| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NC_000913 | 3,897,929 | C→T | P142S (CCC→TCC) | cbrB → | putative inner membrane protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 3,897,929 | 0 | C | T | 99.1% | 389.3 / ‑6.2 | 109 | P142S (CCC→TCC) | cbrB | putative inner membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/0); new base T (47/61); total (48/61) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.40e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 109 total aligned reads displayed.
ATTTTTCTCTTATTGTCGATAACTACGGGAGCTATTCCTGCGTTGTTAACCGGTGTAATGGTTGCCTGTCTGCCGGAAAAGATCGGGTCACAGAAACGTTATCGTTGTCTGGCTGGTGGCATAGGTGGCGTCGTTATCACCGAGATCTATTGTGCAGTTATTGTACATATTAAGGGCATGGCTTCCTCGGAGTTGTTTGAAAACATTCTTTCTGGTGACAGTCTCGTTGTCCGCATCATTCCTGCATTGCTGGCAGGTGTGGTGATGAGCAGAATCATTACCCGTCTACCCGGATTGGATATTTCATGTCCTGAAACAGACTCTTTAAGTTAAGCGGGATACTTTATCTTTGGGCTACTCAAAAGCAGACAGGATGTTTCTATGACTCAAAATATCAGGCCGTTACCCCAATTCAAATATCATCCCAAGCCACTGGAAACAGGCGCATTTGAACAGGATAAAACCGTAGAGTGCGATTGCTGTGAACAACAGACGTCAGTTTATTACTCGGGTCCCTTTTATTGCGTTGATGAAGTTGAACATCTCTGTCCGTGGTGTATTGCGGACGGTTCTGCTG > NC_000913/3897641‑3898217 | aTTTTTCTCTTATTGTCGATAACTACGTGAGCTATTCCTGCGTTGTTAACCGGTGTAATGGTTGCCTGTCTGCCGGAAAAGATCGGGTCACAGAAACGTTATCGTTGTCTGGCTGGTGGCATAGGTGGCGTCGTTATCACCGAGATCTATTGTGCAGTTATTGTACATATTAAGGGCATGGCTTCCTCGGAGTTGTTTGAAAACATTCTTTCTGGTGACAGTCTCGTTGTCCGCATCATTCCTGCATTGCTGGCAGGTGTGGTGATGAGCAGAATCATTACCCGTCTATCCGGATTGGat < 1:175964/300‑1 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ATTTTTCTCTTATTGTCGATAACTACGGGAGCTATTCCTGCGTTGTTAACCGGTGTAATGGTTGCCTGTCTGCCGGAAAAGATCGGGTCACAGAAACGTTATCGTTGTCTGGCTGGTGGCATAGGTGGCGTCGTTATCACCGAGATCTATTGTGCAGTTATTGTACATATTAAGGGCATGGCTTCCTCGGAGTTGTTTGAAAACATTCTTTCTGGTGACAGTCTCGTTGTCCGCATCATTCCTGCATTGCTGGCAGGTGTGGTGATGAGCAGAATCATTACCCGTCTACCCGGATTGGATATTTCATGTCCTGAAACAGACTCTTTAAGTTAAGCGGGATACTTTATCTTTGGGCTACTCAAAAGCAGACAGGATGTTTCTATGACTCAAAATATCAGGCCGTTACCCCAATTCAAATATCATCCCAAGCCACTGGAAACAGGCGCATTTGAACAGGATAAAACCGTAGAGTGCGATTGCTGTGAACAACAGACGTCAGTTTATTACTCGGGTCCCTTTTATTGCGTTGATGAAGTTGAACATCTCTGTCCGTGGTGTATTGCGGACGGTTCTGCTG > NC_000913/3897641‑3898217 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |