| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | NC_000913 | 2,103,891 | G→A | P207S (CCA→TCA) | wbbK ← | putative glycosyltransferase WbbK |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,103,891 | 0 | G | A | 98.4% | 404.6 / NA | 122 | P207S (CCA→TCA) | wbbK | putative glycosyltransferase WbbK |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/1); major base A (68/51); minor base C (2/0); total (70/52) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.08e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 122 total aligned reads displayed.
GAAATCTGATGCTAATACCCACTTACCTCGCTCTTTAGCTTCAGACAACGGCAATCCCCATGTTTCTAACCTAGAGGGAAAACAAACTATATCTGAAATATTATAACAATGATCGATTTTTTCTTTATCCAAGTACCCGAGGAAATGAACATTATCCAGTCCTTCTGCAAGACTGATAATATATTTTGCATACGCATTTTCTGTACCACTGATAGTAAGCAGAAATTTAATATTGGATTGTTCTTTCAATTTCCTTGCTGCACTAATAATAAGCTCGTAATTTTTAAATACTCGTGGAACAGCAGGGTAAAATATTGTCAACTCAGAAGGGTTATTCTTAAATTGAGAATCATCATCAGTAAGTTGGCTTTTATCAGATAATTTAATTTCTGGCCGACTGACAATGATGTTATTTATAGAATATTTCTTGATAAATTTTTCTTTCATCCAGAATTGTTGAACAAACACTGCAGTATTTTTTTTAATGTTTATTTTATATATCAGCCCGTATAGCATTTTAAATAAGAAAAAGCTAGGCTCCATAAGAATTTCACGGAATAAAATTCCTTTATAAAAAGGTGCAGGGTTAT > NC_000913/2103595‑2104184 | gAAATCTGATGCTAATACCCACTTACCTCGCTCTTTAGCTTCAGACAACGGCAATCCCCATGTTTCTAACCTAGAGGGAAAACAAACTATATCTGAAATATTATAACAATGATCGATTTTTTCTTTATCCAAGTACCCGAGGAAATGAACATTATCCAGTCCTTCTGCAAGACTGATAATATATTTTGCATACGCATTTTCTGTACCACTGATAGTAAGCAGAAATTTAATATTGGATTGTTCTTTCAATTTCCTTGCTGCACTAATAATAAGCTCGTAATTTTTAAATACTCGTGAAAc < 1:405928/300‑1 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aaTACTCGTTAAACAGCAGGGTAAAATATTGTCAACTCAGAAGGGTTATTCTTAAATTGAGAATCATCATCAGTAAGTTGGCTTTTATCANATAATTTAATTTCTGGCCGACTGACAATGATGTTATTTATAGAATATTTCTTGATAAATTTTTCTTTCATCCAGAATTGTTGAACAAACACTGCAGTATTTTTTTTAATGTTTATTTTATATATCAGCCCGTATAGCATTTTAAATAAGAAAAAGCTAGGCTCCATAAGAATTTCACGGAATAAAATTCCTTTATAAAAAGGTGCAggg < 2:651671/300‑1 (MQ=255) aTACTCGTGAAACAGCAGGGTAAAATATTGTCAACTCAGAAGGGTTATTCTTAAATTGAGAATCATCATCAGTAAGTTGGCTTTTATCAGATAATTTAATTTCTGGCCGACTGACAATGATGTTATTTATAGAATATTTCTTGATAAATTTTTCTTTCATCCAGAATTGTTGAACAAACACTGCAGTATTTTTTTTAATGTTTATTTTATATATCAGCCCGTATAGCATTTTAAATAAGAAAAAGCTAGGCTCCATAAGAATTTCACGGAATAAAATTCCTTTATAAAAAGGTGCAGGGt < 1:687068/300‑1 (MQ=255) tCGTGAAACAGCAGGGTAAAATATTGTCAACTCAGAAGGGTTATTCTTAAATTGAGAATCATCATCAGTAAGTTGGCTTTTATCAGATAATTTAATTTCTGGCCGACTGACAATGATGTTATTTATAGAATATTTCTTGATAAATTTTTCTTTCATCCAGAATTGTTGAACAAACACTGCAGTATTTTTTTTAATGTTTATTTTATATATCAGCCCGTATAGCATTTTAAATAAGAAAAAGCTAGGCTCCATAAGAATTTCACGGAATAAAATTCCTTTATAAAAAGGTGCAGGGTTAt > 1:112210/1‑299 (MQ=255) | GAAATCTGATGCTAATACCCACTTACCTCGCTCTTTAGCTTCAGACAACGGCAATCCCCATGTTTCTAACCTAGAGGGAAAACAAACTATATCTGAAATATTATAACAATGATCGATTTTTTCTTTATCCAAGTACCCGAGGAAATGAACATTATCCAGTCCTTCTGCAAGACTGATAATATATTTTGCATACGCATTTTCTGTACCACTGATAGTAAGCAGAAATTTAATATTGGATTGTTCTTTCAATTTCCTTGCTGCACTAATAATAAGCTCGTAATTTTTAAATACTCGTGGAACAGCAGGGTAAAATATTGTCAACTCAGAAGGGTTATTCTTAAATTGAGAATCATCATCAGTAAGTTGGCTTTTATCAGATAATTTAATTTCTGGCCGACTGACAATGATGTTATTTATAGAATATTTCTTGATAAATTTTTCTTTCATCCAGAATTGTTGAACAAACACTGCAGTATTTTTTTTAATGTTTATTTTATATATCAGCCCGTATAGCATTTTAAATAAGAAAAAGCTAGGCTCCATAAGAATTTCACGGAATAAAATTCCTTTATAAAAAGGTGCAGGGTTAT > NC_000913/2103595‑2104184 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |