| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | NC_000913 | 4,636,139 | A→C | K45Q (AAG→CAG) | creB → | DNA‑binding transcriptional regulator CreB |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,636,139 | 0 | A | C | 98.9% | 322.9 / NA | 94 | K45Q (AAG→CAG) | creB | DNA‑binding transcriptional regulator CreB |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/0); new base C (45/48); total (46/48) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.89e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
ACGTCCCTGGTCTTTAAGTCGTTACAGGTCGTGCGC‑TTTTATGATGCCAAACGCAACGCGCTCGCTTATCTGGCTTACTCCGACAAAGTTGTAGAAGGTTCGCCGAAAAACGCGATTAGCGCGGTTCCTGTCATGCCGTGGCGGCAATAACAGAGGCGATTTATGCAACGGGAAACGGTCTGGTTAGTGGAAGATGAGCAAG‑GGATAGCCGACACGCTGGTCTACATGTTGCAGCAGGAAGGTTTTGCCGTCGAGGTCTTTGAGCGAGGCTTGCC‑GGTGC‑TGGATAAAGCTCGCAAGCAGGTACCCGACGTCATGATTCTCGATGTTGGTCTGCCGGATATTAGCGGCTTTGAATTGTGCCGCCAGTTACTGGCGCTCCATCCGGCGTTACCTGTACTGTTCCTGACGGCCCGAAGTGAAGAGGTCGATCGCCTGCTTGG‑GCTGGAA‑ATTGGTGCTGACGACTA‑CGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGACATTTTGAATTGAA > NC_000913/4635845‑4636425 | aCGTCCCTGGTCTTTAAGTCGTTACAGGTCGTGCGC‑TTTTATGACGCCAAACGCAACGCGCTCGCTTATCTGGCTTACTCCGACAAAGTTGTAGAAGGTTCGCCGAAAAACGCGATTAGCGCGGTTCCTGTCATGCCGTGGCGGCAATAACAGAGGCGATTTATGCAACGGGAAACGGTCTGGTTAGTGGAAGATGAGCAAG‑GGATAGCCGACACGCTGGTCTACATGTTGCAGCAGGAAGGTTTTGCCGTCGAGGTCTTTGAGCGAGGCTTGCC‑GGTGC‑TGGATAAAGCTCGCcagcag < 1:529277/300‑1 (MQ=255) cGTCCCTGGTCTTTAAGTCGTTACAGGTCTTGCGC‑TTTTATGACGCCAAACGCAACGCGCTCGCTTATCTGGCTTACTCCGACAAAGTTGTAGAAGGTTCGCCGAAAAACGCGATTAGCGCGGTTCCTGTCATGCCGTGGCGGCAATAACAGAGGCGATTTATGCAACGGGAAACGGTCTGGTTAGTGGAAGATGAGCAAG‑GGATAGCCGACACGCTGGTCTACATGTTGCAGCAGGAAGGTTTTGCCGTCGAGGTCTTTGAGCGAGGCTTGCC‑GGTGC‑TGGATAAAGCTCGCCAGCa > 1:624642/1‑298 (MQ=255) tCCCTGGTCTTTAAGTCGTTACAGGTCGTGCGC‑TTTTATGACGCCAAACGCAACGCGCTCGCTTATCTGGCTTACTCCGACAAAGTTGTAGAAGGTTCGCCGAAAAACGCGATTAGCGCGGTTCCTGTCATGCCGTGGCGGCAATAACAGAGGCGATTTATGCAACGGGAAACGGTCTGGTTAGTGGAAGATGAGCAAG‑GGATAGCCGACACGCTGGTCTANATGTTGCAGCAGGAAGGTTTTGCCGTCGAGGTCTTTGAGCGAGGCTTGCC‑GGTGC‑TGGATAAAGCTCGCCAGCAggct > 1:155430/1‑298 (MQ=255) tCCCTGGTCTTTAAGTCGTTACAGGTCGTGCGC‑TTTTATGACGCCAAACGCAACGCGCTCGCTTATCTGGCTTACTCCGACAAAGTTGTAGAAGGTTCGCCGAAAAACGCGATTAGCGCGGTTCCTGTCATGCCGTGGCGGCAATAACAGAGGCGATTTATGCAACGGGAAACGGTCTGGTTAGTGGAAGATGAGCAAG‑GGATAGCCGACACGCTGGTCTACATGTTGCAGCAGGAAGGTTTTGCCGTCGAGGTCTTTGAGCGAGGCTTGCC‑GGTGC‑TGGATAAAGCTCGCCAGCAggct > 1:418082/1‑298 (MQ=255) ggTCTTTAATTCGTTACAGGTCGTGCGC‑TTTTATGACGCCAAACGCAACGCGCTCGCTTATCTGGCTTACTCCGACAAAGTTGTAGAAGGTTCGCCGAAAAACGCGATTAGCGCGGTTCCTGTCATGCCGTGGCGGCAATAACAGAGGCGATTTATGCAACGGGAAACGGTCTGGTTAGTGGAAGATGAGCAAG‑GGATAGCCGACACGCTGGTCTACATGTTGCAGCAGGAAGGTTTTGCCGTCGAGGTCTTTGAGCGAGGCTTGCC‑GGTGC‑TGGATAAAGCTCGCCAGCAggctcccga < 2:353383/300‑8 (MQ=255) ggTCTTTAAGTCGTTACAGGTCGTGCGC‑TTTTATGACGCCAAACGCAACGCGCTCGCTTATCTGGCTTACTCCGACAAAGTTGTAGAAGGTTCGCCGAAAAACGCGATTAGCGCGGTTCCTGTCATGCCGTGGCGGCAATAACAGAGGCGATTTATGCAACGGGAAACGGTCTGGTTAGTGGAAGATGAGCAAG‑GGATAGCCGACACGCTGGTCTACATGTTGCAGCAGGAAGGTTTTGCCGTCGAGGTCTTTGAGCGAGGCTTGCC‑GGTGC‑TGGATAAAGCTCGCCAGCAggctcccga < 1:382880/300‑8 (MQ=255) ggTCTTTAAGTCGTTACAGGTCGTGCGC‑TTTTATGACGCCAAACGCAACGCGCTCGCTTATCTGGCTTACTCCGACAAAGTTGTAGAAGGTTCGCCGAAAAACGCGATTAGCGCGGTTCCTGTCATGCCGTGGCGGCAATAACAGAGGCGATTTATGCAACGGGAAACGGTCTGGTTAGGGGAAGATGAGCAAG‑GGATAGCCGACACGCTGGTCTACATGTTGCAGCAGTAAGGTTTTGCCGTCGAGGTCTTTGAGCGAGGCTTGCC‑GGTGC‑TGGATAAAGCTCGCCAGCAggctcccga < 1:384068/300‑8 (MQ=255) 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ggATAAAGCTCGCCAGCAGGCTCCCGACGTCATGATTCTCGATGTTGGTTTGCCTGATATCAGCGGCTTTGAATTATGCCGCCAGTTACTGGCGCTCCATCCGGCGTTACCTGTACTGTTCCTGACGGCCCGAAGTGAAGAGGTCGATCGCCTGCTTGG‑GCTGGAA‑ATTGGTGCTGACGACTA‑TGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGTCGCCGTCTACCGTCATCCGTATTGGTCATTttgaattgaa > 1:519841/1‑300 (MQ=255) | ACGTCCCTGGTCTTTAAGTCGTTACAGGTCGTGCGC‑TTTTATGATGCCAAACGCAACGCGCTCGCTTATCTGGCTTACTCCGACAAAGTTGTAGAAGGTTCGCCGAAAAACGCGATTAGCGCGGTTCCTGTCATGCCGTGGCGGCAATAACAGAGGCGATTTATGCAACGGGAAACGGTCTGGTTAGTGGAAGATGAGCAAG‑GGATAGCCGACACGCTGGTCTACATGTTGCAGCAGGAAGGTTTTGCCGTCGAGGTCTTTGAGCGAGGCTTGCC‑GGTGC‑TGGATAAAGCTCGCAAGCAGGTACCCGACGTCATGATTCTCGATGTTGGTCTGCCGGATATTAGCGGCTTTGAATTGTGCCGCCAGTTACTGGCGCTCCATCCGGCGTTACCTGTACTGTTCCTGACGGCCCGAAGTGAAGAGGTCGATCGCCTGCTTGG‑GCTGGAA‑ATTGGTGCTGACGACTA‑CGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGACATTTTGAATTGAA > NC_000913/4635845‑4636425 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |