‑CAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGA‑ATATTTGATTGCG‑‑GATTCGTTTGAGAA‑TTCCGGGG‑CTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTc > 1:797357/1‑292 (MQ=255) gggAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCT‑CAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGA‑ATATTTGATTGCG‑‑GATTCGTTTGAGAA‑TTCCGGGG‑CTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTgcgc < 1:455550/296‑1 (MQ=255) gggtatTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCT‑CAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGA‑ATATTTGATTGCG‑‑GATTCGTTTGAGAA‑TTCCGGGG‑CTTTTGAAAGTGAtggtggt > 1:309631/4‑266 (MQ=255) ggaTATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCT‑CGAGTCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGA‑ATATTTGATTGCG‑‑GATTCGTTTGAGAG‑TTCAGGGA‑CTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGAttcgaaccttcgaagtcgctgac > 2:276409/1‑278 (MQ=17) ggaTATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCT‑CAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCGTGGGCAGA‑ATAGTTGATTGCG‑‑GATTCGTTTGGAAA‑TTCCGGGA‑CTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGAtt > 2:275881/1‑278 (MQ=255) atTGTAGTCCCGGTAAACTTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCT‑CAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGA‑ATATTTGATTGCG‑‑GATTCGTTTGAGAA‑TTCCGGGG‑CTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTc < 2:500418/300‑1 (MQ=255) gTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCT‑CAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGA‑ATATTTGATTGCG‑‑GATTCGTTTGAGAA‑TTCCGGGG‑CTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCggg < 1:480218/300‑1 (MQ=255) cGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTACGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCT‑CAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGA‑ATATTTAATTGCG‑‑GATTCGTT‑GGGAAGTTCAGGGA‑CTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGAttcgcaccttc > 2:351291/1‑264 (MQ=14) gTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAGTTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCT‑CAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGA‑ATATTTGATTGCG‑‑GATTCGTTTGAGAG‑TTCAGGGA‑CTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCCGTGCTGCGCGCTTCACCCTTAGGGTCGTTTCCt > 2:467520/1‑300 (MQ=18) gTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCT‑CAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCCTGGGCAGA‑ATATTTAATTGCG‑‑GATTCGTTTGAGAA‑TTCCGGGG‑CTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGAtt > 2:467463/1‑262 (MQ=255) tcgtaGTAACAGGTTTTGATTATTTACGGAAGCGATGGTGGTTGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGTTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCT‑CAAGTCGAACCTGGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGA‑ATATGTGATTGCG‑‑GATTCGTTTGAGAA‑TTCCGGGG‑CTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGc < 2:707200/296‑1 (MQ=255) 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gtggtggGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCT‑CAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGA‑ATATTTGATTGCG‑‑GATTCGTTTGAGAA‑TTCCGGGG‑CTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCAt > 1:67165/1‑299 (MQ=255) gggAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCT‑CAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGA‑ATATTTGATTGCG‑‑GATTCGTTTGAGAA‑TTCAGGGG‑CTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCCTCCGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCACCGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCACCGCATGGGCAGaa > 1:308691/1‑300 (MQ=255) ggATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTTGTTGCCTGCGGCAACGCGCTTTCGCTGGCGCT‑CAGGTCGAACCTTGGGCGAAGCGTTTCATTCTTCCCCGCTTGGGCAGA‑GTAGTGGATTGCG‑‑GATTCGTTTGAGAA‑GTTTTGGG‑CTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTATTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTTGCGCTCAAGTCGAACCTTGGTCGAAGGTTCTCACCCTTCCCCgatg < 1:20453/287‑4 (MQ=11) 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ggATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCT‑CAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTAATCCTTCCCCGCTTGGGCAGA‑ATATCTGATTGCA‑‑GACTCGTATGAGAA‑TTCCGAGG‑CTCTTGAAAGTGATGATGGTGGGGGAGGGATTCATCAGCGCTGCGCGCTTCACCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGAACCTTGGTCGAAGATtctc > 2:20453/1‑273 (MQ=14) ggATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCT‑CAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTAATCCTTCCCCGCGTGGGCAGA‑ATATTTGATTGCG‑‑GATTCGTTTGAGAA‑TTCAGGGG‑CTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAACGCTGCGCGCTTCGCCCTTAGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCAGAACCTTAGTAGACGCTTCTCATCCTTCCCAGCATGGGCAGAATAttt > 2:276421/1‑300 (MQ=14) ggATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTAGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCT‑CAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGA‑ATATTTGATTGCG‑‑GATTCGTTTGAGAA‑TTCCGGGG‑CTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAACGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTTCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCAAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATAttt > 1:262023/1‑300 (MQ=255) tACTCAACGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTTGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCT‑CAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGTCAGA‑ATATTTGATTGCG‑‑GATTCGTTTGAGAA‑TTCCGGGG‑CTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGTGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGAt < 2:776754/299‑1 (MQ=255) aCTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTTGCGCTTCCA‑TAGACCCTTGGTCGAAGTTTCTCATCCTTAAACGCTTGGGCAGA‑ATATTTGATTGCG‑‑GATTCGTTTGAGAA‑TTCAGGGG‑CTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGAtt > 1:627748/1‑299 (MQ=14) aCTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCT‑CAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGA‑ATATTTGATTGCG‑‑GATTCGTTTGAGAA‑TTCCGGGG‑CTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAgcgc > 1:549491/1‑187 (MQ=255) aCTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCT‑CAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGA‑ATATTTGATTGCG‑‑GATTCGTTTGAGAA‑TTCCGGGG‑CTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAgcgc < 2:549491/187‑1 (MQ=255) aCTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCT‑CAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGA‑ATATTTGATTGCG‑‑GATTCGTTTGAGAA‑TTCCGGGG‑CTTTTGAAAGTGATGGTGGTAGGGAAAGAATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGAtt > 1:425933/1‑299 (MQ=255) aCTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCT‑CAAGTAGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCACGCGTGGGCAGA‑ATATTTGATTGCG‑‑GATTCGTTTGAGAA‑TTCCGGGG‑CTTTTGAAAGTGAtggtggtt > 2:346952/1‑166 (MQ=255) gcgcTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCT‑CAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCCTATC‑TATTCTACACATCTACGAGCCCACGAAGCATCGTT‑‑AGCA‑ATCTGGGG‑CTTTTGACGGTGATTGTGGTAGGGGGGGGGTTACTCAGGGCTGCGCGTTTAGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGTGGAAACGCTCTCTCGCTGACGCTTGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCCTCCTTCCCCGCATGGGCAGGATATTTGATTGCggct > 1:433633/1‑298 (MQ=9) tCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCT‑CAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCGTGGGCAGA‑ATATTTGATTGCG‑‑GATTCGTTTGAAAA‑TTCAGGGA‑CTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGAttc > 1:302578/1‑161 (MQ=11) cTTCGGGTCGTTGCCTNCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCT‑CAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGA‑ATATTTGATTGCG‑‑GATTCGTTTGAGAA‑TTCCGGGG‑CTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTAATCCTTCCCCGCATGGGNAGAATATTTGATTGCGGa > 1:662457/1‑282 (MQ=255) 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ctctctCGCTGGCGCT‑CAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGA‑ATATTTGATTGCG‑‑GATTCGTTTGAGAA‑TTCCGGGG‑CTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTACCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGA‑GTTCAGGGACTTTTGAAAGTGAtggtggt > 1:300919/1‑297 (MQ=255) tctcGCTGGCGCT‑CAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGA‑ATATTTGATTGCG‑‑GATTCGTTTGAGAA‑TTCCGGGG‑CTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGA‑GTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGa < 1:268384/300‑1 (MQ=255) gcT‑CAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGA‑ATATTTGATTGCG‑‑GATTCGTTTGAGAA‑TTCCGGGG‑CTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGAAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGA‑GTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTc < 1:514167/300‑1 (MQ=255) 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gTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGA‑ATATTTGATTGCG‑‑GATTCGTTTGAGAA‑TTCCGGGG‑CTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGc > 2:319373/1‑197 (MQ=255) aaGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGA‑ATATTTGATTGCG‑‑GATTCGTTTGAGAA‑TTCCGGGG‑CTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTAATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGCTTGCGTCTTCGCTTGAGA‑GTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGCGGTGGGGGAAGGATTAcccac > 2:452705/1‑277 (MQ=255) cTTCCCCGCTTGGGCAGA‑ATATTTGATTGCG‑‑GCTTCGTTTGAGAA‑TTGCGGGG‑CTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGTGAAGGATTCCTCCACGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCCACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGCCGAACATTGGTCGAAGCTTCTACTCCTTCCACGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCG‑TTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAgggtt > 2:777746/1‑260 (MQ=11) 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ggttgctttgagaaGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTAATCAGCGCGGCACGCTTCGCCCTTCGAGTCGTTGCCTGCGGCAACGCGTTCGCGCTGACGCTCTGGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTATCATCTTTCCCCGCATGGGCAGAGGATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGA‑GTTTGGGGATTTTTGGAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTC‑AGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGc < 2:32580/288‑1 (MQ=14) ggtgtttgtGAAAGTGATGTTGGTGTGGGAAGGACTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATGTGATTGCGGAGTCGCTTGAGA‑GTTCAGGGACTTTTGAAATTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTC‑Agcgc < 2:488340/215‑1 (MQ=17) g‑CTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGA‑GTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTC‑AGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGACCCTTGGTCGAAGCTtct > 1:196792/1‑300 (MQ=255) cTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGTGGCAACGCTCTCTCGCTGCCACTCGCGTCACACCTTCGTCGAAGATTATAGTCCTTCAACGCCTTGGCCGAATATTTGATTGCGTATTTGCCTGGGG‑GTTCAGGACCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGACTACTC‑AGCGCTGCGCGCTTAGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGgcgccaaaattgagcattgctcgaagagtata > 2:411553/1‑272 (MQ=9) gttggtggGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGTGCTTCGCCCTTCTGGTCGTTGCCTGCTGCAGCGCTTTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGA‑GTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGTAAGGATTACTC‑AGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTACCCGCa < 1:415378/297‑1 (MQ=17) | ATGCGCTTCGCTTATCCGACCTACAG‑GGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCT‑CAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGA‑ATATTTGATTGCG‑‑GATTCGTTTGAGAA‑TTCCGGGG‑CTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGA‑GTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTC‑AGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCA > NC_000913/1286599‑1287187 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |