| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| JC JC | NC_000913 | 3,368,685 | IS2 (–) +5 bp | coding (859‑863/1128 nt) | yhcG → | DUF1016 domain‑containing protein YhcG |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | = 3187426 | NA (NA) | 91 (0.940) | 58/588 | 0.3 | 100% | noncoding (1331/1331 nt) | IS2 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 3368689 | 0 (0.000) | coding (863/1128 nt) | yhcG | DUF1016 domain‑containing protein YhcG | |||||
Only 100 of 179 total aligned reads displayed.
TGTCACATGACAAATCAGCCATGCTGCAACAACACGCTCCTGCCGAGACGCATATTCTTCCGCAACAGGCGATACGCGATCCCTTTGTGCTCGAATTTCTGGAATTGAAAGATGAATATTCAGAATCCGATTTTGAGGAGGCGCTGATCAACCACCTGATGGATTTCATGCTGGAACTTGGGGATGATTTTGCCTTTGTTGGTCGGCAGCGAAGGTTACGCATTGATGACAACTGGTTTCGTGTCGATCTGCTGTTTTTCCACCGCCGTTTACGCTGCCTGCTAATCGTCGATCTAAAAGTGGGCAAATTCAGCTATAGCGATGCCGGACAGATGAATATGTATCTCAACTACGCCAAAGAGCACTGGACGCTACCGGATGAAAATCCGCCCATCGGTCTGGTTCTCTGTGCAGAGAAAGGAGCCGGAGAAGCGCATTATGCTCTGGCAGGTTTGCCTAACACCGTTCTGGCAAGCGAATATAAGATGCAACTACCTGATGAGAAACGACTCGCAGATGAACTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAG > NC_000913/3368386‑3368982 | tGTCACGTGACAAATCAGCCAGGCTGCAACAACACGCTCCTGCCTAGACGCATATTCTTCCGCAACGTGCGATACGCGATCCCTTTGTGCTCGAATTTTTGGAATTGAAAGATGAATATTCAGAATCCGATTTTGAGGAGGCGCTGATCAACCACCTGATGGATTTCATGCTGGAACTTGGGGATGATTTTGCCTTTGTTGGTCGGCAGCGAAGGTTACGCATTGATGACAACTGGTTTCGTGTCGATCTGCTGTTTTTCCACCGCCGTTTACGCTGCCTGCTAATCGTCAATCTAAAAg < 1:31660/300‑1 (MQ=255)tGTCACATGACAAATCAGCCATGCTGCAACAACACGCTCCTGCCGAGACGCATATTCTTCCGCAACAGGCGATACGCGATCCCTTTGTGCTCGAATTTCTGGAATTGAAAGATGAATATTCAGAATCCGATTTTTAGGAGGCGCTGATCAACCACCTGATGGATTTCATGCTGGAACTTGGGGATGATTTTGCCTTTGTTGGTCGGCAGCGAAGGTTACGCATTGATGACAACTGGTTTCGTGTCGATCTGCTGTTTTTCCACCGCCGTTTACGCTGCCTGCTAATCGTCGATCTAAAAg < 1:407192/300‑1 (MQ=255) tGACAAATCAGCCATGCTGCAACAACACGCTCCTGCCGAGACGCATATTCTTCCGCAACAGGCGATACGCGATCCCTTTGTGCTCGAATTTCTGGAATTGAAAGATGAATATTCAGAATCCGATTTTGAGGAGGCGCTGATCAACCACCTGATGGATTTCATGCTGGAACTTGGGGATGATTTTGCCTTTGTTGGTCGGCAGCGAAGGTTACGCATTGATGACAACTGGTTTCGTGTCGATCTGCTGTTTTTCCACCGCCGTTTACGCTGCCTGCTAATCGTCGATCTAAAAGTGGGt < 1:654104‑M2/298‑2 (MQ=255) aacctgttctccggcggcgacagcagtaagacttccttcctggtattgcttacgccagagaaataactggctggctgctacaccatgttgcagggcaacgagggagaccgtcatccccggttcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttactgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGTGGGCaa > 1:283759‑M2/293‑300 (MQ=255) 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cTCCTGCCGAGACGCATATTCTTCCGCAACAGGCGATACGCGATCCCTTTGTGCTCGAATTTCTGGAATTGAAAGATGAATATTCAGAATCCGATTTTGAGGAGGCGCTGATCAACCACCTGATGGATTTCATGCNGGAACTTGGGGATGATTTTGCCTTTGTTGGTCGGCAGCGAAGGTTACGCATTGATGACAACTGGTTTCGTGTCGATCTGCTGTTTTTCCACCGCCGTTTACGCTGCCTGCTAATCGTCGATCTAAAAGTGGGtggatttgcccctatatttccagacatctgtt < 2:623292‑M2/300‑33 (MQ=255) acttccttcctggtattgcttacgccagagaaataactggctggctgctacaccatgttgccgggcaacgagggagaccgtcatccccggttcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctcaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGTGGGCAAATTCAGCTATAGCGATGCCGGACAGATGAat < 1:798486‑M2/39‑1 (MQ=255) tccttcctggtattgcttacgccatagaaataactggctggctgctacaccatgttgccgggcaacgagggagaccgtcatccccggttcnaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaattgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGTGGGCAAATTCAGCTATAGCGATGCCGGACAGATGAatat < 2:655611‑M2/41‑1 (MQ=255) tccttcctggtattgcttacaccagagaaataactggctggctgctacaccatgttgccgggcaacgatggagaccgtcatccccggttcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGTGGGCAAATGCAGCTATAGCGATGCCGGACAGAGGAatat < 1:407773‑M2/41‑1 (MQ=255) gCCGAGACGCATATTCTTCCGCAACAGGCGATACGCGATCCCTTTGTGCTCGAATTTCTGGAATTGAAAGATGAATATTCAGAATCCGATTTTGAGTAGGCGCTGATCAACCACCTGATGGATTTCATGCTGGNACTTGGGGATGATTTTGCCTTTGTTGGTCGGCAGCGAAGGTTACGCATTGATGACAACTGGTTTCGTGTCGATCTGCTGTTTTTCCACCGCCGTTTACGCTGCCTGCTAATCGTCGATCTAAAAGTGGGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcac > 2:270902‑M2/1‑263 (MQ=255) cttcctggtattgcttacgccagagaaataactggctggctgctacaccatgttgccgggcaacgagagagaccgtcatccccggttcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaggtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGTGGGCAAATTCAGCTATAGCGATGCAGGACAGATGAATATGt > 1:235728‑M2/258‑300 (MQ=255) 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ctgcTAATCGTCGATCTAAAAGTGGGtggatttgcccatatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcctctgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctggtttgggcatgatactgatgtagtcacgctttatcgttttcacgaagctctctgctattccgttactctccggcctccgcaccgccgtgttcttcggttcacgtccca < 2:90079‑M2/300‑275 (MQ=255) gcTAATCGTCGATCTAAAAGTGGGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcctctgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctggtttgggcatgatactgatgtagtcacgctttatcgttttcacgaagctctctgctattccgttactctccggactccgcaccgccgtgttcttcggttcaagtcccaac < 2:496344‑M2/300‑277 (MQ=255) attcaggagaccagtctaGCGGGCAAATTCAGCTATAGCGATGCCGGACAGATGAATATGTATCTCAACTACGCCAAAGAGCACTGGACGCTACCGGATGAAAATCCGCCCATCGGTCTGGTTCTCTGTGCAGAGAAAGGAGCCGGAGAAGCGCATTATGCTCTGGCAGGTTTGCCTAACACCGTTCTGGCAAGCGAATATAAGATGCAACTACCTGATGAGAAACGACTCGCAGATGAACTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCAGTTAATTTCAGCGGttt > 2:827468‑M2/19‑300 (MQ=255) gggccagtctaGTGGGCAAATTCAGCTATAGCGATGCCGGACAGATGAATATGTATCTCAACTACGCCAAAGAGCACTGGACGCTACCGGATGAAAATCCGCCCATCGGTCTGGTTCTCTGTGCAGAGAAAGGAGCCGGAGAAGCGCATTATGCTCTGGCAGGTTTGCCTAACACCGTTCTGGCAAGCGAATATAAGATGCAACTACCTGATGAGAAACGACTCGCAGATGAACTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTc < 1:147956‑M2/289‑1 (MQ=255) ccagtctaGTGGGCAAATTCAGCTATAGCGATGTCGGACAGATGAATATGTATCTCAACTACGCCAAAGAGCACTGGACGCTACCGGATGAAAATCCGCCCATCGGTCTGGTTCTCTGTGCAGGGAAAGGAGCCGGAGAAGCGCATTATGCTCTGGCAGGTTTGCCTAACACCGTTCTGGCAAGCGAATATAAGATGCAACTACCTGATGAGAAACGACTCGCAGGTGAACTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGaggaaggatatagaggcacttcacttc > 2:280240‑M2/9‑269 (MQ=255) ccagtctaGTGGGCAAATTCAGCTATAGCGATGCCGGACAGATGAATATGTATCTAAACTACGCCAAAGAGCACTGGACGCTACCGGATGAAAATCCGCCCATCGGTCTGGTTCTCTGTGCAGGGAAAGGAGCCGGAGAAGCGCATTATGCTCTGGCAGGTTTGCCTAACACCGTTCTGGCAAGCGAATATAAGATGCAACTAACTGATGAGAAACGACTCGCAGGTGAACTCGTTCGAACACAggcggtgctagaggaaggctatagaggcccttcacttcaaccggttcgaacttctc > 2:280329‑M2/9‑273 (MQ=255) agctaAAAGGGGGtggagtggcccctatagttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcctctgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctggtttgggcatgatactgatgtagtcacgctttatcgttttcactaagctctctgctattccgttactctccggactccgcaccgccgtgttcttcggttcaagtcccaacatc > 1:228173‑M2/3‑13 (MQ=255) aTCTAAAAGTGGGtggatttgcccatatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcctctgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctggtttgggcatgatactgatgtagtcacgctttatcgttttcacgaagctctctgctattccgttactctccggactccgcaccgccgtgttcttcggttcaagtcccaacatccgggcgaa < 2:373150‑M2/300‑288 (MQ=255) | TGTCACATGACAAATCAGCCATGCTGCAACAACACGCTCCTGCCGAGACGCATATTCTTCCGCAACAGGCGATACGCGATCCCTTTGTGCTCGAATTTCTGGAATTGAAAGATGAATATTCAGAATCCGATTTTGAGGAGGCGCTGATCAACCACCTGATGGATTTCATGCTGGAACTTGGGGATGATTTTGCCTTTGTTGGTCGGCAGCGAAGGTTACGCATTGATGACAACTGGTTTCGTGTCGATCTGCTGTTTTTCCACCGCCGTTTACGCTGCCTGCTAATCGTCGATCTAAAAGTGGGCAAATTCAGCTATAGCGATGCCGGACAGATGAATATGTATCTCAACTACGCCAAAGAGCACTGGACGCTACCGGATGAAAATCCGCCCATCGGTCTGGTTCTCTGTGCAGAGAAAGGAGCCGGAGAAGCGCATTATGCTCTGGCAGGTTTGCCTAACACCGTTCTGGCAAGCGAATATAAGATGCAACTACCTGATGAGAAACGACTCGCAGATGAACTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAG > NC_000913/3368386‑3368982 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |