| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 780918 | 70 (0.740) | 6 (0.070) | 4/548 | 7.9 | 7.8% | noncoding (76/76 nt) | lysW | tRNA‑Lys |
| ? | NC_000913 | 781321 = | 76 (0.860) | intergenic (+99/‑48) | lysY/lysZ | tRNA‑Lys/tRNA‑Lys | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
GACCCACCAATCGCTAAGGTGGAAGCGGTAGTAAAACGTGAAGGATAACGTTGCATGAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCACTAACATAGTTAGTTGTAGTATCCAGCGTAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAAC‑ATCGAAGA‑CAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCACTAATGACGGTGGGTTCGGTGGAAGTAGTTTGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGA > NC_000913/780621‑781215 | gacccaccaattgcgggagTGGAAGCGGTAGGAAAAAGTGAAGGGTAACGTTATATGAGCAACGGCCCGAAGGGCGAAACGAAGTCGAGTCGTCTTGCATGATCCACCGCTAAAATAGTTAGGTGGAGTATCCAGCGTAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTAGTAGAGCACCTCCCCTACACTGATGTGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAg < 2:49124/281‑1 (MQ=17)gacacaccaATCGATAAGGTGGAAGCGGTAGGAAAAAGGGAAGGATAACGTGACGTGAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGATTACGTTGGGTCGTCCTGCGCGATTCGCAGCTAACATAGTTAGTTGGGGTATCCAGAGGGGTATCGGGCGATTAGCTCAGAGGGGAGGACACCTCCCTGACAAGGATGGGGTAGGTGCTGCAATCCCGTCATCACCAACCAC‑TGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAg < 2:696425/295‑1 (MQ=9) aaTCGCTAAGGTGGAAGCGGTAGTAAAACGTGAAGGATAACGTTGCATGAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCACTAACATAGTTAGTTGTAGTATCCAGCGTAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGTAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTCGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAAC‑At < 1:748656/300‑1 (MQ=255) aGCGTTAGTAAAACGTGAAGGATAACGTTGCATGAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCACTAACATAGTTAGTTGTAGTATCCAGCGTAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTGACAATGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAAC‑ATCGAAGA‑CAGATGTTa < 1:229872/300‑1 (MQ=255) ggTAGGAAAACGTTAAGGATAACGTTACATGAGCAACGGCCCGAAGGGCTAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCACTAACATAGTTAGTTGTAGTATCCAGCGTAGTATCGTGTGATTAGCTCAGCTTTGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAAC‑ATCGAAGA‑CAGATGTTAAg < 2:281382/299‑1 (MQ=255) aCGTGAAGGATAACGTTGCATGAGCAACGGCCCGAAGGGCTAGACGAATTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCACTAACATAGTTAGTTGTAGTATCCAGCGTAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGATGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAAC‑ATCGAAGA‑CAGATGTTAAGCGTGTAGGAt < 1:183129/300‑1 (MQ=255) aaGGATAACGTTGCATGAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCACTAACATAGTTAGTTGTAGTATCCAGCGTAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAAC‑ATCGAAGA‑CAGATGTTAAGCGTGTAGGATaatgt < 1:681669/300‑4 (MQ=255) aaGGATAACGTTGCATGAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCACTAACATAGTTAGTTGTAGTATCCAGCGTAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAAC‑ATCGAAGA‑CAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGt < 1:646908/300‑1 (MQ=255) aaGGAGAACGTTGCATGAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACTAAGTCGAGTCATCCTACACGACCCACCACTAACATAGTTAGTTGTAGTATCCAGCGTAGTATCGGGTGATTAACTCAGCTGGTAGAGCACCTCCCTTACAATTAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGTTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAAC‑ATCGAAGA‑CAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGt < 2:205004/300‑1 (MQ=21) ggATAACGTTGCATGAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCACTAACATAGTTAGTTGTAGTATCCAGCGTAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTCATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAAC‑ATCGAAGA‑CAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGtt > 1:756157/1‑299 (MQ=255) ggATAACGTTGCATGAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCACTAACATAGTTAGTTGTAGTATCCAGCGTAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAAC‑ATcaaaatcagatgctgcatat > 1:464956/1‑267 (MQ=255) ggATAACGTTGCATGAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATAACATAGTTAGTTGTAGTATCCAGTGTAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTACCTTAAAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAAC‑ATCAAATC‑CAGATGTTAAGCGTGTAGGGTAACGtt > 2:346388/1‑299 (MQ=18) gATAACGTTGCATGAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGCCATCCCGCACGACCCACCACCAACATAATTAGCTGTAGTGTCCAGCGTAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTACCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑CGGGTCGTTAGATCAATTGGTAGAGCAGTTGACTTTTCATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAAA‑ATCAAAGA‑CAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGc > 1:655468/1‑300 (MQ=18) aCGTTGCATGAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCACTAACATAGTTAGTTGTAGTATCCAGCGTAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGttttccc > 2:671003/1‑256 (MQ=255) aCGTTGCATGAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCACTAACATAGTTAGTTGTAGTATCCAGCGTAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAAC‑ATCGAAAA‑CAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTc > 1:187689/1‑299 (MQ=255) gTTGCATGAGCAACGGCCCGAAGGGCTAGACTAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCACTAACATAGTTAGTTGTAGTATCCAGCGTAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCTTTACAAGGAGGGGGTCGGCTGTTCAATCCCGTCATCACCCACCAC‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAAC‑ATCGAAGA‑CAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGc < 1:643978/300‑1 (MQ=255) aaCGGCCCGAAGGTCTAGGCTGAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCACGAACGTAGTTAGTTGGAGTATCCAGCGTAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCGGTGAGAACACCTCCCTTACAAGTAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAAC‑ATCGAAGA‑CAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCaa < 2:221488/291‑1 (MQ=17) aCGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCACTAACATAGTTAGTTGTAGTATCCAGCGTAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAAC‑ATCGAAGA‑CAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTa > 1:296378/1‑299 (MQ=255) aCGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCACTAACACCGTCCATTATAATCCCCCACGCACCCCCGAGTAATCAGCCCCACTGGGAGAGCACCTCCCCTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAAC‑ATCGAAGA‑CAGATGTTAAGCATGTAGGATAACGTTGCGTCAGCCACGGcc > 1:296912/1‑295 (MQ=14) ggCCCGAAGTGCGAGACGAAGTCTAGTCATCCTGCACGACCCACCACTAACATAGTTAGTTGTAGTATCCAGCTTAGTATCGTTTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTGACACGGATGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCGTCACCCACCAC‑TGGGTCTTTAGCTCAGTTGTTAGAGCAGTTTACTTTTAATCAATTGGTCACAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAAC‑ATCGAAGA‑CAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAg < 2:203245/298‑1 (MQ=18) gAAGGGCGAAACGACGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCACGAACGTAGTTAGTTGGAGTATCCAGCGTAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGTGGGTCGATCCTGGCATCACCCACCAC‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAAC‑ATCTAAGA‑CAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAGGgcgag < 2:778274/299‑1 (MQ=17) gAGTCATCCTGCACGACCCACCACTAACATAGTTAGTTGTAGTATCCAGCGTAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCATTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAAC‑ATCAAACT‑CAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTGCGCCAGCAACGGCACGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCa > 2:678536/1‑300 (MQ=255) attCATCCTGCACGACCCACCACTAACATAGTTAGTTGTAGTATCCAGCGTAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAATGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAAC‑ATCGAAGA‑CAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCAc < 1:715513/298‑1 (MQ=255) acaaaTCCTGCACGACCCACCACTAACATAGTTAGTTGTAGTATCCAGCGTAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGTAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGGAGAGCATTTGGTTGTTAGTCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAAC‑ATCGAAGA‑CAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCAc < 1:25212/296‑1 (MQ=17) aGTCATCCTGCACTACCCACCCCTAACGTAGTTAGTTGTAGTATACAGCGTAGTATCGTGTGATTAGCTCAGCTGTTAGAGCACCTCCCTTACAAGTATGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCACCACCCACCAC‑CGGTTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAAC‑ATCGAAGA‑CAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCACCCTGCAc < 2:371728/300‑1 (MQ=17) aGTCATCCTGCACTACCCACCACTAACATAGTTAGTTGTAGTATCCAGCGTAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAAC‑ATCGAAGA‑CAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCAc < 1:683085/300‑1 (MQ=255) aTCCTGCACGACCCACCTCTAACATAGTTAGTTGTAGTATCCAGCGTAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAAC‑ATCAAAAT‑CAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGAcc > 1:732301/1‑300 (MQ=255) aTCCTGCACGACCCACCACTAACATAGTTAGTTGTAGTATCCAGCGTAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGNCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTCGGGNCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGCCCCACCAGTTTTAAC‑ATCAAACT‑CAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGAc > 2:590668/1‑300 (MQ=11) aTCCTGCACGACCCACCACTAACATAGTTAGTTGTAGTATCCAGCGTAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAAC‑ATCAAACT‑CAGATGTTAAGCGTGAAGGATAAc > 2:657957/1‑248 (MQ=255) aTCCTGCACGACCCACCACTAACATAGTTAGTTGTAGTATCCAGCGTAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAAC‑ATCAAACT‑CAGATGTNAAGCGTGAAGGATAAc < 1:657957/248‑1 (MQ=255) aTCCTGCACGACCCACCACTAACATAGTTAGTTGTAGTATCCAGCGTAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAAC‑ATCGAAGA‑CAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGAcc > 1:621652/1‑300 (MQ=255) aCGACTCACCACTGACATGGTTGGTTGTGGTATCTAGAGTAGTATTGGGTGAGTAGCTCAACTGGTAGAGCACCTCTCCTGCGGGGAGGGGGTCTGCGGTGCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑CGGGTCGTTAGCTTGGTTGGTAGAGCAGTTGACTTCTAATCAATTTTTCGCAGGTTCGAATCCTGCACTACCCACCAGTCCTAAC‑ATTGAATA‑CGGGTGTGAAGCGTGTAGGATAACGGTGCGTCAGCAACGTCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCcaccac < 1:117693/299‑1 (MQ=9) aCGACCCACCACTAACATAGTTAGTTGTAGTATCCAGCGTAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGTAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAAC‑ATCGAAGA‑CAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCtaccac < 1:109472/299‑1 (MQ=255) accacTAACATAGTTATTTGTAGTATCCAGCGTGGTATTGGGTGATTAGCTTAGCTGGTAGAGCACCTCCCTTACNAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAAC‑ATCGAAGA‑CAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCACTAATg < 1:575325/297‑1 (MQ=255) accacTAACATAGTTAGTTGTAGTATCCAGCGTAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGATGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCACCACCCACCAC‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAAC‑ATCGAAGA‑CAGATGTTAAGCGTGTAGGTTAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCACTAATGACg < 2:462007/300‑1 (MQ=255) accacTAACATAGTTAGTTGTAGTATCCAGCGTAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAAC‑ATCGAAGA‑CAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCACTAATg < 2:721672/297‑1 (MQ=255) accacTAACATAGTTAGTTGTAGTAGCCAGCGTAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAAC‑ATCGAAGA‑CAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCACTAATg < 2:296378/297‑1 (MQ=255) gtagtaTCCAGCGTAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAAC‑ATCGAAGA‑CAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGAGAGTCATCCTGCACGACCCACCACTAATGACGGTGGGTTCGGTGGAagta > 2:233797/1‑299 (MQ=255) gCGTAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAAC‑ATCGAAGA‑CAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCACTAATGACGGTGGGTTCGGTGGAAGTAGTTTGTAGTAt > 1:734485/1‑300 (MQ=255) gtaTCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAAC‑ATCGAAGA‑CAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCACTAATGACGGTGGGTTCGGTGGAAGTAGTTTGTAGTATCCAgc < 1:691935/300‑1 (MQ=255) gtaTCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACACACCAGTTTTAAC‑ATCGAAGA‑CAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCACTAATGACGGTGGGTTCGGTGGAAGTAGTTTGTAGTATCCAgc < 1:691721/300‑1 (MQ=255) gtaTCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTACCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAAC‑ATCGAAGA‑CAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGCAGGgc > 1:208483/1‑225 (MQ=255) aTCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAAC‑ATCGAAGA‑CAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCACTAATGACGGTGGGTTCGGTGGAAGTAGTTTGTAGTATCCAgcgc < 1:233797/300‑1 (MQ=255) gATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTCATCAATTGGTCGCAGGTTCAAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAAC‑ATCAAAGC‑CAGGTGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGAccc > 2:19291/1‑244 (MQ=255) tAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGATGGGGTCGGCGATTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAAC‑ATCGAAGA‑CAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCACTAATGACGGTGGGTTCGGTGGAAGTAGTTTGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGt < 1:268644/300‑1 (MQ=255) agatCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGTAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAAC‑ATCGAAGA‑CAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCACTAATGACGGTGGGTTCGGTGGAAGTAGTTTGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGt < 1:738602/296‑1 (MQ=255) gCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAAC‑ATCGAAGA‑CAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCATGACGGTTGGtcc > 2:559026/1‑253 (MQ=255) tCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGTTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGTTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAAC‑ATCGAAGA‑CAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCACTAATGACGGTGGGTTCGGTGGAAGTAGTTTGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGgaga < 1:91001/298‑1 (MQ=255) cAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCTGCCCATTCTACCCATCCAAAAGCCCA‑‑CTAAACATATCTAGCAATGTTGCGTCAGCCATGGCCCGTAGGGCGAGCGAGGCGAGTCATCCTGCACGAACAACCAATAATGACGGTGGGTTCGGTGGAAGTAGTTTGTAGTATCCAGTGAAGTATTGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCtaac > 1:259535/1‑297 (MQ=12) gtggttctgcggTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCANTTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAAC‑ATCGAAGA‑CAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCACTAATGACGGTGGGTTCGGTGGAAGTAGTTTGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACaa < 1:565088/292‑1 (MQ=255) ggggTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAAC‑ATCGAAGA‑CAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCACTAATGACGGTGGGTTCGGTGGAAGTAGTTTGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACaa < 2:734485/299‑1 (MQ=255) tCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑CGGTTCGTTAGCTCAGTTGTTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAAC‑ATCGAAGA‑CAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCACTAATGACGGTGGGTTCGGTGGAAGTAGTTTGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTcggc < 1:5668/300‑1 (MQ=255) cGTCATCACCCACCAC‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGtttcaaaatc > 2:683068/1‑97 (MQ=255) cGTCATCACCCACCAC‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAAC‑ATCGAAGA‑CAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGt < 1:518656/135‑1 (MQ=255) cGTCATCACCCACCAC‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAAC‑ATCGAAGA‑CAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGt > 2:518656/1‑135 (MQ=255) acccaccAT‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTAGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAAC‑ATCGAAGA‑CAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGt < 2:153453/128‑1 (MQ=255) acccaccAC‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAAA‑ATCGACGA‑CGGATGTTCCGCGTGTCATATACCGTTACGCCCGCAACGGCCCGTAGGGAGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCACTAATGACGGTGGGTTCGGTGGAAGTAGTTTGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGTTGGGAGAGCACCCCCCTTACAAGGAGGGGGTAGGCGGTTAGATcc > 1:189521/1‑296 (MQ=21) actaaaaagtgggTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAAC‑ATCGAAGA‑CAGATGTTAAGCGTGTAGGAt < 1:592958/113‑1 (MQ=255) acgaaacattgggTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTTAAC‑ATCGAAGA‑CAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAggg < 2:787759/141‑1 (MQ=255) acgaaaaagtgggTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAAC‑ATCGAAGA‑CAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGc < 1:644008/127‑1 (MQ=255) ccac‑cGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACccaccaa < 2:556167/82‑2 (MQ=18) ccac‑cGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACccaccaa < 2:556379/82‑2 (MQ=18) ccac‑cGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACccaccaa > 1:556167/1‑81 (MQ=18) ccac‑cGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACccaccaa > 1:556379/1‑81 (MQ=18) gTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAAC‑ATCGAAGA‑CAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCACTAATGACGGTGGGTTCGGTGGAAGTAGTTTGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGNTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTa > 1:174964/1‑299 (MQ=255) agtggACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAAC‑ATCTAAGA‑CAGAGGTTAAGCGTGTAGGACAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCACCCTGCAc < 2:371640/136‑1 (MQ=14) gTTGACTTTTAATCAATTTGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAAC‑ATCGAAGA‑CAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCTAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCACTAATGACGGTGGGTTCGGTGGAAGTAGTTTGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTag < 2:50307/300‑1 (MQ=255) gTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAAGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAAC‑ATCGAAGA‑CAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCACTAATGACGGTGGGTTCGGTGGAAGTAGTTTGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTag < 2:174964/300‑1 (MQ=255) gTTGACTTTTAATCAATTGGTAGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCAACCAGTTTTAAC‑ATCGAAGA‑CAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGCAGCGAGTCATCCTGCACGACccaccaatattaacgatgggc > 2:203965/1‑148 (MQ=255) aCCCACCAGTTTTAAC‑ATCGAAGA‑CAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTa > 2:49910/1‑70 (MQ=255) aCCCACCAGTTTTAAC‑ATCGAAGA‑CAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATAATGACGGTGGGTTCGGTGGAAGTAGTTTGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCATTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCAACCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCCGTTGACTTTTAATCCATTGGTCGCAGGTTCGAAt > 2:45158/1‑296 (MQ=255) aCCCACCAGTTTTAAC‑ATCGAAGA‑CAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATAATAAAGGTGGGTTCGGCGGAAGTAGTTTGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCGGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGCGGGGGTCGGTGTTTCGATCCCGTCATCAACCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGCCGCAGGTTCGAATCCt > 2:44768/1‑299 (MQ=25) aCCCACCAGTTTTAAC‑ATCGAAGA‑CAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGAACCACCACTAATGAAGGTGGGTTAGGTGGAAGTAGTTTGTAGTGTCCAGCGCAGTATCGGGTGAGTAGTCCAGCTGGGAGAGCACCCCCCTTACAAGGCGGGGGTAGGCGGTTCGATCCCGTAATcacccacc > 2:49898/1‑232 (MQ=25) ccaGTTTTAAC‑ATCGAAGA‑CAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGAACCACCACTCATGCCGGTGGGTTCGGTAGAAGTAGTTTGTAGTATCCAGCGCCGTATCAGGTTATTAGCTCAGCTGGGCGAGCACCTCCCCTACAAGGAGGGAGTAGGCGGTTCGATCCCGTCATCAACCACCACCAGGGTCGTTAGTTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTTGCAGGTTTGAATCCTGCACGa > 2:16813/1‑300 (MQ=21) | GACCCACCAATCGCTAAGGTGGAAGCGGTAGTAAAACGTGAAGGATAACGTTGCATGAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCACTAACATAGTTAGTTGTAGTATCCAGCGTAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAAC‑ATCGAAGA‑CAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCACTAATGACGGTGGGTTCGGTGGAAGTAGTTTGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGA > NC_000913/780621‑781215 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |