| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 1,995,620 | IS5 (–) +4 bp | intergenic (‑261/‑32) | uvrY ← / → yecU | DNA‑binding transcriptional activator UvrY/protein YecU |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 1397238 | NA (NA) | 126 (1.360) | 78/586 | 0.0 | 100% | noncoding (1195/1195 nt) | IS5 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 1995623 | 0 (0.000) | intergenic (‑264/‑32) | uvrY/yecU | DNA‑binding transcriptional activator UvrY/protein YecU | |||||
| * | ? | NC_000913 | 1995620 = | 0 (0.000) | 116 (1.250) | 67/586 | 0.1 | 100% | intergenic (‑261/‑35) | uvrY/yecU | DNA‑binding transcriptional activator UvrY/protein YecU |
| ? | NC_000913 | = 2290113 | NA (NA) | noncoding (1/1195 nt) | IS5 | repeat region | |||||
Only 100 of 116 total aligned reads displayed.
ATCGCCTGCAGCATCAGCGTCAGCATCGCTTTCAGGCAGGAGACTTCATTTGCCAGTTCTTGATTATTCTCGGCAGTAGAAAAATCAGGCGTACTCATTTATTTTCCTCGTCATGTTGCAATGAAAATTTGCGGTGAAAAATGTTAAGGCGGCGGAGTATACCATAAGCTTTGCTAAAAATAGCAGTGGTTGTTTTTTGAGCGTGATATCGGCAGTGCTATAAAATACGTTAATATAATGACCAATAAATATTTTTATCATGAATGTTTTTTGCCCGTATTGTTCGGGTTAATTAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/1995915‑1995620‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAGTCATCAACTTACCTTCGCCGACAGTGAATTCAGCAGTAAGCGCCGTCAGACCAGAAAAGAGATTTTCTTGTCCCGCATGGAGCAGATTCTGCCATGGCAAAACATGGTGGAAGTCATCGAGCCGTTTTACCCCAAGGCTGGTAATGGCCGGCGACCTTATCCGCTGGAAACCATGCTACGCATTCACTGCATGCAGCATTGGTACAACCTGAGCGAT < NC_000913/2290113‑2289824 ATCGCCTGCAGCATCAGTGTCAGCATCGCTTTCCGGCAGGAGACTTCATTTGCCAGTTCTTGATTATCCTCGGCAGTAGAAAAAGCAGGCGTACTCATTTATTTTCCTCTTCATGTGGCAATGAAAATTTGCGGTGAAAAATGTTAAGGCGGCGGAGTATACCATAAGCTTTGCTAAAAATAGCAGTGGTTGTTTTTTGAGCGTGATATCTGCAGTGCTATAAAATACGTTAATACAATGACCAATAAATATTTTTATCATGAATGTTTTTTGCCCGTATTGTTCGGGTTAATTAAGGA < 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ATCAGCGTCAGCATCGCTTTCAGGCAGGAGACTTCATTTGCCAGTTCTTGATTATTCTCGGCAGTAGAAAAATCAGGAGTACTCATTTATTTTCCTCGTCATGTTGCAATGAAAATTTGCGGTGAAAAATGTTAAGGCGGCGGAGTATACCATAAGCTTTGCTAAAAATAGCAGTGGTTGTTTTTTGAGCGTGATATCGGCAGTGCTATAAAATACGTTAATATAATGACCAATAAATATTTTTATCATGAATGTTTTTTGCCCGTATTGTTCGGGTTAATTAAGGAAGGTGCGAACAA > 2:740117/1‑299 AGCGTCAGCATCGCTTTCAGGCAGGAGACTTCATTTGCCAGTTCTTGATTATTCTCGGCAGTAGAAAAATCAGGCGTACTCATTTATTTTCCTCGTCATGTTGCAATGAAAATTTGCGGTGAAAAATGTTAAGGCGGCGGAGTATACCATAAGCTTTGCTAAAAATAGCAGTGGTTGTTTTTTGAGCGTGATATCGGCAGTGCTATAAAATACGTTAATATAATGACCAATAAATATTTTTATCATGAATGTTTTTTGCCCGTATTGTTCGGGTTAATTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCC < 1:498020/300‑1 ATCGCTTTCAGGCAGGAGACTTCATTTGCCAGTTCTTGATTATTCTCGGCAGTAGAAAAATCAGGCGTACTCATTTATTTTCCTCGTCATGTTGCAATGAAAATTTGCGGTGAAAAATGTTAAGGCGGCGGAGTATACCATAAGCTTTGCTAAAAATAGCAGTGGTTGTTTTTTGAGCGTGATATCGGCAGTGCTATAAAATACGTTAATATAATGACCAATAAATATTTTTATCATGAATGTTTTTTGCCCGTATTGTTCGGGTTAATTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATG < 2:752395/299‑1 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TCGGGTTAATTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCAGCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAGTCATCAACTTACCTTCGCCGACAGTGAATTCAGCAGTAAGCGCCGTCAGACCAGAAAAGAGATTTTCTTGTCCCGCATGGAGCAGATTCTGCCATGGCAAAACATGGTGGAAGTCATCGAGCCGTTTTACCCCAAGGCTGGTAATGGCCGGCGACCTTATCCGCTGGAAACCATGCTACGCATTCACTGCATGCAGCATTGGTACAACCTGAGC < 1:234416/300‑1 TCGGGCTAATTAAGGAANATGCGAACAAGTCCCTGANATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAGTCATCAACTTACCTTCGCCGACAGTGAATTCAGCAGTAAGCGCCGTCAGACCAGAAAAGAGATTTTCTTGTCCCGCATGGAGCAGATTCTGCCATGGCAAAACATGGTGGAAGTCATCGAGCCGTTTTACCCCAAGGCTGGTAATGGCCGGCGACCTTATCCGCTGGAAACCATGCTACGCATTCACTGCATGCAGCNTTGGTACAACCTGAGC < 1:637038/300‑1 GGTTAATTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAGTCATCAACTTACCTTCGCCGACAGTGAATTCCGCAGTAAGCGCCGTCAGACCAGAAAAGAGATTTTCTTGTCCCGCATGGAGCAGATTCTGCCATGGCAAAACATGGTGGAAGTCATCGAGCAGTTTTACCCCAAGGCNGGTAATGGCCGGCGACCTTATCCGCTGGAAACCATGCTACGCATTCACTGCATGCAGCATTGGTACAACCTGAGCGAT > 1:151030/1‑300 ATCGCCTGCAGCATCAGCGTCAGCATCGCTTTCAGGCAGGAGACTTCATTTGCCAGTTCTTGATTATTCTCGGCAGTAGAAAAATCAGGCGTACTCATTTATTTTCCTCGTCATGTTGCAATGAAAATTTGCGGTGAAAAATGTTAAGGCGGCGGAGTATACCATAAGCTTTGCTAAAAATAGCAGTGGTTGTTTTTTGAGCGTGATATCGGCAGTGCTATAAAATACGTTAATATAATGACCAATAAATATTTTTATCATGAATGTTTTTTGCCCGTATTGTTCGGGTTAATTAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/1995915‑1995620‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAGTCATCAACTTACCTTCGCCGACAGTGAATTCAGCAGTAAGCGCCGTCAGACCAGAAAAGAGATTTTCTTGTCCCGCATGGAGCAGATTCTGCCATGGCAAAACATGGTGGAAGTCATCGAGCCGTTTTACCCCAAGGCTGGTAATGGCCGGCGACCTTATCCGCTGGAAACCATGCTACGCATTCACTGCATGCAGCATTGGTACAACCTGAGCGAT < NC_000913/2290113‑2289824 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |