| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | NC_000913 | 2,490,240 | 0 | G | T | 26.7% | 192.2 / 12.1 | 105 | intergenic (‑54/+16) | yfdV/oxc | putative transport protein YfdV/oxalyl‑CoA decarboxylase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (42/35); new base T (0/28); total (42/63) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.48e-08 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 109 total aligned reads displayed.
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ggagACGATGTCAGTATTTAATTACCAGCGACTTGTTTTGGGTTAAGTTTGGTAATATGGCCACTTTCAGTTCCTGCTGCAGGGTCGATGACCACATTAATAATGGTCGGTTTGCGCGACTGAATACCGGTGGTTAAAGCATGACGAAGTTCATCTGTCGTGGTGACGTTATAGCCAACGCCACGAAACGCATCCATTAATTTGTCATACCTTGCATGGTGCAACAGATCCGTTGGTGATGGTGCACCAGCGCCACTGAGATCAACACCGTCTCCTCTGTAGATGCCGCCATTATTaaaa > 1:149134/1‑300 (MQ=255) ggagACGATGTCAGTATTTAATTACCAGCGACTTGTTTTGGGTTAAGTTTGGTAATATGGCCACTTTCAGTTCCTGCTGCAGGGTCGATGACCACATTAATAATGGTCGGTTTGCGCGACTGAATACCGGTGGTTAAAGCATGACGAAGTTCATCTGTCGTGGTGACGTTATAGCCAACGCCACGAAACGCATCCATTAATTTGTCATACCTTGCATGGTGCAACAGATCCGTTGGTGATGGTGCACCAGCGCCACTGAGATCAACACCGTCTACTCTGTAGATGCCGCCATTATTaaaa > 1:148893/1‑300 (MQ=255) ggagACGATGTCAGTATTTAATTACCAGCGACTTGTTTTGGGTTAAGTTTGGTAATATGGCCACTTTCAGTTCCTGCTGCAGGGTCGATGACCACATTAATAATGGTCGGTTTGCGCGACTGAATACCGGTGGTTAAAGCATGACGAAGTTCATCTGTCGTGGTGACGTTATAGCCAACGCCACGAAACGCATCCATTAATTTGTCATACCTTGCATGGTGCAACAGATCCGTTGGTGATGGTGCACCAGCGCCACTGAGATCAACACCGTCTAATATGTAGATGCCGCCATTATTaaaa > 1:149124/1‑300 (MQ=255) | AAAAGAAACATCCGACAATAACCACAAGTGATACAAGGGTCAGACGAGTGTCCGCAAAAATCATTTCCCTGTTTGCCCGAGTAATAGATACAAATAGAGCCGCAGGAAGCGCGTAGTTTAATACCAGTTTATTAAATGCCCGAGCTTGATCTTCTGAAAATGTTTCTCGTCTGCCGCTAAAATAACCCAACAGCATGATTACGATAATAGGCAATAAATCGCCAATAAAAAATGTTAGCATAATAGTATTTCCGATAAGGGTCCCCTCACCATCGCATAATGAGTTGGCAAGAGGAGACGATGTCAGTATTTAATTACCAGCGACTTGTTTTGGGTTAAGTTTGGTAATATGGCCACTTTCAGTTCCTGCTGCAGGGTCGATGACCACATTAATAATGGTCGGTTTGCGCGACTGAATACCGGTGGTTAAAGCATGACGAAGTTCATCTGTCGTGGTGACGTTATAGCCAACGCCACGAAACGCATCCATTAATTTGTCATACCTTGCATGGTGCAACAGATCCGTTGGTGATGGTGCACCAGCGCCACTGAGATCAACACCGTCTCCTCTGTAGATGCCGCCATTATTAAAA > NC_000913/2489946‑2490538 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |