| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,176,602 | C→T | P392P (CCC→CCT) | lolC → | lipoprotein release complex ‑ inner membrane subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,176,602 | 0 | C | T | 98.5% | 219.9 / NA | 65 | P392P (CCC→CCT) | lolC | lipoprotein release complex ‑ inner membrane subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base T (43/21); minor base G (0/1); total (43/22) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.38e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
AAGTAGCGATCCTGCAAACGCAAGGCTTAACTCCGCGACAAATCATGATGGTCTTTATGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTGCCAGCCAGTTAAATAATCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAGGTCATTGTTATTGCGCTGGTGGCGATGGCTATCGCGCTGCTGTCTACGCTTTACCCTTCATGGCGCGCTGCCGCCACTCAACCCGCTGAGGCTTTACGTTATGAATAAGATCCTGTTGCAATGCGACAACCTGTGCAAACGCTATCAGGAAGGCAGTGTGCAAACCGATGTGCTGCACAATGTCAGTTTCAGCGTCGGCGAAGGTGAAATGATGGCGATCGTCGGTAGCTCTGGTTCCGGTAAAAGTACCTTGCTGCACCTGCTGGGCGGGCTGGATACGCCAACCTCCGGCGATGTGATTTTTAATGGTCAGCCAATGAGCAAACTGTCGTCGGCAGCGAAAGCTGAACTGCGCAACCAGAAGCTGGGCTTT > NC_000913/1176313‑1176891 | aaGTAGCGATCCTGCAAACGCAAGGCTTAACTCCGCGACAAATCATGATGGTCTTTATGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTGCCAGCCAGTTAAATAATCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAGGTCATTGTTATTGCGCTGGTGGCGATGGCTATCGCGCTGCTGTCTACGCTTTACCCTTCATGGCGCGCTGCCGCCACTCACACTGCTGAGGCtt > 2:355490/1‑300 (MQ=255) aCGCAAGGCTTAACTCCGCGACAAATCATGATGGTCTTTATGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTGCCAGCCAGTTAAATAATCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAGGTCATTGTTATTGCGCTGGTGGCGATGGCTATCGCGCTGCTGTCTACGCTTTACCCTTCATGGCGCGCTGCCGCCACTCAACCTGCTGAGGCTTTACGTTATGAATAAGAt < 1:652787/300‑1 (MQ=255) aTGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTGCCAGCCAGTTAAATAATCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAGGTCATTGTTATTGCGCTGGTGGCGATGGCTATCGCGCTGCTGTCTACGCTTTACCCTTCATGGCGCGCTGCCGCCACTCAACCTGCTGAGGCTTTACGTTATGAATAAGATCCTGTTGCAATGCGACAACCTGTGCAAACGCTATCAGGa > 1:8254/1‑300 (MQ=255) ggTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTGCCAGCCAGTTAAATAATCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAGGTCATTGTTATTGCGCTGGTGGCGATGGCTATCGCGCTGCTGTCTACGCTTTACCCTTCATGGCGCGCTGCCGCCACTCAACCTGCTGAGGCTTTACGTTATGAATAAGATCCTGTTGCAATGCGACAACCTGTGCAAACGATATCAGGaa > 2:695055/1‑299 (MQ=255) gTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTGCCAGCCAGTTAAATAATCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAGGTCATTGTTATTGCGCTGGTGGCGATGGCTATCGCGCTGCTGTCTACGCTTTACCCTTCATGGCGCGCTGCCGCCACTCAACCTGCTGAGGCTTTACGTTATGAATAAGATCCTGTTGCAATGCGACAACCTGTGCAAACGCTATCAGGaa > 1:119263/1‑298 (MQ=255) gcgcCGGGGTTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTGCCAGCCAGTTAAATAATCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCAGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAGGTCATTGTTATTGCGCTGGTGGCGATGGCTATCGCGCTGCTGTCTACGCTTTACCCTTCATGGCGCGCTGCCGCCACTCAACCTGCTGAGGCTTTACGTTATGAATAAGATCCTGTTGCAATGCGACAACCTGTGCAAACGCTATCAGGAAGGCAGTGTGCAAAc > 2:172248/1‑299 (MQ=255) gcgcCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCTGCGCTTGGCGCCCTGCTTGCCAGCCAGTTAAATAATCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACANGTCATTGTTATTGCGCTGGTGGCGATGGCTATCGCGCTGCTGTCTACGCTTTACCCTTCATGGCGCGCTGCCGCCACTCAACCGGCTGAGGCTTTACGTTATGAATAAGATCCTGTTGCAATGCGACAACCTGTGCAAACGCTATCAGGAAGGCAGTGTGCAAAcc < 2:226693/300‑1 (MQ=255) gcgcCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTGCCAGCCAGTTAAATAATCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAGGTCATTGTTATTGCGCTGGTGGCGATGGCTATCGCGCTGCTGTCTACGCTTTACCCTTCATGGCGCGCTGCCGCCACTCAACCTGCTGAGGCTTTACGTTATGAATAAGATCCTGTTGCAATGCGACAACCTGTGCAAACGCTATCAGGAAGGCAGTGTGCAAAcc > 1:110364/1‑300 (MQ=255) gcgcCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTGCCAGCCAGTTAAATAATCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAGGTCATTGTTATTGCGCTGGTGGCGATGGCTATCGCGCTGCTGTCTAAGCTTTACCCTTCATGGCGCGCTGCCGCCACTCAACCTGCTGAGGCTTTACGTTATGAATAAGATCCTGTTGCAATGCGACAACCTGTGCAAATGCTATCAGGAAGGCCGTGTGCaaaac > 2:172235/1‑298 (MQ=255) tggATTATCGGTGCGATCTTCGCGGCGGCGCTTGGCTCCCTGCTTGCCAGCCAGTTAAATAATCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAGGTCATTGTTATTGCGCTGTTGGTGATGGCTATCACGCTACTGGCTACGCTTTACCCTTCATGGCGCGCGGCCGCCACTCAACCTGCTGAGGCTTTACGTTATGAATAAGATCCTGTTGCAATGCGACAACCTGTGCAAACGCTATCAGGAAGGCAGTGTGCAAACCGAtgt < 2:393095/299‑1 (MQ=255) gggATTATAGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTGCCAGCTAGTTAAATAATCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAGTTCATTGTTATTGCGCTGGTTGCGATGGCTATCGCGCTGCTGTCTACGCTTTACCCTTCATGGCGCGCTGCCGCCACTCAACCTGCTGAGGCTTTACGTTATGAATAAGATCCTGTTGCAATGCGACAACCTGTGCAAACGCTATCAGGAAGGCAGTGTGCAAACCGAtg < 2:197076/299‑1 (MQ=255) gATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTGCCAGCCAGTTAAATAATCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAGGTCATTGTTATTGCGCTGGTGGCGATGGCTATCGCGCTGCTGTCTACGCTTTACCCTTCATGGCGCGCTGCCGCCACTCAACCTGCTGAGGCTTTACGTTATGAATAAGATCCTGTTGCAATGCGACAACCTGTGCAAACGCTATCAGGAAGGCAGTGTGCAAACCGATGtgc > 1:159732/1‑300 (MQ=255) tATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTGCCAGCCAGTTAAATAATCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAGGTCATTGTTATTGCGCTGGTGGCGATGGCTATCGCGCTGCTGTCTACGCTTTACCCTTCATGGCGCGCTGCCGCCACTCAACCTGCTGAGGATTTACGTTATGAATAAGATCCTGTTGCAATGCGACAACCTGTGCAAACGCTATCAGGAAGGCAGTGTGCAAACCGATGtgc > 2:360280/1‑297 (MQ=255) tcagTGCGATCCTCGGAGCTGCGCTTGGCGCCCTGCTTGCCAGCCAGTTAAATAATCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAGGTCATTGTTATTGCGCTGGTGGCGATGGCTATCGCGCTGCTGTCTACGCTTTACCCTTCATGGCGCGCTGCCGCCACTCAACCTGCTGAGGCTTTACGTGATGAATAAGATCCTGTTGCAATGCGACAACCTGTGCAAACGCTATCAGGAAGGCAGTGTGCAAACCGATGTGCTGcac < 2:254477/297‑1 (MQ=255) tCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTGCCAGCCAGTTAAATAATCTGATGCCGATAATCGGCGTCCNGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAGGTCATTGTTATTGCGCTGGTGGCGATGGCTATCGCGCTGCTGTCTACGCTTTACCCTTCATGGCGCGCTGCCGCCACTCAACCTGCTGAGGCTTTACGTTATGAATAAGATCCTGTTGCAATGCGACAACCTGTGCAAACGCTATCAGGAAGGCAGTGTGCAAACCGATGTGCTGcac < 1:496223/300‑1 (MQ=255) tCGGTGCAATCTTCGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTGCCAGCCAGTTAAATAATCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAGGTCATTGTTATTGCGCTGGTGGCGATGGCTATCGCGCTGCTGTCTACGCTTTACCCTTCATGGCGCGCTGCCGCCACTCAACCTGCTGAGGCTTTACGTTATGAATAAGATCCTGTTGCAATGCGACAACCTGTGCAAACGCTATCAGGAAGGCAGTGTGCAAACCGATGTGCTGcac < 2:258552/300‑1 (MQ=255) gATCCTCGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTGCCAGCCAGTTAAATAATCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAGGTCATTGTTATTGCGCTGGTGGCGATGGCTATCGCGCTGCTGTCTACGCTTTACCCTTCATGGCGCGCTGCCGCCACTCAACCTGCTGAGGCTTTACGTTATGAATAAGATCCTGTTGCAATGCGACAACCTGTGCAAACGCTATCAGGAAGGCAGTGTGCAAACCGATGTGCTGAACAATGTCa > 2:629805/1‑300 (MQ=255) aTCCTAGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTGCCAGCCAGTTAAATAATCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAGGTCATTGTTATTGCGCTGGTGGCGATGGCTATCGCGCTGCTGTCTACGCTTTACCCTTCATGGCGCGCTGCCGCCACTCAACCTGCTGAGGCTTTACGTTATGAATAAGATCCTGTTGCAATGCGACAACCTGTGCAAACGCTATCAGGAAGGCAGTGTGCAAACCGATGTGCTGCACAATGTCa > 2:444934/1‑299 (MQ=255) ccTCGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTGCCAGCCAGTTAAATAATCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAGGTCATTGTTATTGCGCTGGTGGCGATGGCTATCGCGCTGCTGTCTACGCTTTACCCTTCATGGCGCGCTGCCGCCACTCAACCTGCTGAGGCTTTACGTTATGAATAAGATCCTGTTGCAATGCGACAACCTGTGCAAACGCTATCAGGAAGGCAGTGTGCAAACCGATGTGCTGCACAATGTCAGtt > 1:554459/1‑300 (MQ=255) gcgcTTGGCGCCCTGCTTGCCAGCCAGTTAAATAATCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAGGTCATTGTTATTGCGCTGGTGGCGATGGCTATCGCGCTGCTGTCTACGCTTTACCCTTCATGGCGCGCTGCCGCCACTCAACCTGCTGAGGCTTTACGTTATGAATAAGATCCTGTTGCAATGCGACAACCTGTGCAAACGCTATCAGGAAGGCAGTGTGCAAACCGATGTGCTGCACAATGTCAGTTTCAGCGTc > 1:446853/1‑298 (MQ=255) tGCTTGCCAGCCAGTTAAATAATCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAGGTCATTGTTATTGCGCTGGTGGCGATGGCTATCGCGCTGCTGTCTACGCTTTACCCTTCATGGCGCGCTGCCGCCACTCAACCTGCTGAGGCTTTACGTTATGAATAAGATCCTGTTGCAATGCGACAACCTGTGCAAACGCTATCAGGAAGGCAGTGTGCAAACCGATGTGCTGCACAATGTCAGTTTCAGCGTCGGCGAAGGTGAAatg < 2:667016/300‑1 (MQ=255) tGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAGTTCATTGTTATTNCGCTGGTGGCGATGGCTATCGCGCTGCTGTCTACGCTTTACCCTTCATGGCGCGCTGCCGCCACTCAACCTGCTGAGGCTTTACGTTATGAATAAGATCCTGTTGCAATGCGACAACCTGTGCAAACGCTATCAGGAAGGCAGTGTGCAAACCGATGTGCTGCACAATGTCAGTTTCAGCGTCGGCGAAGGTGAAATGATGGCGATCGTCGGTAGCTCTgg < 1:499240/299‑1 (MQ=255) gATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAGGTCATTGTTATTGCGCTGGTGGCGATGGCTATCGCGCTGCTGTCNACGCTTTACCCTTCATGGCGCGCTGCCGCCACNCAACCTGCTGAGGCTTTACGTTATGAATAAGATCCTGTTGCAATGCGACAACCTGTGCAAACGCTATCAGGAAGGCAGTGTGCAAACCGATGTGCTGCACAATGTCAGTTTCAGCGTCGGCGAAGGTGAAATGATGGCGATCGTCGGTAGCTCTGGTTCCGGTa > 2:527980/1‑300 (MQ=255) cTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAGGTCATTGTTATTGCGCTGGTGGCGATGGCTATCGCGCTGCTGTCTACGCTTTACCCTTCATGGCGCGCTGCCGCCACTCAACCTGCTGAGGCTTTACGTTATGAATAAGATCCTGTTGCAATGCGACAACCTGTGCAAACGCTATCAGGAAGGCAGTGTGCAAACCGATGTGCTGCACAATGTCAGTTTCAGCGTCGGCGAAGGTGAAATGATGGCGATCGTCGGTAGCTCTGGTTCCGGTAAAAGTACCTtgct > 1:290767/1‑300 (MQ=255) gCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAGGTCATTGTTATTGCGCTGGTGGCGATGGCTATCGCGCTGCTGTCTACGCTTTACCCTTCATGGCGCGCTGCCGCCACTCAACCTGCTGAGGCTTTACGTTATGAATAAGATCCTGTTGCAATGCGACAACCTGTGCAAACGCTATCAGGAAGGCAGTGTGCAAACCGATGTGCTGCACAATGTCAGTTTCAGCGTCGGCGAAGGTGAAATGATGGCGATCGTCGGTAGTTCTGGTTCCGGTACAAGTACCTtgctgc > 2:41191/1‑300 (MQ=255) gCTTGATGGCGCGGCACTACCGGTGGCTATCGAACCTTTACAGGTCATTGTTATTGCGCTGGTGGCGATGGCTATCGCGCTGCTGTCTACGCTTTACCCTTCATGGCGCGCTGCCGCCACTCAACCTGTTGAGGCTTTACGTTATGACTAAGATCCTGTTGCAATGCGACAACCTGTGCAAACGCTATCAGGAAGGCAGTGTGTAAACCGATGTGATGCACAATGTCAGCTTCAGCGTCGGCGAAGGTGAAATGATGGCGATCGTCGATAGCTCTGGTTCCGGTaacaacacattgccga > 2:40817/1‑286 (MQ=255) gATGGCGCTGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAGTTCATTGTTATTGCGCTGGTGGCGATGGCTACCACGCTGCTGTCTACGCTTTACCCTTCATGGCGCGCTGCCGCCACTCAACCTGCTGAGGCTTTACGTTATGAATAAGATCCTGTTGCAATGCGACAACCTGTGCAAACGCTATCAGGAAGGCAGTGTGCAAACCGATGTGCTGCACAATGTCAGTTTCAGCGTCGGCGAAGGTGAAATGATGGCGATCGTCGGTAGCTCTGGTTCCGGTAAAAGTACCTTGCTGCACct < 2:689808/300‑1 (MQ=255) gcgcTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAGGTCATTGTTCTTGCGCTGGTGGCGATGGCTATCGCGCTGCTGTCTACGCTTTACCCTTCATGGCGCGCTGCCGCCACTCAACCTGCTGAGGCTTTACGTTATGAATAAGATCCTGTTGCAATGCGACAACCTGTGCAAACGCTATCAGGAAGGCAGTGTGCAAACCGATGTGCTGCACAATGTCAGTTTCAGCGTCGGCGAAGGTGAAATGATGGCGATCGTCGGTAGCTCTGGTTCCGGTAAAAGTACCTTGCTGCACCTGCTgggc > 1:697479/1‑298 (MQ=255) gcgcTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAGGTCATTGTTATTGCGCTGGTGGCGATGGCTATCGCGCTGCTGTCTACGCTTTACCCTTCATGGTGCGCTGCCGCCACTCAACCTGCTGAGGCTTTACGTTATGAATAAGATCCTGTTGCAATGCGACAACCTGTGCAAACGCTATCAGGAAGGCAGTGTGCAAACCGATGTGCTGCACAATGTCAGTTTCAGCGTCGGCGAAGGTGAAATGATGGCGATCGTCGGTAGCTCTGGTTCCGGTAAAAGTACCTTGCTGCACCTGCTgggc > 2:56526/1‑298 (MQ=255) gcgcTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAGGTCATTGTTATTGCGCTGGTGGCGATGGCTATCGCGCTGCTGTCTACGCTTTACCCTTCATGGCGCGCTGCCGCCACTCAACCTGCTTATGCTTTACGTTATGAATAAGATCCTGTTGCAATGCGACAACCTGTGCAAACGCTATCAGGAAGGCAGTGTGCAAACCGATGTGCTGCACAATGTCAGTTTCAGCGTCGGCGAAGGTGAAATGATGGCGATCGTCGGTAGCTCTGGTTCCGGTAAAAGTACCTTGCTGCACCTGCTgggcgg < 2:374392/300‑1 (MQ=255) gCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAGGTCATTGTTATTGCGCTGGTGGCGATGGCTATCGCGCTGCTGTCTACGCTTTACCCTTCATGGCGCGCTGCCGCCACTCAACCTGCTGAGGCTTTACGTTATGAATAAGATCCTGTTGCAATGCGACAACCTGTGCAAACGCTATCAGGAAGGCAGTGTGCAAACCGATGTGCTGCACAATGTCAGTTTCAGCGTCGGCGAAGGTGAAATGATGGCGATCGTCGGTAGCTCTGGTTCCGGTAAAAGTACCTTGCTGCACCTGCTGGGCGGGCt > 2:464965/1‑298 (MQ=255) ggTGGCTATCGAACCTTTACAGGTCATTGTTATTGCGCTGGTGGCGATGGCTATCGCGCTGCTGTCTACGCTTTACCCTTCATGGCGCGCTGCCGCCACTCAACCTGCTGAGGCTTTACGTTATGAATAAGATCCTGTTGCAATGCGACAACCTGTGCAAACGCTATCAGGAAGGCAGTGTGCAAACCGATGTGCTGCACAATGTCAGTTTCAGCGTCGGCGAAGGTGAAATGATGGCGATCGTCGGTAGCTCTGGTTCCGGTAAAAGTACCTTGCTGCACCTGCTGGGCGGGCTGGATa < 2:632144/300‑1 (MQ=255) aaCCTTTACCGGTCATTGTTATTGCGCTGGTGGCGATGGCTATCGCGCTGCTGTCTACGCTTTACCCTTCATGGCGCGCTGCCGCCACTCAACCTGCTTAGGCTTTACGTTATGAATAAGATCCTGTTGCAANGCGACAACCTGTGCAAACGCTATCAGGAAGGCAGTGTGCAAACCGATGTGCTGCACAATGTCAGTTTCAGCGTCGGCGAAGGTGAAATGATTGCGATCGTCGGTAGCTCTGGTTCCGGTAAAAGTACCTTGCTGCACCTGCTGGGCGGGCTGGATACGCCAACCTc < 2:221099/299‑1 (MQ=255) cTTTACAGGTCATTGTTATTGCGCTGGTGGCGATGGCTATCGCGCTGCTGTCTACGCTTTACCCTTCATGGCGCGCTGCCGCCACTCAACCTGCTGAGGCTTTACGTTATGAATAAGATCCTGTTGCAATGCGACAACCTGTGCAAACGCTATCAGGAAGGCAGTGTGCAAACCGATGTGCTGCACAATGTCAGTTTCAGCGTCGGCGAAGGTGAAATGATGGCGATCGTCGGTAGCTCTGGTTCCGGTAAAAGTACCTTGCTGCACCTGCTGGGCGGGCTGGATACGCCAACCTCCGGc > 1:125327/1‑300 (MQ=255) ttGTTATTGCGCTGGTGGCGATGGCTATCGCGCTGCTGTCTACGCTTTACCCTTCATGGCGCGCTGCCGCCACTCAACCTGCTGAGGCTTTACGTTATGAATNAGATCCTGTTGCAATGCGACAACCTGTGCAAANGCTATCAGGAAGGCAGTGTGCAAACCGATGTGCTGCACAATGTCAGTTTCAGCGTCGGCGAAGGTGAAATGATGGCGATCGTCGGTAGCTCTGGTTCCGGTAAAAGTACCTTGCTGCACCTGCTGGGCGGGCTGGATACGCCAACCTCCGGCGATGTGAttttt > 2:525665/1‑300 (MQ=255) ttGTTATTGCGCTGGTGGCGATGGCTATCGCGCTGCTGTCTACGCTTTACCCTTCATGGCGCGCTGCCGCCACTCAACCTGCTGAGGCTTTACGTTATGAATAAGATCCTGTTGCAATGCGACAACCTGTGCAAACGCTATCAGGAAGGCAGTGTGCAAACCGATGTGCTGCACAATGTCAGTTTCAGCGTCGGCGAAGGTGAAATGATGGCGATCGTCGGTAGCTCTGGTTCCGGTAAAAGTACCTTGCTGCACCTGCTGGGCGGGCTGGATACGCCAACCTCCGGCGATGTGAttttt > 1:249756/1‑300 (MQ=255) ttGTTATTGCGCTGGTGGCGATGGCTATCGCGCTGCTGTCTACGCTTTACCCTTCATGGCGCGCTGCCGCCACTCAACCTGCTGAGGCTTTACGTTATGAATAAGATCCTGTTGCAATGCGACAACCTGTGCAAACGCTATCAGGAAGGCAGTGTGCAAACCGATGTGCTGCACAATGTCAGTTTCAGCGTCGGCGAAGGTGAAATGATGGCGATCGTCGGTAGCTCTGGTTCCGGTAAAAGTACCTTGCTGCACCTGCTGGGCGGGCTGGATACGCCAACCTCCGGCAATGTGAttttt > 1:654270/1‑300 (MQ=255) ttGCACTGTTGGCGATGGCTATCGCGTTGCTGTCTACGCTTTACCCTTCATGGCGCGCTGCCGCCACTCAACCTGCTGAGGCTTTACGTTATGAATAAGACCCTGTTGCAATGCGACAACCTGTGCAAACGCTATCAGGAATGCAGTGTGCAAACCGATGTGCTGCACAATGTCAGTTTCAGCGTCGGCGAAGGTGAAATGATGGCGATCGTCGGTAGCTCTGGTTCCGGTAAAAGTACCTTGCTGCACctgct < 2:357376/254‑1 (MQ=255) ggCTATCGCGTTGCTGTCTACGCTTTACCCTTCATGGCGCGCTGCCGCCACTCAACCTGCTGAGGCTGTACGTTATGAATAATATCCTGTTGCAATGCGACAACCTGTGCAAACGCTATCAGGAAGGCAGTGTGCAAACCGATGTGCTGCACAATGTCAGTTTCAGCGTCGGCGAAGGTGAAATGATGGCGATCGTCGGTAGCTCTGGTTCCGGTAAAAGTACCTTGCTGCACCTGCTGGGCGGGCTGGATACGCCAACCTCCGGCGATGTGATTTTTAATGGTCAGCCAATGAGCAAAc < 2:119263/300‑1 (MQ=255) ggCTATCGCGCTGCTGTCTACGCTTTACCCTTCATGGCGCGCTGCCGCCACTCAACCTGCTGAGGCTTTACGTTATGAATAAGATCCTGTTGCAATGCGACAACCTGTGCAAACGCTATCAGGAAGGCAGTGTGCAAACCGATGTGCTGCACAATGTCAGTTTCAGCGTCGGCGAAGGTGAAATGATGGCGATCGTCGGTAGCTCTGGTTCCGGTAAAAGTACCTTGCTGCACCTGCTGGGCGGGCTGGATACGCCAACCTCCGGCGATGTGATTTTTAATGGTCAGCCAATGAGCAAAc > 1:181674/1‑300 (MQ=255) gcgcTGCTGTCTACGCNTTACCCTTCATGGCGCGCTGCCGCCACTCAACCTGCTGATGCTTTACGTTATGAATAAGATCCTGTTGCAATGCGACAACCTGTGCAAACGCTATCAGGAAGGCAGTGTGCAAACCGATGTGCTGCACAATGTCAGTTTCAGCGTCGGCGAAGGTGAAATGATGGCGATCGTCGGTAGCTCTGGTTCCGGTAAAAGTACCTTGCTGCACCTGCTGGGCGGGCTGGATACGCCAACCTCCGGCGATGNGATTTTTAATGGTCAGCCNATGAGCAAACTgtcgtc > 1:580628/1‑300 (MQ=255) gctgTCTACGCTTTACCCTTCATGGCGCGCTGCCGCCACTCAACCTGCTGAGGCTTTACGTTATGAATAAGATCCTGTTGCAATGCGACAACCTGTGCAAACGCTATCAGGAAGGCAGTGTGCAAACCGATGTGCTGCACAATGTCAGTTTCAGCGTCGGCGAAGGTGAAATGATGGCGATCGTCGGTAGCTCTGGTTCCGGTAAAAGTACCTTGCTGCACCTGCTGGGCGGGCTGGATACGCCAACCTCCGGCGATGTGATTTTTAATGGTCAGCCAATGAGCAAACTGTCGTCGGCa > 1:112002/1‑299 (MQ=255) gTCTACGCTTTACCCTTCATGGCGCGCTGCCGCCACTCAACCTGCTGAGGCTTTACGTTATGAATAAGATCCTGTTGCAATGCGACAACCTGTGTAAACGCTATCAGGAAGGCAGTGTGCAAACCGATGTGCTGCACAATGTCAGTTTCAGCGTCGGCGAAGGTGAAATGATGGCGATCGTCGGTAGCTCTGGTTCCGGTAAAAGTACCTTGCTGCACCTGCTGGGCGGGCTGGATACACCAACCTCCGGCGATGTGATTTTTAATGGTCAGCCAATGAGCAAACTGTCGTCGGCAGcaa > 2:260371/1‑298 (MQ=255) gTCTACGCTTTACCCTTCATGGCGCGCTGCCGCCACTCAACCTGCTGAGGCTTTACGTTATGAATAAGATCCTGTTGCAATGCGACAACCTGTGCAAACGCTATCAGGAAGGCAGTGTGCAAACCGATGTGCTGCACAATGTCAGTTTCAGCGTCGGCGAAGGTGAAATGATGGCGATCGTTGGTAGCTCTGGTTCCGGTAAAAGTACCTTGCTGCAc < 1:63748/218‑1 (MQ=255) gTCTACGCTTTACCCTTCATGGCGCGCTGCCGCCACTCAACCTGCTGAGGCTTTACGTTATGAATAAGATCCTGTTGCAATGCGACAACCTGTGCAAACGCTATCAGGAAGGCAGTGTGCAAACCGATGTGCTGCACAATGTCAGTTTCAGCGTCGGCGAAGGTGAAATGATGGCGATCGTCGGTAGCTCTGGTTCCGGTAAAAGTACCTTGCTGCAc > 2:64408/1‑218 (MQ=255) gTCTACGCTTTACCCTTCATGGCGCGCTGCCGCCACTCAACCTGCTGAGGCTTTACGTTATGAATAAGATCCTGTTGCAATGCGACAACCTGTGCAAACGCTATCAGGAAGGCAGTGTGCAAACCGATGTGCTGCACAATGTCAGTTTCAGCGTCGGCGAAGGTGAAATGATGGCGATCGTCGGTAGCTCTGGTTCCGGTAAAAGTACCTTGCTGCAc > 2:63748/1‑218 (MQ=255) gTCTACGCTTTACCCTTCATGGCGCGCTGCCGCCACTCAACCTGCTGAGGCTTTACGTTATGAATAAGATCCTGTTGCAATGCGACAACCTGTGCAAACGCTATCAGGAAGGCAGTGTGCAAACCGATGTGCTGCACAATGTCAGTTTCAGCGTCGGCGAAGGTGAAATGATGGCGATCGTCGGTAGCTCTGGTTCCGGTAAAAGTACCTTGCTGCAc > 2:63670/1‑218 (MQ=255) gTCTACGCTTTACCCTTCATGGCGCGCTGCCGCCACTCAACCTGCTGAGGCTTTACGTTATGAATAAGATCCTGTTGCAATGCGACAACCTGTGCAAACGCTATCAGGAAGGCAGTGTGCAAACCGATGTGCTGCACAATGTCAGTTTCAGCGTCGGCGAAGGTGAAATGATGGCGATCGTCGGTAGCTCTGGTTCCGGTAAAAGTACCTTGCTGCAc < 1:63670/218‑1 (MQ=255) gTCTACGCTTTACCCTTCATGGCGCGCTGCCGCCACTCAACCTGCTGAGGCTTTACGTTATGAATAAGATCCTGTTGCAATGCGACAACCTGTGCAAACGCTATCAGGAAGGCAGTGTGCAAACCGATGTGCTGCACAATGTCAGTTTCAGCGTCGGCGAAGGTGAAATGATGGCGATCGTCGGTAGCTCTGGTTCCGGTAAAAGTACCTTGCTGCAc < 1:64408/218‑1 (MQ=255) gTCTACGCTTTACCCTTCATGGCGCGCTGCCGCCACTCAACCTGCTGAGGCTTTACGTTATGAATAAGATCCTGTTGCAATGCGACAACCTGTGCAAACGCTATCAGGAAGGCAGTGTGCAAACCGATGTGCTGCACAATGTCAGTTTCAGCGTCGGCGAAGGTGAAATGATGGCGATCGTCGGTAGCTCTGGTTCCGGTAAAAGTACCTTGCTGCACCTGCTGGGCGGGCTGGATACGCCAACCTCCGGCGATGTGATTTTTAATGGTCAGCCAATGAGCAAACTGTCGTCGGCAGCGa > 2:188789/1‑300 (MQ=255) gTCTACGCTTTACCCTTCATGGCGCGCTGCCGCCACTCAACCTGCTGAGGCTTTACGTTATGAATAAGATCCTGTTGCAATGCGACAACCTGTGCAAACGCTATCAGGAAGGCAGTGTGCAAACCGATGTGCTGCACAATGTCAGTTTCAGCGTCGGCGAAGGTGAAATGATGGCGATCGTCGGTAGCTCTGGTTCCGGTAAAAGTACCTTGCTGCACCTGCTGGGCGGGCTGGATACGCCAACCTCCGGCGATGTGATTTTTAATGGTCAGCCAATGAGCAAACTGTCGTCGGCAGCGa > 1:673180/1‑300 (MQ=255) gTCTACGCTTTACCCTTCATGGCGCGCTGCCGCCACTCAAACTGCTGAGGCTTTACGTTATGAATAAGATCCTGTTGCAATGTGACAACCTGTGCAAACGCTATCAGGAAGGCAGTGTGCAAACCGATGTGCTGCACAATGTCAGTTTCAGCGTCGGCGAAGGTGAAATGATGGCGATCGTCGGTAGCTCTGGTTCCGGTAAAAGTACCTTGCTGCACCTGCTGGGCGGACTGGATACGCCAACCTCCGGCGATATGATTTTTAATGGTCAGCCAATGAGCAAACTGtcgtcgacaaca > 2:55384/1‑293 (MQ=255) aCGCTTTACCCTTCATGGCGCGCTGCCGCCACTCAACCTGCTGAGGCTTTACGTTATGAATAAGATCCTGTTGCAATTCGACAACCTGTGCAAACGCTATCAGGAAGGCAGTGTGCAAACCGATGTGCTGCACAATGTCAGTTTCAGCGTCGGCGAAGGTGAAATGATGGCGATCGTCGGTAGCTCTGGTTCCGGTAAAAGTACCTTGCTGCACCTGCTGGGCGGGCTGGATACGCCAACCTCCGGCGATGTGATTTTTAATGGTCAGCCAATGAGCAAACTGTCGTCGGCAGCGAAAGc < 2:680429/300‑1 (MQ=255) aCGCTTTACCCTTCATGGCGCGCTGCCGCCACTCAACCTGCTGAGGCTTTACGTTATGAATAAGATCCTGTTGCAATGCGACAACCTGTGCAAACGCTATCAGGAAGGCAGTGTGCAAACCGATGTGCTGCACAATGTCAGTTTCAGCGTCGGCGAAGGTGAAATGATGGCGATCGTCGGTAGCTCTGGTTCCGGTAAAAGTACCTTGCTGCACCTGCTGGGCGGGCTGGATACGCCAACCTCCGGCGATGTGATTTTTAATGGTCAGCCAATGAGTAACTTGTCGTCGGCAGCGAAAGc > 2:380117/1‑300 (MQ=255) aCGCTTTACCCTTCATGGCGCGCTGCCGCCACTCAACCTGCTGAGGCTTTACGTTATGAATAAGATCCTGTTGCAATGCGACAACCTGTGCAAACGCTATCAGGAAGGCAGTGTGCAAACCGATGTGCTGCACAATGTCAGTTTCAGCGTCGGCGAAGGTGAAATGATGGCGATCGTCGGTAGCTCTGGTTCCGGTAAAAGTACCTTGCTGCACCTGCTGGGCGGGCTGGATACGCCAACCTCCGGCGATGTGATTTTTAATGGTCAGCCAATGAGCAAACTGTCGTCGGCAGCGAAAGc > 2:380822/1‑300 (MQ=255) cGCTTTACCCTTCATGGCGCGCTGCCGCCACTCAACCTGCTGAGGCTTTACGTTATGAATAAGATCCTGTTGCAATGCGACAACCTGTGCAAACGCTATCAGGAAGGCAGTGTGCAAACCGATGTGCTGCACAATGTCAGTTTCAGCGTCGGCGAAGGTGAAATGATGGCGATCGTCGGTAGCTCTGGTTCCGGTAAAAGTACCTTGCTGCACCTGCTGGGCGGGCTGGATACGCCAACCTCCGGCGATGTGATTTTTAATGGTCAGCCAATGAGCAAACTGTCGTCGGCAGCGAAAGCt > 1:300619/1‑300 (MQ=255) gCTTTACCCTTCATGGCGCGCTGCCGCCACTCAACCTGCTGAGGCTTTACGTTATGAATAAGATCCTGTTGCAATGCGACAACCTGTGCAAACGCTATCAGGAAGGCAGTGTGCAAACCGATGTGCTGCACAATGTCAGTTTCAGCGTCGGCGAAGGTGAAATGATGGCGATCGTCGGTAGCTCTGGTTCCGGTAAAAGTACCTTGCTGCACCTGCTGGGCGGGCTGGATACGCCAACCTCCGGCGATGTGATTTTTAATGGTCAGCCAATGAGCAAACTGTCGTCGGCAGCGAAAGCt > 2:468014/1‑299 (MQ=255) cTTTACCCTTCATGGCGCGCTGCCGCCACTCAACCTGCTGAGGCTTTACGTTATGAATAAGATCCTGTTGCAATGCGACAACCTGTGCAAACGCTATCAGGAAGGCAGTGTGCAAACCGATGTGCTGCACAATGTCAGTTTCAGCGTCGGCGAAGGTGAAATGATGGCGATCGTCGGTAGCTCTGGTTCCGGTAAAAGTACCTTGCTGCACCTGCTGGGCGGGCTGGATACGCCAACCTCCGGCGATGTGATTTTTAATGGTCAGCCAATGAGCAAACTGTCGTCGGCAGCGAAAGCTGa > 2:472036/1‑300 (MQ=255) ttACCCTTCATTGCGCACTGCCGCCACTCAACCTGCTGATGCTTTACGTTATGAATAAGATCCTGTTGCAATGCGACAACCTGTGCAAACGCTATCAGGAAGGCAGTGTGCAAACCGATGTGCTGCACAATGTCAGTTTCAGCGTCGGCGAAGGTGAAATGATGGCGATCGTCGGTAGCTCTGGTTCCGGTAAAAGTACCTTGCTGCACCTGCTGGGCGGGCTGGATACGCCAACCTCCGGCGATGTGATTTTTAATGGTCAGCCAATGAGCAAACTGTCGTCGGCAGCGAAAGCTGAAc < 2:8254/300‑1 (MQ=255) ttACCCTTCATGGCGCGCTGCCGCCACTCAACCTGCTGAGGCTTTACGTTATGAATAAGATCCTGTTGCAATGCGACAACCTGTGCAAACGCTATCAGGAAGGCAGTGTGCAAACCGATGTGCTGCACAATGTCAGTTTCAGCGTCGGCGAAGGTGAAATGATGGCGATCGTCGGTAGCTCTGGTTCCGGTAAAAGTACCTTGCTGCACCTGCTGGGCGGGCTGGATACGCCAACCTCCGGCGATGTGATTTTTAATGGTCAGCCAATGAGCAAACTGTCGTCGGCAGCGAAAGCTGAAc < 1:570104/300‑1 (MQ=255) aCCCTTCATGGCGCGCTGCCGCCACTCAACCTGCTGAGGCTTTACGTTATGAATAAGATCCTGTTGCAATGCGACAACCTGTGCAAATGCTATCAGGAAGGCAGTGTGCAAACCGATGTGCTGCACAATGTCAGTTTCAGCGTCGGCGAAGGTGAAATGATGGCGATCGTCGGTAGCTCTGGTTCCGGTAAAAGTACCTTGCTGCACCTGCTGGGCGGGCTGGATACGCCAACCTCCGGCGATGTGATTTTTAATGGTCAGCCAATGAGCAAACTGTCATCGGCAGCGAAAGCTGAACt > 2:341718/1‑299 (MQ=255) gcgcgcTGCCGCCACTCAACCTGCTGAGGCTTTACGTTATGAATAAGATCCTGTTGCAATGCGACAACCTGTGCAAACGCTATCAGGAAGGCAGTGTGCAAACCGATGTGCTGCACAATGTCAGTTTCAGCGTCGGCGAAGGTGAAATGATGGCGATCGTCGGTAGCTCTGGTTCCGGTAAAAGTACCTTGCTGCACCTGCTGGGCGGGCTGGATACGCCAACCTCCGGCGATGTGATTTTTAATGGTCAGCCAATGAGCAAACTGTCGTCGGCAGCGAAAGCTGAACTGCGCAACCAGa > 1:29003/1‑300 (MQ=255) gcgcgcTGCCGCCACTCAACCTGCTGAGGCTTTAAGTTATGAATAAGATCCTGTTGCAATGCGACAACCTGTGCAAACGCTATTAGGAAGGCAGTGTGCAAACCGATGTGCTGCACAATGTCAGTTTCAGCGTCGGCGAAGGTGAAATGATGGCGATCGTCGGTAGCTCTGGTTCCGGTAAAAGTACCTTGCTGCACCTGCTGGGCGGGCTGGATACGCCAACCTCCGGCGATGTGATTTTTAATGGTTAGCCAATGAGCAAACTGTCGTAGGCAGCGAAAGTGGAACTGCGAAACCAGa > 2:81133/1‑300 (MQ=255) gcTGCCGCCACTCAACCTGCTGAGGCTTTACGTTATGAATAAGATCCTGTTGCAATGCGACAACCTGTGCAAACGCTATCAGGAAGGCAGTGTGCAAACCGATGTGCTGCACAATGTCAGTTTCAGCGTCGGCGAAGGTGAAATGATGGCGATCGTCGGTAGCTCTGGTTCCGGTAAAAGTACCTTGCTGCACCTGCTGGGCGGGCTGGATACGCCAACCTCCGGCGATGTGATTTTTAATGGTCAGCCAATGAGCAAACTGTCGTCGGCAGCGAAAGCTGAACTGCGCAACCAGAAGc < 1:686313/299‑1 (MQ=255) ccACTCAACCTGCTGAGGCTTTACGTTATGAATAAGATCCTGTTGCAATGCGACAACCTGTGCAAACGCTATCAGGAAGGCAGTGTGCAAACCGATGTGCTGCACAATGTCAGTTTCAGCGTCGGCGAAGGTGAAATGATGGCGATCGTCGGTAGCTCTGGTTCCGGTAAAAGTACCTTGCTGCACCTGCTGGGCGGGCTGGATACGCCAACCTCCGGCGATGTGATTTTTAATGGTCAGCCAATGAGCAAACTGTCGTCGGCAGCGAAAGCTGAACTGCGCAACCAGAAGCTGGGCttt > 1:81689/1‑300 (MQ=255) | AAGTAGCGATCCTGCAAACGCAAGGCTTAACTCCGCGACAAATCATGATGGTCTTTATGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTGCCAGCCAGTTAAATAATCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAGGTCATTGTTATTGCGCTGGTGGCGATGGCTATCGCGCTGCTGTCTACGCTTTACCCTTCATGGCGCGCTGCCGCCACTCAACCCGCTGAGGCTTTACGTTATGAATAAGATCCTGTTGCAATGCGACAACCTGTGCAAACGCTATCAGGAAGGCAGTGTGCAAACCGATGTGCTGCACAATGTCAGTTTCAGCGTCGGCGAAGGTGAAATGATGGCGATCGTCGGTAGCTCTGGTTCCGGTAAAAGTACCTTGCTGCACCTGCTGGGCGGGCTGGATACGCCAACCTCCGGCGATGTGATTTTTAATGGTCAGCCAATGAGCAAACTGTCGTCGGCAGCGAAAGCTGAACTGCGCAACCAGAAGCTGGGCTTT > NC_000913/1176313‑1176891 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |