| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| JC JC | NC_000913 | 3,938,983 | IS2 (–) +5 bp | coding (757‑761/993 nt) | rbsR → | DNA‑binding transcriptional dual regulator RbsR |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | 3938983 = | 0 (0.000) | 82 (1.000) | 51/590 | 0.3 | 100% | coding (757/993 nt) | rbsR | DNA‑binding transcriptional dual regulator RbsR |
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| * | ? | NC_000913 | = 3938987 | 0 (0.000) | 109 (1.330) | 70/590 | 0.0 | 100% | coding (761/993 nt) | rbsR | DNA‑binding transcriptional dual regulator RbsR |
| ? | NC_000913 | = 4499511 | NA (NA) | noncoding (1331/1331 nt) | IS2 | repeat region | |||||
AAGGTTTATCAGTCCATTTGAATATGCAAAGATTAATAATCCATTAAAACAGTAATCATCCCGGGCAAATGCCCGGGAATTATTCTAGGATTATTTTCTTTGTTAAAAAAGACAAACGGTATTAACTGATGTATTTACTATTTACCGCTCCCTGCAGGGGGGATTATCAGAATCCGCGGTTATTCATTATTTATATACATTCAATAAAAAAGTAACCTCATAAAAAATCCTGTACTCACAGGGTGATGCGGGATAACTGACGTAAGGAGTGCTGCAGGGATTTGATGGTCCCTTGTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTTAGACTAGTCATTGGAGAACAGATGATTGATGTCTTAGGGCCGGAGAAACGCAGACGGCGTACCACACAGGAAAAGATCGCAATTGTTCAGCAGAGCTTTGAACCGGGGATGACGGTCTCCCTCGTTGCCCGGCAACATGGTGTAGCAGCCAGCCAGTTATTTCTCTGGCGTAAGCAATACCAGGAAGGAAGTCTTACTGCTGTCGCCGCCGGAGAACAGGTTGTTC > NC_000913/4497886‑4498476 | aaGGTTTATCAGTCCATTTGAATATGCAAAGATTAATAATCCATTAAAACAGTAATCATCCCGGGCAAATGCCCGGGANTTATTCTAGGATTATTTTCTTTGTTAAAAAAGACAAACGGTATTAACTGATGTATTTACTATTTACCGCTCCCTGCAGGGGGGATTATCAGAATCCGCGGTTATTCATTATTTATATACATTCAATAAAAAAGTAACCTCATAAAAAATCCTGTACTCACAGGGTGATGCGGGATAACTGACGTAAGGAGTGCTGCAGGGATTTGATGGTCCCTTGTAGAc < 1:472567/300‑1 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |