| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 129 total aligned reads displayed.
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tGCTGGTAATGAATCAAACTTCTTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATCTTGAGCACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGT‑GCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGATCCATTCGCTGCGTCTATCGCTTGCTGATTACGTGCAGCTTTCCATTCAGGCGGGATTCATACAGCGGCCAGCCATCCGTCATCCCTATCACCACGTCCAAGGGTGACAGCAGGCTCATAAGACGACCCAGCGTCGCCATCGTGCGTTCCCCGa > 2:329668/1‑300 (MQ=11) gCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGT‑GCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGCTGCGTATATCGCTTGCTGATTACGTGCAGCTTTCCCTTCAGGCGGGATTCATACAGCGGCCAGCCATCCGTCATCCATATCACCACGTCAAAGGGTGACAGCAGGCTCATAAGACGCCCCAGCGTCGCCATAGTGCGTTCACCGaa > 1:402742/1‑300 (MQ=31) gCTGGTAATGACTCCAACTTAGTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCTATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGT‑GCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGCTGCGTATATCGCTTGCTGATTACGTGCAGCTTTCCCTTCAGGCGGGATTCATACAGCGGCCAGCCATCCGTCATCCATATCACCACGGCAAAGGGTGACAGCAGGCTCATAAGACGCCCCAGCGTCGCCATAGTGCGtc < 1:697918/293‑2 (MQ=14) | CGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTCAGCACCCGGCGGTACAGCGAATCTGCAATACGGATTATTCTGCGCTTTTTAGTCCAGCGGTGCGTTAATCGGCAGCTCCCCCAAAGTTAAGGTGGGGGAGATAGATTAGTTGTACATTACCACGATTTTGACTCGGCTCATTATTTGCCCGCTTGAGACATTGTTTCCATATGTACGCGGGCGAATAAATAGAGGAATCTGATTACTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGT‑GCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGCTGCGTATATCGCTTGCTGATTACGTGCAGCTTTCCCTTCAGGCGGGATTCATACAGCGGCCAGCCATCCGTCATCCATATCACCACGTCAAAGGGTGACAGCAGGCTCATAAGACGCCCCAGCGTCGCCATAGTGCGTTCACCGAA > NC_000913/19500‑20092 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |