| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,692,288 | A→T | V107E (GTG→GAG) | bcsB ← | cellulose synthase periplasmic subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,692,288 | 0 | A | T | 90.9% | 128.2 / 7.8 | 44 | V107E (GTG→GAG) | bcsB | cellulose synthase periplasmic subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (4/0); new base T (22/18); total (26/18) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.33e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
AGTCCACTGCTCCGCCCAACATCCAGCCAAAGCGTGGTGCTGGCCGGTTTTTCGCACACGTCCTGATAATGGCCGACAAACTCCAGCCGTACACGGTTGAAGTCGCTAATAAACAGTGGGTTAATGGGCATTTGCGCCAGCGTTTTTTTACCCAACTGTTCTTTGGTCACTGGCAGCACGCCCATCAGTTCATCATTGAGATAAACCTTTAACTGCGACTGGACAGGCAGTAACGATGGCGATGGGGTGTATTCGAGGTTGAGCATCGCCTTCGTCACCACTTCATCGCTGCGCATACCAAACTCAATGCTGCCGTTCGGGTTAATGCCACGTAGCACCATGCTGCCCGGCGGCGGTGCAATTTGCGCAAAGGTCAGCTTCACATCACGCGAAGGACCGTTCTGCGCCACGACTGGCGCATCAGCGCCCTGCACGCCCGGCATCACTTGCCCCACCTGCGGATTTTGTTCCGTCTGGGCGGCTACAGCTGGCTCAGCATTGATCAGTGGTTGCGTTGCTGGCGTCGCCTGCGTCATGAAAGAGGGGAACGCACTCATCCCCATAGCCACTGCAC > NC_000913/3692009‑3692582 | aGTCCACTGCTCCGCCCAACATCCAGCCAAAGCGTGGTGCTGGCCGGTTTTTCGCACACGTCCTGATAATGGCCGACAAACTCCAGCCGTACAAGGTTGAAGTCGCTAATAAACAGTGGGTTAATGGGCATTTGCGCCAGCGTTTTTTTACCCAACTGTTCTTTGGTCACTGGCAGCACGCCCATCAGTTCATCATTTAGATAAACCTTTAACTGCGACTGGACAGGCAGTAACGATGGCGATGGGGTGTATTCGAGGTTGAGCATCGCCTTCGTCACCTCTTCATCGCTGCGCATAcc < 1:226544/299‑1 (MQ=255) ccACTGCTCCGCCCAACATCCAGCCAAAGCGTGGTGCTGGCCGGTTTTTCGCACACGTCCTGATAATGGCCGACAAACTCCAGCCGTACACGGTTGAAGTCGCTAATAAACAGTGGGTTAATGGGCATTTGCGCCAGCGTTTTTTTACCCAACTGTTCTTTGGTCACTGGCAGCACGCCCATCAGTTCATCATTGAGATAAACCTTTAACTGCGACTGGACAGGCAGTAACGATGGCGATGGGGTGTATTCGAGGTTGAGCATCGCCTTCGTCACCTCTTCATCGCTGCGCATACCAAAc > 1:19603/1‑300 (MQ=255) gCGTGGTGCTGGCCGGTTTTTCGCACACGTCCTGATAATGGCCGACAAACTCCAGCAGTACACGGTTGAAGTCGCTAATAAACAGTGGGTTAATGGGCATTTGCGCCAGCGTTTTTTTACCCAACTGTTCTTTGGTCACTGGCAGCACGCACATCAGTTCATCATTGAGATAAACCTTTAACTGCGACTGGACAGGCAGTAACGATGGCGATGGGGTGTATTCGAGGTTGAGCATCGCCTTCGTCACCTCTTCATCGCTGCGCATACCAAACTAAATGCTGCCGTTCGGGTTAATGCCAc > 2:94413/1‑300 (MQ=255) gCTGGCCGGTTTTTCGCACACGTCCTGATAATGGCCGACAAACTCCAGCCGTACACGGTTGAAGTCGCTAATAAACAGTGGGTTAATGGGCATTTGCGCCAGCGTTTTTTTACCCAACTGTTCTTTGGTCACTGGCAGCACGCCCATCAGTTCATCATTGAGATAAACCTTTAACTGCGACTGGACAGGCAGTAACGATGGCGATGGGGTGTATTCGAGGTTGAGCATCGCCTTCGTCACCTCTTCATCGCTGCGCATACCAAACTCAATGCTGCCGTTCGGGTTAATGCCACGTAGCAc < 1:679925/300‑1 (MQ=255) ttttCGCACACGTCCTGATAATGGCCGACAAACTCCAGCCGTACACGGTTGAAGTCGCTAATAAACAGTGGGTTAATGGGCATTTGCGCCAGCGTTTTTTTACCCAACTGTTCTTTGGTCACTGGCAGCACGCCCATCAGTTCATCATTGAGATAAACCTTTAACTGCGACTGGACAGGCAGTAACGATGGCGATGGGGTGTATTCGAGGTTGAGCATCGCCTTCGTCACCTCTTCATCGCTGCGCATACCAAACTCAATGCTGCCGTTCGGGTTAATGCCACGTAGCACCATGCTGccc < 1:827733/300‑1 (MQ=255) ttttCGCACACGTCCTGATAATGGCCGACAAACTCCAGCCGTACACGGTTGAAGTCGCTAATAAACAGTGGGTTAATGGGCATTTGCGCCAGCGTTTTTTTACCCAACTGTTCTTTGGTCACTGGCAGCACGCCCATCAGTTCATCATTGAGATAAACCTTTAACTGCGACTGGACAGGCAGTAACGATGGCGATGGGGTGTATTCGAGGTTGAGCATCGCCTTCGTCACCTCTTCATCGCTGCGCATACCAAACTCAATGCTGCCGTTCGGGTTAATGCCACGTAGCACCATGCTGccc < 2:483517/300‑1 (MQ=255) tttCGCACACGTCCTGATAATGGCCGACAAACTCCAGCCGTACACGGTTGAATTCACTAATAAACAGTGGGTTAATGGGCATTTGCGCCAGCGTTTTTTTACCCAACTGTTCGTTGGTCACTGGCAGCACGCNCATCAGTTCATCATTGAGATAAACCTTTAACTGCGACTGGACAGGCAGTAACGATGGCGATGGGGTGTATTCGAGGTTGAGCATCGCCTTCGTCACCTCTTCATCGCTGCGCATACCAAACTCAATGCTGCCGTTCGGGTTAATGCCACGTAGCACCATGCTGccc < 2:259674/299‑1 (MQ=255) cGTCCTGATAATGGCCGACAAACTCCAGCCGTACACGGTTGAAGTCGCTAATAAACAGTGGGTTAATGGGCATTTGCGCCAGCGTTTTTTTACCCAACTGTTCTTTGGTCACTGGCAGCACGCCCATCAGTTCATCATTGAGATAAACCTTTAACTGCGACTGGACAGGCAGTAACGATGGCGATGGGGTGTATTCGAGGTTGAGCATCGCCTTCGTCACCACTTCATCGCTGCGCATACCAAACTCAATGCTGCCGTTCGGGTTAATGCCACGTAGCACCATGCTGCCCGGCGGCGGt > 1:470099/1‑299 (MQ=255) cGTCCTGATAATGGCCGACAAACTCCAGCCGTACACGGTTGAAGTCGCTAATAAACAGTGGGTTAATGGGCATTTGCGCCAGCGTTTTTTTACCCAACTGTTCTTTGGTCACTGGCAGCACGCCCATCAGTTCATCATTGAGATAAACCTTTAACTGCGACTGGACAGGCAGTAACGATGGCGATGGGGTGTATTCGAGGTTGAGCATCGACTTCGTCACCACTTCATCGCTGCGCATACCAAACTCAATGCTGCCGTTCGGGTTAATGCCACGTAGCACCATGCTGCCCGGCGGCGGt > 1:471597/1‑299 (MQ=255) cGTCCTGATAATGGCCGACAAACTCCAGCCGTACACGGTTGAAGTCGCTAATAAACAGTGGGTTAATGGGCATTTGCGCCAGCGTTTCCCCCCCCCCCTCTCCCCTAACCCCTGGCAGCACGCCCATCAGTTCATCATTGAGATAAACCTTTAACTGCGACTGGACAGGCAGTAACGATGGCGATGGGGTGTATTCGAGGTTGAGCATCGCCTTCGTCAACACTTCATCGCTGCGCATACCAAACTCAATGCTGCCGTTCGGGTTAATGCAACGTAGCACCATGCTGCCCGGCGGCGGt > 1:470213/1‑299 (MQ=255) tCCTGATAATGGCCGACAAACTCCAGCCGTACACGGTTGAAGTCGCTAATAAACAGTGGGTTAATGGGCATTTGCGCCAGCGTTTTTTTACCCAACTGTTCTTTGGTCACTGGCAGCACGCCCATCAGTTCATCATTGAGATAAACCTTTAACTGCGACTGGACAGGCAGTAACGATGGCGATGGGGTGTATTCGAGGTTGAGCATCGCCTTCGTCACCTCTTCATCGCTGCGCATACCAAACTCAATGCTGCCGTTCGGGTTAATGCCACGTAGCACCAtgc > 1:416105/1‑283 (MQ=255) tCCTGATAATGGCCGACAAACTCCAGCCGTACACGGTTGAAGTCGCTAATAAACAGTGGGTTAATGGGCATTTGCGCCAGCGTTTTTTTACCCAACTGTTCTTTGGTCACTGGCAGCACGCCCATCAGTTCATCATTGAGATAAACCTTTAACTGCGACTGGACAGGCAGTAACGATGGCGATGGGGTGTATTCGAGGTTGAGCATCGCCTTCGTCACCTCTTCATCGCTGCGCATACCAAACTCAATGCTGCCGTTCGGGTTAATGCCACGTAGCACCAtgc < 2:416105/283‑1 (MQ=255) gATAATGGCCGACAAACTCCAGCCGTACACGGTTGAAGTCGCTAATAAACAGTGGGTTAATGGGCATTTGCGCCAGCGTTTTTTTACCCAACTGTTCTTTGGTCACTGGCAGCACGCCCATCAGTTCATCATTGAGATAAACCTTTAACTGCGACTGGACAGGCAGTAACGATGGCGATGGGGTGTATTCGAGGTTGAGCATCGCCTTCGTCACCTCTTCATCGCTGCGCATACCAAACTCAATGCTGCCGTTCGGGTTAATGCCACGTAGCACCATGCTGCACGGCGGCGGTGCAAttt > 1:56156/1‑300 (MQ=255) aCAAACTCCAGCCGTACACGGTTGAAGTCGCTAATAAACAGTGGGTTAATGGGCATTTGCGCCAGCGTTTTTTTACCCAACTGTTCTTTGGTCACTGGCAGCACGCCCATCAGTTCATCATTGAGATAAACCTTTAACTGCGACTGGACAGGCAGTAACGATGGCGATGGGGTGTATTCGAGGTTGAGCATCGCCTTCGTCACCTCTTCATCGCTGCGCATACCAAACTCAATGCTGCCGTTCGGGTTAATGCCACGTAGCACCATGCTGCCCGGCGGCGGTGCAATTTGCGCAAAGGTc > 1:482866/1‑300 (MQ=255) cTCCAGCCGTACACGGTTGAAGTCGCTAATAAACAGTGGGTTAATGGGCATTTGCGCCAGCGTTTTTTTACCCAACTGTTCTTTGGTCACTGGCAGCACGCCCATCAGTTCATCATTGAGATAAACCTTTAACTGCGACTGGACAGGCAGTAACGATGGCGATGGGGTGTATTCGAGGTTGAGCATCGCCTTCGTCACCTCTTCATCGCTGCGCATACCAAACTCAATGCTGCCGTTCGGGTTAATGCCACGTAGCACCATGCTGCCCGGCGGCGGTGCAATTTGCGCAAAGGTCAGCtt > 2:819477/1‑300 (MQ=255) gTTGAAGTCGCTAATAAACAGTGGGTTAATGGGCATTTGCGCCAGCGTTTTTTTACCCAACTGTTCTTTGGTCACTGGCAGCACGCCCATCAGTTCATCATTGAGATAAACCTTTAACTGCGACTGGACAGGCAGTAACGATGGCGATGGGGTGTATTCGAGGTTGAGCATCGCCTTCGTCACCTCTTCATCGCTGCGCATACCAAACTCAATGCTGCCGTTCGGGTTAATGCCACGTAGCACCATGCTGCCCGGCGGCGGTGCAATTTGCGCAAAGGTCAGCTTCACATCAAGCGaa > 2:693881/1‑298 (MQ=255) gTTGAAGTCGCTAATAAACAGTGGGTTAATGGGCATTTGCGCCAGCGTTTTTTTACCCAACTGTTCTTTGGTCACTGGCAGCACGCCCATCAGTTCATCATTAAGATAAACCTTTAACTGCGACTGGACAGGCAGTAACGATGGCGATGGGGTGTATTCGAGGTTGAGCATCGCCTTCGTCACCTCTTCATCGCTGCGCATACCAAACTCAATGTTTACGTTCGGGTTAACGCCACGTAGCCCCATGCTGCACGGTGGCGGTGCAATTTGCGCAAAGGTCAGCTTCACATccagcgaa > 2:693841/1‑291 (MQ=255) cTAATAAACAGTGGGTTAATGGGCATTTGCGCCAGCGTTTTTTTACCCAACTGTTCTTTGGTCACTGGCAGCACGCCCATCAGTTCATCATTGAGATAAACCTTTAACTGCGACTGGACAGGCAGTAACGATGGCGATGGGGTGTATTCGAGGTTGAGCATCGCCTTCGTCACCTCTTCATCGCTGCGCATACCAAACTCAATGCTGCCGTTCGGGTTAATGCCACGTAGCACCATGCTGCCCGGCGGCGGTGCAATTTGCGCAAAGGTCAGCTTCACATCACGCGAAGGACCGCTCTgc > 1:136199/1‑300 (MQ=255) aataaACAGTGGGTTAATGGGCATTTGCGCCAGCGTTTTTTTACCCAACTGTTCTTTGGTCACTGGCAGCACGCCCATCAGTTCATCATTGAGATAAACCTTTAACTGCGACTGGACAGGCAGTAACGATGGCGATGGGGTGTATTCGAGGTTGAGCATCGCCTTCGTCACCTCTTCATCGCTGCGCATACCAAACTCAATGCTGCCGTTCGGGTTAATGCCACGTAGCACCATGCTGCCCGGCGGCGGTGCAATTTGCGCAAAGGTCAGCTTCACATCACGCGAAGGACCGTTCTgcgc < 1:825822/300‑1 (MQ=255) tGGGCATTTGCGCCAGCGTTTTTTTACCCAACTGTTCTTTGGTCACTGGCAGCACGCCCATCAGTTCATCATTTAGATAAACCTTTAACTGCGACTGGACAGGCAGTAACGATGGCGATGGGGTGTATTCGAGGTTGAGCATCGCCTTCGTCACCTCTTCATCGCTGCGCATACCAAACTCAATGCTGACGTTCGGGTTAATGCCACGTAGCACCATGCTGCCCGGCGGCGGTGCAATTTGCGCAAAGGTCAGCTTCACATCACGCGAAGGACCGTTCTGCGCCACGACTGGCGCATCAg < 1:500973/300‑1 (MQ=255) tCTTTGGTCACTGGCAGCACGCCCATCAGTTCATCATTGAGATAAACCTTTAACTGCGACTGGACAGGCAGTAACGATGGCGATGGGGTGTATTCGAGGTTGAGCATCGCCTTCGTCACCTCTTCATCGCTGCGCATACCAAACTCAATGCTGCCGTTCGGGTTAATGCCACGTAGCACCATGCTGCCCGGCGGCGGTGCAATTTGCGCAAAGGTCAGCTTCACATCACGCGAAGGACCGTTCTGCGCCACGACTGGCGCATCAGCGCCCTGCACGCCCGGCATCACTTGCCCCACCTGc > 1:118441/1‑300 (MQ=255) cagcaCGCCCATCAGTTCATCATTGAGATAAACCTTTAACTGCGACTGGACAGGCAGTAACGATGGCGATGGGGTGTATTCGAGGTTGAGCATCGCCTTCGTCACCTCTTCATCGCTGCGCATACCAAACTCAATGCTGCCGTTCGGGTTAATGCCACGTAGCACCNTGCTGCCCGGCGGCGGTGCAATTTGCGCAAAGGTCAGCTTCACATCACGCGAAGGACCGTTCTGCGCCACGACTGGCGCATCAGCGCCCTGCACGCCCGGCATCACTTGCCCCACCTGCGGATTTTGTTcc > 2:256707/1‑298 (MQ=255) gCCCATCAGTTCATCATTGAGATAAACCTTTAACTGCGACTGGACAGGCAGTAACGATGGCGATGGGGTGTATTCGAGGTTGAGCATCGCCTTCGTCACCTCTTCATCGCTGCGCATACCAAACTCAATGCTGCCGTTCGGGTTAATGCCACGTAGCACCATGCTGCCCGGCGGCGGTGCAATTTGCGCAAAGGTCAGCTTCACATCACGCGAAGGACCGTTCTGCGCCACGACTGGCGCATCAGCGCCCTGCACGCCCGGCATCACTTGCCCCACCTGCGGATTTTGTTCCGTCTGggc < 1:256707/300‑1 (MQ=255) aCCTTTAACTGCGACTGGACAGGCAGTAACGATGGCGATGGGGTGTATTCGAGGTTGAGCATCGCCTTCGTCACCTCTTCATCGCTGCGCATACCAAACTCAATGCTGCCGTTCGGGTTAATGCCACGTAGCACCATGCTGCCCGGCGGCGGTGCCATTTGCGCAAAGGTCAGCTTCACATCACGCGAAGGACCGTTCTGCGCCAAGACTGGCGCATCAGCGCCCTGCACGCCCGGCATCAATTGCCCCACCTGCGGATTTTGTTCCGTCTGGGTGGCTACAGCTGGCTCAGCATTGATc > 2:517529/1‑300 (MQ=255) aCCTTTAACTGCGACTGGACAGGCAGTAACGATGGCGATGGGGTGTATTCGAGGTTGAGCATCGCCTTCGTCACCTCTTCATCGCTGCGCATACCAAACTCAATGCTGCCGTTCGGGTTAATGCCACGTAGCACCATGCTGCCCGGCGGCGGTGCAATTTGCGCAAAGGTCAGCTTCACATCACGCGAAGGACCGTTCTGCGCCACGACTGGCGCATCAGCGCCCTGCACGCCCGGCATCACTTGCCCCACCTGCGGATTTTGTTCCGTCTGGGCGGCTACAGCTGGCTCAGCATTGATc < 2:581741/300‑1 (MQ=255) aCCTTTAACTGCGACTGGACAGGCAGTAACGATGGCGATGGGGTGTATTCGAGGTTGAGCATCGCCTTCGTCACCTCTTCATCGCTGCGCATACCAAACTCAATGCTGCCGTTCGGGTTAATGCCACGTAGCACCATGCTGCCCGGCGGCGGTGCAATTTGCGCAAAGGTCAGCTTCACATCACGCGAAGGACCGTTCTGCGCCACGACTGGCGCATCAGCGCCCTGCACGCCCGGCATCACTTGCCCCACCTGCGGATTTTGTTCCGTCTGGGCGGCTACAGCTGGATCAGCATTGATc < 1:118449/300‑1 (MQ=255) cTTTAACTGCGACTGGACAGGCAGTAACGATGGCGATGGGGTGTATTCGAGGTTGAGCATCGCCTTCGTCACCACTTCATCGCTGCGCATACCAAACTCAATGCTGCCGTTCGGGTTAATGCCACGTAGCACCATGCTGCCCGGCGGCGGTGCAATTTGCGCAAAGGTCAGCTTCACATCACGCGAAGGACCGTTCTGCGCCACGACTGGCGCATCAGCGCCCTGCACGCACGGCATCACCTGCCCCAACTGCGGATTTTGTTCCGTCTGGGCGGCTACAGCTGGCCCAGCATTGATCa > 2:184940/1‑299 (MQ=255) tAACTGCGACTGGATAGGCAGTAACGATGGCGATGTGGTGTATTCGAGGTTGAGCATCGCCTTTGTCACCTCTTCATCGCTGCGCATACCAAATTCAGTGCTGCCGTTCGGGTGAATGCCACTTAGCACCATGCTGCCCTGCGGCGGGGCAATTTGCGCAAAGGTCAGCTTCACATCACGCGAAGGACCGTTCTGCGCCACGACTGGCGCATCAGCGCCCTGCACGCCCGGCATCACTTGCCCCACCTGCGGATTTTGTTCTGTCTGGGCGGCTACAGCTGGCTCAGCATTGATCAGTgg < 2:17238/300‑1 (MQ=255) tAACTGCGACTGGACAGGCAGTAACGATTGCGATGGGGTGTATTCGAGGTTGAGCATCGCCTTCGTCACCTCTTCATCGCTGCGCATACCAAACTCAATGCTGCCGTTCGGGTTAATGCCACGTAGCACCATGCTGCCCGGCGGCGGTGCAATTTGCGCAAAGGTCAGCTTCACATCACGCGAAGGACCGTTCTGCGCCACGACTGGCGCATCAGCGCCCTGCACGCCCGGCATCACTTGCCCCACCTGCGGATTTTGTTCCGTCTGGGCGGCTACAGCTGGCTCAGCATTGATTAGTgg < 2:677580/300‑1 (MQ=255) aCTGCGACTGGACAGGCAGTAACGATGGCGATGGGGTGTATTCGAGGTTGAGCATCGCCTTCGTCACCTCTTCATCGCTGCGCATACCAAACTCAATGCTGCCGTTCGGGTTAATGCCACGTAGCACCATGCTGCCCGGCGGCGTTGCAATTTGCGCAAAGGTCAGCTTCACATCACGCGAAGGACCGTTCTGCGCCACGACTGGCGCATCAGCGCCCTGCACGCCCGGCATCACTTGCCCCACCTGCGGATTTTGTTCCGTCTGGGCGGCTACAGCTGGCTCAGCATTGATCAGTGgtt > 1:455644/1‑300 (MQ=255) gCGACTGGACAGGCAGTAACGATGGCGATGGGGTGTATTCGAGGTTGAGCATCGCCTTCGTCACCTCTTCATCGCTGCGCATACCAAACTCAATGCTGCCGTTCGGGTTAATGCCACGTAGCACCATGCTGCCCGGCGGCGGTGCAATTTGCGCAAAGGTCAGCTTCACATCACGCGAAGGACCGTTCTGCGCCACGACTGGCGCATCAGCGCCCTGCACGCCCGGCATCACTTGCCCCACCTGCGGATTTTGTTCCGTCTGGGCGGCTACAGCTGGCTCAGCATTGATCAGTGgttgcg < 2:118441/300‑1 (MQ=255) cGACTGGACAGGCAGTAACGATGGCGATGGGGTGTATTCGAGGTTGAGCATCGCCTTCGTCACCTCTTCATCGCTGCGCATACCAAACTCAATGCTGCCGTTCGGGTTAATGCCACGTAGCACCATGCTGCCCGGCGGCGGTGCAATTTGCGCAAAGGTCAGCTTCACATCACGCGAAGGACCGTTCTGCGCCACGACTGGCGCATCAGCGCCCTGCACGCCCGGCATCACTTGCCCCACCTGCGGATTTTGTTCCGTCTGGGCGGCTACAGCTGGCTCAGCATTGATCAGTGgttgcgt > 1:524761/1‑300 (MQ=255) ggACAGGCAGTAACGATGGCGATGGGGTGTATTCGAGGTTGAGCATCGCCTTCGTCACCTCTTCATCGCTGCGCATACCAAACTCCATGCTGCCGTTCGGGTTAATGCCCCGTAGCACCATGCTGCCCGGCGGCGGTGCAATTTGCGCAAAGGTCAGCTTCAAATCACGCGAAGGACCGTTCTGCGCACCGACTGGCGCATCAGCGCCCTGCACGCCCGGCATCGCTTGCCCCACCTGCGGATTTTGTTCCGTCTGGGCGGCTACAGCTAGTTCAGCATTGATCAGTGGTTGCGTTGCt > 2:169485/1‑299 (MQ=255) ggACAGGCAGTAACGATGGCGATGGGGTGTATTCGAGGTTGAGCATCGCCTTCGTCACCTCTTCATCGCTGCGCATACCAAACTCAATGCTGCCGTTCGGGTTAATGCCACGTAGCACCATGCTGCCCGGCGGCGGTGCAATTTGCGCAAAGGTCAGCTTCACATCACGCGAAGGACCGTTCTGCGCCACGACTGGCGCATCAGCGCCCTGCACGCCCGGCATCACTTGCCCCACCTGCGGATTTTGTTCCGTCTGGGCGGCTACAGCTGGCTCAGCATTGATCAGTGGTTGCGTTGCt > 2:435493/1‑299 (MQ=255) 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gTAACGATGGCGATGGGGTGTATTCGAGGTTGAGCATCGCCTTCGTCACCTCTTCATCGCTGCGCATACCAAACTCAATGCTGCCGTTCGGGTTAATGCCACGTAGCACCATGCTGCCCGGCGGCGGTGCAATTTGCGCAAAGGTCAGCTTCACATCACGCGAAGGACCGTTCTGCGCCACGACTGGCGCATCAGCGCCCTGCACGCCCGGCATCACTTGCACCACCTGCGGATTTTGTTCCGTCTGGGCGGCTACAGCTGGCTCAGCATTGATCAGTGGTTGCGTTGCTGGCGTCGCCt > 1:103126/1‑300 (MQ=255) aaCGATTGCGATTTGGTGTATTCGAGGTTGAGCACCGCCTTCGTCACCTCTTCATCTCTGCGCATACCAGACTCGATGCTGCCGTTCGGGTCAATGCCACGTAGCACTATGCTGCCCGGCGGCGGTGCAATTTACGCAAAGGTCAGCTTCACATCACTCGAAGTACCGTTCTGCGCCACGACTGGCGCATCAGCGCCCTGCACGCCCGGCATCACTTGCCCCACCTGCGGATTTTGTTCCGTCTGGGCGGCTACAGCTGGCTCAGCATTGATCAGTGgttgcg < 2:478733/283‑1 (MQ=255) atggGGTGTATTCGAGGTTAAGCATCGCCTTCGTCACCTCCTCATCGCTGCGCATACCAAACTCAATGCTGCCGTTCGGGTTAATGCCACTTAGCACCATGCTGCCCGGCGGCGGTGCAATTTGCGCAAAGGTCAGCTTCACATCACGCGAAGGACCGTTCTGCGCCACGACTGGCGCATCAGCGCCCTGCACGCCCGGCATCACTTGCCCCACCTGCGGATTTTGTTCCTTCTGGGCGGCTACAGCTGGCTCAGCATTGATCAGTGGTTGCGTTGCTGGCGTCGCCTGCGTCATGaa < 2:102662/298‑1 (MQ=255) ggTGTATTCGAGGTTGCGCATCGCCTTCGTCACCTCTTCATCGCTGCGCATACCAAACTCAATACCGCCGTTCGGGTTAATGCCACGTAGCACCATGCTGCCCGGCGGCGGTGTAATTTGCGCAAAGGTCAGCTTCACATCACGCGAAGGACCGTTCTGCGCCACGACTGGCGCATCAGCGCCCTGCACGCCCGGCATCACTTGCCACAACTGCGGATTTTGTTCCGTCTGGGCGGCTACAGCTGGCCCAGCAtt > 2:88141/1‑255 (MQ=255) gAGCATCGCCTTCGTCACCTCTTCATCGCTGCGCATACCAAACTCAATGCTGCCGTTCGGGTTAATGCCACGTAGCACCATGCTGCCCGGCGGCGGTGCAATTTGCGCAAAGGTCAGCTTCACATCACGCGAAGGACCGTTCTGCGCCACGACTGGCGCATCAGCGCCCTGCACGCCCGGCATCACTTGCCCCACCTGCGGATTTTGTTCCGTCTGGGCGGCTACAGCTGGCTCAGCATTGATCAGTGGTTGCGTTGCTGGCGTCGCCTGCGTCATGAAAGAGGGGAACGCACTCATccc > 1:425894/1‑300 (MQ=255) aGCATCGCCTTCGTCACCTCTTCATCGCTGCGCATACCAAACTCAATGCTGCCGTTCGGGTTAATGCCACGTAGCACCATGCTGCCCGGCGGCGGTGCAATTTGCGCAAAGGTCAGCTTCACATCACGCGAAGGACCGTTCTGCGCCACGACTGGCGCATCAGCGCCCTGCACGCCCGGCATCACTTGCCCCACCTGCGGATTTTGTTCCGTCTGGGCGGCTACAGCTGGCTCAGCATTGATCAGTGGTTGCGTTGCTGGCGTCGCCTGCGTCATGAAAGAGGGGAACGCACTCATcccc > 1:719900/1‑300 (MQ=255) tCACCTCTTCATCGCTGCGCATACCAAACTCAATGCTGCCGTTCGGGTTAATGCCACGTAGCACCATGCTGCCCGGCGGCGGTGCAATTTGCGCAAAGGTCAGCTTCACATCACGCGAAGGACCGTTCTGCGCCACGACTGGCGCATCAGCGCCCTGCACGCCCGGCATCACTTGCCCCACCTGCGGATTTTGTTCCGTCTGGGCGGCTACAGCTGGCTCAGCATTGATCAGTGGTTGCGTTGCTGGCGTCGCCTGCGTCATGAAAGAGGGGAACGCACTCATCCCCATAGCCACTGcac < 2:13440/300‑1 (MQ=255) | AGTCCACTGCTCCGCCCAACATCCAGCCAAAGCGTGGTGCTGGCCGGTTTTTCGCACACGTCCTGATAATGGCCGACAAACTCCAGCCGTACACGGTTGAAGTCGCTAATAAACAGTGGGTTAATGGGCATTTGCGCCAGCGTTTTTTTACCCAACTGTTCTTTGGTCACTGGCAGCACGCCCATCAGTTCATCATTGAGATAAACCTTTAACTGCGACTGGACAGGCAGTAACGATGGCGATGGGGTGTATTCGAGGTTGAGCATCGCCTTCGTCACCACTTCATCGCTGCGCATACCAAACTCAATGCTGCCGTTCGGGTTAATGCCACGTAGCACCATGCTGCCCGGCGGCGGTGCAATTTGCGCAAAGGTCAGCTTCACATCACGCGAAGGACCGTTCTGCGCCACGACTGGCGCATCAGCGCCCTGCACGCCCGGCATCACTTGCCCCACCTGCGGATTTTGTTCCGTCTGGGCGGCTACAGCTGGCTCAGCATTGATCAGTGGTTGCGTTGCTGGCGTCGCCTGCGTCATGAAAGAGGGGAACGCACTCATCCCCATAGCCACTGCAC > NC_000913/3692009‑3692582 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |