| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_012971 | = 739785 | 65 (0.680) | 13 (0.180) | 13/438 | 3.7 | 19.1% | noncoding (76/76 nt) | ECD_RS03640 | tRNA‑Lys |
| ? | NC_012971 | 740008 = | 62 (0.870) | intergenic (+1/‑132) | ECD_RS03645/ECD_RS03650 | tRNA‑Lys/tRNA‑Lys | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
ACCCACCACCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCACTAATTACGGTGGGTTCGGTGGAAGTAGTTTGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTACGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGAGCCACCAATTTTAAAGATTGGT‑TCCGAGTAGAA‑ATCTTTCAGGTAACAC‑CCATATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAA > NC_012971/739494‑740068 | acccaccACCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCACTAATTACGGTGGGTTCGGTGGAAGTAGTTTGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAAc > 1:500641/1‑300 (MQ=255) accaccGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGGTGACTTGTAATCAATTGGGCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCACTAATTACGGTGGGTTCGGTGGAAGTAGTGTGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGAGTAGTTCAGCTGGGAGAGCACCCCCCTTACAAGGAGGGGGTCTGCGGGTCGATCCCGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAAtttaaagg < 1:751160/297‑6 (MQ=21) gTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATGCTTACGTTGGTCTCGGTGGAAGCAGTTTATAGTATCCCTTGCCTTATCAGGTACTTAACTCCGCTGGGAAATCCCCTCCCTTCCCAGGATTTGTTCGTTGTTTCGATCCCGTCACCCACCACCCTTCGGGTCGTTCGTTCGGTTGGTAGGGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAAttt > 1:40312/1‑284 (MQ=12) gTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCGCTCATCCAGGTGTACTCGGTGGAGATAATGTGGGGTATCTCGCGTAGTACCGGGTGATTAGTTCAGCTGGGAGAGCACATCACTTAAAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATTCCGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGATTCGCATCCTGCACGAACCACCAGTTTTAACATCACACTCAGATGTTAAGAGTGAAGGa > 1:438059/1‑300 (MQ=17) gTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCACTAATTACGGTGGGTTCGGTGGAAGTAGTTTGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGa > 1:317953/1‑300 (MQ=255) aGTTGACGTTGAATCAATTGGTCGCAGTTTCGAATCCTGCACGACCCACCACTAATTACGGTGGGTTCGGTGGAAGTAGTTTGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGt < 2:669688/299‑1 (MQ=255) aTTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATACCTACGGTGGGTTCGGTGGACGTCGTTTGTAGTATCCCACGCCGTATCTGGTGACTAGCTCCTCTGGGCGAACACCTCCCTTACCAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCAACCACCAATCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTAAGCCAGCAACGGccc > 2:718381/1‑300 (MQ=21) cTGCACGACCCACCACTAATTACGGTGGGTTCGGTGGAAGTAGTTTGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTCGGGTCNTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTACGCCAGCAACGGCCCGTAggg < 2:534006/286‑1 (MQ=255) cTGCACGACCCACCACTAATTACGGTGGGTTCGGTGGAAGTAGTTTGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCANTTTTAACATCAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTACGCCAGCAACGGCCCGTAggg > 1:534006/1‑286 (MQ=255) cTGCACGACCCACCACTAATTACGGTGGGTTCGGTGGAAGTAGTTTGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTACGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGt > 1:463056/1‑300 (MQ=255) gCACGACCCACCACTAATTACGGTGGGTTCGGGGGAAGGGGTTTGTAGTATCCAGCGCAGGGTTGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAg < 2:263844/220‑1 (MQ=17) aCCCACCACTAATTACGGTGGGTTCGGTGGAAGTAGTTTGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCAACCAAtttcaagat > 1:383809/1‑218 (MQ=255) ctgcgagatgtgtataagagacaggtagtaTCCAGCGTAGTATTGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTACGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGAGCCACCAAtt > 1:722075/25‑300 (MQ=21) gtagtaTCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTACCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTAAGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGAGCAACCAATTTTAAAGATTGGT‑TAAGAGTAGaa > 2:275284/1‑299 (MQ=255) gtagtaTCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTACCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCAACCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCACACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTa > 2:172803/1‑219 (MQ=255) gtagtaTCCAGCGCAGNATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTACGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCANGAGCCACCAATTTTAAAGNTTGGT‑TCCGAGTAGaa‑a > 1:636012/1‑300 (MQ=255) aTCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAATCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCAAACTCAGATGGTAAGCGTGAAGGATAAGGTTAAGCCAGCAACGGCCAGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGAGCCACCAACTTTAAAGAtt > 2:489080/1‑280 (MQ=255) gcgcAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAAtttcaa > 2:38662/1‑169 (MQ=255) gTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTACGCCAGCAACGGCCCGTCGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGAGCAACCAATTTTAGAGATTGGT‑TCCGAGt > 2:301791/1‑280 (MQ=255) gTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTACCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCAAACTCAGATGTTCCGCGTGAAGGATAACGTTACGCCCGCCACGGCCCGTNGGGCGCGCGAAGCGAATCATCCTGCACGAGCCACCAATTTTACAGATTGGT‑TACGAGTAGAA‑ATCTTTAAGGTAacac > 1:155181/1‑300 (MQ=21) gggTGATTAGCTCAGCTGGTAGAGCACCTCCCTTACAATGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑CGGGTCGTTAGCTNAGTTGTGAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTAGAATCCTGCACGACCCACCAGTGTTAACATCAAACTCAGATGTGAAGCGTGAAGGATAACGTTACGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGAGCCACCAATTTTAAAGATTGGT‑TCCGAGTAGAA‑ATCTTTCAGGTAACAC‑CCatat < 2:585932/300‑1 (MQ=25) ggTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTACGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGAGCCACCAATTTTAAAGATTGGT‑TCCGAGTAGAA‑ATCTTTCAGGTAACAC‑CCatat < 1:582884/300‑1 (MQ=255) tGATTAGCTCAGCTGGGATAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGTTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCTTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTACGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGAGCCACCAATTTTAAAGATTGGT‑TCCGAGTAGAA‑ACCTTTCAGGTAACAC‑CCATATgg < 2:1464/300‑1 (MQ=255) tGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTACGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGAGCCACCAATTTTAAAGATTGGT‑TCCGAGTAGAA‑ATCTTTCAGGTAACAC‑CCATATgg < 1:650396/300‑1 (MQ=255) ttAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTACGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGAGCCACCAATTTTAAAGATTGGT‑TCCGAGTAGAA‑ATCTTTCAGGTAACAC‑CCATATGGGTc < 1:244090/300‑1 (MQ=255) gCTGGGAGAGCACCTCCATTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCAACCACCACTAGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTCAACATCAAACTCAGACGTTAAGCGTGAAGGATAAAGTTaagcaa > 1:501426/1‑185 (MQ=17) ggAGAGCACCTCCATTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCAAACTCAGATGTTAATCGTGAAGGATAACGTTACGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGAGCCACCAATTTTAAAGATTGGT‑TCCGAGTAGAA‑ATCTTTAAGGTAACAC‑CCATATGGGTCGTTAGCTCAGtt > 1:275842/1‑300 (MQ=255) gagCACCTCCCTTACAAGTATGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTACGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGAGCCACCAATTTTAAAGATTGGT‑TCCGAGTAGAA‑ATCTTTCAGGTAACAC‑CCATATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGt < 2:722075/300‑1 (MQ=255) aCCTCCCTTACAATGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTACGCCAGCAACGTCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGAGCCACCAATTTTAAAGATTGGT‑GCCGAGTAGAA‑ATCTTTCAGGTAACAC‑CCATATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTaga < 1:385067/299‑1 (MQ=255) aCCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTACGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGAGCCACCAATTTTAAAGATTGGT‑TCCGAGTAGAA‑ATCTTTCAGGTAACAC‑CCATATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTaga < 2:742902/299‑1 (MQ=255) cccTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTCGGTTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTACGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGAGCCACCAATTTTAAAGATTGGT‑TCCGAGTAGAA‑ATCTTTCAGGTAACAC‑CCATATGGGt < 2:178361/276‑1 (MQ=255) cccTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCAAACTCAGCTGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTACGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAATCATCCTGCACGAGCCAACAAGTTTGAAGATTGGT‑TCCGAGTAGAC‑ATATTTAAGGTACCAC‑CCATATGGGTCGTTAGCTCAGCTGGTAGAGCa > 2:62861/1‑298 (MQ=25) cccTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTACGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGAGCCACCAATTTTAAAGATTGGT‑TCCGAGTAGAA‑ATCTTTCAGGTAACAC‑CCATATGGGt < 2:177643/276‑1 (MQ=255) cccTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTACGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGAGCCACCAATTTTAAAGATTGGT‑TCCGAGTAGAA‑ATCTTTCAGGTAACAC‑CCATATGGGt > 1:177643/1‑276 (MQ=255) cccTTACAAGAAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTACGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGAGCCACCAATTTTAAAGATTGGT‑TCCGAGTAGAA‑ATCTTTCAGGTAACAC‑CCATATGGGt > 1:178361/1‑276 (MQ=255) tACAAGGAGGGGGTCTGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTACGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGAGCCACCAATTTTAAAGATTGGT‑TCCGAGTAGAA‑ATCTTTCAGGTAACAC‑CCATATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGc < 1:230826/293‑1 (MQ=255) ggggggCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTCTGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTGTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCAAACTCAGATGTGAAGAGTGAAGGATAACGTTAAGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGAGCCACCAATTTTAAAGATTGGT‑TCCGAGTAGAA‑ATCTTTTAGGTAACAC‑CCATATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATc < 1:398545/300‑1 (MQ=255) ggggTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAAtttcaaaat > 1:14914/1‑117 (MQ=255) ggggTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTCAACATCCACCCCAGATGTTAAGCATGACGAATACCTCTAAGCCAACAAGGGCAAGTAGGGCGAGTGAAGCGAGTCATCCTGCACGAGCCACCAATTTTAGAGGGTGGT‑TACGAGTAGAG‑ATCTTTAGGGTAACAA‑ACATATGGGTAGTTAGCTCAGTGGGTAGAGAAAGTGACTTTTAATc > 1:14029/1‑299 (MQ=12) ggTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCAACCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTACGCCAGCAACGACCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGAGCCACCAATTTTAAAGATTGGT‑TCCGAGTAGAA‑ATCTTTCAGGTAACGA‑CCATATGGGTGGTTAGCTTAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAAt > 2:14652/1‑300 (MQ=255) cGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCCACCTCAGATGTTCCGCGTTACGGATCACGTTCCGCCAGCAACAGCCCATCGGGCACGCGAAACTACTCCTCCCTCACGAGCCAACAATTTTAGAGATTGGC‑TCCGAGTAGAA‑GTCTTTAAGGTAGCAC‑TCATGTGGGTTGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAAt > 1:579862/1‑300 (MQ=21) cGTCATCAACCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTACGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGAGCCACCAATTTTAAAGATTGGT‑TCCGAGTAGAA‑ATCTTTCAGGTAACAC‑CCATATGGGTCGTTAGCTCAGGTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAAt > 1:42554/1‑300 (MQ=255) gTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTACGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGAGCCACCAATTTTAAAGATTGGT‑TCCGAGTAGAA‑ATCTTTCAGGTAACAC‑CCATATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAAt < 1:407682/299‑1 (MQ=255) atcaCCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCAACCTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTACGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGAGCCACCAATTTTAAAGATTGGT‑TCCGAGTAGAA‑ATCTTTCNGGTAACAA‑CCATATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCt > 1:165751/1‑299 (MQ=255) accacTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGTTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCAAACTCAGATGTTAAGCGGGAAGGATAACGTTACGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGTACGAGCCACCAATTTTAAAGATTGGT‑TCCGAGGAGAA‑ATCTTTCAGGTAACAC‑CCATATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGAc < 1:482333/299‑1 (MQ=255) ccacTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTACGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGAGCCACCAATTTTAAAGATTGGT‑TCCGAGTAGAA‑ATCTTTCAGGTAACAC‑CCATATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTTATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGAccc > 1:186942/1‑300 (MQ=255) tCGGTTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTACGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGAGCCACCAATTTTAAAGATTGGT‑TCCGAGTAGAA‑ATCTTTCAGGTAACAC‑CCATATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACccacc < 1:349872/299‑1 (MQ=255) gggTCGTGAGCTCAGTTGGTAGAGCAGGTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACAGCAAACGCGGGTGTTAAGTGTGAAGGATAACGTTACGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCAc < 2:306909/165‑1 (MQ=25) tAGCTCAGTTGGTAGAGAATTTGACTTTGAAGCAATTGGTCGCATGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCAAACTCGGATGTTAAGCGGTAAGGATAACGTTACGTCGGCAACGGCCCTTAGGGCGAGCTAAGCGAGTCATCCTGTACGAGCCANTAATTTTAAAGATTGGT‑TCCGAGTAGAA‑ATCTTTCAGGTAACAC‑CCATATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAgg < 2:550340/300‑1 (MQ=38) gTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACAt > 1:90523/1‑72 (MQ=255) gTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTACGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGAGCCACCAATTTTAAAGATTGGT‑TCCGAGTAGAA‑ATCTTTCAGGTAACAC‑CCATATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTAc > 1:90836/1‑300 (MQ=255) gTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTACGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGAGCCACCAATTTTAAAGATTGGT‑TCCGAGTAGAA‑ATCTTTCAGGTAACAC‑CCATATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGAACCACCAATTTAAAGGTGGTTAc > 1:90483/1‑300 (MQ=255) tgggtagaatagttagcTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTTAACATCAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTGACGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGAGCCACCAATTTTAAAg < 1:194487/152‑1 (MQ=38) tGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGtttcaa > 2:243320/1‑64 (MQ=255) gTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATTAACCTTAGATGt > 2:449149/1‑81 (MQ=14) agCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTACGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGATCTAATCGAGTCATCCTGCACGAGCCACCAATTTTAAAGAT‑GTTGTCAGGTTAGGG‑GGCTTGTAGGTAGTGC‑CCATATGTGGCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTagag < 1:613125/300‑1 (MQ=37) agCAGTCGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTACGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGAGCCACCAATTTTAAAGATTCGT‑TCCGATTAGAA‑ATCTTTCAGGTAACAC‑CCATATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTagag < 1:612441/300‑1 (MQ=255) aCTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTACGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGAGCCACCAATTTTAAAGATTGGT‑TCCGAGTAGAA‑ATCTTTCAGGTAACAC‑CCATATGGGTCGTTAGCTCAGTTNGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTag > 2:584157/1‑290 (MQ=255) aCTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTACGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGAGCCACCAATTTTAAAGATTGGT‑TCCGAGTAGAA‑ATCTTTCAGGTAACAC‑CCATATGGGTCGTTAGCTCAGTTNGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGAACCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTag > 2:584422/1‑290 (MQ=255) aCTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTACGCCAGCAACGGCACGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGAGCCACCAATTTTAAAGATTGGT‑TCCGAGTAGAA‑ATCTTTCAGGTAACAC‑CCATATGGGTCGTTAGCTCAGTTNGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTag > 2:584137/1‑290 (MQ=255) aCTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCAAACTCAGATGTTAAGCATGAAGGATAACGTTACGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGAGCCACCAATTTTAAAGATTGGT‑TCCGAGTAGAA‑ATCTTTCAGGTAACAC‑CCATATGGGTCGTTAGCTCAGTTNGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTag > 2:584215/1‑290 (MQ=255) aagtGGTCGCAGGGTCGAATCCTGCACGACTCACAAGTTTTAACATCAAACTCAGATGTTAAGCGTTAAGGATAACGNTACGTCAGCAACGGCCCGTAGGGCGGGCGAAGCGAGTCATCCTGTACGAGCCACCAATTTTAAAGAGTGGT‑TCCGAGGAGAA‑ATCCCTCAGGTAACAC‑CCATATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGt < 1:152410/296‑1 (MQ=38) gaagtcgagtcaTCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTACGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGAGCCACCAATTTTAAAGATTGGT‑Tc < 1:500540/133‑1 (MQ=255) gaagtcgagtcaTCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTACGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGAGCCACCAATTTTAAAGATTGGT‑Tc > 2:500540/12‑144 (MQ=255) aGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCATTTTTAACATCAACCTCAGATTTTAAGCGTGAAGGATAACGTTACGCCAGCAACAGCCCGTAGGGCGAGCTAAGCGAGTCATCCTGCACGAGCCACCAATTTTAAAGATTGGT‑TCCGAGTAGAA‑ATCTTTCAGTTAACAC‑CCATATGGGTTGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCa < 2:317953/299‑1 (MQ=255) ggTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCAAACTCAGATTTTAAGCGTTAAGGATAACGTTACTCCAGCAACTTCCCTTATGGCTAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGAGACAGCAATCAGAAGCGTGGGC‑TCTGAGGGGGGGAT‑AAGAAATAAACACACCA‑CTGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAAc < 1:583767/300‑1 (MQ=16) ggTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTACGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGAGCCACCAATTTTAAAGATTGGT‑TCCGAGTAGAA‑ATCTTTCAGGTAACAC‑CCATATGGGTCGTTAGTTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTCAAAGGTGTTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATGACGTTGCGTTAGCAAc > 2:8029/1‑300 (MQ=255) ttCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTACGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGAGCCACCAATTTTAAAGATTGGT‑TCCGAGTAGAA‑ATCTTTCAGGTAACAC‑CCATATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTCCTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTCAGCAAc > 1:126349/1‑298 (MQ=255) cTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTACGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGAGCCACCAATTTTAAAGATTGGT‑TCCGAGTAGAA‑ATCTTTCAGGTAACAC‑CCATATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGGACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGaa > 2:456781/1‑298 (MQ=255) | ACCCACCACCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCACTAATTACGGTGGGTTCGGTGGAAGTAGTTTGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTACGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGAGCCACCAATTTTAAAGATTGGT‑TCCGAGTAGAA‑ATCTTTCAGGTAACAC‑CCATATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAA > NC_012971/739494‑740068 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |