| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 696741 | 64 (0.780) | 10 (0.170) | 8/434 | 4.2 | 17.2% | intergenic (‑1/+15) | metU/glnW | tRNA‑Met/tRNA‑Gln |
| ? | NC_000913 | 697135 = | 49 (0.810) | intergenic (‑2/+378) | metT/asnB | tRNA‑Met/asparagine synthetase B | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
GATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACTGGGTGCACTTACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTT‑‑TTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGAATTTGGTGGCTACGAC‑GGGATTCGAACCTGTGACCCCATCATTATGAGTGATGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCC‑GGTATC‑AAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAG‑‑ATGGC‑‑TGGGGTACCTGGATTC‑‑GAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCGAGACTTGAACTCGCACACCTTGCGGCGCCAGAACCTAAATCTGGTGCGTCTA > NC_000913/696445‑697028 | gATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACTGGGTGCACTTACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTT‑‑TTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGAATTTGGTGGCTACGAC‑GGGATTCGAACCTGTGACCCCATCATTATGAGTGATGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCAGAt > 1:356688/1‑300 (MQ=255) gAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACTGGGTGCACTTACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTT‑‑TTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGAATTTGGTGGCTACGAC‑GGGATTCGAACCTGTGACCCCATCATTATGAGTGATGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGtt < 1:600847/299‑1 (MQ=255) aaTCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACTGGGTGCACTTACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCAGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTT‑‑TTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGAATTTGGTGGCTACGAC‑GGGATTCGAACCTGTGACCCCATCATTATGAGTGATGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTa < 1:53345/300‑1 (MQ=255) aCCGCTTGGCGATACCCCAACTGGGTGCACTTACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTT‑‑TTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGAATTTGGTGGCTACGAC‑GGGATTCGAACCTGTGACCCCATCATTATGAGTGATGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGa < 1:600214/300‑1 (MQ=255) ttGGCGATACCCCAACTGGGTGCACTTACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTT‑‑TTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGAATTTGGTGGCTACGAC‑GGGATTCGAACCTGTGACCCCATCATTATGAGTGATGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGcc < 1:610308/300‑1 (MQ=255) ttGGAGATACCCCGACTGTGTACACTTACCATGTAAGTGTCTTGAATAAAGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCTGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTG‑CGATACCCCAACAAATTGGTT‑‑TTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGAATTTGGTGGCTACGAC‑TGGATTCGAACCTGTGACCCCATCATTATGAGTGATGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTGTCGTCGATTGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGcc < 2:151493/299‑1 (MQ=38) gCGATACCCCAACTGGGTGCACTTACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTT‑‑TTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGAATTTGGTGGCTACGAC‑GGGATTCGAACCTGTGACCCCATCATTATGAGTGATGTGCTCTAACCCACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCAATGACTGGGGTACCTGGGTTCGacacagggcatatagat > 2:391113/1‑284 (MQ=39) tACCCCAACTGGGTGCACTTACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTT‑‑TTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGAATTTGGTGGCTACGAC‑GGGATTCGAACCTGTGACCCCATCATTATGAGTGATGTGCTCTAACCAACTGAGCTCCATAGTCAGATTGTTTATTAGACGGCTGGGGTACCTAGATCCGAAACAGGGAATACC‑GGTATC‑a > 2:266491/1‑300 (MQ=38) tACCCCAACTGGGTGCACTTACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCAAACAAATTGGTT‑‑TTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGAATTTGGTGGCTACGAC‑GGGATTCGAACCTGTGACCCCATCATTATGAGTGATGTGCTCTAACCAACTGAGTTACGTCGCCAGCTTGTTTCTTAGATGACTGGGGTACCGGGATTCGAGACAGGGAATgtgggtaccc > 2:267667/1‑291 (MQ=38) aCCCCAACTGGGTGCACTTACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTT‑‑TTGAATNTGCCGAACATATTCGATACATTCAGAATTTGGTGGCTACGAC‑GGGATTCGAACCTGTGACCCCCTCATTATGAGTGATGTACTCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAAACAGAGAATGCC‑GGTATC‑a > 2:471586/1‑299 (MQ=255) cacaaaCTGGGTGCACTTACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGCATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAGCTGGTT‑‑TTGCATTCGCCAACCATATTCGATCCATTAAGCATCTGTTGGCT‑CCACAGGGATTCGAAGCCGCGCCCACATACTTATGAGTGATGTGCTCTAAACAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCC‑GGTATC‑aaa > 2:576714/5‑300 (MQ=25) ccAACTGGGTGCACTTACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTAGGAATGCCGGCATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAGTTGGTT‑‑TTGCATTTGCCGAACCTATTCGATACATTCCGAATTTGGTGGCTACGAC‑GTGATTCGAACCTATGACCCCCTCATCATGAGTGATGTGCTCTAACCAACCGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGTTGGGGTACCTGGCTTCGAACCAGGGAATGCC‑GGTATC‑aaa > 1:23226/1‑298 (MQ=38) ggTGCACTTACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTT‑‑TTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGAATTTGGTGGCTACGAC‑GGGATTCGAACCTGTGACCCCATCATTATGAGTGATGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGCTGGCTGGGATACCTGTATTCGCACCAGGGAATGCC‑GGTATC‑AAAAACCGGTGc > 2:366055/1‑300 (MQ=255) cTTACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTT‑‑TTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGAATTTGGTGGCTACGAC‑GGGATTCGAACCTGTGACCCCATCATTATGAGTGATGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCC‑GGTATC‑AAAAACCGGTGCCTTAcc > 1:54225/1‑300 (MQ=255) cTTACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTT‑‑TTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGAATTTGGTGGCTACGAC‑GGGATTCGAACCTGTGACCCCATCATTATGAGTGATGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTCAAATGGCTGGGGTaact > 1:11258/1‑252 (MQ=255) cTTACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTT‑‑TTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGAATCTGGTGGCTACGAC‑GGGATTCGAACCTGTGCCCCCATCATTCTGAGTGATGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGTAGCAAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGTA‑GGTATC‑AAAACCAGGTGCCTTaac > 2:223528/1‑298 (MQ=39) tACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTT‑‑TTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGAATTTGGTGGCTACGAC‑GGGATTCGAACCTGTGACCCCATCATTATGAGTGATGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCC‑GGTATC‑AAAAACCGGTGCCTTACCGc < 1:300030/300‑1 (MQ=255) aGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTT‑‑TTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGAATTTGGTGGCTACGAC‑GGGATTCGAACCTGTGACCCCATCATTCTGAGTGATGTGCTCTAACCAAATGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGAGTCGACCCAGGGAATGCC‑GGTATC‑AAAAACCGGTGCCTTACCGCtt > 2:427250/1‑298 (MQ=255) aGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTT‑‑TTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGAATTTGGTGGCTACGAC‑GGGATTCGAACCTGTGACCCCATCATTATGAGTGATGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCCGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGCTTCGAACCCGGGAATGCA‑GGTATC‑ACAAACCGGTGCCTTACCGCtt > 2:520992/1‑298 (MQ=255) 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gggTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTT‑‑TTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGAATTTGGTGGCTACGAC‑GGGATTCGAACCTGTGACCCCATCATTATGAGTGATGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCC‑GGTATC‑AAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAAc > 1:440563/1‑300 (MQ=255) gggTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTT‑‑TTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGAATTTGGTGGCTACGAC‑GGGATTCGAACCTGTGACCCCATCATTATGAGTGATGNGCTCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATAGCTGGAGTCCCTGGATTTGAACCAGGGAATGCC‑GGTATC‑AAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATAcc > 2:201558/1‑280 (MQ=255) aCGATGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTT‑‑TTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGAATTTGGTGGCTACGAC‑GGGATTCGAACCTGTGGCCCCATCATTATGAGTGATGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCC‑GGTATC‑AAAAAc < 2:446147/251‑1 (MQ=255) 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aaTCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTT‑‑TTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGAATTTGGTGGCTACGAC‑GGGATTCGAACCTGTGACCCCATCATTATGATTGATGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCC‑GGTATC‑AAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAG‑‑ATGGC‑‑TGGGGTACCt < 1:84238/300‑1 (MQ=255) aatccttggCCTTACAGCGTGTCGATACCCCAACAAAGTGGTT‑‑TTGAATTGGCCGAACATATTCGATACATTCAGAATTTGGTGGCTACNAC‑GGGATTCGAACCTGTGACCCCATCATTATGGGTGATGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGTGGCCAGATTGTTTCTGCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCC‑GGTATC‑AAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAG‑‑ATGGC‑‑TGGGGTACCTGGAtt < 2:497833/291‑1 (MQ=38) aatcccgtctcccgctgcgtataactACCCCAATAGATGGGTG‑‑TTGAATTTGCCGAACGTATCCGATGCAGTCGGACTTTAGCGGCTGCNGC‑GGGATGCGAACCGGTGACCCCTTCGCTATTGGTGAAGTGCGCAAACCCACTGAGCTACTTGGAAAGATTTTTTTTTAGGTGGCTGGGGTACTGGGATTCGAACCGTGGAATGCC‑GGTATC‑AAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAG‑‑ATGGC‑‑TGGGGTACCTGGAtt < 2:497837/274‑1 (MQ=255) gCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTT‑‑TTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGAATTTGGTGGCTACGAC‑GGGATTCGAACCTGTGACCCCATCATTATGAGTGATGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCC‑GGTATC‑AAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAG‑‑ATGGC‑‑TGGGGTACCTGGATTC‑‑GAACCa > 1:385785/1‑298 (MQ=255) tACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTT‑‑TTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGAATTTGGTGGCTACGAC‑GGGATTCGAACCTGTGACCCCATCATTATGAGTGATGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCC‑GGTATC‑AAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAG‑‑ATGGC‑‑TGGGGTACCTGGATTC‑‑GAACCAggg < 2:417771/297‑1 (MQ=255) gcttttcGATACCCCAACAAATTGGTT‑‑TTGAATTTGCCGAACGGAGGCGCGACATTCGGAATTGGGTGGCTACGAC‑GTGATTCGAACCTGTGACCCCATCGTTATGAGTGATGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCC‑GGTATC‑AAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCTAAGAAG‑‑ATGGC‑‑TGGGGTACCTGGATTC‑‑GAACCAGGGAATGcc < 2:363083/293‑1 (MQ=38) ccccAACAAATTGGTTGGTTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGAATTTGGTGGCTACGAC‑GGGATTCGAACCTGTGACCCCATCATTATGAGTGATGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCCGGTATC‑CAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGGGATGGCCCTGGGGTACCTGGATTCGAGAACCAGGGaagcagc > 1:215947/1‑293 (MQ=38) tttGCCGAACATATTCGATACATTCAGAATTTGGTGGCTACGAC‑GGGATTCGAACCTGTGACCCCATCATTATGAGTGATGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCC‑GGTATC‑AAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAG‑‑ATGGC‑‑TGGGGTACCTGGATTC‑‑GAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGa < 1:101427/300‑1 (MQ=255) tttGCCGAACATATGCGATACATTCAGAATTTGGTGGCTACGAC‑GGGATTCGAACCTGTGACCCCATCATTATGAGTGATGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCC‑GGTATC‑AAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAG‑‑ATGGC‑‑TGGGGTACCTGGATTC‑‑GAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGa < 1:327910/300‑1 (MQ=255) gCCGAACATATTCGATACATTCAGAATTTGGTGGCTACGAC‑GGGATTCGAACCTGTGACCCCATCATTATGAGTGATGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTTTTTCTTCAATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCC‑GATATC‑AAAACCCGATACCTTACCGCTTAGCGATACCCCACTAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAG‑‑ATGGC‑‑TGGGGTACCTGGATTC‑‑GAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATAc > 1:587179/1‑300 (MQ=39) gAACATATTCGATACATTCAGAATTTGGTGGCTACGAC‑GGGATTCGAACCTGTGACCCCATCATTATGATTGATGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCC‑GGTATC‑AAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAG‑‑ATGGC‑‑TGGGGTACCTGGATTC‑‑GAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATAccc < 1:496699/299‑1 (MQ=255) 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(MQ=38) atatTCGATACATTCAGAATTTGGTGGCTACGAC‑GGGATTCGAACCTGTGACCCCATCATTATGAGTGATGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCC‑GGTATC‑AAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAG‑‑ATGGC‑‑TGGGGTACCTGGATTC‑‑GAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATc < 1:570434/299‑1 (MQ=255) tCGATACATTCAGAATTTGGTTGCTACGAC‑GGGATTCGAACCTGTGACCCCATCATTATGAGTGATGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCC‑GGTATC‑AAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAG‑‑ATGGC‑‑TGGGGTACCTGGATTC‑‑GAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTAc < 1:570551/300‑1 (MQ=255) tCGATACATTCAGAATTTGGTGGCTACGAC‑TGGATTCGAACCTGTGACCCCATCATTATGATTGATGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCC‑GGTATC‑AAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGTCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAG‑‑ATGGC‑‑TGGGGTACCTGGATTC‑‑GAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTAc < 1:576714/300‑1 (MQ=255) tCGATACATTCAGAATTTGGTGGCTACGAC‑GGGATTCGAACCTGTGACCCCATCATTATGAGTGATGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCC‑GGTATC‑AAAAACCGGTGCCTTACCGCTTTGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAATAAG‑‑ATGGC‑‑TGGGGTACCTGGATTC‑‑GAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGTCGATACCCCATCCGTAc < 1:570594/300‑1 (MQ=255) tCGATACATTCAGAATTTGGTGGCTACGAC‑GGGATTCGAACCTGTGACCCCATCATTATGAGTGATGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCC‑GGTATC‑AAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAG‑‑ATGGC‑‑TGGGGTACCTGGATTC‑‑GAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTAc < 1:453401/300‑1 (MQ=255) gATACATTCAGAATTTGGGGGCTACGAC‑GGGATTCGAACCTGTGACCCCATCATTATGAGTGATGTGCTCTAACCAACNGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCC‑GGTATC‑AAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAG‑‑ATGGC‑‑TGGGGTACCTGGATTC‑‑GAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACaa < 1:122470/300‑1 (MQ=255) gAATTTGGTGGCTACGAC‑GGGATTCGAACCTGTGACCCCATCATTATGAGTGATGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCC‑GGTATC‑AAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAG‑‑ATGGC‑‑TGGGGTACCTGGATTC‑‑GAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTgg < 1:502525/300‑1 (MQ=255) gggtacgaggATTCGAACCTGTGACCCCATCATTATGAGTGATGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCC‑GGTATC‑AAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAG‑‑ATGGC‑‑TGGGGTACCTAGCTTC‑‑GCACCCGGGAATGCCGTTACCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCAGTACAACGTTTTCTGGTGGATGGTGc > 2:579500/9‑299 (MQ=38) tactactggATTCGAACCTGTGACCCCATCATTATGAGTGATGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCC‑GGTATC‑AAAAACCGGTGCCCTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAG‑‑ATGGC‑‑TGGGGTACCTGGATTC‑‑GAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATgg < 1:360159/288‑1 (MQ=255) ac‑gGGATTCGAACCTGTGACCCCATCATTATGAGTGATGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCC‑GGTATC‑AAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAG‑‑ATGGC‑‑TGGGGTACCTGGATTC‑‑GAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAgg < 1:451669/300‑1 (MQ=255) tgATTCGAGCCTTTGACCCCATCATTATGAGTTATGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCC‑GGTATC‑AAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCTAAGAAG‑‑ATGGC‑‑TGGGGTACCTGGATTC‑‑GAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAg < 2:550066/295‑1 (MQ=255) gcgagatgtgtataagagacagcatTATGAGTGATGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCC‑GGTATC‑AAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAG‑‑ATGGC‑‑TGGGGTACCTGGATTC‑‑GAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAggtga > 1:272877/23‑297 (MQ=255) atTATGAGTGATGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCC‑GGTATC‑AAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAG‑‑ATGGC‑‑TGGGGTACCTGGATTC‑‑GAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCGAGACTTGAACTCGCACACCTTgc > 1:61305/1‑299 (MQ=255) tATGAGTGATGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATTGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCC‑GGTATC‑AAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAG‑‑ATGGC‑‑TGGGGTACCTGGATTC‑‑GAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCGAGACTTGAACTCGCACACCTTgcgg < 1:183590/299‑1 (MQ=255) aGTGATGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCC‑GGTATC‑AAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAG‑‑ATGGC‑‑TGGGGTACCTGGATTC‑‑GAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCGAGACTTGAACTCGCACACCTTGCGGCGCCa > 1:446491/1‑300 (MQ=255) ggtgtgCTCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGACTGCG‑GGTATC‑AAAAAACGGTGCCCTAACGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTCACGCgaa > 2:354081/3‑150 (MQ=25) gATGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCC‑GGTATC‑AAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAG‑‑ATGGC‑‑TGGGGTACCTGGATTC‑‑AAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCGAGACTTGAACTCGCACCCCTTGCGGCGCCAGaa > 1:449788/1‑300 (MQ=255) 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GATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACTGGGTGCACTTACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTT‑‑TTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGAATTTGGTGGCTACGAC‑GGGATTCGAACCTGTGACCCCATCATTATGAGTGATGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCC‑GGTATC‑AAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAG‑‑ATGGC‑‑TGGGGTACCTGGATTC‑‑GAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCGAGACTTGAACTCGCACACCTTGCGGCGCCAGAACCTAAATCTGGTGCGTCTA > NC_000913/696445‑697028 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |