| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NC_000913 | 4,294,266 | T→C | intergenic (+127/‑215) | nrfG → / → gltP | putative formate‑dependent nitrite reductase complex subunit NrfG/glutamate/aspartate : H(+) symporter GltP |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 4,294,266 | 0 | T | C | 98.5% | 476.2 / NA | 129 | intergenic (+127/‑215) | nrfG/gltP | putative formate‑dependent nitrite reductase complex subunit NrfG/glutamate/aspartate : H(+) symporter GltP |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (2/0); new base C (58/69); total (60/69) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.14e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 129 total aligned reads displayed.
GCCCTGATGCTGCTGGCTTCCGATGCGTTTATGCAGGCGAACTACGCGCAAGCCATCGAACTATGGCAAAAAGTGATGGATCTCAACTCACCGCGAGTTAACCGAACACAGCTGGTTGAGTCGATTAATATGGCGAAATTGTTGCAGCGGAGATTGGATTAATCATCTGGTGATGAAGATTATGTCATTGAGCTGCATAAAAAATAATCGAATGAACATATGCCAAAAATAATCACTAATCAGTATTATTGCAGATTAAACAAATAAAAATCTTTCCATAACAAATGGTTATTCATTAATCCTGCCATAAACTCGCGTTATTATGCATTAATGCAGCGAAAAGCTCTGTTGTTAAAGG‑GTTGCGCAACATACCGCGCAAATGATACTGATCATAAGCGTTAAAAAAATCTACAAACCAACGCAACACAATTCATGCCCTGGCAGTATGTCACGTTCTCGCGTTTCTGAACGGGGAACGGCGCTCCATTGAGGAAGTCATTCATATGAAAAATATAAAATTCAGCCTGGCCTGGCAGATTCTGTTTGCTATGGTGCTGGGCATTCTCCTGGGAAGCTACCTGCA > NC_000913/4293978‑4294560 | gCCCTGATGCTGCTGGCTTCCGATGCGTTTATGCAGGCGAACTACGCGCAAGCCATCGAACTATGGCAAAAAGTGATGGATCTCAACTCACCGCGAGTTAACCGAACACAGCTGGTTGAGTCGATTAATATGGCGAAATTGTTGCAGCGGAGATTGGATTAATCATCTGGTGATGAAGATTATGTCATTGAGCTGCATAAAAAATAATCGAATGAACATATGCCAAAAATAATCACTAATCAGTATTATTGCAGATTAAACAAATAAAAATCTTTACATAACAAATGGCTATTCATTAAt > 1:188174/1‑300 (MQ=255) 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GCCCTGATGCTGCTGGCTTCCGATGCGTTTATGCAGGCGAACTACGCGCAAGCCATCGAACTATGGCAAAAAGTGATGGATCTCAACTCACCGCGAGTTAACCGAACACAGCTGGTTGAGTCGATTAATATGGCGAAATTGTTGCAGCGGAGATTGGATTAATCATCTGGTGATGAAGATTATGTCATTGAGCTGCATAAAAAATAATCGAATGAACATATGCCAAAAATAATCACTAATCAGTATTATTGCAGATTAAACAAATAAAAATCTTTCCATAACAAATGGTTATTCATTAATCCTGCCATAAACTCGCGTTATTATGCATTAATGCAGCGAAAAGCTCTGTTGTTAAAGG‑GTTGCGCAACATACCGCGCAAATGATACTGATCATAAGCGTTAAAAAAATCTACAAACCAACGCAACACAATTCATGCCCTGGCAGTATGTCACGTTCTCGCGTTTCTGAACGGGGAACGGCGCTCCATTGAGGAAGTCATTCATATGAAAAATATAAAATTCAGCCTGGCCTGGCAGATTCTGTTTGCTATGGTGCTGGGCATTCTCCTGGGAAGCTACCTGCA > NC_000913/4293978‑4294560 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |