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| Missing coverage evidence... | ||||||||||
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| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 101 total aligned reads displayed.
TACTGGAAGAACGATCCGTTCAGCCCGGAAGAGGACTCACGCTTAATCACCTCATCATCTGCTGACGGTAAATTATTAGAGATCCCATTTAACCCGGTGTATCGGAATTTTGACAAAGGTCTTCAGGAAATCACCGACTGGATCGAAAAACGCTTGTGTTAAAAATTTGCTAAATTTTGCCAATTTGGTAAAACAGTTGCATCACAACAGGAGATAGCAATGACGTTACCGAGTGGACACCCGAAGAGCAGATTGATCAA‑‑AAAATTTACCGCAC‑TAGGCCCGTATATTCGTGAAGGTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 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AA‑‑AAAATTTACCGCAC‑TAGTCCCGTATATTCTTTAAGGTAAGTG‑CAAAGATAATCGATTCTTTTTCGATTGTCTGGCTGTATGCGTCAACGTGAAACCGGCACCGGAAGTGCGTGAATTCTGGGGCTGG‑TGGATGGAGCTGGAAG‑CGCAGGAATCCC‑GTTTTACCTACAGTTACCAGTTTGGTCTGTTCGATAAAGCAGGCGACTGGAAGAGTGTTCCGGTAAAAGACACTG‑AAGTGGTTGAACGACTGGAGCACACCCTGCGTGAGTTTCACGAGAAGCTGCGTGAACTGCTGACGAC < 2:40521/299‑1 AA‑‑AAAATTTACCACAC‑TAGGCCCGTATATTCGTGAAGGTAAGTG‑CAAAGATAATCGATTCTTTTTCGATTGTCTGGCTGTATGCGTCAACGTGAAACCGGCACCGGAAGTGCGTGAATTCTGGGGCTGG‑TGGATGGAGCTGGAAG‑CGCAGGAATCCC‑GTTTTACCTACAGTTACCAGTTTGGTCTGTTCGATAAAGCAGGCGACTGGAAGAGTGTTCCGGTAAAAGACACTG‑AAGTGGTTGAACGACTGGAGCACACCCTGCGTGAGTTTCACGAGAAGCTGCGTGAACTGCTGACGAC < 2:181410/299‑1 TTTACCGCAC‑TAGGCCCGTATATTCGTGAAGGTAAGTG‑CAAAGATAATCGATTCTTTTTCGATTGTCTGGCTGTATGCGTCAACGTGAAACCGGCACCGGAAGTGCGTGAATTCTGGGGCTGG‑TGGATGGAGCTGGAAG‑CGCAGGAATCCC‑GTTTTACCTACAGTTACCAGTTTGGTCTGTTCGATAAAGCAGGCGACTGGAAGAGTGTTCCGGTAAAAGACACTG‑AAGTGGTTGAACGACTGGAGCACACCCTGCGTGAGTTTCACGAGAAGCTGCGTGAACTGCTGACGACGCTGAAT < 1:447474/300‑1 GCAC‑TAGGCCCGTATATTCGTGAAGGTAAGTG‑CAAAGATAATCGATTCTTTTTCGATTGTCTGGCTGTATGCGTCAACGTGAAACCGGCACCGGAAGTGCGTGAATTCTGGGGCTGG‑TGGATGGAGCTGGAAG‑CGCAGGAATCCC‑GTTTTACCTACAGTTACCAGTTTGGTCTGTTCGATAAAGCAGGCGACTGGAAGAGTGTTCCGGTAAAAGACACTG‑AAGTGGTTGAACGACTGGAGCACACCCTGCGTGAGTTTCACGAGAAGCTGCGTGAACTGCTGACGACGCTGAATCTGAA > 1:89606/1‑299 CAC‑TAGGCCCGTATATTCGTGAAGGTAAGTG‑CAAAGATAATCGATTCTTTTTCGATTGTCTGGCTGTATGCGTCAACGTGAAACCGGCACCGGAAGTGCGTGAATTCTGGGGCTGG‑TGGATGGAGCTGGAAG‑CGCAGGAATCCC‑GTTTTACCTACAGTTACCAGTTTGGTCTGTTCGATAAAGCAGGCGACTGGAAGAGTGTTCCGGTAAAAGACACTG‑AAGTGGTTGAACGACTGGAGCACACCTTGCGTGAGTTTCACGAGAAGCTGCGTGAACTGCTGACGACGCTGAATCTGAAGC > 2:160752/1‑300 CAC‑TAGGCCCGTATATTCGTGAAGGTAAGTG‑CAAAGATAATCGATTCTTTTTCGATTGTCTGGCTGTATGCGTCAACGTGAAACCGGCACCGGAAGTGCGTGAATTCTGGGGCTGG‑TGGATGGAGCTGGAAG‑CGCAGGAATCCC‑GTTTTACCTACAGTTACCAGTTTGGTCTGTTCGATAAAGCAGGCGACTGGAAGAGTGTTCCGGTAAAAGACACTG‑AAGTGGTTGAACGACTGGAGCACACCCTGCGTGAGTTTCACGAGAAGCTGCGTGAACTGCTGACGACGCTGAATCTGAAGC > 2:313372/1‑300 caccAGGCCCGTATATTCGTGGAGGTAAGTG‑CAAAGATAATCGATTCTTTTTCGATTGTCTGGCTGTATGCGTCAACGTGAAACCGGCACCGGAAGTGCGTGAATTCTGGGGCTGG‑TGGATGGAGCTGGCAG‑CGCAGGCATCCA‑GTTTTACCTACAGTTACCAGTTTGGTCTGTTCGATAAAGCAGGCGACTGGAAGAGTGTTCCGGTAAAAGCCCCTT‑ACGTGGTTGAACGACTGGAGCACACCCTGCGTGAGTTTCACGAAAAGTTGCGTGAACTGCTGACGACGCTGACTCTGAcgc > 2:258489/5‑297 GCCCGTATATTCGTGANGGTAAGTG‑CAAAGATAATCGATTCTTTTTCGATTGTCTGGCTGTATGCGTCAACGTGAAACCGGCACCGGAAGTGCGTGAATTCTGGGGCTGG‑TGGATGGAGCTGGAAG‑CGCAGGAATCCC‑GTTTTACCTACAGTTACCAGTTTGGTCTGTTCGATAAAGCAGGCGACTGGAAGAGTGTTCCGGTAAAAGACACTG‑AAGTGGTTGAACGACTGGAGCACACCCTGCGTGAGTTTCACGAGAAGCTGNGTGAACTGCTGACGACGCNGAATCTGCAGCTGGAAC > 1:641249/1‑300 ccgcATATTCGTGAAGATAAGTG‑CAAAGATAATCGATTCTTTTTCGATTGTCTGGCTGTATGCGTCAACGTGAAACCGGCACCGGAAGTGCGTGAATTCTGGGGCTGG‑TGGATGGAGCTGGAAG‑CGCAGGAATCCC‑GTTTTACCTAAAGTTACCAGTTTGGTCTGTTCGATAAAGCAGGCGACTGGAAGAGTGTTCCGGTAAAAGACAACG‑AAGTTGTTGAACGACTGGAGCACACCCTGCGTGAGTTTCACGAGAAGCTGCGTGAACTGCTGACTAAGATGAATCTGAAGCTGGAAC > 2:134218/5‑298 TACTGGAAGAACGATCCGTTCAGCCCGGAAGAGGACTCACGCTTAATCACCTCATCATCTGCTGACGGTAAATTATTAGAGATCCCATTTAACCCGGTGTATCGGAATTTTGACAAAGGTCTTCAGGAAATCACCGACTGGATCGAAAAACGCTTGTGTTAAAAATTTGCTAAATTTTGCCAATTTGGTAAAACAGTTGCATCACAACAGGAGATAGCAATGACGTTACCGAGTGGACACCCGAAGAGCAGATTGATCAA‑‑AAAATTTACCGCAC‑TAGGCCCGTATATTCGTGAAGGTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/257610‑257907‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tgaaggtaAGTG‑CAAAGATAATCGATTCTTTTTCGATTGTCTGGCTGTATGCGTCAACGTGAAACCGGCACCGGAAGTGCGTGAATTCTGGGGCTGG‑TGGATGGAGCTGGAAG‑CGCAGGAATCCC‑GTTTTACCTACAGTTACCAGTTTGGTCTGTTCGATAAAGCAGGCGACTGGAAGAGTGTTCCGGTAAAAGACACTG‑AAGTGGTTGAACGACTGGAGCACACCCTGCGTGAGTTTCACGAGAAGCTGCGTGAACTGCTGACGACGCTGAATCTGAAGCTGGAACCGGC > NC_000913/258684‑258966 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |